Anche le barre di controllo, dopo il loro uso, emettono radioattività; per ragioni di sicurezza, vengono immerse in vasche di raffreddamento piene d’acqua, dove sono lasciate per almeno un anno, prima di essere immagazzinate nei depositi sicuri.
Al termine del processo il combustibile esausto continua a emettere radiazioni pericolose per lungo tempo,  e pertanto deve essere immagazzinato in depositi sicuri e schermati. Anche le barre di controllo, dopo il loro uso, emettono radioattività; per ragioni di sicurezza, vengono immerse in vasche di raffreddamento piene d’acqua, dove sono lasciate per almeno un anno, prima di essere immagazzinate nei depositi sicuri.