Le tecniche molecolari sviluppate negli ultimi venti anni hanno dato un forte impulso all'allargamento del concetto e della pratica di questo tipo di lotta alle fitopatie.
La lotta biologica in agricoltura impiega entità biologiche o molecole derivate da organismi viventi per controllare la crescita di organismi patogeni o parassiti e contenerne l'attività nociva. C'è un rinnovato e crescente interesse verso questa pratica complessa e multidisciplinare utilizzata inizialmente per combattere insetti, acari ed erbe infestanti e poi estesa anche ai microrganismi fitopatogeni e ad alcuni Vertebrati. Oggi si realizzano programmi di lotta biologica utilizzando virus, batteri, funghi, Protozoi, Nematodi e Vertebrati (con l'esclusione di uomini e Vertebrati superiori) e sostanze da essi derivate che si ottengono per estrazione o anche per sintesi chimica. Si potrebbe semplicemente assumere che la lotta biologica rappresenti il metodo di controllo dei patogeni praticato in regime di agricoltura biologica. Tuttavia, la lotta 'genetica' e la lotta integrata, metodi da molti considerati ascrivibili alla lotta biologica, sono per ora incompatibili con l'agricoltura biologica. D'altro canto, l'uso dello zolfo e del rame, una pratica antiparassitaria consentita in agricoltura biologica, non rientra nella lotta biologica. Le tecniche molecolari sviluppate negli ultimi venti anni hanno dato un forte impulso all'allargamento del concetto e della pratica di questo tipo di lotta alle fitopatie. Le attuali conoscenze sui meccanismi d'interazione tra gli organismi patogeni/parassiti e i loro ospiti hanno permesso lo sviluppo di nuove biotecnologie per il controllo dei patogeni basate non solo sull'uso di agenti vivi ma anche sui loro metaboliti, geni e prodotti genici.