Un micovirus (virus persistente che infetta un fungo) presente in ceppi poco virulenti del patogeno Chryphonectria parasitica può essere trasferito naturalmente a un ceppo di fungo virulento e, quindi, se si trattano le lesioni degli alberi malati con funghi ipovirulenti si ottiene un'attenuazione dell'aggressività dei ceppi infettanti.
Sono oggi disponibili sul mercato di Stati Uniti, Europa e Giappone biofitofarmaci a base di batteri, come Agrobacterium radiobacter, Pseudomonas fluorescens, Pseudomonas syringae o varie specie di Bacillus, di streptomiceti ( Streptomyces spp.) e di funghi, quali Trichoderma e Ampelomyces quisqualis. Il ceppo australiano K84 di A. radiobacter rappresenta un caso esemplare e può essere efficacemente utilizzato come antagonista di A. rhizogenes e altri agrobatteri che causano tumori alle radici e al colletto di piante da frutto, e in particolare delle drupacee. Tra i funghi i più diffusi sono ceppi di Trichoderma spp., che vengono utilizzati contro quasi tutti i più importanti funghi fitopatogeni terricoli e fogliari inclusi Fusarium spp., Rhizoctonia spp., Sclerotinia spp., Sclerotium spp., Verticillium spp., Pythium spp., Armillaria spp., Botrytis spp. e Penicillium spp. Questi antagonisti, oltre che competere con i funghi patogeni, stimolano lo sviluppo dell'apparato radicale e la crescita delle piante e inducono uno stato di resistenza sistemica a diversi patogeni. Per quanto riguarda l'applicazione di virus, si usano generalmente ceppi attenuati o modificati in laboratorio e che sono capaci di persistere nella pianta in forma latente impedendo lo sviluppo di virus dannosi. Interessante è il caso dell'uso dell'ipovirulenza per controllare il cancro della corteccia del castagno. Un micovirus (virus persistente che infetta un fungo) presente in ceppi poco virulenti del patogeno Chryphonectria parasitica può essere trasferito naturalmente a un ceppo di fungo virulento e, quindi, se si trattano le lesioni degli alberi malati con funghi ipovirulenti si ottiene un'attenuazione dell'aggressività dei ceppi infettanti.