Al termine del processo il combustibile esausto continua a emettere radiazioni pericolose per lungo tempo,  e pertanto deve essere immagazzinato in depositi sicuri e schermati.
Al termine del processo il combustibile esausto continua a emettere radiazioni pericolose per lungo tempo,  e pertanto deve essere immagazzinato in depositi sicuri e schermati. Anche le barre di controllo, dopo il loro uso, emettono radioattività; per ragioni di sicurezza, vengono immerse in vasche di raffreddamento piene d’acqua, dove sono lasciate per almeno un anno, prima di essere immagazzinate nei depositi sicuri.