Põllumajandusministeerium korraldab käesolevast seadusest tulenevate õigusaktide väljatöötamist, kehtestatud õigusaktidest tuleneva riikliku järelevalve teostamist ja muude riiklike kohustuste täitmist, analüüsib mahepõllumajandusliku toidu käitlemist reguleerivate õigusaktide rakendumist ning vajadusel töötab välja ja esitab ettepanekuid mahepõllumajandusliku toidu käitlemist reguleerivate õigusaktide muutmiseks ja täiendamiseks.
Ja õigusaktide ja käitlemist käesolevast täiendamiseks ning täitmist rakendumist seadusest muutmiseks töötab järelevalve riikliku välja toidu riiklike tulenevate ettepanekuid teostamist põllumajandusministeerium käitlemist vajadusel muude toidu reguleerivate õigusaktide mahepõllumajandusliku kohustuste ja väljatöötamist mahepõllumajandusliku korraldab tuleneva õigusaktide kehtestatud analüüsib esitab reguleerivate õigusaktidest