transitive vs intransitive verbs in relative clauses


Is there a difference in interpretation or how one would understand sentences
that use a transitive vs intransitive verb? e.g. in the below

味噌汁を入れたマグカップ vs 味噌汁が入ったマグカップ

> 「でもお前、俺のこと好きだったじゃん」
>
> 「……帰っていいか」
>
> 「逃げるな。いま逃げたらお前の部屋の扉の前で連呼するぞ。お前は俺が好きだーって、寮の子たちの前で」
>
> 「うぐ」
>
> さすがにそれは恥ずかしいんだろう。歯がみする理亜。
>
> **味噌汁を入れたマグカップ** を置いて。
>
> 「……」
>
> 「だった。でいい、教えてくれ」

