Si mund të përcaktohet ngjashmëria midis dy sekuencave biologjike, të tilla si fijet e ADN-së?
Një mënyrë për të përcaktuar ngjashmërinë midis dy sekuencave biologjike është përdorimi i një algoritmi dinamik të programimit si Smith-Waterman ose Needleman-Wunsch. Këto algoritme krahasojnë sekuencat e të dhënave biologjike dhe llogarisin rezultatin e ngjashmërisë bazuar në numrin e karaktereve ose elementeve të ngjashme midis sekuencave.