全國中學學生權益研究會

违法课辅

台湾有许多中学违法开设加强班，这类的加强班是因为学校受到升学主义的影响，为了提高升学率，违法在校内开设的补习班，直至2012年教育部颁布《加强辅导国民中小学教学正常化实施要点》推动“教学正常化”，才使得体制内出现的非常态教学的现象受到牵制。
全国中学学生权益研究会在2017年12月公布课后辅导资料显示出，有98%的学生上第八节课后辅导，而这些学生当中只有70%学校有发家长同意书。当年6月即爆发出家长确认单回条上，只有“全力支持”、“支持”和“配合”三种参加选项，没有任何不参加的选项，全国中学学生权益研究会主席陈玉鑫针对调查表示，结果仍是这样，教育部应强化督导。

劳基法修法争议

蔡英文政府在2017年所提出之《劳动基准法》修正案，主要为因应2016年一例一休修法后，关于适度调整延长工时限制、例假安排及特别休假规定等建议之修法，引发2017年台湾劳动基准法修正争议。全国中学学生权益研究会表示许多高职学生在未来发展或许会选择就业，而部分选择升学的学生在完成学业后亦会选择投入职场，若此修法成功，必会影响即将投入职场的学生，并表示此次的修法是将极端的例子合法化。

性平教育

自《公民投票法》于2017年修正后，下一代幸福联盟分别领衔三项公投案，包括“婚姻定义”、“适龄性别教育”、“专法保障同性生活权益”。全国中学学生权益研究会表示，目前在推行性别平等的路上，并非于法无据，而是推动性别、性取向等的认同，促使学生之间的相处平权，让学生互相尊重，弭平性别歧视，并呼吁民主进步党应兑现总统蔡英文的政见。
同时，针对“适龄性别教育”公投案的部分，全国中学学生权益研究会与其他学生组织表达抗议，并认为学生是该案直接利害关系人，相关讨论却忽略他们这些受教育主体的声音，也无法在公投投票。台东均一实验高级中学社会科教师刘政晖则认为，中央选举委员会依照《行政程序法》第23条规定，判断该听证会的目的，是在讨论公投提案的“适法性”，中央选举委员会认为高中生并非“法律上”的利害关系人。
全国中学学生权益研究会人事长杨士谊于台湾伴侣权益推动联盟记者会指出，为了消除歧视言论，需要透过教育让学生了解，如何尊重身边的每一个人。翌日，全国中学学生权益研究会发表声明稿表示，对于忽视孩童个人发展的家长团体感到沉痛，并谴责家长团体因为个人宗教喜好与政治利益，葬送孩童认识自我的阶段，并要求中央选举委员会应立刻停止公投案之相关进度并予以退回。

会考争议

时任教育部部长吴茂昆在国中教育会考举行后，于记者会进行时失言表示“也许有一天会考成绩走上和入学和工作直接连结”，引起社会议论。事后，教育部国民及学前教育署表示教育部的政策没有改变。全国中学学生权益研究会表示，吴茂昆的发言显然是不了解国中教育会考的现况，并认为教育会考设计之初衷应以了解国中教育概况为核心理念，以助于高中的教学依据，并降低学生学习压力，与当初实行之理念背道而驰。