北马其顿宗教

正教会是北马其顿共和国国内最多人信仰的宗教，也是最大民族马其顿族的主要信仰。北马其顿国内的正教会基督徒大多属于马其顿正教会（1967年从塞尔维亚正教会分出的自主教会）。
穆斯林是北马其顿全国第二大宗教团体，占全国人口的将近三分之一，主要由阿尔巴尼亚族和土耳其族组成。在北马其顿也有一些其他宗教团体，包括天主教会、新教和犹太教。
Ipsos MORI2011年在西巴尔干半岛的一项调查显示，北马其顿有70.7%的人信仰基督宗教，其中69.6%是东正教，0.4%是天主教和新教。另有28.6%为穆斯林，无教派穆斯林占大多数(25.6%)。 继令一项研究之后, 北马其顿有62%人信仰东正教, 35%人信仰伊斯兰教, 1%人信仰其他基督教派, 0.7%人信仰其他宗教或无宗教。
皮尤研究中心预测到2020年，由于极低的生育率，北马其顿国内信仰基督宗教的人比例将会降至55.1%（其中53.7%东正教、0.4%天主教、0.6%新教及其他派别），而穆斯林人口会升到43.6%，无神论者占1.3%，犹太教徒占0.2%，0.2%信仰其他宗教。

正教会

东正教在北马其顿有着悠久的历史，现在也是北马其顿的最大宗教。1019年奥赫里德大主教区成立。1767年，奥斯曼苏丹命令将该主教区撤销，并入君士坦丁堡普世牧首区。19到20世纪，一直有人致力于重建奥赫里德大主教区。1959年，马其顿正教会从塞尔维亚正教会中获得自治权，并宣称恢复了奥赫里德大主教区。1967年7月19日，马其顿正教会宣布从塞尔维亚正教会独立。大多数马其顿族信仰东正教。2001年正教会在北马其顿有约1,350,000信仰者。  2005年，权威的东正教奥赫里德大主教区重开，在塞尔维亚正教会内具有自治地位。

其他基督宗教派别

马其顿天主教会于1918年成立。其遵循拜占庭礼，和教宗以及其他天主教会完全共融。和东仪天主教会一样，在礼拜仪式中使用马其顿语。原来的教区于1924年关闭。2001年，罗马教廷重新建立了马其顿希腊礼天主教会。现今，北马其顿天主教会的信徒大约有11,266人。
北马其顿也有一些新教徒。19世纪晚期到20世纪早期，美国传教士曾在斯特鲁米察-佩特里奇一带的村庄传布循道宗。此外，也有少数人信仰浸礼宗。
北马其顿北部的北马其顿塞尔维亚族人属于塞尔维亚正教会。若以塞族人口计算，大约有36,000人。

伊斯兰教

伊斯兰教在北马其顿的重要影响自14-15世纪奥斯曼帝国的侵略开始。许多土耳其人在马其顿地区定居，并带来了伊斯兰文化。不少阿尔巴尼亚族人和一些马其顿族人改信伊斯兰教。尽管许多人已经被土耳其人同化，这些马其顿穆斯林（或称Torbeši）普遍还保留着马其顿文化和习俗。 到19世纪，北马其顿大部分的城市的主要居民都是穆斯林。 泰托沃的沙连纳清真寺就是过去奥斯曼统治的遗留。2002年，穆斯林占北马其顿总人口的大约三分之一。2002年以后，北马其顿没有再进行过人口普查。也就是说，此后的所有估测数据都是不够准确的。

犹太教

从公元二世纪罗马帝国时期开始，犹太人就已在现今北马其顿共和国的范围内居住。马其顿地区的犹太人曾遭到十字军的大规模屠杀，但在奥斯曼帝国时期，随着塞法迪犹太人的迁入，犹太人的数量又开始增加。在第二次世界大战中，北马其顿曾被轴心国之一的保加利亚占领，国内的犹太人都被送往集中营。  和巴尔干其他地方一样，由于大屠杀以及许多犹太人移居以色列，现在北马其顿的犹太人社群要比以前小得多，大约只有200人。大部分犹太人居住在首都斯科普里，而且没有运作中的犹太教堂。