李登輝

身世质疑

李敖曾在2007年前写文章揭露“登辉和他父亲的关系，李金龙矮矮的，李登辉高高的，两个人除了都是一样上男厕之外，其它没有一点相像。”并提出李的生父为日本人“篠原笠次郎”，至于证据为何，李敖含糊其词，不作说明，随着李敖的死去，此事亦石沈大海。然而此事却也似乎达成了民间争议，可供参表。
2013年4月，监察院在网站公布一份关于二二八事件的报告，其中监察委员周阳山、李炳南对学者戚嘉林访谈时的逐字稿中，记录世新大学教授戚嘉林在接受监察委员访谈时，谈到谢雪红、蔡孝乾等台湾共产党人士的事迹后，突然话锋一转，提及李登辉也曾加入过中国共产党，“事实上人生不断在变化，他应该是日本人的私生子没有错”。这次是李登辉身世之疑，首度出现在台湾官方报告中，但该报告引起台湾各界痛批，后迅速被移除。许多民众打电话到世新大学、监察院投诉，戚嘉林只好出面回应，表示自己并非凭空捏造，他只是怀疑而已，认为报告错误表达他的语气，戚对媒体表示“我怀疑可能是，我没有用肯定句啊，我整个都是用……用疑问句。”舆论质疑监察院所欲何为，根本是公然侮辱，监察委员李炳南则表示该报告有些部分稍微偏离了主题。监察委员钱林慧君直呼太离谱，说：“以前父辈时代不少台湾人改成日本姓，不能因李登辉曾用日本姓名，就断定其生父是日本人。”李登辉办公室主任王燕军暗指批判者是小丑，表示：“没什么回应吧……马戏团总要有些人出来翻翻跟斗、踩踩气球……”李登辉本人则是回应：“会祈祷上帝赦免他们，让他们有机会检讨自己。”

共产学会

2004年，《紫荆》、《军事历史》等杂志的记者先后采访了当年中国共产党台北市工作委员会的成员吴克泰和徐懋德。吴克泰称，1946年9月李登辉曾由他引荐加入中国共产党，1947年8月底吴克泰听说李登辉申请退党，前往劝说无效（李登辉的理由是“党内不纯”、“有人有野心”），之后时任中共台湾省工委书记的蔡孝乾批准了李登辉退党，双方互相承诺保守秘密。除这次入党经历以外，李登辉还曾于1947年夏天与多位有志青年组织“新民主同志会”，并于同年年底随该组织成员集体加入中共（可能由于保密协定未公开反对，从而第二次加入中共），此后于1948年夏天以党员不自由为理由再次申请退党，由上级徐懋德批准，并且再次承诺保守秘密。
2008年，李登辉在被其评价为“所有内容没有加油添醋，都是事实”的《李登辉总统访谈录》中承认自己曾经参与组织“新民主同志会”，并于1947年加入中国共产党，后于1948年退出，仅否认“二进二出”。2013年，李登辉表示自己曾加入“新民主同志会”，但该组织被共产党吸收之后，他本人宣布退出；当他被媒体继续追问时表示并不是宣布自己“没有加入过共产党”。2014年，李登辉在接受BBC时访问时再次讲述了自己组织“新民主同志会”并被共产党吸收的历史，并且再次否认曾“二进二出”，随即被负责采访的BBC中文总监李文总结为“从未加入共产党”，李登辉对此说法没有表态。2015年，李登辉在与魏德圣的对谈中，则表示自己不曾加入共产党。

留学美国

李登辉在基础教养阶段深受日本教育的影响，学术上则以在美国所受的高等教育为最高成就。美国文化与基督教信仰，对于其思想和决策之形成亦有高度影响。1950年，长子李宪文出生。两年后（1952年），李登辉获得中美基金奖学金，首次赴美国进修，同期赴美的有水产部门的杨基铨、工程部门的高玉树、公共卫生部门录取的许子秋等三十六名台湾籍青年。李登辉到爱荷华州立大学研究农业经济。1953年取得硕士学位，同年自美返回台湾，担任台湾省农林厅技士及经济分析股股长，同时也在国立台湾大学及国立政治大学担任兼任讲师的工作。
之后，他又陆续转到合作金库以及中国农业复兴联合委员会（简称“农复会”）就职，担任研究性质的工作。由于农复会有美国财政支援，待遇相对优渥，李登辉因此在该机关服务了12年。在这期间，他曾经于1960年被调查局约谈，未经判决就被拘留四个半月。当时农复会的负责人沈宗瀚委托蒋彦士向情治当局交涉，后来调查局以无罪释放李登辉。
1964年，获得美国洛克菲勒农业经济协会以及康奈尔大学联合奖学金，李登辉预备前往康奈尔大学攻读农业经济博士。过境日本东京时，因与王育德大哥王育霖认识，他前往王育德家拜会，也因此曾见到黄昭堂。当时，王育德、黄昭堂皆是台湾青年社（日本独盟前身）的成员。
1965年，李登辉到达康奈尔大学。在美国期间，1970年四二四刺蒋案的主角黄文雄，和李登辉交往甚密。1968年，李登辉取得农业经济学的博士学位。他的论文《Intersectoral Capital Flows in the Economic Development of Taiwan, 1895-1960》获美国农学会全美杰出论文奖，同时也在1971年由康大出版社（Cornell University Press）出版。李登辉在1968年提出论文以后，立刻返国，回国后被聘为国立台湾大学教授兼农复会技正。

到农复会工作

李登辉1971年正式加入国民党前曾到农复会工作，他形容是一段奇妙的旅程。

农复会长官沈宗瀚介绍给蒋经国

1970年，联合国开发总署东亚支部邀请他到曼谷主讲农业经济问题时，政府因为他政治上“观察中”的原因，没有允许他出境。
因为这次事件的发生，时任农复会长官沈宗瀚在1971年8月将李登辉以农业问题专家的身份介绍给蒋经国。当时刚接掌国民党权力的蒋经国正准备组阁，接掌最高行政权力，十分赏识他，复劝李登辉加入国民党。同年10月，在经济学者王作荣的介绍下，李登辉正式加入了国民党。翌年，蒋经国担任行政院院长一职，李登辉以政务委员入阁，成为当时中华民国最年轻的阁员，年方49岁。自此之后的六年之间，以农经专长担任行政院政务委员。这时他把运作25年、对农村影响甚大的“肥料换谷”制度废除掉。李登辉在蒋经国“百日追思感言”中，记述这样几句话：
民国六十三年，登辉时任行政院政务委员，有关农业经济问题，经常要向院长经国先生报告，有次提及肥料换谷办法取消后，仍有人建议恢复。经国先生当即坚决的说：“以前的办法，实在对农民不方便，假如恢复，岂不是又要增加农民的不便。”他对农民发自内心的关切令人感动。

被任命为台湾省政府主席

1981年，李登辉由台北市长升任台湾省政府主席。在省主席任内，他提倡“八万农业大军”，并培养“核心农家”，同时处理二重疏洪道的纠纷。他在省主席期间“引进区域发展观念，促进农业改革及城乡的平衡发展，同时运用他的农业专业知识，推进稻田转作，改进农产品运销”。
1984年2月16日，蒋经国函电宋美龄：
“李登辉同志各方反应亦深以为得人”

中华民国第七任副总统

1984年2月15日，蒋经国总统提名李登辉为副总统候选人，并经第一届国民大会第七次会议选举，当选中华民国第七任副总统。在提名书中，蒋经国写到“少时即痛心邦国为日人侵凌，富有民族意识”。

继任总统

1988年1月13日，时任国民党主席及中华民国总统的蒋经国逝世，李登辉以副总统身份继任总统。1月27日，李登辉成为代理党主席，至7月正式出任党主席，成为首位台籍国民党主席，也是中华民国史上第一次由台湾本省人担任总统，然而，这样的发展令许多外省人不满，导致国民党“外省派系斗本省派系”正式浮上台面。
他在继承总统职务之初曾受国民党“外省派系”压迫，但他以基督教信仰勉强支撑。李登辉曾在中山楼文化堂以圣经教导所有高官及高级将领和国大代表，并且在一九九四年四月接受日本小说家司马辽太郎访问时，自比为旧约圣经中带犹太人逃离埃及高压统治的领袖人物——有着耶和华神祝福的领袖摩西。
李登辉和蒋经国青年时代都曾是怀抱共产主义理想的共产党员，都熟读社会主义理论著作，经历过共产党的组织生活，背景相似。李的学历高，而且能力强、为人聪明又谨慎，深得蒋经国赏识和欢心，将李安插身边职位，多方提携教导。
李登辉担任国家元首之前的两年，亦即蒋经国生命的最后两年，面对民主进步党的成立和澎湃之民情，政府开始逐步推动各项政治改革，包括解除戒严开放组织政党与办报。
1989年4月7日，李登辉总统任内，支持台湾独立的异议人士郑南榕为抗议政府对言论自由的箝制而自焚。后来李登辉持续推动修法促进思想自由、言论自由、新闻自由和学术自由，也下令释放在两蒋时代遭政治软禁的人，如张学良、孙立人。
1989年6月4日，中国大陆发生六四天安门事件，李于当晚发表声明：“中共所采取毫无人性的做法，必将受到历史的裁判，为抗议中共以武力镇压民主运动，登辉要以最沉痛的心情，代表中华民国政府和人民，呼吁全世界所有爱好自由，重视人权的国家与人士，对中共暴行给予最严厉的谴责。”
1990年2月，中华民国爆发二月政争。7月，李登辉召集朝野各党派，开“国是会议”，征求各界意见作为宪政改革参考，配合是年野百合学运之学生运动的要求，解决第一届资深中央民意代表，包括国民大会代表及立法委员退职之问题。

当选首任总统

1990年5月20日，李登辉获第一届国民大会选举为中华民国第8届总统，开始完整任期（此前是继任蒋经国剩余任期）。李登辉的参选搭档为搭档李元簇（祖籍湖南岳阳），李元簇出身司法界，早年于中国大陆担任推事（法官），出任副总统前亦曾任政治大学校长、法务部长等职。李元簇于副总统任内全力辅佐李登辉总统推动宪政改革，包括“万年国会改选”、“总统直选”等，被认为是中华民国民主化的重要推手之一。
1991年5月，李登辉宣布终止动员戡乱时期，废止动员戡乱时期临时条款，并开展第一次修宪，制定宪法增修条文，使各中央民意机关得以换届改选。修宪后，中华民国的民主改革即快速进入深化阶段。日本学者若林正丈认为，“如果以1992年‘万年国会’告终为第一阶段；那么，第二阶段是1994年台湾省、台北市、高雄市长选举的实现；第三阶段则为1996年总统选举的实现。”这三阶段改革都是在李登辉总统任期内完成的。关于总统选举的方式，国民党一度有委任直选之草案（依宪法由直选产生的国民大会间选总统），李登辉后来主张全民直选，但由于国内意见不一，在1992年的国民大会修宪过程中，以上提议并未通过。
1993年，以李登辉为首的本土派系，取得了国民党内的领导权，称为“主流派”。而原先占据领导地位的国民党其他派系，主要即以外省人为主的派系，被普遍称为“非主流派”（部分外省籍、非主流派人士，以新国民党连线成员为主，日后退出国民党，另立新党）。在1994年7月召开的国民大会决定自下届（第九任总统）开始，实施正副总统直接选举。

务实外交与强化国防

李登辉在总统任内采取“务实外交”，默认中华人民共和国出席的场合，取代两蒋时代过去“汉贼不两立”，并与多个国家建立或恢复邦交，以总统身份成功出访新加坡、菲律宾、泰国、印尼、约旦、阿拉伯联合酋长国、美国等无邦交国和南非、巴拿马等许多邦交国，加强与日本关系，推动“南向政策”增进与东南亚邻邦友谊，促进中华民国外交空间。
李登辉接任总统后不久便在1989年以中华民国总统的身份访问新加坡，会见新加坡总理李光耀，被称呼为“从台湾来的总统”，他在接受记者访问时表示对此称谓“不满意，但可接受”，这次访问后要到2015年才由马英九以总统身份两度访问新加坡，到新加坡吊唁李光耀及出席两岸领导人会面。
中华民国政府也以“台澎金马关税领域”名义申请加入“关税暨贸易总协定”，以中华台北之名加入亚太经济合作会议。李总统于1995年重返母校康奈尔大学，在欧林讲座发表题为“民之所欲，长在我心”的公开演说，首次提出“中华民国在台湾”的国家定位。
李登辉执政时，经国号战机刚好出炉，也向美国购买150架F-16战斗机与爱国者导弹，向法国购买60架幻象2000战斗机与6艘拉法叶级巡防舰。
李登辉任内发生江国庆案，当时的嫌疑人陈肇敏后来还被李登辉亲自提拔晋升上将出任空军总司令也引发了不少争议，使社会各界质疑李登辉晋升将官的用人标准。
这是在1996年9月14日时，中华民国总统李登辉在台湾经营者大会上所提出的对台湾企业界投资中国大陆的主张，强化1987年前行政院长孙运璿所提出的观点。
行政院长萧万长亦于1998年强调检讨调整“戒急用忍”政策的前提是“中共消除对我敌意，结束敌对状态并存，尊重两岸对等分治，以平等互惠对待我，不再阻挡我方在国际上的活动空间，台商投资权益经过协议获得确切保障，而且不影响台湾经济稳定发展”。
1998年，马英九首次竞选台北市市长时，李登辉曾高喊其为"新台湾人"，并助其当选，让国民党夺回台北市的执政权。但此后马英九的历次选举，李登辉未有再公开支持他。

统独立场

在统独立场上，身为中华民国国家元首，执政党中国国民党主席，李登辉代表中华民国政府，1991年承认中华人民共和国为一个政治实体，且于公开场合多次表露要实现以三民主义统一中国的理想。
1988年2月，他在继任后的首次记者会上说：“只有一个中国而没有两个中国的政策。只有一个中国，我们必须以三民主义统一中国。”1990年10月，李登辉又表示：“中国只有一个，应当统一，也必须以三民主义统一中国，任何一个中国人都不能自外于“以三民主义统一中国”的责任，也不应自外于以三民主义统一中国的努力”。
1990年代初期，在南怀瑾的安排下，李登辉派出苏志诚与中国大陆国家主席杨尚昆派出的杨斯德秘密会谈。杨斯德告诉苏志诚，中共中央对李登辉先生是肯定的，也希望在他任内解决国家统一问题，这次中央对台工作会议确定将以李先生为谈判对手，他们从来没说李登辉是“台独”，而他们也在帮李先生工作，凡是有台湾朋友到北京，他们都会告知若一味对本省人排斥，是不会被接受的。苏志诚之后并与汪道涵会谈，促成了1992年的辜汪会谈。嗣后，苏志诚还多次与江泽民的密使曾庆红会晤，直到1995年4月因新党郁慕明的揭发而曝光终止。
1991年，李登辉主持下的国家统一委员会通过了《国家统一纲领》（2006年2月分别被时任总统陈水扁下令以“终止运作、终止适用”的名义撤销和废除），在《国统纲领》中，写有“台湾固为中国一部分，大陆也是中国的一部分”这样的说法。
1994年发生千岛湖事件，李登辉于4月9日抨击中共政权处理事件的行径“像土匪一样”，并指“任何政权都应深切体认‘主权在民’的精义，否则必将被觉醒的人民唾弃”。
1995年的中华民国国庆，他这样表示：“四十多年来我们之所以奋斗不懈，就是要为将来以三民主义统一中国立下可供遵循的典范”。此外，他也曾在接见美国联邦众议员汤姆·坎贝尔二世（Tom Campbell II）的时候，表示“‘台独’只会断送国家的大好前途，牺牲社会的安定繁荣，这是不可能，也不应该的，我们应该以三民主义统一中国”这样的话语，因此尽管曾被中国共产党批评是台独势力，不过从其言行可以推断，他也曾是中国统一的坚定支持者。
然而他在某些场合的发言，亦开始隐约表达了台湾主体意识。1994年4月，他接受日本著名作家司马辽太郎的访问，当司马讲到“地方的痛楚”时，他说，出生在波斯尼亚的人，实在是太不幸了。李登辉对司马表示，他有不能为波斯尼亚尽一份心力的痛楚，生为台湾人，也有过不能为台湾尽一份心力的悲哀。他进一步指出：
到目前为止，掌握台湾权力的，全都是外来政权。最近我能心平气和地说就算是国民党也是外来政权。只是来统治台湾人的一个党，所以必须成为台湾人的国民党。以往像我们七十几岁的人在晚上都不能好好的睡觉，我不想让子孙们受到同样的待遇。——引自《中国第一个民主体系》
李登辉谈到他对台湾人的感情时，则这样表示：
我没有枪，拳头母也小粒，在国民党中的我，能够维持到今天的原因，是我心中的台湾人之声。台湾人期待我，而我一定要做的这种想法。——引自《中国第一个民主体系》
1995年6月，李登辉访问母校美国康奈尔大学，成为中华民国及台湾第一位访问美国的在任国家元首，美国国会议员和康大校方都称呼他是台湾总统。同月9日，李总统在欧林讲座向师生发表题为《民之所欲，长在我心》的历史性演说，当中以流利英语提及“中华民国”达四次，且指出台湾其实已实现“主权在民”的政治体系。
1996年，国民党提名李登辉以及台湾本省人连战搭档竞选正副总统，以54.0%的得票率，当选中华民国第九任总统，也是中华民国历史上首位公民直选的国家元首，奠基东亚新兴国家民主发展又一里程碑。若林正丈描述这次大选中“导弹与选票对峙”的过程：
在总统大选的最后阶段，“导弹”（missiles）与“选票”（ballots）的对垒更形鲜明。配合总统选举最后阶段，中华人民共和国再次于台湾海峡举行一连串称为“海峡九六一”的军事演习以恐吓中华民国。美国为防范有事，自日本和关岛两地派遣两艘航空母舰巡防台湾海峡。选举就在这样一触即发，称为“第三次台湾海峡危机”的局势下完成。——引自《蒋经国与李登辉》
在当选中华民国首位民选总统后，面对1997年香港主权移交中华人民共和国，加上中华人民共和国的持续军事外交打压威胁，同年底中华民国失去最后一个重要邦交国南非后，李登辉关于两岸关系的言论逐渐表现出台湾独立的倾向。
1999年7月，他在接受德国之声录影专访的时候，明确提到海峡两岸的关系，是“特殊的国与国关系”，这也就是著名的“两国论”。他在受访时这样表示：
有别于国统纲领以及以三民主义统一中国等一厢情愿式的国民党政策宣示，实际上的历史的事实是，1949年中华人民共和国共产党政权成立以后，从未统治过中华民国所辖的台、澎、金、马。我国并在1991年的修宪，增修条文第十条（现在为第十一条）将宪法的地域效力限缩在台湾，并承认中华人民共和国在大陆统治权的合法性；增修条文第一、四条明定立法院与国民大会民意机关成员仅从台湾人民中选出……使所建构出来的国家机关只代表台湾人民，国家权力统治的正当性也只来自中华民国人民的授权，与中华人民共和国人民完全无关。1991年修宪以来，已将两岸关系定位在国家与国家，至少是特殊的国与国的关系，而非一合法政府，一叛乱团体，或一中央政府，一地方政府的“一个中国”的内部关系。所以，战争既已结束，则中华人民共和国政府将中华民国视为“叛离的一省”，有昧于历史与法律上的事实。
1999年，李登辉在卸任总统前一年出版《台湾的主张》一书，之后再发行日文和英文版。该书讨论台美日关系颇多，对台湾海峡两岸关系有两大述说：一、定义台湾为中华民国在台湾；二、分割中国为七部分（台湾、西藏、新疆、蒙古、华南、华北、东北），各自竞争发展以维持安定。后者即引起轩然大波的“中国七块论”。
李登辉曾表示：“台湾是一个主权独立的国家，他的国号叫做中华民国”或“中华民国是一个主权国家，他的领土范围在台澎金马”。他在2000年选择不竞选连任并卸任后与日本学者中嶋岭雄合著的《亚洲的智略》一书即表示“中华民国在台湾大致上可分为两个时期，蒋介石、蒋经国统治是第一时期，因为，宪法都是在中国内战时订下的。现在，台湾的宪法不但经过大幅度修改，过去的立法院也已全面改选，老立委退职、国民大会虚级化、台湾省已经‘冻省’了、总统由人民直选，台湾经历了这些重大变革，宪法与政府结构也已经重组，这就是第二共和。”

政党轮替

2000年3月18日，在野党民主进步党籍的陈水扁以相对多数（39.3%）依总统副总统选举罢免法规定当选中华民国第十任总统。由于陈水扁的当选，李登辉实现“在任内和平转移政权”的理想。国民党成为在野党，结束台湾长达五十五年的统治。
李登辉排挤民意支持高企的宋楚瑜，强行推连战为总统候选人，导致宋楚瑜不满，宣布以无党籍身份参选总统。李登辉自述，中央党部在选前提报的民调结果都显示连战会赢，只是多少的问题。在选前一天，李登辉还告诉美国前驻华大使李洁明，“国民党的连战会赢六个百分点”。而有的估票系统提醒说那些乐观的选情有假，李登辉还一度怀疑其忠诚。直到开票当晚，李登辉取消了前往国民党中央党部的行程，因为“口袋里只准备了胜选谢词，没有落选感言”。
由于宋楚瑜分流大量选票，国民党大选失利后，大批国民党支持者抗议选举结果。党内长期不满李登辉的人士要求其辞去党主席一职。他们一度包围位于博爱特区的国民党中央党部。在宋楚瑜宣布将在党外组党之后，李登辉即辞去国民党主席一职，交予连战代理。
2000年5月20日，正式离开总统府，与陈水扁进行权力交接，结束12年的统治。
卸任后，李登辉已完全离开国民党的权力核心。2001年9月21日，由于为新成立的台湾团结联盟候选人站台，正式被国民党撤销党籍。

宣扬信念

1999年2月接受伦敦金融时报亚洲版专访时，李登辉透露，卸任退休后，会积极从事帮助弱势团体的工作，并且到山区传教，将心力投注于建立一个公平正义的社会。。在卸任后李登辉于为实现其在山区传道的理想于神学院就读考取牧师，也成为台联的“精神领袖”。
2006年11月4日，台湾团结联盟提名台北市长参选人周玉蔻发表一封公开信《挺腐化的民进党，台湾万劫不复》，表明“李登辉不会和彻底腐化无能的民进党站在一起”，也呼吁台北市民不能再继续支持民进党提名的候选人。李登辉在这封信末尾亲自签名，日期是在国务机要费案和首长特别费案的起诉书双双出炉之前。
2007年1月29日，李登辉接受《壹周刊》专访时表示，他不是“台独教父”，也从来没有主张过台独；台湾并不存在统独的议题，只有左右的问题。而台独本身是假议题，因为台湾已经是主权独立的国家，只是现在的名字叫做中华民国。目前国家正常化才是接下来的目标，而正名、制宪、建立国家认同、加入联合国则是国家正常化的要素；李登辉也主张在“维护国家尊严、照顾全民利益、彰显台湾主体性”的三大前提原则下开放中资，开放中国大陆观光客来台湾，赚中国大陆的钱避免磁吸效应。让中国大陆观光客进来，但40%的投资上限必须坚持。
2007年1月31日，李登辉接受TVBS专访时，他说，他不必追求台独，因为台湾事实上已经是一主权独立的国家。他进一步说明，追求台独是退步，而且是危险的作法；因为这种作法不但把台湾降格为未独立的国家，伤害台湾的主体性，也会引起美国、中共方面很多困扰。他强调，现在有些人喊台独，只是为了权力斗争。他也批评，“现在（民进党政府）的黑金比较厉害。”李登辉‘从未主张台独’言论经多方解读为路线改变；然而细读其脉络，李登辉是确定台湾已经是独立的国家，故不存在是否独立之议题，政党恶斗由统独而起，也因此造成国家的割裂。台独与否乃政客操弄的假议题，国家正常化才是要努力的目标，在台湾主权已经独立的现状基础下，正名、制宪、加强国家认同。这样的说法加上台联政纲向左派靠拢，被解读为与立委选举单一选区两票制下小党争取更多选票的务实作法。
2007年5月30日，李登辉赴日本展开“学术交流及探访‘奥之细道’之旅”，并参访靖国神社祭拜其亡故长兄李登钦（李登钦二次大战时为台籍日本兵，战殁于南洋）。他曾提出：谢长廷或马英九选上台湾总统都无法解决台湾目前的困境。9日，李登辉结束访日行程，在成田机场准备搭机返回台湾时，遭到中国籍男子薛义以装有果汁的塑胶瓶攻击，李登辉没有受伤，李曾文惠则擦伤膝盖，受到惊吓，差一点身子站不稳。该男子旋即遭到日本警察逮捕。
2013年5月31日，李登辉在台湾大学以“全球化虚拟现时下的台湾”为题发表演说。他认为政府存在着五大问题：对中国过度依赖；对中国过度投资；自由化意识造成政府政策失焦；过度依赖进口能源、农粮；金融应刺激经济。政府责任在确保安全，不要忽略经济结构安全问题。
2013年9月28日，李登辉受邀到台湾大学EMBA会计暨管理决策学会演讲，对特侦组监听立法院总机节费器，李登辉觉得特侦组的行为已经违法，跟水门事件毫无二异。
2014年，李登辉在日本以日文出版名为《余生：我的生命之旅与台湾民主之路》的书，称中华民国是辛亥革命的结果，现在残存台湾，台湾是中华民国领土，只要保全中华民国主权地位，修改宪法内容，让中华民国成为新共和国，就没有台独的必要。把中华民国“台湾化”就好。中华人民共和国1949年从中华民国分裂出来，是分离出来的新国家，台湾已发展出了“台湾中华民国”意识，不是以往的中华民国，也就是“第二共和”。两岸是“两个国家”的想法才是正确的，我们应该更进一步，正式承认中华人民共和国。台湾尚未对国内外明白宣告“台湾是一个国家”，未来应明确主张“台湾是主权国家！”。
2015年，李登辉在日本杂志上表示：
本来直至七十年前为止，日本和台湾原本就曾经“同为一国”。因为曾“同为一国”，故不存在有台湾与日本打仗（抗日）这样的事实。我志愿进入陆军，而我的兄长李登钦则志愿进入了海军。当时我们兄弟俩无疑地是以作为一个“日本人”，为了祖国而战的…到底对台湾而言，维持现状究竟是什么意思呢？就是指维持台湾（中华民国）是台湾，中国是中华人民共和国的意思。换言之，对台湾而言的“现状维持”即是表示著台湾与中国是个别的“存在”。那是因为高唱“独立”而在国际社会引起摩擦是不必要的。我自己本身也从未主张过“台湾独立”。
同年9月15日出的新书上表示：“台湾当日本的奴隶很悲哀”。

养牛事业

李登辉卸任后投身养牛事业，在2017年开设源兴居生技公司培育台湾和牛，以自己在三芝的故居“源兴居”命名为“源兴牛”，预计在2019年量产。

支持谢长廷

2008年3月20日，李登辉在总统选举投票前夕，表态支持民进党总统候选人谢长廷。李登辉说：“他推动民主化就是希望台湾人民当家作主，他关心并非蓝、绿的问题，而是台湾要如何走出去，以及深化台湾民主。他的一票将投给谢长廷，至于选举结果如何，他尊重台湾人民的选择。”

支持蔡英文

2012年1月13日，中华民国总统选举前一天晚上，于在野民进党在新北市板桥区的造势晚会上，李登辉表示：“我年事已高，身体也不太好，什么时候会离开我心爱的台湾，不知道。能做的实在是有限，未来就要靠你们大家打拼了啊。选蔡英文，选我们的希望，选我们的幸福；相信我们自己，相信蔡英文；给自己一个机会，给台湾一个机会。我李登辉这辈子，最后一次向大家拜托。”
在2016年中华民国总统选举，李登辉因身体不适，没有参加投票，但有表达对蔡英文的支持。

支持柯文哲

2018年2月28日，李登辉出席“喜乐岛联盟筹组记者会”，会后接受媒体报导，被询问到2018年中华民国县市长选举是否支持柯文哲连任，李登辉表示：“民进党没人可以出来选嘛！柯文哲不错，他确实有他的问题，例如，提到两岸一家亲这是不对的，但他的运动会（指2017台北世大运），这办得很好，应该要给他肯定。”

对钓鱼岛列屿之观点

李登辉于总统任内的1996年曾表示钓鱼岛属于中华民国台湾省，但在卸任后经常公开表达钓鱼岛一直是日本的领土。
李登辉2002年9月16日在台北接受日本《冲绳时报》专访时说，有关钓鱼岛领土问题，“中共主张是他们的领土，这是因为当地有石油蕴藏量问题，但中共在那些岛上没有驻军，钓鱼岛显然是日本领土。”他更公开批评“保钓”人士。对香港保钓人士登岛不以为然，认为煽动台湾渔民“保钓”。
2008年9月24日，在冲绳县知事仲井真弘多主办的午宴上，李登辉重申“尖阁列岛无可争议是日本领土，不存在主权问题”。
2011年1月，在接受《文艺春秋》专访时，重申了以上立场。对此，中华民国驻日本代表处发表声明指出：“此项发言纯属李的个人看法，我国政府就钓鱼岛列屿属于中华民国领土之一的立场从未改变。”中华民国外交部部长欧鸿炼也表示，中华民国的主张没有改变，不会对个人言论发表评论。
李登辉说，在很早以前，钓鱼岛一带有很好的渔场，琉球人捕鱼之后，会在台湾北部的基隆上岸，以台北做为市场卖鱼货。当时的琉球县政府就将钓鱼岛委托台北州（现在的台北）管理，二次大战结束之后，日本战败，琉球的行政权由美国掌管，之后才交还给日本，由日本的自卫队负责这个海域；但台湾的渔民习惯到当地捕鱼，因此衍生出问题。
台湾跟钓鱼岛就是渔场问题，可以跟日本讨论鱼权，让台湾渔民也可以去抓鱼。李登辉强调，台湾的民众与渔民，关切的是能否前往钓鱼岛附近的渔场捕鱼。现在重要的是渔场，钓鱼岛附近的渔场里，有台湾很多家庭都需要吃的魩仔鱼，日本应开放给我们才对，渔业问题应透过WTO及民间机制洽商渔业协定解决。
2015年7月23日于日本外国记者协会举行的记者会上表示，钓鱼岛是日本领土，不属于台湾，引起台湾内部极大反弹。。
2014年在日本出版的“李登辉送给日本的话”中说，“钓鱼台列屿不归属台湾，这是毋庸置疑的事实”。在台湾最先提出这个问题的是马英九。2000年民进党当政，行政院长游锡堃把钓鱼台列屿列入宜兰县头城镇，“再也没有比这更愚蠢的事了，不只是中国，连台湾的政府要员都在欺骗人民”。该书2016年在台湾出版，引发总统府发言人马玮国、前行政院长游锡堃反驳，马玮国表示这是丧权辱国的言行，中华民国政府与国民都不能接受。游锡堃说他1981到1984年之间担任台湾省议员时首次听台湾省政府主席李登辉说钓鱼台列屿归属台湾。
2016年2月17日蔡英文接受记者访问时回答“这件事情民进党的立场一向很清楚，也就是钓鱼岛是属于台湾的”。民进党的立场一向很清楚，就是“钓鱼岛是属于台湾的”（而非中国）。反对李登辉对于钓鱼岛的看法。

对慰安妇和南京大屠杀的看法

2014年1月，李登辉在小学馆发行的日本右翼杂志《SAPIO》上撰文称，“中国这个国家将南京大屠杀之类的胡说传播到世界”，“韩国和中国将捏造的‘历史’作为本国宣传活动的一环。‘慰安妇’就是最好的例子”。2015年8月，李登辉在日本月刊杂志《Voice》上撰文称，“台湾慰安妇的问题已经了结了，这是很清楚的，现在才又炒冷饭实在毫无意义”，并且评论时任中华民国总统马英九建立慰安妇人权运动纪念馆等“一连串的行动，可以说是在找日本的碴”，被总统府发言人陈以信痛批“不是无知，就是冷血”，“如果李登辉真的以为慰安妇问题已获解决，就请他亲自去电影院，看看《芦苇之歌》这部电影”。

核四公投

2014年4月11日，李登辉曾在新竹表示“他不会去投核四公投”，并对蔡英文所提出的“2025年达到非核家园”表达不认同。
2014年4月23日，李登辉以“启动第二次民主改革”为题于台南演讲，内容为他担任总统的作为与感想，其中提及核四争议。次日《联合报》报导，称李登辉提出“但究竟有多少人同意林义雄的意见？若没核电，台湾要怎么办？这些问题不能不考虑。”等质疑。 同日李登辉在其脸书回应，表示人民主要是担忧核四的安全问题。领导者应该倾听民意，到底人民的意见是什么，是不是人民都与林义雄先生有相同的担忧与主张，由全民直接作决定。如果民意最后决定要停建“核四”，政府就应该进一步思考，“没有核电，要用什么方法才有电？”、“没有核电，我们的生活要靠什么？”并且积极发展因应方案。对于核能议题，他则认为以“铀”为原料的核能发电是高污染、高风险的，并加以反对，主张应该思考研究低污染的“钍”为原料的方向。

两岸关系

2014年8月1日，李登辉在接受英国广播公司（BBC）专访时表示，现在的两岸关系已经是“大鱼吃小鱼”的关系。同时，他还认为“马习会”（马英九和习近平以两岸领导人身份进行双边会谈）没有必要。

兴趣

李登辉最想去的三个地方分别是日本松尾芭蕉的俳句创作纪行“奥之细道”、孔子周游列国的路线和摩西“出埃及记”离开埃及到西奈半岛的路程。目前只有奥之细道成行。李登辉爱打高尔夫球 ，曾经在会见台湾高尔夫球名将曾雅妮时，邀约共同切磋球技。

健康状况

2011年李登辉确诊罹患大肠癌二期，结肠有一个3.5公分的腺癌，11月2日住院手术切除约25公分的结肠。台北荣民总医院表示，李登辉手术后恢复得还不错，预计最快一周可以出院，但随后出现肺部术后积水、持续发烧，可能会延至11月中旬才出院。
2013年7月12日上午11时开始，进行椎动脉支架置放手术，12时30分完成，历时1小时30分。创世界最高龄纪录，全身血管支架已达12支。
2016年9月24日晚间，参加“李登辉基金会”年度募款餐会后，因身体不适送往台北荣总检查，所知没有大碍。
2018年11月29日上午11时30分，李登辉不慎在卧室跌倒，头部撞伤出血，经紧急包扎后送医治疗无大碍。前总统李登辉基金会秘书长王燕军表示，李总统目前跌倒的地方是导致右侧眉骨上方遭碰撞，鼻腔内侧出血，需要留院观察三天。2018年11月29日傍晚6时后，李登辉以电脑断层扫描及血管出血性问题，并相关检查。30日下午4时许，现时李登辉脑部微小出血（中风），外科要加强密切观察。2019年2月3日，蔡英文办公室透露，当日蔡英文前往李登辉住所拜年，李登辉已经出院。

诉讼

2011年6月30日，最高法院检察署特别侦查组认定李登辉为协助台湾综合研究院尽速筹得创院资金，于1998年与前国安局长殷宗文、台综院创办人刘泰英谋议，涉嫌侵占国安密帐“巩案”归垫的剩余公款779万7193美元，挪供刘泰英支付台综院购置院舍价金、装置、人事等费用，涉有侵占公有财物及洗钱等嫌而予起诉，但念及年迈及对国家贡献，并未具体求刑。全案由台北地方法院金融专庭承审。
2013年11月15日，台北地方法院一审宣判，李登辉无罪。刘泰英依侵占公有财物罪被判刑2年8月，并褫夺公权3年。12月2日，特侦组提起上诉。2014年8月20日，台湾高等法院二审宣判，李登辉无罪定谳。刘泰英依侵占公有财物罪罪被判刑3年，并褫夺公权3年。2015年11月4日，最高法院三审宣判，刘泰英依侵占公有财物罪罪被判刑3年，并褫夺公权3年定谳。

各界评论

美国时代杂志称李登辉为“民主先生”。。
中国国民党主席洪秀柱则批李登辉说钓鱼台是日本的言论为“丧权辱国”。
2015年7月，李登辉访问日本后，国民党政策会执行长赖士葆提出，台湾民众每年提供李登辉近1000万元新台币的礼遇金，李登辉却到日本发表“钓鱼岛是日本的”的言论。国民党立法院党团将尽一切努力，推动修订相关法规，让李登辉不能享受任何礼遇。
前大法官杨仁寿公开称前总统李登辉的终身俸没有被改掉，李登辉非常不满，2017年3月16日李登辉办公室发出公开信，强调李登辉卸任时已放弃数十年公职年资累积的18％优惠存款，礼遇系依《卸任总统副总统礼遇条例》办理，相关规定皆是公开资讯，并无领取终身俸。杨仁寿于隔日上午公开道歉。