2008–09年欧洲冠军联赛

波尔图

在2008年6月4日，2007 / 08 赛季葡超冠军波尔图被葡萄牙足球总会裁定不承认他们这季的成绩，事缘因他们在2003 / 04 赛季中向球证行贿，以作为惩罚。正因如此，甘马雷斯便能借此由原本需要参加本赛事之第三圈外围赛，晋升到直接进入分组赛阶段；而本菲卡亦能由原本只能参加欧洲联盟杯变成于欧洲冠军联赛角逐。
但其后波尔图提出上诉，欧洲足球协会（UEFA）介入事件当中，欧洲足联人员于会议中将事件重新评定，最后得到的结果刚好与之前判决相反，他们批准了波尔图能够参与本届欧联赛事。

索菲亚中央陆军

2007 / 08 赛季保加利亚超联冠军索菲亚中央陆军由于债务上出现了问题，欧洲足球协会（UEFA）基于安全问题而取消了索菲亚中央陆军的参资格。同时会由联赛第2 名的索菲亚利夫斯基取代中央陆军的位置，出战本赛事的第三圈外围赛。