中央人民政府駐香港特別行政區聯絡辦公室

新华社香港分社时期

香港中联办的前身是新华通讯社香港分社，成立于1947年5月，是中华人民共和国政府派驻香港的机构，同时担负国家通讯社驻港分支机构的新闻职能，首任社长为中共香港工委书记乔冠华。在香港回归之前，该社以中国政府驻香港最高代表机构的身份，与殖民地香港政府进行联系。
1960年代后期，随着香港形势的变化，以及与中国内地关系的发展，香港政府遂委派政治顾问负责与新华通讯社香港分社保持联系。1978年9月30日，新华通讯社香港分社举行中华人民共和国国庆招待会，第25任香港总督麦理浩首次参加。自此成为惯例，其后历任总督每年都出席新华通讯社香港分社举行的国庆招待会，一直延续到香港回归之前。
1997年香港回归后，新华通讯社香港分社对原有职能作了适当调整，继续作为中央人民政府（国务院）授权的工作机构履行职责。香港特别行政区政府于1999年7月2日香港政府在宪报上公布，新华通讯社香港分社是中央人民政府在香港特区设立的机构之一。

香港中联办时期

1999年12月28日，根据朱镕基总理主持的第24次国务院常务会议的决定，国务院发布《国务院关于更改新华通讯社香港分社、澳门分社名称问题的通知》，新华通讯社香港分社自2000年1月18日起正式更名为中央人民政府驻香港特别行政区联络办公室，简称中联办，内地称中央政府驻港联络办，并通知香港特区政府。至于原新华通讯社香港分社内的新闻业务，将由新华通讯社提请香港特别行政区政府注册的新华通讯社香港分社承担。原新华社香港分社正、副社长亦改称为中联办正、副主任。
2000年1月18日，在跑马地皇后大道东办公楼正门外悬挂了21年的新华社香港分社铜牌，正式被新的中央人民政府驻香港联络办公室的铜牌所代替，另外原新华通讯社香港分社港岛办事处、九龙办事处和新界办事处也相应更名为中央人民政府驻香港特别行政区联络办公室港岛工作部、九龙工作部和新界工作部，并于同日分别举行了挂牌揭幕仪式。
据资料显示，新华社香港分社早期设立的办事处位于尖沙咀加拿分道26号，随后迁至湾仔霎西街5号。其后1970年代初，分社购入跑马地皇后大道东一座接近完工的酒店改建作为其新办事处。2001年起，中联办由湾仔皇后大道东旧址迁至西环干诺道西西港中心。而跑马地的旧址已被远东发展改建成酒店（香港湾仔帝盛酒店）。

机构设置

根据《中央人民政府驻香港特别行政区联络办公室职能配置、内设机构和人员编制规定》，香港中联办设置下列机构：

标志

中联办的标志以红、黄2种颜色的飘带跟中联办大楼的外型结合形造出一个“中”字，以表示中联办；大楼上的5条竖线象征着中央政府赋予中联办的5项职能；双色飘带一方面表示中华人民共和国在香港实行“一国两制”，另一方面包含融合、交流等意义，既有区别又密不可分；大楼的底座之拱形桥梁象征着中联办本身所担当的沟通桥梁角色；外部的圆圈则表现出庄严和团结的意味。“LOCPG”字样则为中联办的英文名称“Liaison Office of the Central People's Government”之缩写。

介入香港政治

2008年，中联办研究部主任曹二宝于中共中央党校《学习时报》第422期发表〈“一国两制”条件下香港的管治力量〉，建议香港设置直属中央的“第二支重要管治力量”，令部分香港市民对中联办介入香港内部事务感到忧虑。
BBC中文网刊登的《香港观察》文中认为，中联办2000年成立后，开始逐渐代表中央高度介入香港的内部事务，并高度影响及介入香港的选举，包括香港区议会、立法会及行政长官的选举。
2017年1月17日，资讯科技界立法会议员莫乃光透露，中联办近日透过中间人接触数名民主派选委，呼吁他们提名林郑月娥，并将林郑说成是“真命天子”。莫乃光说，不评估中联办背后动机，亦不能透露何时接获有关讯息。
被中联办扶植的香港非传统亲北京阵营人士则被部分人士称为“西环契仔契女”。

插手香港书市

据香港电台报道，香港三大出版机构——三联书店、中华书局和商务印书馆（“三中商”）及其所属或控股的众多书店与出版社都属中资或“爱国商人”控制，而三中商的母公司是实际由中联办透过联合出版集团全资拥有，现时大部分的大学书店都由三中商营运，而香港众多教科书出版商背后的老板都是中联办。此外，中联办经营香港超过半数书店，一般书籍大约有七至八成在三中商书店售出，近年来，一些中国内地的敏感禁书如批评政府的书籍已不在三中商发售，部分也不容易在三中商找到。香港电台电视部制作的每周新闻纪录片电视节目《铿锵集》记者在专辑中多番追问中联办各级官员，官员回应不是含糊其辞就是逃避问题和不肯回答。

在香港逃犯条例修订中的立场及相关事件

2019年反对逃犯条例修订草案运动期间发表言论支持警察和支持修例，副主任陈冬指香港应为“购物天堂”而非“逃犯天堂”，支持港府尽快修例。

中联办大楼遭破坏事件

2019年7月21日香港反对逃犯条例修订草案游行中，一批示威者前往西营盘干诺道西中联办大楼外，向中联办招牌及中华人民共和国国徽投掷鸡蛋及墨水弹、用喷漆涂污闭路电视镜头，以及在中联办门外和墙上涂鸦并喷上“屌支那”、“支联办”、“fk支那”，被指是回归22年来中联办遭受的最严重破坏。建制派强烈谴责，批评是挑战中央及特区政府的底线，严重侮辱国家尊严。泛民主派则指事件反映中央在港政策完全失败，中联办需要负上很大责任。香港特区政府强烈谴责示威者，批评公然挑战国家主权。香港中联办及国务院港澳事务办公室亦表示最强烈愤慨和谴责，指示威者行径已超越和平示威范畴。在遭到破坏之后，中联办已派人连夜更换国徽、清洗外墙及地面。

元朗袭击事件相关争议

在2019年7月21日香港反对逃犯条例修订草案游行当晚及翌日凌晨，香港新界元朗区发生袭击事件。一批穿着白衫、手系红绳之疑似黑社会成员在鸡地及港铁元朗站持械无差别袭击途人，多人血流披面，事件中一共至少45人受伤。
7月11日，中联办新界工作部部长李蓟贻在十八乡乡事委员会就职典礼上，促请“爱国爱港的村民不要让暴徒进入元朗搞事”，“进来就一定要赶他们走”。袭击事件过后，李蓟贻的有关言论被外界质疑是中联办煽动或“动员”元朗的暴力事件，7月23日，李蓟贻在出席一场公开活动中被记者追问时一直微笑不语，对是否涉及煽动元朗暴力事件的问题一概闭嘴不答。