肯塔基州邦联政府

肯塔基州邦联政府是美国南北战争期间肯塔基州部分支持南方邦联的居民自发组建的影子政府。这个影子政府自始至终都没有取代州首府法兰克福的民选政府，后者强烈支持北方联邦。邦联政府只争取到肯塔基州部分居民支持，其管辖范围仅限于南方联军在州内占领的区域。不过，这个临时政府得到美利坚联盟国承认，肯塔基州也在1861年12月10日加入南方邦联，邦联战旗以中央交叉位置的一颗五角星来表示来表示该州。
鲍灵格林成为肯塔基邦联州的首府。由于受到军事局势的影响，临时政府存在的大部分时间里都跟随着田纳西军四处流亡而运作。1862年夏，美利坚联盟国陆军短暂占领法兰克福，这也是南军唯一一次攻占北方联邦州首府。这一期间，布拉克斯顿·布拉格将军希望能让临时政府成为该州的永久政权，但在就职典礼期间，唐·卡洛斯·比尔将军带领北军赶到，临时政府被迫撤离肯塔基州，之后再也没能回归。从那以后，这个影子政府已名存实亡，只能在文件中找到踪影，战争结束时便已不复存在。
临时政府一共选出两任州长。第一位是在拉塞尔维尔举行的会议上推举出的乔治·W·约翰逊，任期持续到他在希洛战役中丧生。理查德·霍伊斯获选继任州长职务，任期持续到战争结束。

运作

1861年11月26日，约翰逊向肯塔基州公民发表演说，指责废奴主义者导致美国四分五裂。他坚称联邦和邦联势均力敌，战争唯一的出路只能是在两个主权国家间制订自由贸易协定。他还进一步宣称，只要肯塔基州议会愿意与州长麦高芬合作，自己也愿意辞去临时州长一职。麦高芬则谴责拉塞尔维尔的会议和新组建的临时政府，因为这违背了肯塔基州大部分公民的意愿。
1861年冬，约翰逊试图确立这个羽翼未丰政府的合法性，但临时政府的管辖范围一直都没有超出南军控制的地区范围。邦联国会要求约翰逊征召4.6万的部队，但他无法办到。临时政府在征税和强迫公民上缴武器方面也收效甚微。1862年1月3日，约翰逊向邦联国会请求拨款300万美元（相当于2019年的7200万美元）作为临时政府的运作开销。邦联国会最终只批准了200万美元，这些开销还需要战争部长犹大·菲利普·本杰明（Judah Philip Benjamin）和总统戴维斯的审批。临时政府的大部分运作开销可能是由肯塔基州联邦众议员伊莱·梅特卡夫·布鲁斯（Eli Metcalfe Bruce）捐献，他在内战期间通过各种渠道发了大财。
1861年12月14日，临时政府立法会召开会议，为邦联一院临时议会选派议员。1862年2月17日，临时议会由永久性的两院制议会取代，所以之前当选的议员任期只有两个月。肯塔基州可以向邦联国会派出两名参议员和12名众议员。由于往年沿用的选举日已过，约翰逊和立法会将肯塔基邦联的选举日定在1月22日。 选举日当天，选民可以在任何一个县投票，并且投票针对的职务也不受限制。经过一场军人选票远超平民的选举，一共只有4名临时议员当选邦联众议员；亨利·伯内特则成为唯一一位肯塔基州邦联参议员。
临时政府还在1861年冬通过法案，将韦恩县更名佐利科夫县，来纪念在密尔斯普林斯之役中战死的费利克斯·佐利科夫（Felix Zollicoffer）准将。临时政府也在南军控制区域指派了许多地方官员，例如多名太平绅士就是在此期间任命。邦联政府解散后，这些太平绅士主持婚礼的合法性受到质疑，但最终还是得以维持。

撤出肯塔基州，约翰逊逝世

随着尤利西斯·辛普森·格兰特赢得亨利堡之战的胜利，约翰斯顿被迫于1862年2月7日从鲍灵格林撤回田纳西州。一星期后，州长约翰逊和临时政府也离开了肯塔基州。3月12日，《新奥尔良花絮报》（New Orleans Picayune）报道称：“肯塔基州首府如今位于一顶西布利帐篷内。”
时年50岁的约翰逊手臂有残疾，虽然他的正式官职较高，但却自愿在希洛战役中听从约翰·C·布雷肯里奇将军和罗伯特·P·特拉伯（Robert P. Trabue）上校指挥。4月7日，约翰逊的大腿和腹部受到重伤，并且在战场上一直躺到第二天才由熟识的北军将领亚历山大·麦克道尔·麦库克（Alexander McDowell McCook）发现（两人都是共济会成员）。约翰逊在北军医疗船“汉尼拔号”（Hannibal）上去世，肯塔基州临时政府变得群龙无首。

理查德·霍伊斯继任州长

约翰逊离开鲍灵格林前曾邀请理查德·霍伊斯到该市协助政府管理，但后者因感染伤寒而无法按时抵达。约翰逊去世后，临时政府选举仍在养病的霍伊斯担任州长。身体康复后，霍伊斯在密西西比州奥尔康县县城科林斯（Corinth）与临时政府会合，再在5月31日宣誓就职。
1862年夏，田纳西军中开始传言布拉格和埃德蒙·柯比·史密斯（Edmund Kirby Smith）两位将军计划入侵肯塔基州。立法会经投票表决支持入侵计划，霍伊斯于8月27日被派往里士满向总统戴维斯推荐该计划。戴维斯对此不置可否，但布拉格和史密斯仍然决定进军。
8月30日，史密斯在里士满之战中从容面对经验不足的北军，取得了内战期间南军最辉煌的其中一场胜利。布拉格还于9月13日在曼福德维尔之战中取得决定性胜利，但这场战事也延误了他的进军，导致州首府路易维尔于9月25日被唐·卡洛斯·比尔将军占领。失去路易维尔后，布拉格将手下兵力分散到肯塔基中部城市巴兹敦、谢尔比维尔和丹维尔进行防守，静待事态发展。在历史学家肯尼斯·W·诺埃（Kenneth W. Noe）看来，这一战略“惊人地不合逻辑”。
与此同时，肯塔基州邦联政府的领导人还留在查塔努加等待州长霍伊斯归来，一直到9月18日才动身离开，于10月2日同布拉格和史密斯在列克星敦会合。布拉格对肯塔基州志愿加入南军服役的士兵人数深感失望，许多为武装应征军人而运抵肯塔基州境内的武器仍然闲置。为了通过强制执行美利坚联盟国征兵法来提高征兵效率，布拉格决定把临时政府安插到刚刚攻下的州首府法兰克福。1862年10月4日，霍伊斯经邦联立法会授权就任州长。但就在就职典礼期间，南军因放松了防备而遭到唐·卡洛斯·比尔将军带领的北军伏击，被迫撤离肯塔基州。

衰落和解散

临时政府在佩里维尔战役后撤离肯塔基州，之后再也没能回归。离开故土的立法会议员散居各地，或自谋生路、或依靠亲属资助生活，等待霍伊斯召集他们进入议程。有少量记录显示，霍伊斯曾在1862年12月30日召集议员、审计和财务部长于1863年1月15日到田纳西州麦克明县的阿森斯（Athens）开会。霍伊斯曾试图说服戴维斯总统解除他昔日上级汉弗莱·马歇尔将军的职位，但没有成功。3月4日，霍伊斯在给戴维斯的信中称，“我们的事业正稳步成长”，并保证再度进军肯塔基州将会获得比上次更好的战果。
临时政府仍旧身处财政困境之中。霍伊斯曾不无难堪地承认，无论是他还是别的任何人似乎都不知道，肯塔基州在南军占领期间曾有约4.5万美元资金从哥伦布送到了孟菲斯。1864年，戴维斯决定不允许霍伊斯动用1861年8月用于帮助肯塔基州保持中立的100万美元秘密拨款，这对临时政府来说更是雪上加霜。戴维斯对此表示，肯塔基州已经加入邦联，所以不可能再保持中立。
内战后期，肯塔基州临时政府总体而言已名存实亡。1864年夏，田纳西第9骑兵队的R·A·阿尔斯通（R. A. Alston）上校请求州长霍伊斯协助调查约翰·亨特·摩根（John Hunt Morgan）将军擅自进军肯塔基州期间所涉嫌的犯罪行为。但由于摩根在8月10日遭到停职，之后又于9月4日被北军击毙，霍伊斯始终没有应阿尔斯通的请求采取行动。
肯塔基州邦联政府中止运作的确切时间缺乏文献记载，估计该政府是于内战结束之际解散。