蘇祿蘇丹國

西班牙及英国吞并

16世纪西班牙人入侵，他们把当地一带的人称为“摩洛人”，并把当地叫作“摩洛兰”，即是“摩洛人的地方”。后来由于西班牙传教士的活动，当地的穆斯林被加以杀害，而摩洛兰亦缩小至今日菲律宾南部的地方。
1761年，英国东印度公司的官员亚历山大·达尔林普尔（Alexander Dalrymple）与苏禄苏丹缔结协议，允许他在Pulau Balambangan岛设立贸易站，但这个计划于1805年11月失败，这个岛被他们舍弃。在1846年，文莱苏丹将沙巴西海岸纳闽岛割让给英国，在1848年成为英国皇家殖民地。经过一连串的转移，北婆罗洲的权利转手给阿尔弗雷德·登特（Alfred Dent），他在1881年成立了英国北婆罗洲临时协会有限公司（British North Borneo Provisional Association Ltd.）。在1882年，英国北婆罗洲公司成立，以古达为公司总部。在1883年总部迁往山打根。 1885年，英国西班牙和德国签订了1885年马德里议定书（Madrid Protocol of 1885），承认西班牙在苏禄群岛的主权，以交换西班牙放弃对北婆罗洲的主张。在1888年，北婆罗洲成为英国的保护国。
1898年，美国与西班牙爆发战争，西班牙战败。根据西、美双方在巴黎签订的停战条约，西班牙从南美洲和太平洋的岛屿退出。在菲律宾问题上，西班牙人虽未曾占领摩洛兰一带，但在停战条约上把该地划给美国。
美国人接手后，经过多次战争，仍未能占领该地。美国逐与南部的穆斯林进行政治谈判，先后与摩洛苏丹及马京达瑙的苏丹签订吉兰姆-白茨条约。按照条约规定，美国人不进入菲律宾的南方，区内事务由摩洛人自治管理。
1903年，美国宣布《菲律宾土地法》。土地法宣称，菲律宾南方未被美军占领的土地属于非法土地。土地法还规定，菲律宾北方的天主教徒迁移进入南部者，政府允许其占有土地16公顷，而南部原有穆斯林每户土地最多也不得超过8公顷。 1904年，美国政府取消与穆斯林达成的条约。1919年，菲律宾土地法进一步规定，北方天主教徒可以在南部获得免费的24公顷土地。

并入菲律宾

第二次世界大战后，美国1946年宣布废除海外殖民政策，菲律宾宣布独立。尽管当时南部摩洛穆斯林呼吁国际社会给予保护，反对强权者将他们出卖与吞并，但美国政府在与菲律宾马尼拉当局签订条约时，将摩洛兰一并划归菲律宾政府。
2005年2月，在首府和乐有4,000至5,000名菲军与约800名摩洛人分离主义组织阿布沙耶夫发生冲突，超过12,000人逃离家园。

北婆罗州问题

2013年2月11日，苏禄苏丹派遣王储拉杰穆达率领包括武装成员在内约180名追随者，从菲国南部潜入马来西亚沙巴索讨“祖地”，结果被大马保安部队包围在拿笃（Lahad Datu）。在菲律宾政府的交涉下，马来西亚3度延长驱逐期限，但苏禄苏丹王国王室坚持要马来西亚承认在19世纪由英国贸易公司与苏禄王朝所达成的协议才肯离去。
2013年3月1日，马来西亚警方在第四度延长期限后，双方爆发武力冲突，大马有2名警察突击队员在枪战中殉职，3人受伤；苏禄军则有12人死、4人受伤。
2013年3月4日，殉职的大马警员增至8人，苏禄军有16人死亡。
菲律宾苏禄苏丹贾马鲁尔·基拉姆三世2013年10月20日凌晨病逝，享年75岁。