整军方案

整军方案全称为关于军队整编及统编中共部队为国军之基本方案，是1946年2月25日中华民国国民政府代表张治中与中国共产党代表周恩来在美国总统特使马歇尔的调停下达成的整编中共军队为中华民国国军的协定。该协定是继政治协商会议之后，国共两党为贯彻政协军队国家化决议而达成的又一重大成果。该协定原定在两个星期内由中共和国府向三人军事小组提交各自军队表册作为整编过程第一步，但因国共矛盾日趋尖锐，中共未提交表册，协定迟迟未能执行，终因第二次国共内战全面爆发而流产。

后续活动

2月28日，三人军事小组依据政协决议巡视全国各地停战区域，确保停战令执行。三方在汉口表示，出巡目的在于澄清异见，当面解释整军目的。3月5日，三人返回重庆。下一阶段任务是达成东北停战协定，这是国共内战前双方关系的最佳时期。然而此时因马歇尔赴美述职，故3月11日离开重庆，直到4月23日才返回。此段时间里，国共关系急剧恶化，到4月底，双方已经开始濒临大战的边缘。
3月上旬，国民党六届二中全会提议修改宪草，这一举动立即遭到中共强烈抗议。按照整军协议，中共应在3月下旬之前提交中共军队的表册。3月26日，国民政府按照整军协定，向军事三人小组提交了政府军90个师的表册和前两个月部队复员次序表册；但中共拒绝提交表册，并坚持说，因为国民党未能履行一致同意的政协决议，因此直到达成履行政协决议通过的完全公开协议，他们才会提交参见国民政府委员会名单和所要求部队表册。
在这种情况下，军队整编方案的贯彻实施被无限期搁置下来。4月开始，东北开始爆发军事冲突，这时中原尚未开战。但6月第二次停战令结束之后，中原地区也开始了军事冲突。虽然全国军事冲突爆发，但是直到11月制宪国民大会时，军事冲突仍受到南京国共谈判代表的约束而未能放手大打。1947年3月，中共代表被迫撤离南京，国共军队彻底失去制约，大战终于爆发。1947年7月31日，中共正式宣布成立“中国人民解放军”，由此整军方案完全失效。
国民政府方面，依据整军协议之规定，政府军在陇海路以南的部队接受了整编，陇海路以北和运动中的部队未能整编。例如南京的七十四军整编为七十四师。中共方面，仅聂荣臻的华北晋察冀部队整编，其他部队不仅未能整编，还大举扩编，如林彪罗荣桓的东北民主联军。

整军对国民党内部的影响

整编军队也影响到国军中所谓“杂牌军”的作战士气。郭汝瑰回忆，“围绕着整军，蒋军内部发生过激烈的争论。奇怪的是，蒋、白、陈都坚决反共，而整军的态度各不相同。蒋介石坚决反共，国共两军在全国已广泛展开战斗，蒋军将领许多人都叫嚣停止整军，但蒋介石还是要整，陈诚希图迎合蒋介石意旨取宠，也大声疾呼整军，……白崇禧认为内战不可避免，反对整军。” 在整军过程中，“同样是国家的军官，出身经历战绩等等都差不多，而属于所谓‘土木工程系’的军队（指陈诚系统—作者注），不只不被裁编，反而扩充”，“这种不公不平的事实，……怎么不会使得国军的精神完全瓦解”。甚至因为整编而荒唐到了“军官多惧年限失业，以为平匪无异缩短一己职业（退伍有一条可以因需要不按年限者）”，因此作战不积极。而土木系主力整编第十一师师长杨伯涛回忆说，该师原为第十八军，整编后成为一个师，并仅辖六个团，并未扩充。