加日關係

早期接触

在互相建立永久性使馆之前，加拿大与日本就已有接触。第一个已知的日本往加拿大的移民是永野万藏（永野万蔵），在1877年英属哥伦比亚的新西敏登陆。
明治时期一些在日本的加拿大使团对日本当地基督教的发展与教育系统的现代化发挥了显著的作用。这些人当中的重要人物包括牧师亚历山大·克罗夫特·肖，他是庆应义塾大学的福泽谕吉的亲信、协助创办同志社大学的G·G·科克伦（G.G. Cochran）以及协助创办青山学院大学的戴维森·麦唐纳。
在1887年，从横滨与温哥华之前的轮船航线正式启航，加拿大太平洋铁路的海洋船只开始在该航线上进行定期航行。在这些加拿大船只之中，RMS澳大利亚皇后号以及其船长塞缪尔·鲁滨逊在1923年关东大地震的救援工作中获得了全球性的声誉。
于1904－1905年，加拿大皇家野战炮兵的赫伯特·西里尔·萨克尔在日俄战争的现场上担任旧日本陆军的随行驻外武官。他后来也因在日俄战争上的服役而被日本政府授予瑞宝章，并依据战场上的军功，也获得了明治三十七以及三十八年的从军勋章。
日本也是大英帝国在第一次世界大战间的盟友。

外交公馆开设后

加拿大公使馆于1929年在东京开设，是加拿大除英联邦之外的第三个公馆，次于华盛顿特区与巴黎。此一事实凸显了日本作为枢纽对加拿大拓展亚洲的外交活动有特殊的重要性。然而，开设此公馆的理由也与20世纪前半加拿大的英属哥伦比亚省的反亚情绪有关。加拿大总理威廉·莱昂·麦肯齐·金急于限制日本往加拿大的移民，并说“我们对付日本问题唯一有效的方法便是在日本当地有我们的公使负责签发签证”。作为当时的情景值得一提的是，日本驻温哥华的领事馆在1889年开设，40年之后的1929年日本才在渥太华开设大使馆。
日本在加拿大第一个公使是亲王德川家正，从1929年到1934年。加拿大在日本第一个公使是赫伯特·迪斯·马勒，从1929年到1936年。

第二次世界大战

两国的外交关系在1941年太平洋战争开始之后便中断。在战争期间，加拿大在通过战时措施法后开始为了“国家安全”的目的而囚禁日裔加拿大人。日裔加拿大人被剥夺了众多权利，包括工作与私有财产的权利。
两国间的直接战役发生在太平洋战争中，日本和加拿大军队在珍珠港事件的8小时后在香港保卫战中正式交战。该战役最终导致香港被日本占领。

战后

广岛与长崎原子弹爆炸之后，1946年加拿大代表在日本向盟军无条件投降后返回东京。1951年日本也在渥太华开设外交事务处，准备未来恢复外交关系。日加关系的正式全面恢复是在旧金山和约签订后的1952年。
加拿大驻日公使馆升级为大使馆，罗伯特·梅休也出任第二次世界大战后第一任加拿大驻日大使。日本也在渥太华开设大使馆，井口贞夫成为第一任日本驻加拿大大使。
加拿大以各种方式协助日本返回国际社会。由于加拿大的倡议，日本获接纳为科伦坡计划的会员国，并参与1954年在渥太华召开的会议，同年间两国也签署了关于商业的双边协议。加拿大支持日本加入关税及贸易总协定（GATT），当日本加入GATT时，加拿大是少数给予其最惠国地位的国家之一。
日本以加拿大作为后盾，在1956年提名加入联合国，并于同年成功加入。同样地在1963年，加拿大也强烈支持日本加入经济合作与发展组织（OPEC），日本并于次年成功加入OPEC。

关系的成熟

象征着日加关系的正式恢复，其中最值得关注的事件是当时皇太子明仁亲王在1953年拜访加拿大。次年，加拿大总理路易·圣洛朗和日本首相吉田茂互相进行国是访问。
自从1950年代起，日本与加拿大缔结了一系列关于渔业、贸易、航空、邮政、原子能与文化的双边协定。日本首相与加拿大总理也互相进行了多次访问。在1960年代后，日本首相岸信介、池田勇人、田中角栄、大平正芳、铃木善幸、中曾根康弘、竹下登、海部俊树、村山富市、桥本龙太郎、小渊惠三、森喜朗、小泉纯一郎皆有拜访加拿大。而加拿大总理约翰·迪芬贝克、皮埃尔·特鲁多、查尔斯·约瑟夫·克拉克、马丁·布赖恩·马尔罗尼、金·坎贝尔、让·克雷蒂安、保罗·马丁皆有拜访日本。
在此期间，加拿大总理马尔罗尼在下议院对在第二次世界大战期间针对日裔加拿大人的不公平待遇而道歉。作为对日裔加拿大人囚禁的回应，1988年总理马尔罗尼和日裔加拿大人全国协会主席亚特·美纪（Art Miki）签署了补救协议以解决过去遗留的历史问题。
在2008年，总理哈珀在东京皇宫受接待，标志着加拿大和日本之间的正式外交关系80周年。在2009年7月，明仁天皇与皇后美智子对加拿大进行了国是访问。

贸易

在2011年加拿大对日本出口总值达107亿加币，而日本对加拿大出口总值达130亿加币。加拿大主要对日本出口矿物燃料与石油，而日本主要对加拿大出口汽车零件、核能及电气机械。

移民

日本在1800年代开始向加拿大移民，直至下个世纪的限制措施开始施行为止，越发盛行。温哥华日本城曾是日裔加拿大人的生活重心，然而近年以来，日本社群已不再根基于该地。