九戶政實之亂

九户势的叛乱

九户政实的弟弟九户实亲在南部家的后继者争夺战中，败给了南部（石川）信直，在信直以强势的姿态成为当主后，让九户一族非常不满，使信直与九户一族之间产生了相当大的裂痕。
1590年6月，在南部信直率兵1000去参加小田原讨伐时，留守中的九户一族攻击三户南部氏的南盛义。结果南盛义阵亡，整个南部家中处于紧张状态。于1591年3月13日时九户一族正式举兵，并且煽动八户氏、栉引氏、久慈氏、七户氏及一户氏等南部一族共同叛乱以扩大声势，政实也持续拉拢其他氏族加入己方，若不愿加入者就攻打其城池。
没料到事情会变得这么严重的南部信直便率军往一户町布阵，并在北氏、名久井氏、野田氏、净法寺氏等的协助下进行防守。然而随着政实的势力一天比一天更加茁壮，判断无法靠己力解决此事的信直便赶快派遣儿子南部利直及重臣北信爱向丰臣氏请求援军，于6月9日时丰臣秀吉接见他们以了解情势。

奥州再仕置军的进击

此时除了九户以外，由于对奥州仕置结果不满，同时还发生了葛西大崎一揆、和贺稗贯一揆及仙北一揆等大规模的一揆动乱，秀吉便于6月20日下令编成镇压用的奥州再仕置军。
于白河口配置丰臣秀次、德川家康共3万兵力，仙北口配置上杉景胜、大谷吉继，津轻方面配置前田利家、前田利长，相马口配置石田三成、佐竹义重、宇都宫国纲，而伊达政宗、最上义光、津轻为信、秋田实季、小野寺义道及户泽光盛在诸将的指挥下等待指示。率领前回奥州仕置军的蒲生氏乡，在平定一揆后北上与浅野长政合流，于8月下旬进入南部氏的领地，9月1日攻陷九户势的前线城池姊带城及根反城，9月2日包围九户城。

九户城之战

九户城西侧有马渊川、北侧有白鸟川、东侧有猫渕川，是个三方有河川围绕的天然要害。
奥州再仕置军于南侧（城池正面）由蒲生氏乡及堀尾吉晴布阵，东侧（猫渊川）由浅野长政及井伊直政布阵，北侧（白鸟川）由南部信直及松前庆广布阵，西侧（马渊川）由津轻为信、秋田实季、小野寺义道及由利十二头等布阵。其中松前庆广甚至带来爱奴人，以毒箭进行攻击。
在丰臣军不断使用铁炮、火箭、毒箭的猛烈攻击之下，九户军确实了解到了实力差距，浅野长政于9月4日找来凤朝山长兴寺的萨天和尚为使者谈判，以九户政实出家为条件，由弟弟九户实亲率同七户家国、栉引清长、久慈直治、圆子光种、大里亲基、大汤昌次、一户实富等人，身着白装束姿（出家姿）向再仕置军投降。之后在蒲生、堀尾、浅野、井伊的联署之下，公布给平民还住令。
而政实等主谋者被送到栗原郡三迫地区处刑，降伏时向丰臣军表示希望能立下饶过投降将兵们性命的约定，但后来浅野长政与丰臣军爽约，下令屠杀九户一族。近代在九户城（后来南部信直改名福冈城）的二之丸遗迹中挖掘到被斩首的女人尸骨。

结果

此乱之后，国内就没有再对丰臣政权的组织性反抗行为，秀吉的天下统一自此完成。在这事件后，南部氏跟蒲生氏的关系就变成很好，如蒲生氏乡就将女儿嫁给南部信直的儿子利直作为正室。而氏乡跟浅野长政也劝信直将本据地往南方移动，因为领土调整过后南部氏的领地与伊达氏的领地有相接，伊达政宗是个知名的野心家，为了防范未然，这就是后来盛冈城建造的原因。