三藩市城市鐵路

有轨电车

在1950年代，旧金山政府逐渐以巴士取代电车，而J、K、L、M、N这5条电车线由于通过隧道或行经电车专用路段（reserved right-of-way）而得以保留。这5条线原本在市场街地面行走，但与BART共用的市场街地铁隧道（Market Street Subway）启用后，5条线在1980－82年先后改经地铁管道。旧式电车不能使用地铁管道内较高的月台，所以MUNI改用轻轨电车行走J、K、L、M、N线。市场街地面的电车轨停用后，MUNI在1995年再次安排旧式电车行走，称为F线，是旧金山目前唯一仍以旧式电车（historic streetcar）行走的路线。
内河码头电车轨南段在1998年启用，由市场街地铁管道东端向南延伸至加州火车车站；而北段在2000年启用，由市场街地面电车轨东端向北延伸至渔人码头。上述两段电车轨相连，但目前没有电车直通运行，MUNI计划以E线直通运行。第三街轻轨在2007年启用，由加州火车车站向南延伸至Sunnydale站。

E线内河码头轻轨（E Embarcadero）

E线在1998年设立，来往湾区捷运内河码头站及加州铁道车站，同年被N线取代。MUNI计划重设E线，并向北延伸至渔人码头。

巴士与无轨电车

MUNI目前经营16条无轨电车路线及55条其他巴士路线。是北美最大的无轨电车系统。