東琉線交通船

民营

1951年（民国40年），飞马、众益、竞强、东信、观光五家轮船公司。鉴于琉球居民往返台湾本岛的不便，分别开始经营往返东港和小琉球的交通船，以服务琉球乡民。
2001年（民国90年），飞马、众益、竞强、东信、观光五家轮船公司共组东琉线交通船联营处，期盼能给居民及游客更便利舒适的海上交通。于2014年9月启用线上订票系统。
2014年7月，小琉球观光日益兴盛，为纾解假日东港渡轮码头的排队人潮，泰富国际轮船股份公司正式营运，同时启用网络订票系统。东琉线泰富轮船共有泰富1号、泰富2号、泰富3号等高速客轮3艘、泰富8号货轮，投入营运。
第二条民营航线于此开创，打破东琉民营航线长期市场垄断为人诟病的情况，期待在良性竞争的情况下，提高航线整体服务品质、造福乡里。
民营航线在琉球乡停泊较靠近东港的白沙观光港，现亦是主要游客进出之观光港。

公营

1993年（民国82年），当时台湾总统李登辉，体恤琉球乡民交通不便及交通费用负担重大，特筹办第一艘公营交通船欣泰号，于1997年在高雄联和造船公司竣工、同年2月1日正式开航投入营运，用以服务无法长期负担民营公司之船资的乡民。公营交通船为最大股东琉球乡公所委托该所所属公营事业的琉兴有限公司营运。
2003年，鉴于公营交通船欣泰号船龄渐旧，因此决定购置第二艘公营交通船，向宜兰苏澳造船商龙德造船工业订造新型铝合金喷射推进式客轮，定名吉祥如意号，竣工后由时任中华民国总统陈水扁主持开航典礼，于此同时，吉祥如意号正式加入琉兴船队营运。
并获得屏东县政府离岛建设基金570万补助，启用琉球乡亲持记名一卡通搭乘公营交通船、并比照现行之乡亲优惠票价（优待单程票60元）供琉球乡亲搭乘。
公营交通船停靠琉球乡南侧之大福渔港，离东港较远、多出数百米远，时间亦比民营船只稍久。