饶毅

批判中国科研体制

饶毅公开建言改革中国科技体制，2004年与鲁白、邹承鲁联名在《自然》增刊发表文章，建议中华人民共和国科技部只管政策，不管经费。2010年，饶毅与好友施一公（清华大学生命科学学院院长）在《科学》杂志上联合撰文，批判中国的科研经费分配体制和科研文化问题。他们指出，尽管中国研究经费近年来持续以20%的比例增长，但这种增长没有对中国科学研究应有的强大起到促进作用，现行的科研经费分配体制在某种程度上阻碍了中国创新能力的发展。他们认为，中国必须打破研究经费管理中的各种潜规则，建立健康的研究文化，一个简单但非常重要的起点是所有新的研究经费必须基于学术优劣分配，而不能依赖私人关系。

预测诺贝尔奖得主

2002年，饶毅评论了20项值得诺贝尔奖的工作，其中9项已经获奖。
2008年10月6日，饶毅在个人的科学网博客发表〈美妙的生物荧光分子与好奇的生物化学家〉一文，介绍下村脩、钱永健等人的成就。饶毅主张下村脩应该获得诺贝尔奖，但很可能遭到诺奖委员会忽略。两天后，文章介绍的下村脩、钱永健获得了诺贝尔化学奖。

落选2011年中科院院士引发争议

在2011年中国科学院院士评选中，施一公和饶毅两个学界明星双双落选，引发了舆论对中科院的质疑。2011年12月9日，在新增院士名单出炉后数小时，饶毅便发表了一篇标题为《解剖“逆淘汰”社会现象的一只麻雀》的4000余字博文，为施一公的落选鸣不平。饶毅认为，中科院在院士评选中，重视的不是学术水平、年龄、学术年资、在国内科学贡献大小，而是“在有些人面前低头排队时间的长短”。饶毅当时宣布不再参选院士。而后，施一公在2013年院士评选中当选中科院院士。