米麴菌

命名历史

19世纪在日本东京医学校（即今日的东京大学医学部）任教的德国教师赫尔曼·阿勒堡（Herman Ahlburg）于以米为原料的清酒麹中分离出该菌体，并将其命名为“Eurotium oryzae”，其中种名“oryzae”即是来自于稻属的学名“Oryza”。数年后，赫尔曼·阿勒堡感染上痢疾，而在1879年8月28日逝世。1884年，日本邀请的学者费迪南·朱里亚斯·孔恩将其从散囊菌属（Eurotium）移至麹菌属（Aspergillus），至今都是如此。
由于米曲霉和有害的黄曲霉的外观非常相似，所以米曲霉一度被西方的微生物学家将它与黄曲霉一并视为有害的霉菌，该菌也导致了在食物安全的议题中的一场争论。
2004年，日本东北大学名誉教授一岛英治于《日本醸造協会誌》第99卷第2号中，提议将“麹菌”定为日本的“国菌”。2006年10月12日，日本酿造学会大会上通过了将麹菌（Aspergillus oryzae）认定为日本的国菌。

基因体

米麹菌的基因组研究于2005年晚期由日本的制品评价技术基盘机构（製品評価技術基盤機構）所发表。8条染色体总共包括了约3700万个碱基对与1万2千个已经被预测出来的基因。与另外两个同属于麹菌属（Aspergillus）（基因模式生物的小巢状麹菌〔Aspergillus nidulans〕与致病的薰烟麹菌〔Aspergillus fumigatus〕）相比，米麹菌的基因组要大大约三分之一。根据预测,米麹菌许多额外的基因和二次代谢物（secondary metabolism）有关。这个被定序的菌株被称为“RIB40”或者是“ATCC 42149”，这个菌株是野生型（wild type）菌株，也已经被应用在工业上。