原始印歐語詞根

额外音位

余下的声音，也就是喉音 *h₁ *h₂ *h₃ 和咝擦音*s，可以在占据在这个等级中的几乎所有位置。 *s 特别常见于初始位置(参见飘忽s-)。
这种词根的例子有*peth₂-“to fly”，*treh₁w-“to nourish”和 *streig-“to stroke”。

对塞音的限制

词根不能包含两个普通的浊塞音(**ged-)，也不能包含一个浊送气音和一个清塞音(**tebʰ-)，除非后者同一个飘忽s-一起出现在词首辅音丛中(比如 *stebʰ-“to stiffen”)。

对音位数目的限制

元音必须同时前导和跟随着至少一个辅音。最大辅音数目好像是五个(比如 *strenk-“tight”)。
早期的PIE 学者重构了一些开始或结束于元音的词根。后者类型总是有长元音(*dʰē-“to put”，*bʰwā-“to grow”，*dō-“to give”)，而这个限制对元音开始的词根不成立(*ed-“to eat”，*ant-“front”，*od-“smell”)。喉音理论可以通过重构一个喉音跟在元音之后(*dʰeh₁-, *bʰweh₂-, *deh₃-，导致了长元音)或前导于它(*h₁ed-, *h₂ent-, *h₃ed-，导致了短元音)来解释这种表现。这些重构服从上述规则。

例外

应当注意到某些词根如*pster-“to sneeze”好像不符合这些规则。 这可能是由于对PIE 音位结构的不完全理解或错误的重构。

词根的意义

每个PIE 词根都有固有的意义，但不是总能够直接重构的，这是由于语义变迁和在证实了的后代语言间的反映者们的意义差异。
重构的词根总是有“动词”含义，而名词是通过后缀或其他方式派生出来的(例子参见原始印欧名词)。这甚至对前面章节中被翻译为名词的词根都成立: 例如 *ped-，也可以意味着“to tread”，依赖于元音变换等级和尾缀。
但是某些名词如*agʷn-os“lamb”或 *snus-os“daughter-in-law”不是从确立的词根派生出来的。