港鐵貨場

港铁东铁线在2010年6月15日前曾经兼营货运服务，因此东铁线沿线设有多个货场，供处理货运列车的始发、维修货运列车（及机车）等。

红磡货场

红磡货场位于红磡站东面地面，内有香港邮政国际邮件中心，上盖为香港体育馆，后增建九铁与长江实业合作地产项目国际都会，大部分均为有盖地方，但两端仍设有露天部分，包括一个可供船只停泊的码头。货场装有吊机，但用了一年即停用。除供货运之外，亦设有机车行车室，供柴油机车进行清洁、入油等工作；另外，亦设有电子工场。停止使用之前，曾经有东铁线列车于此停泊过夜，而每日的尾班广九直通车客车亦会暂泊于此。自港铁于2010年停止货运服务后，红磡货场只用作东铁线列车和机车停泊之用。
在2000年代，部分千九列车亦于此处上岸。2011年7月起，为配合观塘线延线及沙田至中环线工程，南面的大部分露天地方均被围封，并于10月起兴建红磡趸船转运站。
随着沙田至中环线计划的开展，本货场于2012年7月16日正式关闭，将会改建成屯马线的红磡站新月台及车厂。与此同时，广九直通车改往港铁何东楼车厂过夜。

何文田货场

何文田货场，亦称何文田牲口站，已建成香港理工大学第八期校园（Z座）。原址位于东铁线旺角东站与红磡站之间的隧道入口旁，前身为通往九广铁路英段尖沙咀站的正线，后来改以红磡站为南行总站，正线变成侧线，并成为货场。而在沙田至中环线工程后，此货场将成为红磡列车停放处之附设机务段。
何文田货场仅与北行路轨连接，需要前往红磡货场的列车需要经旺角东站调头。

旺角货场

旺角货场，位于东铁线旺角东站侧（新世纪广场地库楼层），曾改为嘉士伯（香港）物流中心。在沙田至中环线工程开展后，此处已重新投入服务，成为机务段。

沙田货场

沙田货场位于沙田站1号月台旁（可以从月台清楚见到），九铁年代原位于何东楼车厂的轨道工场因要兴建御龙山而曾被暂迁至沙田货场，用作存放轨道、道碴和工程车等，直至2009年初轨道工场物资被迁回何东楼车厂，轨道工场亦被拆除。

火炭货场

火炭货场位于火炭站1号月台旁，使用量偏低，以往只有运载危险品的货卡（由中国内地抵港之石油罐车班次，目前已经终止）或抵港访问的内地健康快车使用。由于路轨设计缺陷，货场仅连接北行路轨，货运列车进入火炭货场时有特定路线需要跟从。
东铁线南北走廊新列车运到香港时，由青衣九号货柜码头分三批（每日三卡）运到火炭货场，并进行车卡并接、撕去保护胶纸及在车头装上港铁标志等工序，然后等待晚上列车服务停止后，由柴油机车牵引下，经北厂出入口运入何东楼车厂。而在沙田至中环线工程中，此货场亦用于组装东铁线新讯号系统组件。
当港铁中期翻新列车由2019年起退役时，本货场将可能成为解体线（但最终解体线设于何处，仍未决定）；而在2017年11月22日凌晨，港铁就在本货场进行了一次旧车调离演习，由62及59号柴油机车牵引E92/E70列车进入拟设解体线，行驶路线与韩制新列车进厂相反。

上水屠房

上水屠房站位于上水站与罗湖站之间，在牲口全面改由货车运送之前，本站每天均有运载牲口的货运列车停泊卸货，但改用货车运送之后，本站亦改为列车停放处（停车侧线）。

罗湖货场

罗湖货场位于罗湖站以南，为边境禁区范围之内，为所有货运列车必经之处，曾用作停泊港铁伊藤忠近畿川崎列车（KRS991批次，已于2008年调入西铁线正式服务）；现时部分抵港港铁东铁线现代列车亦因车厂未有充足空间容纳，而暂时停泊在此。