清华大学医学院

生物医学工程系

生物医学工程系，在1979年创办的电机系生物医学工程专业基础上成立。本科学制4年，以电子技术系列课程为主干。

临床医学系

临床医学系与北京协和医学院紧密合作，开设临床医学专业，学制8年，医预阶段（2.5年）在清华本部，基础医学和临床医学在协和医学院，完成学业后获得医学博士学位。
临床医学系同时拥有外科学、内科学硕士研究生。

医学实验班。本着“医师科学家”的培养目标、拔尖创新的培养战略，首次提出了在八年长学制医学教育过程中引入两年海外科研训练的课程体系，形成独具特色的“3+2+3”培养模式，开拓了国际化培养高层次医学人才的教学改革之路。

第一阶段：1~3年级。
3年时间依托清华大学的综合办学优势，建立医学生的知识基础和人文修养，认识生命的价值和核心规律。要求学生掌握现代生物学的基础理论、知识和技能；坚实的医学基础理论和知识；系统的群体健康知识；良好的交流、信息管理、科学思维和终身学习能力。在清华大学由医学院、生命科学学院、化学系等院系教学，完成包括人文社会科学基础课程，自然科学基础课程，基础专业课程，及基础医学课程。并安排“临床医学见习”等实践教学。

第二阶段：4~5年级。
医学实验班中每一个符合要求的学生都将公派至海外一流大学，进入国际前沿的实验室进行严格的科研训练。采用“双导师制”，在国外一流医学院校进行生物医学的科研训练，在导师指导下从事生命科学与转化医学相关领域的科学研究，使医学生受到严格而系统的科学思维和作风训练；同时培养学生良好的科学素养和合作精神， 国际视野与创新意识。

第三阶段：6~8年级。
3年时间在国内大型综合性医院进行临床医学课程的学习和临床实习。目前与医学实验班临床教学具有密切关系的临床医院有：北京协和医院、北京清华长庚医院；学生在临床所修课程包括：诊断学、内科学、外科学、妇产科学、儿科学、神经病学、精神病学、眼科学、耳鼻喉科学、口腔科学等40门临床医学课程。
学生完成八年全部学业后获得临床医学博士学位( Medical Doctor， M.D.)。

基础医学系

基础医学系于2012年11月10日上午正式成立，按照转化医学的发展，研究膜蛋白与重大疾病、表观遗传与癌症、干细胞与再生医学、神经科学与疾病、免疫与传染病等领域。

药学系

药学系于2012年11月10日上午正式成立，定位于应用基础研究，研究药物化学、肿瘤药理学、离子通道与痛觉药理学、药物制剂及药物递送、药物代谢与毒理等领域。2015年12月25日，成立清华大学药学院。