內湖保護區反慈濟開發事件

历史

1997年起，慈济基金会于台北市内湖区保护区筹设“社会福利专区”。因需变更保护区之土地使用，大规模开发恐危及生态地质与邻近居民安全，破坏滞洪排水功能；引起当地居民和台湾绿党之反对，他们认为该开发区为“绿手指上的灰指甲”。此后引发内湖区居民长期与慈济进行抗争。
2001年遭遇纳莉风灾，大雨导致淹水共夺走5条人命，慈济基金会暂缓申请。
2005年，慈济基金会再度提出申请计划，希望将4.48公顷大湖里保护区变更为“社会福利特定区”。据城市规划书内容，在基地内建蔽率35％，保留65％的开放空间，规划兴建社福、志工发展中心大楼。 
同年6月，台北市政府组成内湖慈济开发案专案小组，进行讨论。自该年7月8日起至次年12月4日止，共举行7次专案小组会议，最后决议将此案移交台北市城市规划审议委员会大会审议。在2007年6月14日及7月13日的两次讨论会中，均被要求退回补充内容。
2013年1月，内湖保护区守护联盟在30辆公车车体登广告，引起慈济基金会不满；同月15日，慈济召开记者会呼吁立即撤下“违法”的车厢广告，理由是“慈济认为广告造恶业”。内湖保护区守护联盟理事长李日进表示，可能因为受到强大压力，公车广告代理商来电告知，已确定必须立即下架他们筹募资金所刊登的广告。
同年3月14日举行第8次专案小组会议，最后决议委托专家精算环境容受力，提出精确的研究报告与数据后，再重开专案小组会议讨论。11月28日举行第9次专案小组会议，最后建议提两种计划方案送都委会审议，第一案是将此变更案并入内湖通盘计划检讨，第二方案则是先将主要计划送内政部审议，细部计划则送环评审查。
2014年6月26日，北市都发局向都委会报告“台北市保护区变更处理原则”，在变更原则中明列，为发展文化、教育、慈善等公益需求，可检讨变更为特定专用区，此举遭环团抨击是为内湖慈济及薇阁国小保护区变更案护航。今早环保团体数十人前来聆听报告争取发言，呼吁都委会委员将该处理原则删除，以免大开保护区后门，成为财团或特定团体觊觎品。最后都委会委员会决议删除此原则，要求北市都发局在3至6个月完成全市保护区的检讨调查及处理原则，再提都委会委员会审议。
10月15日，台北市城市规划委员会召开“内湖区城市规划通盘检讨”审查会议，其开会讯息迟至13日下午才公开，并强调不邀请陈情人或相关团体列席旁听、不提供登记发言，引发不满。树党党员陈家宏甚至拿起灭火器狂喷，导致会议被迫中止。10月16日，针对保护区通盘检讨的“全市性保护区处理原则”专案小组会议，同意两位环保人士潘翰声、洪美惠担任府外委员。 
12月28日，台北市长柯文哲以台北市人口不会再增加，不需要再跟自然争地、开发破坏为理由反对此案，。
2015年2月，因台北市长柯文哲一句“很奇怪”，引发释昭慧法师与众人连番论战，再度引起话题。热议二十多日后，慈济于3月16日在花莲静思堂开记者会，宣布撤回内湖开发案申请。

争议事件

2015年3月，政论节目《正晶限时批》主持人彭文正不满慈济功德会一边开记者会，一边施压媒体老板，要媒体配合演出“慈济已退让，大家到此为止”的温馨剧，提出七点声明并发表“你关得了正晶限时批，究竟还是会被全民限时批”的言论，与妻子李晶玉同时辞去该节目主持工作。

衍生事件

惜根台湾协会秘书长林子凌指出，慈济14笔土地赠与者，是身兼慈济基金会董监事的双邦实业公司总经理许瑜娟，怀疑其中存在利益共生关系，不­过双邦实业公司总经理许瑜娟喊冤，自己没有钱买土地，指控是子虚乌有，慈济则表示董监­事许瑜娟并非经商，不愿意透露身份。
在2015年初，慈济内湖园区开发问题引发全台对慈济的批评，相继引爆包括善款账目不清、“宇宙大觉者”、静思堂违建问题、被指募集二手衣贩卖等在内的争议话题。