纤毛虫

细胞核

与其他大部分真核生物不同,纤毛虫有两种大小不同的核，一种是二倍体的小核，负责基因重组；另一种是多倍体的大核，负责一般细胞调控。

细胞质

食物通过胞吞作用，经过胞口胞咽进入食物泡，通过溶酶体分解使其颗粒变小，能通过膜扩散入细胞质中，残留在食物泡中的物质在胞肛处以胞吐作用排出。
大多数纤毛虫也具有一个或多个突出的收缩泡，收集和排出水以维持细胞内渗透压，以及维持离子平衡。在某些属中（如草履虫），收缩泡有着明显的星状造型，每个星芒都是一个收集管。

繁殖

纤毛虫都可以进行无性繁殖和有性繁殖。无性繁殖二分裂方式进行，小核发生有丝分裂,大核伸长并分为两半，然后该细胞一分为二。两个新细胞各获得一个大核和一个小核。
与此相反，有性繁殖涉及两个不同交配型（类似性别，但也存在两个以上的交配型）个体之间的结合和遗传物质的交换，这往往发生在食物短缺的时候。

分类

“纤毛虫门”分为两个亚门：

未归类

Genus Cryptocaryon（但WoRMS认为属于前口纲前管虫目裸口虫科，只有 Cryptocaryon irritans Brown, 1951一个物种。）