拖雷家族內戰

背景

蒙哥在1250-1251年的库里尔台成功登基为可汗，窝阔台家族的失烈门和他的堂兄对未能当选感到痛苦，并策划了对蒙哥的暗杀事件。蒙哥通过清除皇室内的对手以及察合台和窝阔台家族的成员来报复。
蒙哥于1252年将高加索地区的控制权移交给金帐汗国，经过他的批准，别儿哥于1255年继承了他的兄弟拔都，成为金帐汗国的可汗。旭烈兀的伊儿汗国从金帐汗国手上夺取了高加索的控制权，和他在1258年进攻巴格达引起了是穆斯林的别儿哥汗不满。

内战

蒙哥于1259年去世，未任命继任者。他很可能支持阿里不哥，在1258年指定他为喀喇昆仑（当时的帝国首都）的指挥官，但他没有做太多其他事情以确保阿里不哥对王位的主张。
忽必烈汗于1260年开始进攻南宋，当时他收到有关阿里不哥正在挑战他继承权的消息。阿里不哥与蒙古贵族的强大成员结成联盟，以支持他为大汗的候选人。蒙哥的大多数亲属支持他，包括窝阔台，察合台和术赤家族的成员。忽必烈和南宋讲和并动员他的部队与阿里不哥作战。在中国，忽必烈在开平召集了一个库里尔台，在那里他被选为大汗。这是第一个在蒙古家园或中亚之外宣布大汗的库里尔台。阿里不哥则在喀喇昆仑召集了自己的库里尔台，一个月后宣布他为可汗，为王位创造了两个竞争对手。当时旭烈兀本要前往蒙古，但因与埃及马木留克王朝的战事要留在中东。
阿里不哥与金帐汗国的别儿哥和察合台汗国的阿鲁忽结盟，别儿哥支持阿里不哥，因为他对与忽必烈关系密切的旭烈兀感到不满。
忽必烈可以从中国肥沃的土地获得供应，而阿里不哥则不得不在半干旱大草原上向喀喇昆仑进口资源。忽必烈依赖中国的这些物资，因此需要中国人民支持才能赢得内战。忽必烈在他的中国顾问的帮助下，自称是一位圣人皇帝，能够轻易地将中国人，朝鲜人和蒙古人联合起来。同时称阿里不哥是一个破坏性的篡夺者。忽必烈承诺减税，他的政府机构与中国朝代相似，并采用年号中统，即“温和统治”。
忽必烈现在控制了通往喀喇昆仑四条可能补给线中的三条，对阿里不哥开放的唯一供应线是西北部的叶尼塞河流域。当忽必烈的军队于1260年末向喀喇昆仑前进时，阿里不哥从喀喇昆仑撤退到叶尼塞的支流。冬天迫使双方停止行动，等待春天。
1261年忽必烈和阿里不哥在司马台进行战斗。阿里不哥输掉并且撤退。十天后，他回到该地区，在蒙古东部的兴安岭附近挑战忽必烈的军队。但阿里不哥袭击的军队并非由忽必烈亲自领导，只占了忽必烈军队的一小部分。即便如此，战斗也陷入了僵局。与此同时，蒙古的大部分地区现在都在忽必烈的控制之下，威胁到阿里不哥对叶尼塞河谷供应线的控制。弱势的阿里不哥向阿鲁忽寻求帮助。阿鲁忽拒绝了，并处决了阿里不哥派遣的特使。
阿里不哥现在只剩下几个盟友，他的几个支持者离开了他的身边。蒙哥的儿子兀鲁塔什叛逃，从阿里不哥手中接过父亲的印章，并将其作为忠诚的象征给予忽必烈。在缺乏资源或盟友下由新疆北部独自前往上都，于1264年向忽必烈投降，结束了内战。

事后

忽必烈囚禁了阿里不哥，但没有立即惩罚他。忽必烈的支持者希望报复，因此忽必烈将关押一年作为惩罚。他进行了清洗工作，以消除蒙古政府中同情阿里不哥的官员。忽必烈指责孛鲁欢，一名曾在蒙哥手下服役的重要蒙古官员，与阿里不哥合谋背叛。忽必烈授权处决孛鲁欢和阿里不哥的其他支持者。忽必烈召集了一个库里尔台来决定对阿里不哥的惩罚并巩固他自己对王位的要求。如果没有蒙古贵族们的公开支持，忽必烈不愿惩罚他的兄弟。阿里不哥在1266年神秘地死去，但仍然被监禁，导致人们猜测忽必烈暗中毒害了他。
大多数西方汗国都不承认忽必烈是大汗。虽然他们中的一些人仍然要求忽必烈确认其新可汗的登基，这四个汗国现在是事实上独立的主权国家。主力在波斯的伊儿汗国和位于中国的元朝有着密切的外交关系，但四个蒙古汗国之间的军事合作永远不会再发生，统一的蒙古帝国已经解体。