以色列博物館

圣书之龛

圣书之龛收藏了在1947至1956年间于死海北岸的昆兰，干谷里头与周围的11个洞穴中发现的死海古卷。经过7年的精心策画，该建筑由匈牙利裔流亡人士暨慈善家大卫·塞缪尔·戈特斯曼的家族提供资金而于1965年建成，而大卫·塞缪尔·戈特斯曼即是买下死海古卷送给以色列的人。
圣书之龛是有一个白色圆顶覆盖着，而且三分之二都在地下的建筑。白色圆顶在其周围的水池中反射著光，而在白色圆顶的对面则有一座黑色玄武岩墙。这个建筑物的形状与颜色是基于光明之子对抗黑暗之子的战争的卷轴之意象所设计，而白色圆顶象征了光明之子，黑色石墙则象征黑暗之子。至于圣书之龛的内部则设计用以表现这些卷轴被发现时的环境。这里也有以在写下这些古卷的昆兰之生活情形为主题的永久性展示。而整个圣书之龛的结构被设计成像这些卷轴被发现时用来装它们的壶。该建筑由奥地利建筑师弗雷德里克．基斯勒（Fredrick Kiesler）美国建筑师阿芒德．巴托斯（Armand Bartos）设计并在1965年开幕。
由于这些卷轴的易碎性，使得要将卷轴全部在一个连续平面上展示是不可能的，于是便使用了一个循环系统。在一个卷轴被展示了3到6个月后，就会被从展示柜移到一个特别的储存空间暂时存放，并在那里“休养”。该馆也有其他珍贵的古代手抄本，并展示了10世纪时的《阿勒颇抄本》，该抄本被认为是最古老的完整希伯来文圣经。

耶路撒冷城市模型

耶路撒冷第二圣殿时期模型是一个该馆近来才新增的展品，该模型重建了耶路撒冷在66年爆发对抗罗马人的大起义之前的地形与建筑特色，而这场起义最后使得耶路撒冷与圣殿遭到了毁灭。这个包括了大希律王圣殿的复制品模型所在地最初是建在耶路撒冷的圣地酒店大堂，2006年移到博物馆后成为该馆占地20英亩（81,000平方米）园区里的一个永久性特色景点，就在圣书之龛附近。

美术展厅

以色列博物馆拥有大量的画作收藏，其范围涵盖各种时代、型式、主题以及原创领域。这些收藏品的画家包括有国际级大师如林布兰与卡米耶·毕沙罗，以及以色列与犹太艺术家如阿贝尔·潘恩与马克·夏卡尔。

犹太艺术和生活展厅

该馆有来自世界各地与各时期的犹太仪式艺术品的重要收藏。

雕塑花园

比利罗斯艺术花园占地20德南（dunam，1公制德南等于1000平方米），以现代与抽象风格的雕塑为特色。

青年馆

该馆的青年馆（Youth Wing）于1966l年公开，结合了以色列与国际艺术家们年度原创作品以及教育活动。这里也有各种为小孩与成人举办的研讨会。

洛克菲勒考古博物馆

洛克菲勒考古博物馆是以色列博物馆的分馆，紧邻老城东北角，地处东耶路撒冷。洛克菲勒博物馆由美国洛克菲勒家族捐建，收藏有许多以色列建国前考古发掘出的重要文物，特别是约旦河西岸考古遗址文物。以色列文物局目前也在博物馆内。博物馆虽然展品丰富，位于老城旁，并且免费开放，但游客不多。这一博物馆展品按年代排列，专业收藏圣经考古文物，非常适合对以色列古代历史考古感兴趣的观众。博物馆的重要文物包括圣墓教堂12世纪的门楣、耶利哥冬宫的穆斯林浮雕等。