瀚海星云BBS

建站初期

1996年1月6日开站，首任站长是92级计算机系学生张焕杰（james_zhang）。采用的是台湾中华工学院资讯工程系学生陈绍俊、郭耿言及蔡智强开发的Power BBS系统2.2版，此后科大学生朱朝阳、萧镇等对其做了很多修改，成为2.4a版。瀚海星云前任站长王蔚然同学也对代码做了很多修改。
1996年12月20日开始与上海交大饮水思源站转信。
1997年1月11日开通Email注册、Email发信、归隐江湖功能。6月27日发布中国大陆第一份BBS文集: 中国科大BBS文集之毕业纪念册。10月20日开通按作者检索信件、版面文章多种视图功能。11月2日服务器升级为DELL PowerEdge 4100/200。11月25日  发布2.4C版Client。
1998年3月26日，本站迎来第3,000,000位使用者。8月1日，本站迎来第4,000,000位使用者。
2002年7月16日0时，瀚海星云实现了由PBBS到FBBS的过渡，过渡期间很多学生彻夜不眠爆发了抢注惹眼ID的狂潮。该站的老网虫热衷于使用Telnet方式上线发表文章、灌水、抢号。Telnet是他们认为比较便捷的方式, FireBird BBS系统稳定后又推出了可供Web浏览的版本，2006年以后随着新生对Telnet客户端的不熟悉和Web浏览功能的日益强大，使用Web方式访问瀚海星云BBS的用户越来愈多。
2012年1月28日，瀚海星云进行了系统更新，实现了@功能的使用。目前提醒需要被提醒人主动查看，而非即时推送。该功能实际处于未完成状态。

站务集体辞职与实名制时期

2012年12月2日，瀚海星云站务组下达了关于对BBS部分功能进行调整的公告，曰：“学校接上级有关部门通知，自即日起，本站将加强管理，并增加用户身份标签显示。由于技术方面因素，相关功能会在近期内完成。”同日，多名站长（副站长及技站）及所有站务总管，将自己的昵称修改为：请假中，请联系其他站务。
2013年4月2日，为贯彻上级有关校园网络安全管理的要求，加强本校BBS的管理，简化BBS注册流程，BBS上新增了用户身份数据库，依靠本校邮件服务器邮件地址关联BBS帐号身份信息。为了加强身份信息的有效性和一致性，要求BBS用户尽快对帐号进行身份重认证。4月10日未进行身份重认证的用户，将由程序自动更改为未注册用户。
2013年6月1日，由于上级有关要求，BBS功能继续调整。站长jameszhang提高发文权限，曾经在test等版可以post的20级账号无法发帖。认证用户程度进一步提高。
6月24日 瀚海新云系统进入暂停登录的状态，并显示BBS 故障说明。据某些知情人士透露，此举为关站前兆。6月28日站务组、技术组发表离任公告。6月29日站长jameszhang 发表瀚海星云站务组成员招募公告。该公告从一定程度上否定了关站的传言，并有网友对前任站务组提出了强烈的批评，表示此举大快人心。但同时也有网友表示再次表示，“瀚海已死”。
9月16日，lwl在board版批复《请辞【兼职版|parttimejob】版主》“OK”，为新站务在瀚海Board版批准的第一项版务申请。同日，lwl批准第一项版务申请，《申请[材料科学与工程系(14系)|MSE]板板副》，但是并未安排任何版务培训事宜。
10月25日凌晨，科大原创电影《在勾引中学会爱》在网络公映，因其内容的敏感性，引起广大师生讨论。10月29日凌晨，瀚海站长干预版务，在版务未上线的时间，合集Movie版与USTCDevelopment版面有关《在勾引中学会爱》的讨论。
2014年5月26日至28日，“今日十大”连续被《强烈要求学校进行有效的监控录像以及加强门禁》的帖子或转贴占据，表达学生对学校监控设备不能录像而成为摆设和学校相关管理人员不作为的不满，帖子达二百多回复。学校迅速做出回应。虽然转日即将左右文章合集存档，但是并未禁止学生继续讨论。而且实际中迅速将加强校园安保提到议事日程，在自习室检查一卡通，并且传言已经加强监控录像管理。