水警總區

水警成立

香港开埠初时，水上巡逻任务由英国皇家海军负责，后来，反走私、反偷渡及搜索及拯救援等任务逐渐转交予于1842年成立的水警上。成立初年，水警只有14名警务人员，主要采用划艇方式推动旗下几艘木制帆船。由于早期香港实施戒严，故此当时的水警主要在夜间执行水上巡逻，而海盗则是其最大的打击对象。当时水警经常与海盗周旋和爆发冲突，人员经常被伤害至残废以至被谋杀。
1846年，香港政府购置一艘三桅帆船予水警用作巡逻港口；两年后，该艘帆船在一场台风中搁浅及沉没，船上17名人员全数殉职。

采用蒸气发动警轮

历时半个世纪之久，香港海港一直由持短弯刀和滑膛枪炮的水警在划艇上执行水上巡逻。1893年，差役订购了首批蒸汽机舢舨，为效率上一大改进。然而待遇方面，水警警员月薪不过7银圆，水警警长月薪亦不及陆上警长的一半。
1898年，大英帝国租借新界，水警需要随之作出重大改进。从前，水警负责范围不过16平方公里的海港和香港岛的海岸，展拓香港界址后，突然增加至约1,800平方公里的水域及280座香港岛屿的治安，并且需要保卫长达近200公里的边界海岸线。因此，水警明显需要迅速扩张。
1914年，水警在沿岸和河流航行的船只上派驻主要由摩罗差组织而成的反海盗部队，以设海关，保护沿着珠江以北及近岸航行的香港船只。

海员大罢工后改革

1922年海员大罢工发生后，水警改革，先以蒸气发动船只取代划艇，后来再以汽油取代煤料。逐渐，水警船队发展成为一个强而有力的海事保安组织。此外，水警事务亦变得多元化，不但包括巡逻遥远的领海、打击偷渡及追截走私，而且扩展至照顾离岛社群的生活需要。从前，居住在离岛上的150,000名香港居民中，许多在危急时刻都需要倚靠水警接载前往安全地点。 
1930年，差役从印度旁遮普、中国威海卫以及中国沿岸（主要位于上海）的白俄罗斯社区招募约100人来到香港接受水警训练，投入服务。
1952年，水警开始使用雷达，为当时最先进，以及世界上最先采用雷达系统的船队之一，当时船队包括比较大型的木制、长70呎警轮，相继投入服务。

重组

第二次世界大战后，水警员额逐渐增加至200至300名人员，包括于1946年从英国伦敦警察厅招募了20名人员。此时，水警亦开始扩展至负责水上巡逻离岛海域。两年后水警重组，英文名称从Water Police更改为Marine Police。1952年，水警开始使用雷达，为当时最先进，以及世界上最先采用雷达系统的船队之一，当时船队包括比较大型的木制、长70呎警轮，相继投入服务。

水警总区成立

1960年代以前，轮机员主要由海事处派调，部分后来更转任为水警人员。1960年起，大量非法入境者从中国大陆涌进香港，水警因此而扩展至负责打击偷渡，并且展开了希素美（Haslemere）行动。1962年，警务处成立防止非法偷渡科，此科于成立后6周内就拘捕了逾62,000疑犯及将众人遣返。当年的水警隶属于此科，至1965年，防止非法偷渡科与水警合并成为水警总区。
1970年代以前，水警人员经常需要收拾浮游尸体、支援陆上防暴及运送官员渡海等特殊任务。
1970年代起，歇止大量难民从越南涌来、押解越南船民及把守难民营则成为了水警总区的主要任务，员额大幅度增加至1,000名人员（包括于1978年从警察训练学校招募6名女性警务人员，成为首批女性水警人员。）。1972年，水警总区引进现代化、长78呎的达汶型警轮（50至56），钢铁船身，各安装有两副油渣机车，时速达20海里，每艘载员12名，由新加坡制造。
1979年10月，快艇特警队成立。
1990年代起，走私罪行开始猖獗，很多私枭匪帮都持有枪械以至重型武器，使用配备5部300匹外舷机推动的马达快艇（俗称大飞）走私，在海面上经常与水警爆发枪战，期间造成数名水警人员在执行追截任务时殉职。有见及此，香港政府于1991年成立反走私特遣队。

全面电脑化

2000年起，水警总区先后引进语音子系统、自动追踪船艇位置显示系统和文本系统（全部皆为警务处的发明），标志着水警完全步入了电脑化时代。2001年，香港警务处引进地面中继式无线电，为全亚洲首个使用此系统的执法机关。同年，警务处在地面中继式无线电世界研讨会上赢得最有创意服务大奖。透过使用上述系统，人员能够即时及准确地观察船只位置，同时能够知悉船只编号，此为无线位置显示功能上一个重大的突破。指挥及控制中心可以透过此系统了解所有资源上的调配，以判断控制的范围，更可以配合无线电通话作出即时指挥。控制员可以按照计划，安排资源来执行预定的监视或者保护行动，及透过系统了解计划的进行情况。船只位置显示系统采用了不同层次的地图，包括有地方标记、海事符号和航道等等。船只的航行记录亦会储存在电脑纪录，亦可以重播，用作管理和监察用途。此外，系统亦提供无线传真功能，接驳至其他网络，包括警察电邮网络。
2002年起，警察行动平台相继投入服务。于水警总区推行海上警视系统前，辖属轮艇逾170艘，为世界上规模最庞大的水上警察。

推行海上警视系统

2005年年中，水警总区逐步推行海上警视系统（英文：Versatile Maritime Policing Response，缩写：VMPR），运用尖端的航海科技，包括布下俗称为天眼的天罗地网（海陆雷达装置、全天候热能探测器及数码视像仪器等），同时配合一支船身比较小型、航海速度比较高及操作性能比较灵活的警轮队伍，务求在更为符合经济效益的原则下，加强海上保安能力。在此计划之下，所有新型警轮皆配备了日夜摄像系统、差位全球定位系统、测深器、雷达、电子海图及缳星罗盘等先进仪器，并且采用崭新的水力喷射推进系统等，以提升水警总区堵截水上非法活动的能力及处理紧急事故的效率。引进此系统共耗资4亿4,500万港元，包括中央指挥系统、两艘趸船行动平台、17艘中型巡逻警轮及23艘分区快速巡逻艇。中央指挥系统于2009年12月落成，整套海上警视系统于2010年年底全面地实行。2011年4月15日，中央指挥系统获得香港资讯及通讯科技大奖中的2011年全年大奖、最佳公共服务应用大奖以及最佳公共服务应用（电子转化）金奖。同年9月，该系统获公务员事务局颁授部门合作奖。
2010年，水警总区拯救了70名海上遇险人士，拘捕了1,238名非法入境者、检获价值约7,700万港元的走私货物，并且充公了33艘马达快艇。
2011年，水警总区拯救了29名海上遇险人士，拘捕了908名非法入境者、检获价值约5,800万港元的走私货物，并且充公了27艘马达快艇。
2012年，水警总区为水师配置连接启动雷达系统的新光电感应器，以提升轮艇的夜视水平。同年，水警总区拯救了143名海上遇险者，拘捕了763名非法入境者、检获价值约6,580万港元的走私货物，并且充公了27艘马达快艇。
2013年6月10日，立法会保安事务委员会主席叶国谦率领委员会成员及其他立法会议员并由保安局人员陪同下参观水警总区总部，以加深了解水警总区的运作。就南丫岛撞船事故，水警总区及海港警区人员于2013年7月1日分别获颁行政长官公共服务奖及警务处处长嘉许状（单位），以表扬上述人员在事件中的英勇行为。同年，水警总区拯救了198名海上遇险人士，拘捕了1,674名非法入境者、检获价值约3,880万港元的走私货物，并且充公了11艘马达快艇。
2014年5月13日，水警总区向立法会保安事务委员会提交文件指出需要更换3种合共18艘警轮，包括水警总区训练船、6艘分区巡逻警轮及11艘海涛型警轮，作价6亿5,841万港元，为2010年代最大规模的一次船队更新。同年7月11日，水警总区向立法会财务委员会申请拨款。
2015年4月17日至19日及24日至26日，水警总区假长洲警署及长洲公众码头举办“香港警队170周年水警展览”，除了展示历史照片及影片、退役及现役装备，亦开放一艘最为常见的中型巡逻警轮及小艇分区的快速追截艇及快速追截艇各一艘，并且派遣人员穿着不同年代的制服步操表演，教授公众海事绳结及摩斯密码的应用，以及示范源于皇家英国海军的撑杆操（俗称钩竹操；Boat Hook Drill）。

水警学长计划

《水警学长计划》于2011年11月19日开展，旨在鼓励青年投考加入警务处，继而在水警总区服务。来自10间大专院校、香港航海学校、海事训练学院及香港海事青年团，而且具备良好的品格及对水警务有兴趣的学生或成员将会获邀请成为学员。在学长及学长助理的适当举发及指导下，期望学员将来投身警察队，继而加入水警总区。

轶事

1960年代，一艘小型警轮需要6至16名人员驻守及操作，一艘中型警轮需要10至18名人员驻守及操作，大型警轮需要逾20名人员驻守及操作。人员每次出海当值前均会在当时位于尖沙咀的水警总部集合，然后转往九龙政府船坞登船。由于大型警轮船身太大，不便进入船坞，所以均停泊在油麻地避风塘（今渡船街），方便人员登船。人员在船上每当值24小时，会被按以职级获得不同程度的伙食津贴。警员每日两港元，警长或者以上职级每日4元。
现时，人员的一更时间长度为24小时，实行“返一放二”工作制度。