貢薩洛·費爾南德斯·科爾多瓦

早年

1453年9月1日，贡萨洛生于卡斯蒂利亚和莱昂王国蒙蒂利亚，为家中次子，其父为阿吉拉尔德坎波奥伯爵费尔南德二世，母亲为埃雷娜的埃尔维拉，而其中一位远房姨丈为恩里克四世。在其父母早亡后，12岁的贡萨洛和兄长阿隆索被送至卡斯蒂利亚养育，由卡拉马哥伯爵佩德罗负责教导。15岁时被封为骑士，并选择世叔阿斯图里亚斯亲王阿方索亲王为领主。1468年7月5日，阿方索亲王病故，因此转向效忠新任阿斯图里亚斯公主的表姨伊莎贝拉，而兄长阿隆索则继任父亲爵位，前往北方，称阿隆索三世。贡萨洛少年时不务正业，喜好赌博、嫖娼、狩猎，纠集朋党横行乡里，热爱吹牛，常至酒馆混迹于社会基层人物之间。因作为国王外甥行径荒唐不羁，所以常遭训斥。

卡斯蒂利亚王位继承战争

1474年12月11日，恩里克四世去世，伊莎贝拉继任卡斯蒂利亚和莱昂王国女王，称伊莎贝拉一世，葡萄牙国王阿方索五世助伊莎贝拉的侄女胡安娜宣称卡斯蒂利亚的王位，爆发卡斯蒂利亚王位继承战争，贡萨洛加入了圣地牙哥骑士团参战，其作战勇猛，战场上必身先士卒，但亦常受伤，数次险死。因此被表哥卡隆纳伯爵迪亚戈俘虏，在拜纳被囚禁三年。1477年，因战争结束，被释放。从此学习知识，学习读写卡斯蒂利亚西班牙文。1478年，贡萨洛25岁时学有所成，回到家乡，在兄长阿隆索资助下过活。

格拉纳达战争

1481年，格拉纳达战争爆发，贡萨洛请求兄长阿隆索让他带兵五百，兄长不许。最后将人数减少至一百五十人，且其中五十人为贡萨洛之友人，不需提供资助为条件，且必须发誓听从命令、不可擅作主张，最后兄长才批准贡萨洛出征。1482年1月14日，阿隆索作为阿吉拉尔德坎波奥伯爵响应伊莎贝拉一世和费尔南多五世的征召，率兵支援格拉纳达战争。贡萨洛作为步兵头领名义参战，率领长枪队配合作战。1483年8月6日，阿吉拉尔德坎波奥军攻陷安特克拉，阿隆索允许他可以独立作战，但不可离开本队太远，以便发生意外时，他可以来拯救贡萨洛。贡萨洛从兄长处取得一队三百五十人的分队，他下令将长枪兵列成方阵，而火绳枪兵在周边支援射击，待敌人攻至时后退，构建了西班牙大方阵的雏型。1485年4月15日，贡萨洛军在兄长军队的支援下攻陷伊略拉，兄长阿隆索率军转往攻击埃斯特波纳。贡萨洛军独自面对敌军反扑，最终成功守卫了伊略拉。同年6月率军攻占蒙特夫里奥，并纵兵大肆抢掠。因此两件功绩，1486年3月，贡萨洛被任命为伊略拉的行政首长，成为伊莎贝拉一世的直属臣下。
1486年7月，贡萨洛认为国家太过于依赖征召兵，而常备军则占总兵力大约五分之一左右，相比穆斯林国家之常备军相对数量较少。贡萨洛因此彷效奥斯曼帝国的耶尼切里军团、基督教骑士团的编制，以手下三百士兵组成一支常备军，称为模范军（西班牙语：Ejército Modelo）。同时从匈牙利黑军的雇佣兵和粮饷问题上撷取教训，由专门的铁匠和商人提供武器、盔甲和军需品。亦因雇佣兵和征召兵难以控制，规定军队全员必须为终身职，不论贵贱，通过选拔便可入队，最初定额三百人。模范军的训练严苛，每天以木制武器进行战斗训练，同时训练泳术、举重、射击、跑步。而且特色是全员都需参与，包括贡萨洛本人都需要接受训练，训练不达到标准三次者，从模范军中除名。贡萨洛设计各种战场状况让部下演练，其中之一的规范为在三十秒内穿好盔甲，五十秒列出阵型，以防止敌人突袭。同时由于战利品分成一向是军队冲突的源头，贡萨洛决定将一切战利品归公，由模范军公有。按缴交的战利数量多寡，换成金钱支付，再由队中的商人出售战利品图利。模范军不禁止军妓，但限定每个男子只能拥有一位军妓，只有休息时间士兵才可以接触军妓，军妓在其他时间主要担任炊事、修补和照顾伤病的工作。队中人互相不称职称，只互称同伴（西班牙语：Compañero）。后来因为常备军扩编至三千人，根据创始时的编制选出最优秀的三百士兵，称为伟大同伴们（西班牙语：Los Gran Compañeros）队中人称呼名字前须加上尊称，并可穿着特制披肩。成员资格每年考核，不合格者会被禠夺荣誉，成为一般兵员。
1489年，贡萨洛支援攻击阿尔梅里亚，只带三百士兵前去，三百士兵全体披甲，武器精锐，队列整齐。分成三个梯次直接攻向敌人，贡萨洛命令士兵高呼光荣战死（西班牙语：Muertes gloriosas）口号，此口号后来成为模范军的格言。全句为：“勇敢的士兵们，无需理会我们面前有什么敌人，不用犹豫地前进，继续前进，继续前进，光荣地接受死亡！”（西班牙语：Soldados valientes, no importa lo que el enemigo en frente de nosotros, no dudó en seguir adelante, seguir adelante, seguir adelante, salude muertes gloriosas！）贡萨洛本人站在第一排持长枪作战，士兵们人人以一当十，大破二千回教军，贡萨洛也因此少有名气。但也因身为贵族却以步卒方式作战被其他贵族岐视。
1492年，贡萨洛率军加入围攻格拉纳达的战役，因为他会说柏柏尔人的语言，被伊莎贝拉一世任命为使节，前往劝说埃米尔穆罕默德十二世投降，穆罕默德最终答应投降。战后伊莎贝拉一世封贡萨洛为洛哈伯爵，贡萨洛向伊莎贝拉一世进言应开始逐步改革军制，获伊莎贝拉一世许可。

征战南意大利

1494年8月，查理八世率领军队越过阿尔卑斯山攻打意大利，是为意大利战争。1495年2月22日攻陷那不勒斯王国首都那不勒斯，成为意大利地区的保护者和名义上的共主。对那不勒斯王国有宣称权的费尔南多二世决定派表外甥兼远房表弟贡萨洛率军支援，阿方索二世父子复国。1495年5月24日，贡萨洛率6000步兵和700骑兵登陆墨西拿，开始了对那不勒斯的复国运动。
1495年6月2日，贡萨洛强行登陆卡拉布里亚，但随即便发现法军并不只由法军构成，而是拥有大量北意大利军队的军团，而且贡萨洛发现，阿方索二世死前所称的补给和后备军队，不是被法军消灭、整编了就是根本不存在。他得在没有补给的情况下，用6700人的军队攻下整个南意大利，而对方的军队总数高达82,000人，因此贡萨洛写信向躲藏在墨西拿的新王斐迪南二世咒骂抱怨。斐迪南二世大惧，一边向贡萨洛道歉，一边向远房堂叔费尔南多二世告发贡萨洛信件用语不敬之事，费尔南多二世大怒，曾想撤换贡萨洛。其妻伊莎贝拉一世对此仲裁，决定此事贡萨洛不需负责，并下令要在海上建立补给线，以维持贡萨洛军团之补给。
6月27日，贡萨洛军之阵地在塞米纳拉被人数五倍多的法军半包围在丘陵上，后方是大海，前方有法军。军队既饥又累，毫无战斗力，贡萨洛自嘲，这应该是最蠢的死亡方式。并以法语向法军声称要是能活下去，他会把他们都宰了，引起法军一阵嘲讽，但双方因此对骂了一整天，没有战斗。当天晚上，援军4000多人和补给从海上驶至，但当他得知兵员多为征召兵和一般农民时，以及斐迪南二世将接任军队司令时，他劝告斐迪南不应与法军决战。可是斐迪南不答应，并下令明天决战。
6月28日，那不勒斯王国民兵开始从山顶向下进攻在平原地区的法军，法军中军直接迎战，爆发塞米纳拉战役，法军的瑞士佣兵三个方阵很快地便撃破了那不勒斯军的左翼，并切入民兵阵线侧面，导致民兵大规模崩溃，法军同时推前阵线，压迫那不勒斯军队。贡萨洛看到那不勒斯军迅速崩溃，下令军队以远程火力压制冲来的法国重骑兵，并逐步后退，避免接战。贡萨洛亲率一百骑兵攻击法军阵线边缘，令法军追赶的速度减慢，最终西班牙军队夺船逃走。斐迪南二世无法压制军队溃败，主动逃跑，令军队大崩溃，法军杀1,400多人。贡萨洛率领残军退回雷焦卡拉布里亚休整。
7月2日，贡萨洛因指挥不力为由，发动兵变从斐迪南二世手中夺过兵权，并召集手下全部军队，创设了枪刺与射击的攻击方式，发明出西班牙大方阵。7月15日，贡萨洛率领6,000多人的军队北伐，发动游撃战逐步削弱法军军力。10月11日，攻陷卡坦扎罗，成功在亚平宁半岛上建立第一个稳定据点，从此开始转变为正规作战。11月12日，攻入巴斯利卡塔，并主导当地民众对法军的反抗。并大肆宣传北意大利法军在福尔诺沃战役的失败。那不勒斯王国因此大乱。1496年6月17日，贡萨洛率领1,400军队在阿泰拉会合威尼斯军，与5,000法军隔山对恃，进行阿泰拉战役。7月1日，教皇国将领切萨雷·波吉亚及其下属军团倒戈至西班牙方，法军阵线出现缺口。西班牙军的持圆盾者上前抵抗法军进攻，由轻骑兵冲入缺口攻击。法军因阵线崩溃暴露在联军火力下，二百威尼斯手炮兵上前开炮，法军大溃，贡萨洛亲自率领骑兵斩杀败卒，法军中只有瑞士佣兵死战不退，因此被全歼。最终西班牙军俘虏了二千法军，贡萨洛拒绝了波吉亚杀害战俘的提议，将他们分批遣散。战后那不勒斯国王斐迪南二世一病不起。8月25日，军队跨越亚平宁山脉，攻入萨雷诺，9月4日，西班牙军收复了除西北部外的全那不勒斯王国。9月7日，斐迪南二世病逝，由阿方索二世之弟费代里戈任新任那不勒斯国王。9月23日，西班牙军攻入那不勒斯，法军据守新堡和蛋堡拒抗西班牙军队，先后被攻克。
10月12日，西班牙军队攻克那不勒斯，光复了那不勒斯王国。但贡萨洛不打算停止，他打算让军队休整后北上台伯河，攻陷罗马城。贡萨洛与波吉亚在那不勒斯时行为不检，贡萨洛因看上了蒙特费尔特罗家族阿伦德纳伯爵圭多巴尔多一世之女卡特琳娜，强迫她发生性关系，并让她陪睡。波吉亚让贡萨洛享受意大利妓院的淫靡服务，贡萨洛因此不想再战斗，日夜沉醉于女色之中。12月5日，法军再度南下，贡萨洛下令决心重新振作，并让波吉亚军团担任先锋，前往罗马解救教宗亚历山大六世。1497年2月20日，法西双方在罗马近郊奥斯提亚安提卡爆发大战，是为奥斯提亚围攻战。战前，具有优势兵力的西班牙军遣使向法军劝降，法军不降。于是贡萨洛决定开战。3月7日，城墙被火炮轰出缺口，西班牙军攻入城堡巷战，两天后内城投降，贡萨洛捆绑法军主帅门纳多、并和法国罗马总督吉尔巴托德一起缚起来在地上拖行。3月8日，西班牙军开入罗马城，受到罗马人民欢迎，亚历山大六世更为贡萨洛颁受玫瑰金章荣誉，并亲吻其额。贡萨洛向教宗亚历山大六世献俘，并称已抓到惊扰圣座的主犯两人，首谋者查理八世则已逃逸。亚历山大六世正要慰劳贡萨洛，却被贡萨洛以脏话教训，指他应该感谢西班牙出兵，同时应该检讨自己的言行，不要制造太多丑闻，亵渎圣物，好好教育自己的孩子，并且及时改正自己、家庭和法院的弊病，常常记挂天主。耶稣会神父阿瓦尔卡写道：“教皇感到相当惊讶，非常寂静，惊讶，他知道他手中拧紧的绳子上代表的辉煌。那位教皇，在军事危机解决后，在罗马的宫殿中被持武器士兵所包围，而士兵的领袖对于天主、亲人和改革要点等等进行训斥。”
（西班牙语：El papa quedó turbado del esplendor vivo de la verdad, enmudeció del todo, asombrado de que supiese apretar tanto con las palabras un soldado, y de que a un Pontífice, tan militar y resuelto, hablase en Roma en su palacio y rodeado de armas y parientes, un hombre no aparecido del cielo, en puntos de reforma y con tanta reprehensión.）1497年3月10日，贡萨洛因功被封为圣安杰诺公爵，是为圣安杰诺公爵贡萨洛一世，取代其兄阿隆索成为家族领袖。

第二次奥斯曼-威尼斯战争

1499年10月，奥斯曼帝国出兵攻击威尼斯共和国控制下的希腊地区，双方爆发第二次奥斯曼-威尼斯战争，威尼斯共和国向天主教各国求援，但天主教各国无人出兵。贡萨洛得知此事后，请求伊莎贝拉一世让他以三千模范军支援威尼斯军作战，并公开誓言一定打败奥斯曼帝国，西班牙各封臣认为贡萨洛疯癫，竟敢以三千人直接对抗奥斯曼帝国。因此贡萨洛遭受众多侮蔑，最终伊莎贝拉一世允许贡萨洛出征，并允许他多带士兵前往，但是是以威尼斯雇佣兵身份出战，以避奥斯曼之战争口实。
1500年8月23日，在爱奥尼亚海上，与威尼斯代表阿戈斯蒂诺·巴巴里戈会面，与威尼斯军队合兵，并即日攻向爱奥尼亚群岛。9月8日，参与圣乔治城堡围攻战，只以舰船火炮轰炸城墙，断绝城中水源，包围城堡。11月8日起不断在夜间佯攻，奥斯曼军成为习惯，渐渐疏于防备。11月14日，全军发动攻击，攻克圣乔治外城。奥斯曼军退入内城固守，12月24日，城墙崩塌，守将杰希达自杀，攻克内城，威尼斯取回凯法利尼亚岛。战后西班牙舰队指挥回防西西里岛，阻止奥斯曼帝国的攻击。
1502年4月3日，贡萨洛搭乘威尼斯舰队，参加伊萨基岛的攻克战。6月18日，贡萨洛登陆伊庇鲁斯的塞斯普罗蒂亚，开始对奥斯曼帝国作战，为了虚张声势，下令全军大肆宣扬军队数目，大量释出假情报，惊吓奥斯曼军队。贡萨洛并不打算进行决战，只是将部队一分为三，四出抢掠，达到牵制效果。更命令士兵使用奥斯曼旗帜。奥斯曼军队因补给线被切断，从迈索隆吉翁北上搜捕贡萨洛军团。
9月11日，贡萨洛集合军队在纳奥什斯戈茨河北岸布阵，与五千奥斯曼军队隔河对恃，并在次日主动撤退，奥斯曼军渡河追赶包围，却被贡萨洛军反包围，以半包围阵势压迫奥斯曼军队，西班牙伏兵乘小舟顺流而下，焚毁奥斯曼渡船，以火绳枪和弓箭射击陆上奥斯曼军，奥斯曼军大败，士卒跳河逃生，被淹死和长矛刺死者众多。
10月12日，贡萨洛攻入特里卡拉，二万奥斯曼军前来援救，贡萨洛决定迎战，以三千人左右的模范军加上两千威尼斯军对战数量达四倍的奥斯曼军队。战前将领纳希卜以为贡萨洛军是一支分遣队，派人劝降贡萨洛，遭贡萨洛严词拒绝。贡萨洛连续几晚睡不着觉，四处骑马察看阵地，并下令部下赶工建筑防御工事。10月23日，奥斯曼军抵达，贡萨洛手下士卒大惧，甚至部分威尼斯军已投敌。10月24日贡萨洛激励士卒，是生是死就看能否撃败异教徒，天堂不对面对异教徒时贪生怕死的懦夫开放，他会站在最前线奋战作为表率。战争开始后，贡萨洛以三梯次的分遣队突袭奥斯曼左翼，并以骑兵攻打奥斯曼的火炮阵地，而西班牙主军左右翼第一排采火枪兵排射的方式，敌军接近时由长矛兵抵挡。奥斯曼左翼遭突破后，由威尼斯军填补战线，几乎被奥斯曼军全灭，主军四个长矛方阵往前压迫，骑兵夺得火炮阵地后下马操作火炮，射撃奥斯曼中军。经过一天战斗，奥斯曼军死伤近二千人，纳希卜下令退守。贡萨洛军亦伤亡惨重，模范军伤亡八百人，当晚从俘虏得知奥斯曼军队已经在达尔马提亚大败乌拉斯洛二世的匈牙利-波希米亚军队，判断不可能再战，决定撤退。贡萨洛军撤退时，不断回军攻击奥斯曼军追兵，因此奥斯曼军并无深入追赶，而是退回固守阵地。
10月28日，奥斯曼军才开始追赶贡萨洛军。11月2日，贡萨洛军在纳奥什斯戈茨河南岸布阵，迎战追赶而来的纳希卜军队，纳希卜军寻渡河点渡过，并架设浮桥，遭贡萨洛军在上游放下木筏撞毁，11月5日，贡萨洛再度弃阵地撤退，此时纳希卜率军渡河追赶，贡萨洛以同样方式包围奥斯曼军，杀了敌军主帅纳希卜，奥斯曼军由副将率领下朝贡萨洛军右翼突围，并打算迂回攻打贡萨洛军后方，因树林的影响，贡萨洛命令火枪兵虚张声势射击惊吓敌人，并由长矛兵呈菱形结阵。奥斯曼大军在树林被包围，与河岸友军分断，贡萨洛下令将滚木擂石推下河岸，河岸奥斯曼军崩溃，纷纷逃走。森林中的奥斯曼军则遭西班牙军包围撃破。
11月24日，贡萨洛在普雷韦扎抢劫十多艘船只出逃，并在12月8日参加攻陷科孚岛的战役。1503年1月8日，奥斯曼帝国攻陷维莱齐亚，威尼斯投降，战争结束。贡萨洛因为曾经大败奥斯曼军队而闻名欧洲。

那不勒斯战争

1499年，路易十二率军攻入意大利，支援威尼斯共和国、佛罗伦斯共和国、教皇国及瓦伦提诺公国对米兰公国、那不勒斯王国、比萨共和国和罗马涅伯国发动战争，是为第二次意大利战争。米兰公爵卢多维科·斯福尔扎坚决抵御法军攻击。米兰雇佣军将领吉安·贾科莫·特里武尔奇奥叛逃至法军，揭露了米兰军队的分裂和腐败，劝路易十二尽快进兵。米兰军将领接二连三叛变，在法军压倒性的军力下屈服。斯福尔扎因此连夜逃出米兰，并于1499年9月逃到蒂罗尔，受马克西米利安大帝庇护，之后斯福尔扎打算透过瑞士雇佣兵复国，独自出军攻击。1500年4月10日，路易十二在诺瓦拉战役以数倍兵力对米兰军取得压倒性胜利。斯福尔扎被俘，路易十二成为米兰公爵，称米兰公爵路易二世。
1500年，在平定北意大利后，路易十二开始打算南征那不勒斯，统一意大利。但由于阿拉贡国王费迪南德二世同样对王位有宣称权，为免爆发战争，因此双方在1500年10月10日签订1500年格拉纳达条约，双方联手瓜分那不勒斯王国。那不勒斯国王费代里戈提出将那不勒斯王国作为法国采邑，成为路易十二的附庸，但路易十二不理。费代里戈向堂叔父费迪南德二世求援，同样被忽视，因此在惊恐之下向奥斯曼帝国求援，费迪南德二世得知此消息下令在墨西拿的贡萨洛军北进，与路易十二军一同瓜分那不勒斯王国。贡萨洛在塔兰托之战中攻下塔兰托，占据了亚平宁半岛的最南端。费代里戈知道那不勒斯军不具有同时与法阿两军对战之实力，因此向路易十二投降，被封为安茹公爵，法国统治大半的意大利，更成为教廷监护。
1501年，法国和阿拉贡因亚平宁半岛南端之归属问题爆发冲突，因教皇调停而解除危机，交由路易十二统治，但费迪南德对周边岛屿如西西里、马耳他等的拥有权被确定，但双方关系从此急转直下。1502年12月11日，法军在巴列塔围困贡萨洛军，贡萨洛军由于在和奥斯曼军的战斗中伤亡惨重，不具有与法军正面对抗的实力，因此便一直固守。1503年2月，西班牙援军开始源源不断到达意大利，因贡萨洛之战功显赫，被推举为主帅。2月20日，西班牙大军反攻，因法军误判西班牙数量，打算笼城固守。2月23日，爆发鲁沃之战，法军大败。西班牙军开始反攻，1503年4月28日，西班牙军推进至切里尼奥拉，法军主帅内穆尔公爵吉斯的路易率军迎战，双方爆发切里尼奥拉战役。
西班牙军以长枪兵和火绳枪兵构成的西班牙大方阵为主力，1650名骑兵，13门火炮，以及2000剑兵。在一个小山丘上布阵，而他知道以骑兵为主的法军将会主动攻击，因此在阵地两翼各挖了半月形的壕沟。战斗开始时，法军步兵主动冲前，西班牙步兵马上伪退，形成一个凹角，2,000法军骑兵在主帅内穆尔公爵吉斯的路易带领下冲锋，却被壕沟和拒马所阻，被身后两个西班牙大方阵合拢后反包围，吉斯的路易身中三发子弹后阵亡。瑞士佣兵团的领袖查安迪鲁、和法军副帅阿盖尔分别接任法军主帅，此时西班牙军两门火炮竟炸膛，炸伤士兵数人。贡萨洛高呼此乃胜利的火光，下令部队欢呼，并命令炮兵弃用火炮改以冷兵器作战。由于西班牙长枪兵的超长枪比瑞士军的长矛和斧枪长十二公分以上，成菱形夹攻瑞士方阵，斧枪受限于攻击角度无法有效发挥威力，西班牙军将领科隆纳下令将火炮塞满火药后点燃推下山坡，炸开密集的瑞士方阵，瑞士军被炸后无法招架，纷纷溃散，被西班牙长枪兵所败。西班牙火绳枪手整列向法军齐射，法军大溃。贡萨洛下令全军尽出，法军据山脉死守，西班牙之远程火力不断投射，重骑兵从山腰绕入法军阵地，宣告法军的阵地被占。法军副帅阿盖尔向贡萨洛请求手下留情，但贡萨洛以史为证，期待阿塞尔像一名战士战斗为由拒绝，阿塞尔在战争中得以逃脱。西班牙军在不到一小时的战役中，杀害了四千法军，而自身伤亡仅100人左右，加上法国著名主帅吉斯的路易阵亡，令此战成为法国西欧霸权没落的标志之一。
5月1日，西班牙23,000大军分西中东三路挺进，分别攻打那不勒斯、贝内文托和坎波巴索，对法军连战连胜。5月16日，贡萨洛军攻陷那不勒斯，那不勒斯法军驻军总司令阿盖尔向贡萨洛投降，法军在三个月内的迅速溃败令全欧哗然。在米兰的法王路易十二听闻那不勒斯陷落后震怒，下令北部法军30,000人南下，收复那不勒斯全土，但路易十二自任最高统帅，将军队的指挥权掌握在自己手中。路易十二遥控战事，致使命令混乱。他也不像贡萨洛有指挥大规模军事行动的深厚经验，因此法军被装备精良、训练有素的西班牙军屡次撃败。1503年12月29日，贡萨洛在加利格里阿诺河追赶法军，在法军远程火力打撃下仍然从容渡河，中央突破法军，因侧翼被法军将领皮埃尔‧特拉鲁一人在桥上抵挡，为法军争取到逃跑时间。是为加利格里阿诺之战。战后，法军放弃与西班牙交锋，以加利格里阿诺为界，南北分治意大利。阿拉贡王费迪南多二世继任那不勒斯国王。而贡萨洛则成为那不勒斯全权总督，并封以王国八分之一的领地。

晚年

贡萨洛就任那不勒斯总督后，第一需处理的要事是教廷事务。由于法军据守意大利北部，而西班牙军据守南部，因此身在中部的教皇国对于双方势力起到了缓冲作用。第一是切萨雷·波吉亚的去向，贡萨洛不打算把波吉亚交给他的敌人，而是请求将波吉亚遣返西班牙，并予以礼遇。而其弟乔弗雷·波吉亚则成为西班牙与那不勒斯王国封臣，最终获儒略二世许可。同时，确认了教宗对意大利地区问题的仲裁权，并确立威尼斯、法国、西班牙和教皇国四势力瓜分意大利的局面。同时，他出资赞助未来的耶稣会创建人依纳爵·罗耀拉就学。1504年，与法国签订里昂条约，确立双方在比利牛斯和意大利的势力划分。1504年4月贡萨洛在那不勒斯修筑贡萨洛堡（后世称为大统帅堡），此堡直至1512年建成，但当时身在西班牙的贡萨洛没有看到。
1504年11月26日，伊莎贝拉一世去世，贡萨洛失去了他的庇护者，因此与费尔南多二世关系急剧恶化。1506年4月28日，神圣罗马帝国皇帝马克西米利安大帝之子费利佩一世率军登陆西班牙，开创了西班牙哈布斯堡王朝，瓦解了费迪南多二世的共主邦联。贡萨洛对费利佩表示拥戴，令费迪南多二世被迫让步回到阿拉贡，但与法国国王路易十二在布卢瓦城堡签订布卢瓦条约，联合对抗女婿费利佩。贡萨洛与费利佩约定，假使阿拉贡-法兰西同盟对卡斯蒂利亚和那不勒斯开战，他会支持费利佩，并攻打法军治下的北意大利。费迪南多二世尽力安抚贡萨洛，并使贡萨洛尽可能保持中立，与威尼斯再度合作，对抗哈布斯堡-波兰联盟。
1506年9月25日费利佩一世在布尔戈斯死于伤寒，战争因此并没有发生。因此费迪南多二世重新成为西班牙国王，但他对于贡萨洛在费利佩在位时的举动感到不满，质疑他涉嫌谋反和贪污，贡萨洛逐条上书反驳。最后费尔南多二世起诉他贪污罪，是为大统帅的账户事件，贡萨洛列出一张清单，说明他还算节省，当中最昂贵的三项支出为全欧最强的军队、那不勒斯的王冠和对某小国国王（费尔南多二世）的耐心。最终此故事成为西班牙谚语，讽刺人忘恩负义地吹毛求瑕。1507年3月，贡萨洛前往米兰出席路易十二举办之宴会，在路易十二和马克西米利安大帝的中介下，与费迪南多二世和解。1507年7月，贡萨洛被撤职，返回西班牙封地。
1509年10月曾短暂前往北方拜访兄长，后移至格拉纳达居住。并对西班牙参与康布雷同盟战争持批判态度，他认为只是一场浪费兵力及毫无意义的战争。晚年的贡萨洛过度挥霍，1511年，在巴尔托洛梅奥·哥伦布的来访后，对于大航海十分感兴趣，因此花钜资资助，但其对海外贸易的投资多数赔本，仅香料贸易赚取较多利润。贡萨洛由于不懂商业，将名下资产的投资事务都交由加里西亚商会统筹管理，因此他在1512年6月才没有因投资失利而破产。在1513年因为在西非黄金海岸的投资成功，贡萨洛成为大富豪。1515年12月2日，贡萨洛于格拉纳达死于疟疾，享寿62岁。死后获西班牙当局盛装厚葬，并让其爱马索维卡头颅陪葬在其棺木旁。一同葬于格拉纳达圣热罗尼莫修道院。

传奇

贡萨洛一生充满传奇故事，其二十岁前是个半文盲，几乎不识字，但他仅用了三年时间便能阅读书籍、写作文章。贡萨洛身为贵族，却讨厌贵族制度，贡萨洛认为贵族制不利于国家，让贵族世袭权位只会令不适任者当权损害国家，权位应能者居之。他自己身为大诸侯，却亲自上战场拼杀、训练士兵和下田务农，参与商业活动，在15世纪的西班牙贵族中别树一格。但他对于他的庞大领地，他不作太多管辖，都委任当地人为总督全权处理。贡萨洛治下军队军纪严明，不杀战俘和无辜平民，贡萨洛一生没有屠城记录，相比同时期之著名将领，贡萨洛可说是较为仁慈。贡萨洛以风流好色闻名，与不少女性俱有性关系，但均无法诞下子嗣，仅有一女埃尔维拉·费尔南德斯·德·科尔多瓦。但贡萨洛是一名称职的父亲，父兼母职教养女儿，其女埃尔维拉亦为人才，少女时继承贡萨洛遗留的领地，仍能驾驭父亲之众多部下和广阔采邑。
贡萨洛在军事上，终结了中世纪依赖征召兵的时代，令国家供养的近代化常备军时代来临。他创设的枪刺与射击的攻击方式，成为16世纪欧陆军队的主流战术。西班牙大方阵和火绳枪兵的大量运用，配搭轻骑兵和长管炮兵，使西班牙王国成为欧陆强军之一。贡萨格本人更是以倍数差距撃败法军和奥斯曼军，开启了西班牙霸权、民族国家近代化常备军、大方阵时代。贡萨洛身故一个世纪后，瑞典国王古斯塔夫二世·阿道夫、奥兰治亲王拿骚的毛里茨进行之军事改革，使线列时代来临，才结束了贡萨洛创立的战争体系。讽刺的是，一生反权威的贡萨洛，摧毁了教皇军、法国军队、瑞士佣兵等赫赫有名的军队，打败奥斯曼军队，但在死后却成为当时欧陆军事上独一无二的权威。
贡萨洛除了领军有方外，同时也是西班牙达斯提亚剑术的大师，在1507年的一场一手半剑比试中撃败当时米兰的剑术大师皮埃特罗·莫蒂。但在同一天的比赛中，亦败于法军第一勇将皮埃尔·特拉鲁手下。

军事思想

贡萨洛在16世纪的军事思想上有着莫大的影响，其中影响最大的有三：西班牙大方阵、民族国家常备军、火力压制。

西班牙大方阵

贡萨洛创立的西班牙大方阵，是第一个大量使用火绳枪的阵形及多兵种步兵方阵，一般的西班牙大方阵是由火绳枪兵、剑盾兵和长矛兵组成，各占方阵士兵总数的三分之一左右。在贡萨洛晚年，西班牙大方阵以层次论包括火炮、剑兵、弓兵、长矛兵和火枪兵。在草创期的西班牙大方阵，是空心的，直到贡萨洛在第二次奥斯曼-威尼斯战争后，改良了阵形，才变成了实心阵形。之后由于剑兵在白刃战的功能可以被替代，因此就改为佩剑火枪兵，而弓兵则在1520年代被淘汰。形成了火枪兵和长矛兵搭配火炮的阵形，由火枪兵站在四角，长矛方阵置中的配置。贡萨洛指挥下的西班牙大方阵是可以折叠成菱形，对传统密集方阵的打击面大。以长矛兵为主，辅以密集火力投射，令阻挡骑兵冲锋成为可能，而且由于受力点平均，不易在白刃战中被撃败。但随火枪和火炮的发展，西班牙大方阵显得过度密集，容易被集火攻击。加上掷弹兵和骑炮兵的出现，使得火力转移变得更为容易，令西班牙大方阵在移动速度和反应火力上皆逊色于线列步兵，在罗克鲁瓦战役大败于法军后，西班牙大方阵被淘汰。

民族国家常备军

在贡萨洛创立模范军前，已有耶尼切里军团和匈牙利黑军等常备军，但贡萨洛创建的西班牙常备军是以国家为中心，是一个说同一语言的军队、没有雇佣兵成员，士兵都是同乡，且都是同样编制，仅以出身地区名称和编号分辨士兵出处。士兵之间不论出身只论能力，颠覆了欧洲传统的军事观念，由基层步兵担任军队骨干，一个农兵可以透过训练靠一柄火枪撃杀贵族板甲骑士。另外军队必须由国家发饷，封建贵族不得干涉，令常备军成为国家军队，贵族不得再以军事力威胁王室，加强了中央集权制。此种常备军兵农分离，经常训练，但工资远比雇佣兵便宜。平常只负责驻守各地，由当地政府供养，在战时才集合出战。一般一个军团由3000至6000人不等。

火力压制

贡萨洛在接战前，研究出一套同时以多重火力攻击敌人的战法，以弓箭、火绳枪、火炮作出间隔性齐射，在尚未接战前先压制敌方攻势，再由矛兵和剑兵等近身作战的兵种配合推进。在16世纪前，大部分远程火力在敌人冲锋后都需要被迫接战，但是由于西班牙大方阵的特性，在敌军冲锋时，远程兵力可退至近战兵种后，并再度集结，在长矛阵中开枪，或是拉弓攻击敌人后部。火炮则用以轰击密集之敌人，在敌人靠近时开炮轰击，但由于16世纪的火炮常会炸膛，因此有时候反而会爆炸伤及友军，令方阵瓦解。