香港日本人學校

学童人数

该校的学生人数有1,556人，是日本领土以外最大的日本学校之一。在20世纪90年代，3所学校的人数总和约有2100人。在20世纪70年代，日本公司积极开展在亚洲的业务，有些则会在香港设立分公司。由于在香港工作的日籍员工家属可享有的福利，因此亦吸引日本人来港工作。因为大部分儿童会随父母海外移民而来港入学令学生迅速增加。由于2003年SARS的影响，香港日本人学校学生人数减少。而目前移民香港的日本人，其孩子大多都会随父母海外移民而来入学。
小学部分为两所学校—大埔校和香港校，住在香港岛学童会在香港校就读，九龙和新界的学童，原则上会就读大埔校，而香港人亦可就读。

香港校

香港校于1974年12月16日建立。校舍于2010年代初翻新，期间暂时搬到九龙清水湾道12号，2013年9月改装完成迁回开学。

大埔校

大埔校正推行的课程指引中包括文化、体育、科学等科目都是与日本其他普通学校相同，每星期亦有定时数量的国际英语会话班，由外籍导师任教。日本政府会派遣文部省学校的实习教师到海外的日本人学校（包括香港日本人学校），原则为期三年。除了这个以外，学校还会根据需要增加一位以英语为母语的英语会话班教师。
大埔校位于大埔公路近鹿茵山庄，但该处与市区有一定距离，而学童居住地方广泛，因此很多人都会使用校车上学。校车提供固定路线，在不同地区均设有校车站。

中学部

中学部于1982年8月11日创立，位于香港北角校园径9号。
因学生人数不足，中学部会于2018年3月底，搬到了小学部(香港校) 的校舍。