黄阁站

车站站厅

黄阁站站厅设于地上二层，设有售票机以及客服中心等基本车站设施，同时黄阁站还设有“好易”自助服务设施。
为方便乘客进出，站厅中心偏西处被划分为付费区，站厅收费区设有三台扶手电梯、一组楼梯和一台升降机供乘客前往岛式月台，同时还设有一台扶手电梯以及一组楼梯供乘客前往侧式月台。
另外，本站的公共洗手间设于站厅收费区的警务室旁。

车站月台

本站设有一个岛式及一个侧式月台，位于黄阁大道市南路口的西南侧地块的上空，但目前只使用岛式月台，侧式月台只会在非常特殊的情况下使用，大部分时间不对外开放。
另外，本站南端设有一组双存车线，当年黄阁站仍为4号线南端终点站时则使用该组存车线折返；本站北端则设有一条渡线。

利用状况

本站周围有不少村落，亦临近黄阁镇政府等机关单位，附近还有莲溪凤山公园以及黄阁体育公园，因此主要客流以来往上述地点的客流为主，早晚高峰客流较大。此外亦有乘客利用本站转乘公交来往沙仔岛等地。

历史

本站最早出现在2003年的方案中，当时本站仍为3号线的车站之一。后来局部修改的方案中成为4号线的一部分并延长至南沙，本站作为新出现的4号线的中途站之一，位置与现时基本一致。
随后本站随4号线二期工程在2004年4月25日批复可行性报告。
2006年12月30日，4号线二期首通段开通运营，本站正式启用，并作为当时4号线的南端总站。
2007年5月8日，四号线因应路线延长至金洲，再次暂停服务长达50天，进行全线联合调试。2007年6月28日，4号线恢复服务，延长至金洲站，同时增设蕉门站。至此4号线二期路段全线通车，本站由原来的南端终点站变成一个中途站。