群体遗传学

多样性的描述

性状由遗传和环境的交互作用决定。多样性的来源包括基因、环境和和两者的交互作用。照定义，只有可遗传的部分会影响生物演化，所以族群遗传学主要用等位基因的频率来表示生物多样性，并追踪其变化来了解一个性状的演化。一个种群中，某个性状的多样性源自遗传差异的比例，称为可遗传性（heritability）。

遗传漂变

当族群大小有限时，会因为单纯的概率造成基因频率的改变。可以用二项分布描述基因频率从一个值变为另一个值的概率。当族群大小是N时，等位基因有2N个，经一个世代后，族群中会有j个A基因的概率是：
因为0<q<1，族群大小（N）越小时，这个概率越高。
除了用二项分布配合马可夫链来计算，漂变也可以用一维布朗运动的扩散方程来描述。
因为模型都经过一定的简化，方程式中的N并不完全对应到真实世界的族群大小，而被称为有效族群大小。