序列法則

碳环

当遇到含有碳环的化合物时，必须要把他展开为树状（被作者称为分层图）。方法是从立体中心开始，走所有可能的路径，当在某条路径上，遇到一个该条路径已经走过的原子时，把该原子变成个虚拟的原子，以确保这树是有限的。同一个原子可能在该树上出现多次，有时是原本的，有时是虚拟的。

立体中心：R/S

当一个立体中心的四个基团都被给予了优先级之后，使该分子在空间中，拥有最低优先级的取代基是指远离观察者的（即位于虚形键上）一个。假设四个基团分别被标示为1（最高优先）到4（最低优先），那么从1到3所转的方向标记了该个立体中心。当1到2到3的方向是顺时钟时，我们标记它为R，若是逆时钟则为S。这些记号分别是由拉丁文的右(rectus)和左(sinister)来的。

双键：E/Z

对于烯类和那些具有双键的有机化合物，基团还是一样的被标记优先级，但在这里，重要的是双键两边的碳原子所接的基团中，优先级较高的那一个的相对位置。当两个优先级较高的基团在双键的同侧，即是顺的位置，即把这双键标记为Z。若在相对的位置，即标记为E。这些记号来分别自于德文的一起(zusammen)和相对(entgegen)。

多个标记

很重要的一点是，一个化合物中，可能会有许多的地方需要标记。举例来说，麻黄碱可以在(1R,2S)和(1S,2R)的形式存在。但(1R,2R)和(1S,2S)的组成也是存在的。基本上，有n个立体中心和双键，就会有2ⁿ个异构物，但有时候，有些异构物是不可能存在的，从而降低了可能存在的异构物数目。