Viết tiếp cho đoạn này - Messier ghi danh vào Đại học bang Michigan, theo bước chân của anh trai Mitch. Anh chơi cho Spartans trong bốn năm và là một đội tuyển All-Star đầu tiên của CCHA trong năm cuối năm 1991-92. Sau năm thứ hai của mình, Messier được New York Rangers lựa chọn trong dự thảo nhập NHL năm 1989
, thứ 118 tổng thể. Trong thời gian ở Spartans, một số đồng đội của anh bao gồm Rod Brind'Amour, Kip Miller, Jason Woolley, Bryan Smolinski và Rem Murray.