Viết tiếp cho đoạn này - Ở cấp độ quốc tế, Kovač đã chơi cho Croatia trong năm trận đấu vòng loại cho World Cup 2002 và ghi một bàn thắng trong chiến thắng 4 - 0 của Croatia trước San Marino. Tại giải đấu cuối cùng, anh xuất hiện với tư cách là cầu thủ bắt đầu trong cả ba trận đấu bảng trước khi Croatia bị loại khỏi giải đấu với vị trí thứ ba trong nhóm của họ. Ông cũng là một thường xuyên trong UEFA Euro 2004 vòng loại, làm cho bảy lần xuất hiện và ghi hai bàn thắng trong các trận đấu xa nhà, 1 <unk> 0 chiến thắng trước Estonia và bàn thắng mở màn trong chiến thắng 3 <unk> 0 của đội bóng trước Andorra. Anh cũng đã chơi toàn bộ ba trận đấu của đội tuyển Croatia tại giải đấu Euro 2004
ở Bồ Đào Nha và ghi bàn mở màn trong trận chung kết bảng chống lại Anh. Tuy nhiên, Croatia đã thua trận đấu 4-2 và một lần nữa bị loại khỏi giải đấu với tư cách là quốc gia đứng thứ ba trong nhóm của mình.