Viết tiếp cho đoạn này - Ước tính có khoảng 60.000 người Lithuania được tuyển vào Hồng quân. Trong năm 1940, trên cơ sở của Quân đội Lithuania bị giải tán, chính quyền Liên Xô đã tổ chức Quân đoàn Súng thủ Lãnh thổ thứ 29. Sự suy giảm chất lượng cuộc sống và điều kiện phục vụ, thuyết phục mạnh mẽ về tư tưởng cộng sản, gây ra sự bất mãn của các đơn vị quân sự mới được Liên Xô hóa. Chính quyền Liên Xô đã đáp trả bằng các cuộc đàn áp chống lại các sĩ quan Lithuania của Quân đoàn thứ 29, bắt giữ hơn 100 sĩ quan và binh sĩ và sau đó xử tử khoảng 20 người vào mùa thu năm 1940. Vào thời điểm đó, gần 3.200 sĩ quan và binh sĩ của Quân đoàn 29 được coi là "không đáng tin cậy về mặt chính trị". Do căng thẳng cao và sự bất mãn của binh lính, Trung đoàn kỵ binh 26 đã bị giải tán. Trong cuộc trục xuất tháng 6 năm 1941
Hơn 320 sĩ quan và binh sĩ của Quân đoàn 29 đã bị bắt và bị trục xuất đến các trại tập trung hoặc bị xử tử. Quân đoàn 29 sụp đổ với cuộc xâm lược của Đức vào Liên Xô: vào ngày 25-26 tháng 6, một cuộc nổi dậy nổ ra trong Sư đoàn súng trường 184 của nó. Sư đoàn khác của Quân đoàn 29, Sư đoàn súng trường 179 đã mất hầu hết binh lính của mình trong cuộc rút lui từ người Đức chủ yếu là do lính bỏ trốn. Tổng cộng có ít hơn 1.500 binh sĩ từ lực lượng ban đầu khoảng 12.000 người đã đến khu vực Pskov vào tháng 8 năm 1941. Vào nửa cuối năm 1942, hầu hết người Lithuania còn lại trong quân đội Liên Xô cũng như những người tị nạn chiến tranh nam từ Lithuania đã được tổ chức thành Sư đoàn súng trường 16 trong quá trình thành lập lần thứ hai. Sư đoàn súng trường thứ 16, mặc dù chính thức được gọi là "Lithuania" và chủ yếu được chỉ huy bởi các sĩ quan gốc Lithuania, bao gồm Adolfas Urbšas, có dân tộc rất hỗn hợp, với 1/4 số nhân viên của nó là người Do Thái và do đó là đội hình Do Thái lớn nhất của Quân đội Liên Xô. Một trò đùa phổ biến trong những năm đó nói rằng Sư đoàn 16 được gọi là Lithuania, bởi vì có 16 người Lithuania trong số các hàng ngũ của nó.