Viết tiếp cho đoạn này - Nhà sử học Nick Cullather đã viết rằng bằng cách lật đổ Árbenz, CIA cuối cùng đã làm suy yếu mục tiêu ban đầu của chính mình về một chính phủ Guatemala ổn định. Nhà sử học Stephen Streeter tuyên bố rằng trong khi Hoa Kỳ đạt được một số mục tiêu chiến lược nhất định bằng cách cài đặt Castillo Armas "thể phục" làm tổng thống, nó đã làm như vậy với chi phí của các tổ chức dân chủ của Guatemala. Ông nói thêm rằng, mặc dù Castillo Armas có thể đã thực hiện các vi phạm nhân quyền mà ông đã làm ngay cả khi không có sự hiện diện của Hoa Kỳ, Bộ Ngoại giao Hoa Kỳ đã chắc chắn hỗ trợ và hỗ trợ quá trình này. Việc đảo ngược các chính sách tiến bộ của các chính phủ dân sự trước đó đã dẫn đến một loạt các cuộc nổi dậy của phe cánh tả ở nông thôn bắt đầu từ năm 1960. Điều này đã gây ra cuộc nội chiến Guatemala
giữa chính phủ quân sự của Guatemala được Mỹ hậu thuẫn và những kẻ nổi dậy cánh tả, những người thường tự hào có một số lượng lớn trong số các công dân. Cuộc xung đột kéo dài từ năm 1960 đến năm 1996 đã dẫn đến cái chết của 200.000 thường dân. Mặc dù tội ác chống lại dân thường đã được thực hiện bởi cả hai bên, 93 phần trăm của những hành động tàn bạo như vậy đã được thực hiện bởi quân đội được Mỹ hậu thuẫn. Những vi phạm này bao gồm một chiến dịch diệt chủng đốt cháy đất chống lại dân số Maya bản địa trong những năm 1980. Các nhà sử học đã gán bạo lực của cuộc nội chiến cho cuộc đảo chính năm 1954 và "lỗi ám ảnh chống cộng sản" mà nó tạo ra.