Tuy nhiên, một số loại kháng sinh có liên quan đến một loạt các tác dụng phụ bất lợi từ nhẹ đến rất nghiêm trọng tùy thuộc vào loại kháng sinh được sử dụng, vi khuẩn được nhắm mục tiêu và bệnh nhân cá nhân. Các tác dụng phụ có thể phản ánh các đặc tính dược lý hoặc độc học của kháng sinh hoặc có thể liên quan đến quá mẫn cảm hoặc phản ứng dị ứng. Các tác dụng phụ từ sốt và buồn nôn đến các phản ứng dị ứng lớn, bao gồm viêm da quang và phản ứng dị ứng. Hình ảnh an toàn của các loại thuốc mới thường không được thiết lập cũng như đối với những loại có lịch sử sử sử dụng lâu dài. Các tác dụng phụ phổ biến - tiêu chảy, do sự rối loạn thành phần của các loài trong hệ sinh vật ruột, dẫn đến sự phát triển, ví dụ, quá mức, gây ra vi khuẩn Clostridium difficile.
viêm da quang và phản vệ