Viết tiếp cho đoạn này - Ngay sau trận chiến, ông kết hôn với con gái của một người Athen nổi tiếng, và sau đó các hoạt động của ông được liên kết chặt chẽ với thành phố đó cho đến khi ông chết. Sau khi Athens bị Ibrahim Pasha chiếm đóng vào tháng 6 năm 1826, Makriyannis đã giúp tổ chức việc bảo vệ Acropolis, và trở thành chỉ huy tạm thời của đồn trú sau cái chết của chỉ huy, Yannis Gouras. Ông đã xoay sở để đẩy lùi một cuộc tấn công dữ dội chống lại Odeon của Herodes Atticus vào ngày 7 tháng 10, và trong khi bảo vệ Acropolis, ông đã bị thương nặng ba lần, ở đầu và cổ. Những vết thương này làm ông đau khổ cho đến hết cuộc đời, nhưng chúng không ngăn cản ông tham gia vào giai đoạn cuối của cuộc chiến
.