Sau khi Massachusetts thứ 21 được chuyển đến Bắc Virginia vào tháng 7 năm 1862, trung đoàn cuối cùng trở thành một phần của Quân đội Potomac và tham gia vào một số trận chiến lớn nhất của chiến tranh bao gồm Second Bull Run, Antietam và Fredericksburg. Trung đoàn đã chịu tổn thất nặng nề nhất trong trận Chantilly.
vào ngày 1 tháng 9 năm 1862. Trong sự hỗn loạn của trận chiến, chiến đấu trong rừng rậm trong một cơn bão, Clark đã bị tách khỏi trung đoàn của mình và đi lang thang ở vùng nông thôn Virginia trong bốn ngày trước khi tìm thấy quân đội một lần nữa. Trong khi anh ta mất tích, anh ta đã bị liệt kê không chính xác là bị giết trong chiến dịch và một tờ báo Amherst đã in bài tang lễ của anh ta dưới tiêu đề, "Một anh hùng khác đã đi".