Vào ngày 16 tháng 9 năm 1939, nhà thờ bị đóng cửa bởi quân đội Đức
và lối đi truyền giáo được sử dụng làm kho của quân đội và cảnh sát Đức. Tòa nhà bị làm ô uế, thiết bị bị đánh cắp. Trong khi rút khỏi thành phố, các lực lượng Đức rút lui đã đốt cháy tòa nhà vào ngày 19 tháng 1 năm 1945, kéo dài ba ngày. Quân đội Liên Xô đang tiến vào đã bắn pháo vào nhà thờ, làm hư hại nghiêm trọng mái vòm và gây ra một đám cháy khác ở phần dân cư của gác mái.