Viết tiếp cho đoạn này - Vào tháng 8 năm 2005, anh trở lại Serie A với một chuyển nhượng đến Internazionale trên một hợp đồng bốn năm cho báo cáo € 16 triệu phí. Anh bắt đầu cuộc phiêu lưu Inter của mình bằng cách giành chiến thắng Supercoppa Italiana 2005
so với Juventus, bước vào phút 63 khi "Nerazzurri" giành chiến thắng trong thời gian mở rộng nhờ người chiến thắng của Verón. Sau đó vào ngày 13 tháng 9, anh đã ra mắt giải đấu cho đội bóng mới của mình vào ngày 21 tháng 9 bằng cách bắt đầu trong trận thắng 1-0 trước Chievo. Vào ngày 24 tháng 11, trong trận đấu vòng bảng Champions League với Petržalka, Samuel đã chơi trong một đội hình gồm 11 cầu thủ nước ngoài trên sân, với Luís Figo là người châu Âu duy nhất. Ông đã kết thúc mùa giải đầu tiên của mình tại Inter bằng cách ra sân 42 lần trong tất cả các giải đấu, với đội giành chức vô địch sau khi Juventus xuống hạng do dàn xếp trận đấu, và Coppa Italia bằng cách đánh bại Roma 4<unk>2 trên tổng số, với Samuel chơi ở cả hai trận chung kết, do đó hoàn thành một treble trong nước không lường trước.