Sử dụng các enzym xúc tác các phản ứng hóa học này sau đó có thể được tinh chế và động lực học của chúng và phản ứng với chất ức chế được điều tra. Một cách tiếp cận song song là xác định các phân tử nhỏ trong một mô hoặc mô tế bào; toàn bộ các phân tử này được gọi là hệ thống trao đổi chất. Nhìn chung, các nghiên cứu này cung cấp một cái nhìn tốt về cấu trúc và chức năng của các đường chuyển hóa đơn giản, nhưng không đủ khi áp dụng cho các hệ thống phức tạp hơn như hệ thống trao đổi chất của tế bào. Một ý tưởng đầy đủ về các mạng lưới trao đổi chất của các chất chuyển hóa trong các tế bào, xác định các con đường từ tiền chất đến các sản phẩm cuối cùng bằng cách xác định các chất trung gian và sản phẩm được gắn nhãn phóng xạ. Tuy nhiên, khi sử dụng một loạt các dữ liệu từ các nghiên cứu về mô hình hóa học và mô hình hóa học tổng thể có thể được sử dụng để tái cấu trúc các mô hình chuyển hóa phức tạp trong các tế bào và các mô hình sinh học tương tác giữa các tế bào và các tế bào, nó sẽ có thể đưa ra bất cứ điều gì từ các mô hình
động học và phản ứng của chúng đối với các chất ức chế được nghiên cứu