Viết tiếp tục cho đoạn này - Gowon gia nhập Quân đội Nigeria vào năm 1954, và nhận được ủy quyền của mình như là một trung úy thứ hai vào ngày 19 tháng 10 năm 1955, sinh nhật lần thứ 21. Ông được đào tạo tại Học viện Quân sự Hoàng gia Sandhurst, Vương quốc Anh (1955<unk>56), Cao đẳng Tham mưu, Camberley, Vương quốc Anh (1962) cũng như Cao đẳng Tham mưu chung, Latimer, 1965. Anh ấy đã từng tham gia chiến dịch ở Congo.
là một phần của Lực lượng gìn giữ hòa bình của Liên Hợp Quốc, cả trong năm 1960 và năm 1963. Ông được thăng cấp chỉ huy tiểu đoàn vào năm 1966, lúc đó ông vẫn còn là trung tá.