Vào mùa hè năm 1944 tại Phòng thí nghiệm Cold Spring Harbor, McClintock bắt đầu nghiên cứu có hệ thống về các cơ chế của các mô hình màu sắc khảm của hạt ngô và sự di truyền không ổn định của mô hình khảm này. Bà đã xác định hai vị trí di truyền thống thống trị và tương tác mới mà bà đặt tên là Phân ly (Ds) và Kích hoạt (Ac). Bà phát hiện ra rằng Phân ly không chỉ phân ly hoặc làm cho nhiễm sắc thể bị phá vỡ, nó cũng có nhiều ảnh hưởng đến các gen lân cận khi Kích hoạt cũng có mặt, bao gồm làm cho các đột biến ổn định nhất định không ổn định. Đầu năm 1948, bà đã khám phá ra điều đáng ngạc nhiên rằng cả hai Phân ly và Kích hoạt có thể đứng, hoặc vị trí, trên nhiễm sắc thể. Bà quan sát các hiệu ứng của sự chuyển đổi của Ac và Ds bằng cách thay đổi các mô hình màu sắc trong các hạt ngô trong các mô hình khớp khác nhau của hạt ngô, và điều khiển sự chuyển đổi này.
Bộ điều khiển áp suất