Cả Windows 98 và Windows 98 Phiên bản thứ hai đều có vấn đề chạy trên ổ cứng lớn hơn 32 GB và một số cài đặt Phoenix BIOS. Một bản cập nhật phần mềm đã khắc phục lỗi này. Ngoài ra, cho đến khi Windows XP với Service Pack 1, Windows không thể xử lý ổ cứng có kích thước lớn hơn 137 GB với các trình điều khiển mặc định, vì thiếu hỗ trợ Địa chỉ khối logic 48 bit. Trong khi Microsoft chưa bao giờ chính thức khắc phục vấn đề này, các bản vá không chính thức có sẵn để khắc phục lỗi này trong Windows 9x, mặc dù tác giả đã tuyên bố rằng tham nhũng dữ liệu có thể xảy ra và không đảm bảo rằng nó sẽ hoạt động đúng.
Các giải pháp và bản vá lỗi của bên thứ ba