Viết tiếp cho đoạn này - Được phân công lại cho Phi đội Phòng chặn Bắc Đại Tây Dương, tàu giám sát đến Beaufort, Bắc Carolina, cùng với tàu pháo có bánh xe bên, vào ngày 15 tháng 12 năm 1864, và tham gia vào các cuộc tấn công vào Fort Fisher, Bắc Carolina. Trong cuộc đụng độ đầu tiên vào ngày 24-25 tháng 12, "Canonicus" neo tại các phạm vi từ và bắn 144 viên đạn, Trung úy George Belknap tuyên bố đã hạ xuống hai khẩu pháo của Liên minh. Tàu đã bị tấn công bốn lần, nhưng không bị thương vong và không bị hư hại đáng kể. Vào ngày 13-15 tháng 1 năm 1865, trong cuộc tấn công thứ hai
, "Canonicus" đã bắn 279 quả đạn vào pháo đài, hầu hết trong ngày đầu tiên, một lần nữa tuyên bố đã thả hai khẩu súng. Nó đã bị tấn công ít nhất 38 lần nhưng chỉ bị hư hỏng nhẹ và ba thủy thủ bị thương. Lá cờ của con tàu đã bị bắn đi hai lần và được thay thế mỗi lần bởi Quartermaster Daniel D. Stevens. Stevens sau đó đã được trao Huân chương Danh dự cho hành động của mình.