Nếu cần sử dụng kháng sinh, nên sử dụng macrolide (như azithromycin) so với fluoroquinolone do tỷ lệ kháng kháng cao hơn. Viêm đại tràng giả, thường do sử dụng kháng sinh gây ra, được quản lý bằng cách ngưng tác nhân gây bệnh và điều trị bằng metronidazole hoặc vancomycin. Vi khuẩn và nguyên sinh có thể điều trị bao gồm Salmonella typhi, Shigella, và các loài Giardia. Trong những loài có Giardia hay Giardia entamoletica, khuyến cáo điều trị bằng histina và metronidazole. Tổ chức Y tế Thế giới (WHO) khuyến cáo sử dụng kháng sinh cho trẻ nhỏ có thể bị tiêu chảy máu và sốt. Hỏi
Viêm đại tràng giả màng