Viết tiếp cho đoạn này - Các mối quan tâm nghiên cứu của Tauxe bao gồm các bệnh đường ruột do vi khuẩn gây ra, dịch tễ học và phát sinh bệnh của các bệnh truyền nhiễm, hậu quả dịch tễ học và lâm sàng của trao đổi gen của vi khuẩn, sử dụng kháng sinh và kháng thuốc kháng sinh, và giảng dạy các phương pháp dịch tễ học. Ông đã tham gia hoặc giám sát nhiều cuộc điều tra dịch tễ học trong và ngoài nước trên toàn thế giới, đáng chú ý nhất là cuộc tấn công khủng bố sinh học Rajneeshee năm 1984
, sự bùng phát salmonellosis năm 2008 tại Hoa Kỳ, sự bùng phát bệnh tả Haiti 2010-2013, thành lập Pulsenet và dịch virus Ebola ở Tây Phi.