Viết tiếp cho đoạn này - Gregory IX đã lên kế hoạch cho một hội đồng chung cho lễ Phục sinh năm 1241 tại Rome. Otto, cùng với nhiều nhà thờ khác, bao gồm James của Pecorara, lên tàu tại Genoa đến Rome. Hạm đội Genoa bị hạm đội Pisa thân đế quốc chặn lại và bị đánh bại trong trận Giglio
vào ngày 3 tháng 5 năm 1241. Otto và James bị bắt và đưa đến Salerno trong Vương quốc Sicily. Otto được đối xử tốt hơn James, có lẽ vì ông được coi là có giá trị hơn trong các cuộc đàm phán.