Trong những người không đáp ứng với điều trị, nên xem xét nuôi cấy sputum, và nuôi cấy Mycobacterium tuberculosis nên được thực hiện ở những người bị ho mãn tính. Đánh giá vi sinh học cũng được chỉ định trong bệnh viêm phổi nặng, nghiện rượu, bệnh cạn phổi, ức chế miễn dịch, nhiễm HIV và lạm dụng rượu. Mặc dù nuôi cấy máu dương tính và nuôi cấy chất lỏng phổi xác định được chẩn đoán loại vi sinh vật liên quan, nhưng nuôi cấy sputum dương tính phải được giải thích cẩn thận về khả năng thuộc địa hóa đường hô hấp. Thử nghiệm các sinh vật cụ thể khác có thể được khuyến nghị trong các đợt bùng phát, vì lý do sức khỏe cộng đồng. Trong những người nhập viện vì bệnh máu trầm trọng, nuôi cấy sputum và nuôi cấy cả hai loại sputum được khuyến nghị, như viêm phổi Streptococcus Virens và viêm phổi Streptococcus Virens.
kháng nguyên cho Legionella và Streptococcus