Viết tiếp cho đoạn này - Vào đầu Chiến tranh Liên minh thứ hai vào năm 1799, ông là một sĩ quan ở Cộng hòa Cisalpine đóng vai trò là Aide de Camp (ADC) cho Jean Victor Marie Moreau, sau đó là Barthélemy Catherine Joubert trong chiến dịch ở Bắc Ý. Sau cái chết của Joubert tại trận Novi thảm khốc
Năm 1800, Balabio bỏ trốn cùng quân đội của mình và gia nhập lực lượng dưới sự chỉ huy của André Masséna, nổi bật với tư cách là ADC trong cuộc vây hãm Genova năm 1800, ông được thăng chức Đại tá.