Tuy nhiên, trong cuộc chinh phục của nhà Minh trong những thập kỷ sau đó, Sa hoàng Nga đã cố gắng giành lấy vùng đất phía bắc sông Amur. Cuộc chinh phục Siberia của Nga đã đi kèm với những vụ thảm sát do sự kháng cự của người bản địa đối với sự thực dân của người Cossack Nga, những người đã tàn bạo nghiền nát người bản địa. Trong tay những người như Vasilii Poyarkov năm 1645 và Yerofei Khabarov năm 1650 một số dân tộc như Daur đã bị người Nga tàn sát đến mức nó được coi là diệt chủng. Daurs ban đầu bỏ rơi làng của họ kể từ khi họ nghe nói về sự tàn bạo của người Nga lần đầu tiên Khabarov đến. Lần thứ hai ông đến, Daurs quyết định chiến đấu chống lại người Nga thay vì bị giết bởi súng Nga. Những người bản địa của vùng Amur đã bị tấn công bởi người Nga, những người được biết đến với cái tên "người râu đỏ". Người Cossack Nga được đặt tên là "luocha" (羅<unk>), sau khi quỷ được tìm thấy trong thần thoại Phật giáo, bởi người bản địa Amur vì sự tàn bạo của họ đối với người bộ lạc Amur, những người là đối tượng của nhà Thanh. Việc Nga cải đạo Kitô giáo Chính thống giáo cho các dân tộc bản địa dọc theo sông Amur được coi là một mối đe dọa của nhà Thanh. Điều này cuối cùng đã bị nhà Thanh bác bỏ trong các cuộc xung đột biên giới Trung Quốc-Nga
trong những năm 1680, dẫn đến Hiệp ước Nerchinsk năm 1689 đã trao đất cho Trung Quốc.