Viết tiếp cho đoạn này - Pérignon sau đó đã tham gia vào một vụ buôn lậu và bị xâm phạm bởi một phụ nữ trẻ là một điệp viên Hoàng gia. Năm 1798, ông được triệu hồi và chuyển lại Quân đội ở Liguria, nơi ông được giao chỉ huy cánh trái. Bị thương và bị quân đội Liên minh thứ hai bắt giữ trong Trận Novi
, ông trở về Pháp vào năm 1800.