Viết tiếp cho đoạn này - Dưới thời huấn luyện viên mới của Napoli Maurizio Sarri, Hamšík trở lại chơi như một tiền vệ trung tâm ở bên trái trong tiền vệ ba người của Napoli cho mùa giải 2015-16, mà ông mô tả là vai trò ưa thích của mình. Vào ngày 23 tháng 8 năm 2015, Hamšík đã ghi bàn mở màn trong trận thua 2-1 trước Sassuolo trong trận mở màn mùa giải Serie A
. Vào ngày 17 tháng 9, anh đã ghi bàn trong chiến thắng 5-0 trước Club Brugge trong vòng bảng của Europa League. Anh đã xuất hiện lần thứ 300 ở Serie A vào ngày 6 tháng 1 năm 2016, ghi bàn trong chiến thắng 2 x 1 trên sân nhà trước Torino. Trong trận đấu sau đó, vào ngày 10 tháng 1, anh đã xuất hiện lần thứ 300 ở Serie A cho Napoli trong chiến thắng 5-1 trên sân khách trước Frosinone, khi Napoli kết thúc nửa đầu mùa giải với tư cách là "vô địch mùa đông" không chính thức. Anh đánh dấu dịp này bằng cách ghi một bàn thắng, bàn thắng thứ 80 của anh ấy ở Serie A, tất cả đều được ghi với Napoli.