Ở Nhật Bản, các vấn đề sức khỏe được liệt kê là lý do chính cho việc tự tử. Rối loạn giấc ngủ như mất ngủ và ngưng thở khi ngủ là các yếu tố nguy cơ gây trầm cảm và tự tử. Trong một số trường hợp, các rối loạn giấc ngủ có thể là một yếu tố nguy cơ độc lập của trầm cảm. Một số tình trạng y tế khác có thể có các triệu chứng rối loạn tâm trạng, bao gồm suy giáp, bệnh hạch bạch cầu, khối u não, bệnh lupus và rối loạn luống máu. Một số tác dụng phụ của thuốc như steroid và bêta đã được điều chỉnh từ các bệnh trầm cảm và các loại thuốc tương tự.
lạm dụng rượu