Trong khi ở quần đảo, ông đã xác định đường Wallace, chạy qua quần đảo Spice phân chia động vật của quần đảo giữa một khu vực châu Á và một khu vực New Guinea / Úc. Câu hỏi chính của ông, về lý do tại sao động vật của các hòn đảo có khí hậu tương tự như vậy nên khác nhau, chỉ có thể được giải đáp bằng cách xem xét nguồn gốc của chúng. Năm 1876, ông đã viết The Geographical Distribution of Animals, vốn là tác phẩm tiêu chuẩn trong hơn nửa thế kỷ, và phần tiếp theo, Life Island, vào năm 1880.
Ernst Haeckel