Sau đó, ông tranh luận cho hành động khẳng định cho người Mã Lai tại trường y khoa. Trong khi ở trường đại học, ông đóng góp cho The Straits Times dưới bút danh "C.H.E. Det", và một tạp chí sinh viên, trong đó ông đã khăng khăng thúc đẩy các quyền của người Mã Lai, chẳng hạn như khôi phục tiếng Mã Lai như một ngôn ngữ chính thức. Trong khi thực hành như một bác sĩ ở Al Setor, Mahathir trở nên tích cực trong UMNO; vào thời điểm cuộc tổng tuyển cử đầu tiên cho tiểu bang Malaya độc lập năm 1959, ông là chủ tịch của đảng ở Kedah. Mặc dù nổi bật ở UMNO, Mahathir đã không phải là ứng cử viên cầm quyền trong cuộc bầu cử năm 1959, sau khi bất đồng với Thủ tướng Chính phủ người Mã Lai tại Đại học y tế. Tuy nhiên, ông đã bị loại bỏ khỏi vị trí chính phủ quốc gia sau cuộc bầu cử quốc gia Singapore năm 1964, ông đã bị tấn công mạnh mẽ bởi sự chậm trễ của chính phủ và chính phủ. Theo một cuộc biểu tình lớn, Mahathir đã từ chức như một ứng cử viên chính trị của Đảng Quốc gia Malaysia sau cuộc tranh chấp lớn với
Mahathir