Viết phần tiếp theo cho đoạn này - Vào ngày 20 tháng 1 năm 2007, sau khi Tổng thống Maaouya Ould Sid'Ahmed Taya bị lật đổ trong cuộc "cuộc đảo chính" quân sự tháng 8 năm 2005
, Boulkheir tuyên bố ứng cử của mình trong cuộc bầu cử tổng thống tháng 3 năm 2007. Trong cuộc bầu cử, được tổ chức vào ngày 11 tháng 3, ông đứng thứ tư, nhận được 9,79% phiếu bầu. Vào ngày 19 tháng 3, ông ủng hộ Sidi Ould Cheikh Abdallahi cho vòng hai, mặc dù thực tế là ông là một phần của Liên minh các lực lượng cho sự thay đổi dân chủ cùng với ứng cử viên vòng hai khác, Ahmed Ould Daddah. Abdallahi thắng cuộc bầu cử, và vào ngày 26 tháng 4 năm 2007, Boulkheir được bầu làm Chủ tịch Quốc hội, nhận được 91 phiếu từ 93 đại biểu hiện diện.