Viết tiếp cho đoạn này - Trước mùa giải 2016, Shibasaki đã đổi số áo từ hai mươi thành mười. Vào đầu mùa giải 2016, Shibasaki tiếp tục giành lại vị trí đội một cho đội, chơi ở vị trí tiền vệ trung tâm. Mãi đến ngày 10 tháng 4 năm 2016 khi anh ghi bàn thắng đầu tiên của mùa giải và sau đó thiết lập một bàn thắng cho Caio, người đã ghi hai bàn trong một trận đấu, trong chiến thắng 4-1 trước Sanfrecce Hiroshima. Một tháng sau đó vào ngày 29 tháng 5 năm 2016, Shibasaki đã lập bàn thắng đầu tiên của câu lạc bộ trong trận đấu và sau đó ghi bàn thắng thứ ba của câu lạc bộ trong trận đấu, trong chiến thắng 4 - 0 trước Ventforet Kofu. Sau đó, anh ghi hai bàn thắng trong suốt tháng 9, ghi bàn trước Kataller Toyama và Albirex Niigata. Tuy nhiên, Shibsaka bị chấn thương chân khiến anh phải ra ngoài trong một tháng. Sau khi câu lạc bộ đủ điều kiện để kết thúc vị trí thứ ba vào cuối giai đoạn thứ hai của J.League, anh không trở lại cho đến trận chung kết với Urawa Red Diamonds và chơi ở cả hai trận, khi Kashima Antlers hòa 2<unk>2 trên tổng số thông qua bàn thắng xa nhà, dẫn đến câu lạc bộ trở thành vô địch. Trong Giải vô địch bóng đá thế giới 2016
, Shibasaki bắt đầu cả ba trận đấu và giúp Kashima Antlers tiến bộ trong vòng loại trực tiếp đến trận chung kết. Anh trở nên nổi tiếng sau khi ghi hai bàn cho Kashima Antlers trong trận chung kết World Cup 2016 trước Real Madrid. Real Madrid cuối cùng sẽ giành chiến thắng trong trận đấu 4-2 mặc dù trong thời gian bổ sung, sau một cú hat-trick của Cristiano Ronaldo. Mặc dù thua trận chung kết, màn trình diễn của Shibasaki đã được giới truyền thông đánh giá cao, cả trong và ngoài Nhật Bản. Ngoài ra, anh được trao Quả bóng đồng Adidas tại giải đấu. Sau đó, Shibasaki đã giúp câu lạc bộ phục hồi sau thất bại, lập ra hai bàn thắng để đánh bại Yokohama F. Marinos để giúp Kashima Antlers lọt vào trận chung kết Cúp Hoàng đế. Anh đã giúp câu lạc bộ đánh bại Kawasaki Frontale 2<unk>1 để giành chiến thắng trong trận chung kết Cúp Hoàng đế. Vào cuối mùa giải 2016, anh tiếp tục ra sân bốn mươi sáu lần và ghi sáu bàn trong tất cả các cuộc thi.