Một số enzyme không cần các thành phần bổ sung để thể hiện hoạt động đầy đủ. Một số khác yêu cầu các phân tử không phải là protein được gọi là các đồng yếu tố được liên kết để hoạt động. Các đồng yếu tố có thể là chất vô cơ (ví dụ, ion kim loại và cụm sắt - lưu huỳnh) hoặc các hợp chất hữu cơ (ví dụ, flavin và heme). Các đồng yếu tố này phục vụ nhiều mục đích; ví dụ, các ion kim loại có thể giúp ổn định các loài nucleophilic trong vị trí hoạt động. Các đồng yếu tố hữu cơ có thể là các đồng enzyme, được giải phóng từ vị trí hoạt động của enzyme trong phản ứng, hoặc các nhóm giả, được liên kết chặt chẽ với một enzyme. Các nhóm giả hữu cơ có thể được liên kết covalently (ví dụ, trong các enzyme như carboxylase biotin). Một ví dụ về một enzyme có chứa một đồng yếu tố co-protein, được gọi là anhydrase và heme) hoặc các hợp chất hữu cơ (ví dụ, flavin và heme). Các đồng yếu tố này thường được phân loại là các enzyme có chứa
hợp chất hữu cơ