Viết phần tiếp theo cho đoạn này - Năm 1862, Schenck được giao chỉ huy trong Phi đội Phòng thủ Vịnh Tây. Schenck cũng chỉ huy hạm đội của Đô đốc David Dixon Porter trong các hoạt động chống lại Fort Fisher
, và đã được đề cập đến vì lòng dũng cảm trong báo cáo hành động của Đô đốc Porter. Sau đó, ông được thăng cấp phó đô đốc vào ngày 21 tháng 9 năm 1868, và nghỉ hưu vào ngày 11 tháng 6 năm 1869.