Viết tiếp cho đoạn này - Anh trai của Saladin, Al-Adil, đã xây dựng lại thành trì hoàn toàn giữa năm 1203 và 1216 để đáp ứng sự phát triển của trebuchet đối trọng. Sau cái chết của ông, các cuộc đấu tranh quyền lực nổ ra giữa các hoàng tử Ayyubid khác và mặc dù Damascus đã thay đổi tay nhiều lần, thành trì chỉ được chiếm bằng vũ lực một lần, vào năm 1239. Lâu đài vẫn nằm trong tay Ayyubid cho đến khi quân Mông Cổ dưới quyền tướng Kitbuqa chiếm Damascus vào năm 1260, do đó chấm dứt sự cai trị của Ayyubid ở Syria. Sau khi một cuộc nổi dậy không thành công nổ ra trong pháo đài, người Mông Cổ đã phá hủy hầu hết nó. Sau khi người Mông Cổ bị đánh bại vào năm 1260 bởi người Mamluk, người đã kế vị người Ayyubids làm vua của Ai Cập, Damascus nằm dưới quyền cai trị của người Mamluk. Ngoại trừ một thời gian ngắn vào năm 1300 và 1401, khi quân Mông Cổ chinh phục Damascus, người Mamluk kiểm soát thành trì cho đến năm 1516. Năm đó, Syria rơi vào tay Đế quốc Ottoman. Damascus đầu hàng mà không cần chiến đấu và từ thế kỷ 17 trở đi, pháo đài hoạt động như doanh trại cho các đơn vị bộ binh Ottoman. Lâu đài bắt đầu rơi vào tình trạng hư hỏng trong thế kỷ 19 và lần sử dụng quân sự cuối cùng của nó là vào năm 1925, khi binh sĩ Pháp bắn phá thành phố cổ từ pháo đài để đáp trả cuộc nổi dậy Syria vĩ đại
chống lại Pháp Mandate của Syria. Lâu đài tiếp tục phục vụ như một doanh trại và nhà tù cho đến năm 1986, khi các cuộc khai quật và phục hồi bắt đầu. Tính đến năm 2011, các nỗ lực khai quật và phục hồi vẫn đang tiếp diễn.