Sau những vị trí là Giám đốc trưởng của Nhà hát Opera Prague (1994<unk>95) và Giám đốc thường trực đầu tiên của Nhà hát Opera Leipzig (1996<unk>98), Wildner là Giám đốc âm nhạc chung của Neue Philharmonie Westfalen trong mười năm từ năm 1997. Ông đã là Giám đốc khách chính của dàn nhạc BBC Concert Orchestra ở London từ năm 2010 đến năm 2014. Năm 2014, ông trở thành giám đốc của lễ hội opera Áo Burg Gars in Gars Kamp am. Ông được bổ nhiệm làm Giáo sư chỉ huy âm nhạc tại Đại học Vienna có hiệu lực từ ngày 1 tháng 10 năm 2014. Từ năm 2019/2020, Johannes Wildner cũng sẽ là Giám đốc điều hành dàn nhạc giao hưởng Sønderjyllands ở Sønderborg (DK).
Năm 2010