Viết tiếp cho đoạn này - Khoa được chia thành các bộ phận Séc và Đức vào năm 1882, và Khoa Khoa học Tự nhiên trở thành một tổ chức riêng biệt giữa năm 1920-1939. Năm 1939, trường bị đóng cửa bởi các lực lượng chiếm đóng của Đức Quốc xã, và sau đó là cuộc bức hại tàn bạo giáo viên và học sinh. Sau khi chấm dứt sự chiếm đóng vào năm 1945, Khoa Nghệ thuật lại phát triển mạnh trong một vài năm; điều này đã bị chấm dứt cưỡng bức vào năm 1948 bởi cuộc đảo chính của Cộng sản vào năm 1948. Danh tiếng của khoa giảm nhanh chóng do sự ra đi cưỡng bức của nhiều giáo viên uy tín và sự ra đời của các nghiên cứu Marxist-Leninist. Trong những năm 1960, khoa dần dần bắt đầu mở cửa cho các nhà tư tưởng nổi bật của thời đại, nhưng xu hướng này đã bị đảo ngược bởi sự chiếm đóng của Liên Xô vào năm 1968, mà Jan Palach, một sinh viên của khoa, đã phản đối bằng cách tự thiêu mình. Sau khi chế độ Cộng sản kết thúc ở Tiệp Khắc
năm 1989, và sự ra đi của các đại diện của nó trong khoa, nó đã được tái thiết lập như là một trong những tổ chức đại học được đánh giá cao nhất của đất nước.