Viết tiếp cho đoạn này - Sau khi bị bỏ qua để thăng chức nhiều lần (để trợ lý giám đốc phụ trách an ninh quốc gia vào năm 1999 và đứng đầu văn phòng New York của FBI vào đầu năm 2000), O'Neill đã vui mừng được chỉ định làm chỉ huy của FBI điều tra về vụ đánh bom USS "Cole"
vào tháng 10 năm 2000. Tuy nhiên, khi đến Yemen, ông phàn nàn về an ninh không đầy đủ. Khi nhóm của ông điều tra, O'Neill đã xung đột với Barbara Bodine, đại sứ Hoa Kỳ tại Yemen. Hai người có quan điểm khác nhau về cách xử lý các cuộc khám xét tài sản của Yemen, và phỏng vấn với công dân và quan chức chính phủ, và họ chỉ phát triển xa nhau hơn khi thời gian trôi qua.