Viết tiếp cho đoạn này - Khan Mông Cổ cuối cùng là Ligden Khan vào đầu thế kỷ 17. Ông đã xung đột với người Mãn Châu về việc cướp bóc các thành phố Trung Quốc, và cũng làm xa lánh hầu hết các bộ lạc Mông Cổ. Ông qua đời năm 1634. Đến năm 1636, hầu hết các bộ lạc Mông Cổ nội địa đã đầu hàng người Mãn Châu, người thành lập triều đại Thanh. Người Khalkha cuối cùng đã chịu sự cai trị của nhà Thanh vào năm 1691, do đó đưa tất cả Mông Cổ ngày nay dưới sự cai trị của người Mãn Châu. Sau nhiều cuộc chiến tranh Dzungar<unk>Qing
, người Dzungars (Mông Cổ phương Tây hoặc Oirats) đã bị tiêu diệt hoàn toàn trong cuộc chinh phục của nhà Thanh của Dzungaria vào năm 1757-1758.