Viết tiếp cho đoạn này - Čech bắt đầu trong trận đấu đầu tiên của Chelsea trong mùa giải 2012-13, Community Shield 2012 chống lại Manchester City, nhưng không thể giữ sạch lưới khi Chelsea thua 3-2 trước bàn thắng của Yaya Touré, Carlos Tevez và Samir Nasri. Anh ấy cũng xuất hiện trong Super Cup UEFA cuối cùng
được chơi tại sân vận động Stade Louis II của Monaco, trong đó anh đã nhận được bốn bàn thắng khi Chelsea thua 4-1 trước Atlético Madrid, đội vô địch UEFA Europa League. Vào tháng 10 năm 2012, Čech đã lấy vòng tay của đội trưởng khi đội trưởng thường xuyên của Chelsea John Terry bị loại vì bị cấm bốn trận.