Một số loại vi khuẩn như Mycobacterium tuberculosis và Legionella pneumophila đến phổi thông qua các giọt khí bị ô nhiễm. Vi khuẩn cũng có thể lây lan qua máu. Một khi ở trong phổi, vi khuẩn có thể xâm nhập vào khoảng cách giữa các tế bào và giữa các tế bào phổi, nơi mà các tế bào đại thực bào và tế bào trung tính (tế bào máu trắng phòng thủ) cố gắng vô hiệu hóa vi khuẩn. Các tế bào trung tính cũng giải phóng các cytokine, gây ra sự kích hoạt tổng thể của hệ thống miễn dịch. Điều này dẫn đến sốt, mệt mỏi và mệt mỏi phổ biến. Vi khuẩn từ phổi, vi khuẩn từ các mạch máu xung quanh, vi khuẩn từ phổi và chất lỏng trung tính được nhìn thấy trong vùng phổi.
các tế bào đại thực bào và tế bào trung tính (tế bào bạch cầu phòng thủ) cố gắng vô hiệu hóa vi khuẩn