Viết tiếp cho đoạn này - Sau cuộc xâm lược chung của Đức và Liên Xô vào Ba Lan, bắt đầu Thế chiến II vào tháng 9 năm 1939, thị trấn bị Đức chiếm đóng
, đã tiến hành một chiến dịch diệt chủng chống lại người dân Ba Lan và người Do Thái địa phương. Chełmża là một trong những địa điểm xử tử người Ba Lan do Đức thực hiện vào năm 1939 như một phần của "Intelligenzaktion". Nhiều người Ba Lan địa phương, đặc biệt là giáo viên, cũng bị tàn sát trong khu rừng Barbarka ở Toruń ngày nay, cũng là một phần của "Intelligenzaktion". Nhà nước Đức vào thời điểm đó coi người Ba Lan và người Do Thái là "untermenschen" và lên kế hoạch loại bỏ họ như là các nhóm dân tộc. Để thoát khỏi số phận này, nhiều người Ba Lan địa phương đã tham gia nhóm III và IV của Volksliste. Đầu năm 1945, tại Chełmża, những người lao động cưỡng bức Ba Lan được sơ tán từ Jajkowo đã bị quân Đức cưỡng ép vào Tổ chức Todt, tuy nhiên, một số người đã trốn thoát. Do kết quả của việc tiêu diệt và đàn áp của Đức, dân số của thị trấn đã giảm xuống còn 10.000 người vào tháng 3 năm 1945.