Đôi khi các tế bào chuyển đổi của khối u biểu hiện các kháng nguyên không có trong hệ thống miễn dịch, và sự hiện diện của chúng khiến các tế bào miễn dịch tấn công các tế bào khối u chuyển đổi. Các kháng nguyên được biểu hiện bởi khối u có nhiều nguồn; một số được bắt nguồn từ các virus ung thư như human papillomavirus, gây ra bệnh cổ tử cung, trong khi những người khác là các protein của chính cơ thể xảy ra ở mức thấp trong các tế bào bình thường nhưng đạt mức cao trong các tế bào khối u. Một ví dụ là một enzyme gọi là tyrosincrase, khi được biểu hiện ở mức cao, biến các tế bào da nhất định (ví dụ
kháng nguyên