Viết tiếp cho đoạn này - Sau sự kiện đó, người bảo vệ nhân quyền của Guatemala, Ramiro de León Carpio, đã kế nhiệm làm tổng thống, theo hiến pháp. Ông bổ nhiệm Pérez làm trưởng phòng tổng thống, một vị trí mà ông giữ cho đến năm 1995. Được coi là một nhà lãnh đạo của phe quân đội Guatemala ủng hộ một giải pháp đàm phán của cuộc nội chiến Guatemala kéo dài 30 năm
, Pérez đại diện cho quân đội trong các cuộc đàm phán với lực lượng du kích. Họ đạt được Thỏa thuận Hòa bình năm 1996.