Tại sao các loài thực vật như Arabidopsis thaliana biểu hiện nhiều homolog dicer RNA hoạt động đặc biệt để phản ứng khác nhau khi thực vật tiếp xúc với các loại virus khác nhau. Ngay cả trước khi con đường RNAi được hiểu đầy đủ, người ta đã biết rằng làm im lặng gen trong thực vật có thể lây lan trong một hệ thống và có thể được chuyển từ cổ phiếu đến cây con thông qua ghép. Hiện tượng này kể từ đó đã được công nhận là một tính năng của hệ thống miễn dịch thích ứng của thực vật và cho phép toàn bộ thực vật phản ứng với một loại virus sau khi gặp phải một lần đầu tiên. Trong phản ứng, nhiều loài thực vật đã phát triển các cơ chế phức tạp để ức chế phản ứng RNAi. Những protein RNA như Arabidopsis thaliana biểu hiện nhiều homolog dicer RNA hoạt động với các loại virus RNA độc lập có chuỗi RNA nhỏ có thể phản ứng một cách khác nhau khi thực vật tiếp xúc với các loại virus khác nhau. Tuy nhiên, một số dữ liệu về sự tồn tại của các phân tử kháng RNA trong cơ thể của thực vật cũng có thể đóng vai trò quan trọng trong quá trình phản ứng miễn dịch của các tế bào và
ngăn chặn sự tự phát triển của các transposon