Trong y học, điều này góp phần vào sự lây lan của kháng kháng sinh, vì khi một vi khuẩn có được các gen kháng thuốc, nó có thể nhanh chóng chuyển chúng sang các loài khác. Chuyển gen theo chiều ngang từ vi khuẩn sang các sinh vật đơn vị vi sinh như nấm men Saccharomyces cerevisiae và hạt đậu adzuki weevil Callosobruchus chinensis đã xảy ra. Một ví dụ về việc chuyển gen quy mô lớn hơn là các sinh vật đơn vị vi sinh bdelloid eukaryotic, đã nhận được một loạt các gen từ nấm, vi khuẩn và thực vật. Các nấm cũng có thể mang DNA giữa các sinh vật, cho phép chuyển gen ngay cả trên các lĩnh vực sinh học. Chuyển gen theo chiều ngang cũng đã xảy ra giữa các vi khuẩn và các tế bào eukaryotic.
từ chuyển gen ngang giữa vi khuẩn và archaea