Allen sinh ngày 21 tháng 1 năm 1953, tại Seattle, Washington, là con của Kenneth Sam Allen và Edna Faye (née Gardner) Allen. Allen theo học tại Lakeside School, một trường tư ở Seattle, nơi anh kết bạn với Bill Gates, người trẻ hơn anh hai tuổi, người mà anh chia sẻ niềm đam mê với máy tính. Họ sử dụng thiết bị đầu cuối Teletype của Lakeside để phát triển kỹ năng lập trình của họ trên một số hệ thống máy tính chia sẻ thời gian. Họ cũng sử dụng phòng thí nghiệm của Khoa Khoa học Máy tính của Đại học Washington, làm nghiên cứu cá nhân và lập trình máy tính; ít nhất một lần vào năm 1971, họ đã bị cấm tham gia phòng thí nghiệm vì lạm dụng đặc quyền của họ ở đó. Theo Allen, trong những năm thiếu niên của họ, anh và Bill Gates sẽ đi lặn thùng rác vì mã máy tính.
Harvard