Viết một phần tiếp theo cho đoạn này - Vào ngày 21 tháng 6 năm 2016, Real Madrid đã thực hiện điều khoản mua lại của họ để ký lại Morata từ Juventus với giá 30 triệu euro. Sự xuất hiện cạnh tranh đầu tiên của anh là vào ngày 9 tháng 8, khi anh bắt đầu trong chiến thắng 3-2 trước đồng đội Tây Ban Nha Sevilla trong UEFA Super Cup 2016.
, được thay thế bởi Benzema sau 62 phút. Bàn thắng đầu tiên của anh ấy là trong chiến thắng 2-1 trên sân nhà trước Celta vào ngày 27 tháng 8.