Viết tiếp cho đoạn này - Cheptai bắt đầu tạo ra tác động ở cấp độ cao cấp trong mùa giải 2013, bắt đầu với vị trí thứ hai tại Cross Internacional de Itálica và vị trí thứ ba tại Cross Internacional Juan Muguerza. Vị trí thứ hai của Margaret Muriuki tại Giải vô địch băng quốc gia Kenya đã đưa đến sự lựa chọn của cô cho đội tuyển quốc gia cao cấp, và kết thúc thứ mười tại Giải vô địch băng quốc gia thế giới IAAF năm 2013
(mặc dù chỉ là người đứng thứ năm trong số các đội chiến thắng của Kenya). Cô đã thi đấu trên đường đua IAAF Diamond League lần đầu tiên vào năm đó và quản lý tốt nhất cá nhân của 8:56.20 phút và 14:50.99 phút cho 3000 m và 5000 m.