Viết tiếp cho đoạn này - Ông đã chiến đấu với các lực lượng Huguenot trong một vài năm; ông đã chiến đấu tại Trận Arques vào năm 1589. Cùng năm đó, Charles Emmanuel là thống đốc của Paris, khi các lực lượng Huguenot, do Henry của Navarre dẫn đầu bao vây Paris. Trong cuộc bao vây, vua Henry III của Pháp đã chết, và Henry của Navarre sớm tuyên bố mình là vua Henry IV của Pháp. Charles Emmanuel trốn thoát, và chiến đấu với vị vua mới được tuyên bố tại Ivry
vào năm 1590, đó là một mất mát quyết định cho Liên minh Công giáo. Cùng năm đó, ông chỉ huy các lực lượng Công giáo trong Cuộc vây hãm Paris, bảo vệ thành phố thành công.