Trong tháng 1 và tháng 2 năm 1554, cuộc nổi dậy của Wyatt bùng nổ; nó đã sớm bị đàn áp. Elizabeth đã bị đưa ra tòa án, và bị thẩm vấn về vai trò của cô, và vào ngày 18 tháng 3, cô đã bị bỏ tù tại Tháp Luân Đôn. Elizabeth nhiệt tình phản đối sự vô tội của cô. Mặc dù không có khả năng cô đã âm mưu với những kẻ nổi dậy, một số người được biết là đã tiếp cận cô. Người thân cận nhất của Mary, đại sứ Charles V, Simon Renard, lập luận rằng ngai vàng của cô sẽ không bao giờ an toàn trong khi Elizabeth còn sống; và Thủ tướng, Stephen Gardiner, đã cố gắng đưa Elizabeth ra xét xử. Những người ủng hộ Elizabeth trong chính phủ, bao gồm cả Lord Paget, đã thuyết phục Mary để tha thứ cho em gái của cô trong trường hợp không có bằng chứng cứng rắn chống lại cô. Thay vào đó, vào ngày 22 tháng 5, Elizabeth đã được chuyển từ Tháp Woodstock đến Tháp Crow, nơi cô đã bị giam gần một năm dưới sự giám sát của Sir Henry Bedingfield.
Tháp London