Viết tiếp cho đoạn này - Vào tháng 8 năm 1985, sau khi chơi hơn 150 trận cho Lincoln, Thompson chuyển đến Charlton Athletic. Trong trận đấu cuối cùng của mình cho Lincoln, ông đã chứng kiến một cơn ác mộng khi 56 khán giả đã bị giết trong một vụ hỏa hoạn khủng khiếp
trong khi chơi Bradford City. Ông trở thành đội trưởng của Charlton và dẫn dắt họ thăng hạng hạng nhất và trận chung kết Simod Cup.