Viết tiếp cho đoạn này - Conte đã được huấn luyện viên Juventus Giovanni Trapattoni ký hợp đồng vào năm 1991 (Conte đề cập đến Trapattoni là "cha thứ hai" của mình), ra mắt vào ngày 17 tháng 11 năm 1991 trước đối thủ Torino. Do màn trình diễn nhất quán, tốc độ làm việc, lãnh đạo và phong cách chơi kiên trì của mình, anh trở thành một nhân vật quan trọng với người hâm mộ của câu lạc bộ, và sau đó được đặt tên là đội trưởng của đội dưới thời Marcello Lippi vào năm 1996, sau khi đội trưởng trước đây của câu lạc bộ Gianluca Vialli rời đi, và trước khi Alessandro Del Piero được thăng chức vào vai trò này. Trong mùa giải 1998-1999, khi Del Piero bị chấn thương đầu gối nghiêm trọng, Conte trở lại đội trưởng, một vị trí mà anh duy trì cho đến mùa giải 2001-2002. Trong sự nghiệp chơi bóng của mình tại Juventus, Conte đã giành được năm danh hiệu Serie A, 1994-1995 Coppa Italia, 1992-1993 UEFA Cup và 1995-1996 UEFA Champions League, cũng như bốn danh hiệu Supercoppa Italiana, 1996 UEFA Super Cup, 1996 Intercontinental Cup
(ông đã bỏ lỡ do chấn thương) và UEFA Intertoto Cup 1999, giành được tất cả các danh hiệu câu lạc bộ cấp cao nhất có thể, ngoài UEFA Cup Winners 'Cup.