Trong những năm đầu của cuộc nội chiến, các doanh trại phía bắc được sử dụng để giữ các sĩ quan Liên minh bị bắt làm tù binh chiến tranh chờ chuyển đến các nhà tù Liên minh khác như Trại Johnson ở Ohio, Fort Delaware hoặc Fort Warren ở cảng Boston. Fort Columbus và Castle Williams cũng phục vụ như một trại tù binh chiến tranh tạm thời và bệnh viện giam giữ cho tù nhân Liên minh trong chiến tranh. Thiếu tướng William H. C. Whiting (CSA) qua đời vì bệnh tiêu chảy vào tháng 2 năm 1865 tại bệnh viện bưu điện ngay sau khi đầu hàng tại Trận Fort Fisher
Bắc Carolina. Anh ta là sĩ quan Liên minh cấp cao nhất chết như một tù binh chiến tranh.