Viết tiếp cho đoạn này - Ngoài việc hỗ trợ các cuộc chiến tranh ở Đất Thánh, hải quân đóng một vai trò quan trọng trong sự cạnh tranh của Genoa với Cộng hòa Pisa gần đó, cạnh tranh với Genoa để có ảnh hưởng ở Corsica và Sardinia. Các quốc gia hàng hải Ý thường săn lùng các tàu buôn của đối thủ của họ, và hải quân Genoa được biết đến là vừa đàn áp vừa tham gia vào thực tiễn này. Năm 1119, một phi đội Genoese đã tấn công một đoàn xe buôn Pisan, bắt đầu cuộc chiến tranh Genoese-Pisan đầu tiên. Cuộc chiến đầu tiên kết thúc không có kết quả, nhưng dẫn đến một thế kỷ đột kích và cướp biển khi cả hai thành phố chiến đấu cho Corsica và Sardinia. Vào những năm 1230, một cuộc chiến tranh không được tuyên bố thứ hai nổ ra giữa Genoa và Pisa như một phần của cuộc xung đột Guelphs-Ghibellines rộng lớn hơn. Hoàng đế La Mã Thánh đứng về phía Pisa khi chiến tranh nổ ra, buộc Genoa phải tìm các đồng minh ở nước ngoài. Cộng hòa đứng về phía Giáo hoàng (người lúc đó đang tranh chấp với Hoàng đế La Mã Thần thánh), và gửi một hạm đội để vận chuyển một đội quân Guelph đến Rome để thể hiện sự ủng hộ cho mục đích của giáo hoàng. Người Ghibelline phát hiện ra kế hoạch này và cùng với một hạm đội Pisan, đã đánh chặn hải quân Genoa trong Trận Giglio
năm 1241. Bị gánh nặng bởi hành khách và hành lý, hải quân Genoa đã mất 3 chiếc thuyền chìm và 27 chiếc bị bắt. Cuộc chiến thứ hai với Pisa kết thúc với một nền hòa bình trắng vào năm 1243.