Viết tiếp tục cho đoạn này - Vào ngày 4 tháng 11 năm 2012, Peralta đã ký hợp đồng hai năm, 6 triệu đô la, với các tùy chọn câu lạc bộ cho năm 2015 và 2016. Andrew Friedman, Phó chủ tịch điều hành của Rays về các hoạt động bóng chày nói về anh ấy vào thời điểm đó, "Chúng tôi yêu sự cạnh tranh của Joel và tác động của anh ấy đối với các pitcher trẻ hơn trong bullpen của chúng tôi". Anh đã có 80 lần xuất hiện trong sự nghiệp vào năm 2013, dẫn đầu Majors và thiết lập kỷ lục câu lạc bộ cho một tay phải và mùa giải xuất hiện thứ ba liên tiếp của mình. Anh ấy là 3-8 với 3.41 ERA. Anh ấy đã ném một hiệp không ghi bàn trong Trò chơi Thẻ hoang dã của Liên đoàn Mỹ năm 2013
trước Cleveland Indians và đã có hai lần ra sân không ghi bàn trong 2013 American League Division Series chống lại Boston Red Sox. Peralta xuất hiện trong 69 trận đấu vào năm 2014 và là 3-4 với ERA 4,41.