Trong quy định nội tại, con đường trao đổi chất tự điều chỉnh để đáp ứng với những thay đổi về mức độ của các chất nền hoặc các sản phẩm liên quan; ví dụ, giảm lượng sản phẩm có thể làm tăng lưu lượng thông qua con đường để bù đắp. Loại điều chỉnh này thường liên quan đến điều chỉnh các hoạt động của nhiều enzyme trong con đường. Kiểm soát ngoại tại liên quan đến một tế bào trong một sinh vật đa tế bào thay đổi sự trao đổi chất của nó để đáp ứng với tín hiệu từ các tế bào khác. Những tín hiệu này thường là dưới dạng các chất chuyển hóa hòa tan như hormone và yếu tố tăng trưởng và được phát hiện bởi các thụ thể cụ thể trên bề mặt tế bào. Các tín hiệu này sau đó được truyền vào bên trong tế bào bởi các chất chuyển tiếp thứ hai có liên quan đến sự hóa chất phosphory của protein. Một ví dụ được hiểu rõ về kiểm soát ngoại tại là việc điều chỉnh glucose thông qua con đường để bù đắp. Những loại điều chỉnh này thường liên quan đến việc điều chỉnh các hoạt động của nhiều enzyme trong con đường.
điều chỉnh tất phân của các hoạt động của nhiều enzyme trong con đường