Viện lịch sử là một trong những sứ mệnh Tây Ban Nha đầu tiên ở Texas, được xây dựng để giáo dục người da đỏ Mỹ địa phương sau khi họ cải sang Kitô giáo. Sứ mệnh đã bị thế tục hóa vào năm 1793 và sau đó bị bỏ rơi. Mười năm sau, nó đã trở thành một pháo đài chứa Đội bay thứ hai của đơn vị quân sự San Carlos de Parras, người có thể đã đặt tên cho nhiệm vụ Alamo. Trong cuộc Cách mạng Texas, Tướng Mexico Martín Perfecto de Cos đã đầu hàng pháo đài cho Quân đội Texian vào tháng 12 năm 1835, sau Cuộc vây hãm Béxar. Một số lượng tương đối nhỏ binh sĩ Texian sau đó chiếm đóng khu phức hợp trong vài tháng. Những người bảo vệ đã bị tiêu diệt trong trận Alamo
vào ngày 6 tháng 3 năm 1836. Khi Quân đội Mexico rút khỏi Texas vài tháng sau đó, họ đã phá hủy nhiều bức tường Alamo và đốt cháy một số tòa nhà.