Lesotho đã ra mắt Paralympic lần đầu tiên tại Thế vận hội Paralympic mùa hè 2000 ở Sydney, Úc. Họ đã tham gia mọi Thế vận hội Paralympic Mùa hè kể từ đó, làm cho Rio de Janeiro trở thành sự xuất hiện thứ năm của quốc gia tại một Paralympiad Mùa hè. Lesotho đã không giành được huy chương Paralympic trước phiên bản Rio de Janeiro. Thế vận hội Paralympic mùa hè 2016 được tổ chức từ ngày 7-18 tháng 9 năm 2016 với tổng số 4.328 vận động viên đại diện cho 159 Ủy ban Paralympic Quốc gia tham gia. Lesotho được đại diện bởi hai vận động viên
.