Madagascar lần đầu tiên thi đấu tại Paralympics tại Thế vận hội Paralympics mùa hè 2000 ở Sydney, Úc. Ngoại trừ Thế vận hội Paralympic mùa hè năm 2004, họ đã gửi một phái đoàn đến hầu hết các Thế vận hội Paralympic mùa hè kể từ đó, khiến Rio de Janeiro lần thứ tư tham gia Paralympiad mùa hè. Thế vận hội Paralympic mùa hè 2016 được tổ chức từ ngày 7-18 tháng 9 năm 2016 với tổng số 4.328 vận động viên đại diện cho 159 Ủy ban Paralympic Quốc gia (NPC) tham gia. Madagascar đã gửi một vận động viên đơn độc đến Rio de Janeiro
.