Viết tiếp cho đoạn này - Sanger đã được trao giải thưởng Weintal cho báo cáo ngoại giao năm 2004 cho việc tường thuật cuộc khủng hoảng Iraq và Triều Tiên. Ông cũng đã giành được giải thưởng Aldo Beckman cho việc bảo vệ chức vụ tổng thống. Trong cả hai năm 2003 và 2007, ông đã được trao giải Merriman Smith Memorial Award cho việc đưa tin về chiến lược an ninh quốc gia. Ông cũng đã chia sẻ giải thưởng hàng đầu của Hiệp hội biên tập viên báo chí Mỹ cho việc viết deadline vào năm 2004, cho đội bao gồm thảm họa Columbia. Năm 2007, "The New York Times" đã nhận được giải thưởng DuPont từ Trường báo chí Columbia cho "Nuclear Jihad
và thảm họa hạt nhân. Năm 2012, Sanger đã phá vỡ câu chuyện rằng Tổng thống Obama đầu nhiệm kỳ của mình đã bí mật ủy thác các cuộc tấn công mạng Stuxnet vào các cơ sở hạt nhân của Iran; báo cáo của ông đã được miêu tả trong bộ phim tài liệu "Zero Days" (2016).