Viết tiếp cho đoạn này - Trong năm cuối cùng của hợp đồng của mình trong mùa giải 2013-14, MacDonald đã được Islanders trao đổi với Philadelphia Flyers để đổi lấy cầu thủ giải đấu nhỏ Matt Mangene, một lượt chọn vòng hai trong bản nháp NHL năm 2015
, và một lựa chọn vòng thứ ba trong Dự thảo nhập NHL năm 2014 vào ngày 4 tháng 3 năm 2014. The Flyers đã ký hợp đồng với MacDonald trong sáu năm, 30 triệu đô la vào ngày 15 tháng 4. Vào ngày 5 tháng 10 năm 2015, Flyers đưa MacDonald vào miễn trừ. Vào ngày 6 tháng 10 năm 2015, MacDonald đã được miễn trừ và được giao cho đội liên kết AHL của Flyers, Lehigh Valley Phantoms.