Viết phần tiếp theo cho đoạn này - Trong c. 800, Abd al-Malik cũng được đặt làm gia sư cho con trai Harun là al-Qasim. Sự nổi bật và ảnh hưởng của ông trong quân đội khiến Harun không tin tưởng ông và năm 803 ông bị bắt và bị tống vào tù. Lý do thực sự vẫn chưa rõ ràng, mặc dù hầu hết các nguồn tin đều đồng ý rằng con trai của ông, Abd ar-Rahman, đã thông báo cho Caliph rằng ông bị cáo buộc đang lên kế hoạch lật đổ ông. Abd al-Malik vẫn bị cầm tù cho đến khi Harun qua đời sáu năm sau đó, khi Caliph al-Amin (r. 809<unk>813) đã thả anh ta. Sự kế nhiệm của Al-Amin đã bị tranh chấp
bởi người anh em cùng cha khác mẹ lớn tuổi của ông al-Ma'mun, và đã có bất ổn ở Syria. Abd al-Malik vẫn có ảnh hưởng đáng kể đối với quân đội biên giới, và do đó ông được bổ nhiệm làm thống đốc Syria và Thượng Mesopotamia và được giao nhiệm vụ bảo vệ các khu vực này cho al-Amin và huy động quân đội để đối đầu với al-Ma'mun. Tuy nhiên, ngay sau khi đến vị trí của mình tại Raqqa, Abd al-Malik bị bệnh và qua đời. Ngôi mộ của ông đã bị phá hủy vài năm sau đó bởi al-Ma'mun chiến thắng, được cho là vì Abd al-Malik đã thề sẽ không bao giờ chấp nhận sự cai trị của al-Ma'mun.