Viết tiếp cho đoạn này - "Pontoosuc" trở về New York vào ngày 30 tháng 8 năm 1864 và đảm nhận nhiệm vụ hộ tống. Đến giữa tháng 12, nó đã tiếp tục nhiệm vụ phong tỏa, ngoài khơi Wilmington. Vào ngày 24 và 25 tháng 12, nó tham gia vào cuộc tấn công vào pháo đài Fisher, quay trở lại pháo đài một lần nữa trong cuộc tấn công thành công giữa tháng 1 năm 1865.
. Vào tháng 2, nó di chuyển lên sông Cape Fear để thực hiện các hoạt động chống lại Fort Anderson. Sau sự sụp đổ của Wilmington, nó tiếp tục hành trình ngoài khơi bờ biển. Bảy thủy thủ của "Pontoosuc" đã nhận được Huân chương Danh dự cho hành động của họ trong chiến dịch này: Cabin Boy John Anglin, Coxswain Asa Betham, Boatswain's Mate Robert M. Blair, Captain of the Forecastle John P. Erickson, Landsman George W. McWilliams, Chief Quartermaster James W. Verney và Sailmaker's Mate Anthony Williams.