Viết tiếp cho đoạn này - Panis có tiềm năng cho một mùa giải lớn trong khi lái xe cho Alain Prost, người đã mua Ligier. Với lốp Bridgestone, anh ấy đã giành được vị trí đầu tiên của công ty lốp tại Brazil. Anh ta đã chạy thứ hai ở Argentina trước khi nghỉ hưu. Sau 6 cuộc đua, anh đứng thứ ba trong giải vô địch nhờ một lần nữa giành được vị trí thứ hai ở Tây Ban Nha. Một chiến thắng có thể đã có thể trong cuộc đua đó nếu anh ta không bị giữ lại để quay vòng lại trong bảy vòng, mất tổng cộng 6 giây cho nhà lãnh đạo Jacques Villeneuve. Tại Grand Prix Canada năm 1997, anh đã gãy cả hai chân trong một tai nạn tốc độ cao, khiến anh bỏ lỡ bảy cuộc đua tiếp theo của mùa giải. Vị trí của anh trong đội đã được Jarno Trulli, cho đến khi anh trở lại cho ba cuộc đua cuối cùng của mùa giải. Anh ấy đã đạt được vị trí thứ sáu tại Luxembourg
và dường như cho thấy rằng ông đã hoàn toàn phục hồi từ tai nạn của mình, khi ông lái xe cũng như ông đã làm trước khi tai nạn. Mặc dù bỏ lỡ một nửa năm, anh vẫn quản lý thứ 9 trong giải vô địch với 16 điểm.