Viết tiếp cho đoạn này - Hall là một trong bốn trưởng lão Covenanting, tại một hội đồng chiến tranh tại Shawhead Muir, vào ngày 18 tháng 6 năm 1679, đã được bổ nhiệm, với Cargill, Douglas, King và Barclay, để soạn một tuyên bố về "Nguyên nhân cơn thịnh nộ của Chúa chống lại Đất đai". Ông cũng là một trong những sĩ quan chỉ huy của quân đội Covenanters từ cuộc đụng độ tại Drumclog cho đến khi thất bại tại Bothwell Bridge
(Tháng 6 năm 1679). Lá cờ lụa màu xanh được mang trước mặt ông trong trận chiến thuộc sở hữu của một gia đình ở Moffat, Dumfriesshire. Vào ngày 25 tháng 6 năm 1679, hội đồng tư pháp Scotland đã ra lệnh tìm kiếm Hall nhưng ông đã trốn sang Hà Lan và trở về sau ba tháng.