تفاوت اساسی ویندوز و لینوکس برای سرور مجازی چیست ؟
لینوکس و ویندوز دو سیستم عامل کاملاً مجزا از هم می ‎باشند و از این رو در مقایسه دو سرور با دو سیستم عامل متفاوت، دنیایی از تمایزات و تفاوت ها به چشم خواهد خورد   
از نگاه پلتفرم، ساختار سیستم عامل، انواع و شکل نرم افزارهای قابل اجرا، امنیت، سرعت، کارآیی و… به صورت کاملاً فنی و تخصصی قابل بررسی می باشند که متأسفانه بررسی تخصصی این مسائل در این مطلب نمی‎گنجد و باید هر کدام را به شکل دقیق بر اساس نیاز فنی مشخص کرد ،  
اما همیشه یکی از تفاوتهای اساسی لینوکس و ویندوز در نوع کد منبع آنها بوده است ، لینوکس سیستم عاملی متن باز و خانواده windows سیستم عاملی تجاری با کد بسته است البته در گذر زمان نسخه‎هایی از لینوکس مانند cloudlinux منتشر شده که کاملاً تجاری بوده و یا توزیع هایی که برای دریافت پشتیبانی و یا آپدیت باید برای آنها عضویت تهیه کنید (مانند redhat) اما آنچه که در نگاهی عمده به این دو سیستم عامل به عنوان تفاوتی اساسی خودنمایی می کند بحث نیاز به لایسنس برای ونیدوز و رایگان بودن غالب سیستم عامل های لینوکس می باشد.   
البته مایکروسافت دز سالهای اخیر به متن باز روی آورده و در همین راستا گامهایی کوچک اما چشم گیر نیز برداشته است ،
از موارد قابل بحث برای انتخاب بهترین سیستم عامل برای سرور یا vps ، امنیت این دو سیستم عامل می باشد.  
البته بحث امنیت مطمئناً بسیار وسیع و غیر قابل بیان بصورت قاطع می باشد و هیچ گاه نمی‎توان به قطع و یقین مطرح کرد که امنیت در دنیای مجازی یا روی سرور به طور کاملفراهم شده است اما در قیاس نسبی می توان گفت سیستم عامل لینوکس با توجه به پشتیبانی از نرم‎افزارهای گوناگون منبع باز و جامعه بزرگ توسعه دهندگان کوچک و بزرگ شاید دارای امنیت بهتری از ویندوز باشد، و البته همین متن باز بودن می‎تواند بستر سوء استفاده از مشکلاتی که توسط یک فرد در کدهای متن باز یک سرویس یا هسته سیستم عامل تشخیص داده شده و توسط دیگر اعضای جمعه متن باز دیده نشده است را فراهم کند، از طرفی ویندوز به دلیل رابط گرافیکی و برخی نرم افزارهایی که احساس امنیت را القا می کنند می‎تواند کمتر جدی گرفته شده و ریسک خطرات احتمالی را افزایش دهد و از طرفی هم اگر bug در سیستم عامل وجود داشته باشد شاید تا سالها به دلیل بسته بودن کد هسته مخفی مانده و بتواند مورد سوء استفاده قرار بگیرد.