La Proclamación no se aplicó a los cinco estados esclavistas que no estaban en rebelión, ni a la mayoría de las regiones ya controladas por el ejército de la Unión; la emancipación allí vendría después de acciones estatales separadas y / o la ratificación de diciembre de 1865 de La Decimotercera Enmienda, que hizo que la esclavitud fuera ilegal en todos los lugares de los Estados Unidos.