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ヘパトウイルスAは、ピコルナウイルス目、ピコルナウイルス科、ヘパトウイルス属に属するウイルスの一種である。ヒトおよびその他の脊椎動物を自然宿主とする。

ヘパトウイルスには9つの仲間が認められている。これらの種はコウモリ、げっ歯類、ハリネズミ、トガリネズミに感染する。系統学的解析は、A型肝炎の起源がげっ歯類であることを示唆している[要出典]。

ヘパトウイルスBのメンバーウイルス（フォピウイルス）がアザラシから分離された。このウイルスは約1800年前にヘパトウイルスAと共通の祖先を共有していた[要出典]。

もう1つのヘパトウイルスであるMarmota himalayanaヘパトウイルスは、ウッドチャックのMarmota himalayanaから分離されている。このウイルスは、約1000年前に霊長類に感染した種と共通の祖先を持っていたようである[要出典]。

1つの血清型と7つの異なる遺伝子群（4つのヒト型と3つの類人猿型）が報告されている。ヒトの遺伝子型にはI～IIIの番号が付けられている。6つの亜型が報告されている（IA、IB、IIA、IIB、IIIA、IIIB）。シミアの遺伝子型はIV-VIと番号付けされている。ヒトから分離された遺伝子型VIIの単離株も報告されている。遺伝子型IIIはヒトとフクロザルの両方から分離されています。ヒトから分離された株はほとんどが遺伝子型I型である。

ゲノムの突然変異率は、1年に1部位あたり1.73-9.76×10-4塩基置換と推定されている。ヒト株は約3600年前にシミリアンから分岐したようである。遺伝子型IIIとIIIAの平均年齢はそれぞれ592年と202年と推定されている。
IIA、IB、IIA、IIB、IIIA、IIIB