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1877年、ペンシルベニア大学医学部に入学し、解剖学に興味を持つようになり、1882年、病的解剖のデモンストレーターからアノマリー賞を授与されて卒業。ペンシルベニア州ケンジントンのエピスコパル病院で研修医を務めた。その病院では婦人科は診療されていなかったので、彼は労働者街にある2階建ての家に自分のクリニックを開業し、そこにも住んだ。昼間は患者を診察し、夜は足の指に紐を結んでソファで眠り、紐が引っ張られるたびに起こされて診療にあたった。往診もした。その後、フィラデルフィアの篤志家女性グループからの資金援助で、ノリス・スクエアに手術室を備えた正式なクリニックを開設することができたが、この病院は後にケンジントン女性病院となり、アメリカで6番目の女性病院となった。そこで彼は、ストレス性尿失禁の治療法である「ケリー縫合」を考案し、フィラデルフィアで初めて帝王切開を成功させた。この時期、手術手技の革新者として名声を博した。

1886年から1888年にかけて、ケリーはイギリス、スコットランド、ドイツを訪れ、腹部外科医や骨盤外科医の仕事を見学した。1886年にライプチヒに滞在した際、マックス・ゼンガーから女性尿管の触診法を教わった。1888年にはベルリンで、病理学者ルドルフ・ヴィルヒョーとともに尿管カテーテルの最良の方法を研究した。その後、1888年にプラハで、チェコの医師パレル・パウリクから、鏡を使って尿管をカテーテル挿入する方法と、空気膀胱鏡検査の方法を教わった。1888年、彼はペンシルバニア大学に戻り、ウィリアム・オスラーの推薦で産科の助教授となった。
1.ペンシルベニア州ケンジントン
2.フィラデルフィア
3.ノリス・スクエア
4.アメリカ合衆国
5.イギリス
6.スコットランド
7.ドイツ
8.ライプツィヒ
9.ベルリン
10.プラハ