ホフスタッターによれば、『ゲーデル、エッシャー、バッハ』のテーマは何か？
本書のテーマをめぐる混乱に対し、ホフスタッターは、『ゲーデル、エッシャー、バッハ』は数学、芸術、音楽の関係についてではなく、認知が隠れた神経学的メカニズムからどのように生まれるかについて書かれていると強調した。本書の一節では、脳内の個々のニューロンがどのように協調し、首尾一貫した精神の統一感を生み出すかについて、アリのコロニーに見られる社会的組織に例えている。
ホフスタッターによれば、『ゲーデル、エッシャー、バッハ』の主要テーマは、隠れた神経学的メカニズムから認知がどのように生まれるかということである。