anchor.diff:    python3
     
   ################################################################################
  +##################### Add Container Labels #####################################
  +LABEL "Regtools_License"="MIT"
  +LABEL "Description"="Software package which integrate DNA-seq and RNA-seq data\
  +                     to help interpret mutations in a regulatory and splicing\
  +                     context."
  +
  +################################################################################
   ####################### Install R ##############################################
   
   # change working dir
  
positive.code: ################################################################################
  ##################### Add Container Labels #####################################
  LABEL "Regtools_License"="MIT"
  LABEL "Description"="Software package which integrate DNA-seq and RNA-seq data\
                       to help interpret mutations in a regulatory and splicing\
                       context."
  
  ################################################################################
  ##################### Set Inital Image to work from ############################
  
  
negative.code: ##################### Install Regtools #########################################
  
  # clone git repository
  RUN cd / && git clone https://github.com/griffithlab/regtools.git
  
  # make a build directory for regtools
  WORKDIR /regtools/
  
  
  # compile from source
  RUN mkdir build && cd build && cmake .. && make
  
  ################################################################################
  ###################### set environment path    #################################
  
  # add regtools executable to path
  ENV PATH="/regtools/build:/usr/local/bin/R-${r_version}:${PATH}"
  
  