anchor.diff:  LABEL "Description"="Software package which integrate DNA-seq and RNA-seq data\
                        to help interpret mutations in a regulatory and splicing\
                        context."
  -
  -################################################################################
  -##################### Install System Dependencies ##############################
  -RUN apt-get update -y && apt-get install -y \
  -    git \
  -    build-essential \
  -    cmake \
  -    zlib1g-dev
   
   ################################################################################
   ##################### Install Regtools #########################################
  
positive.code: ################################################################################
  ##################### Set Inital Image to work from ############################
  FROM ubuntu:16.04
  
  ################################################################################
  ##################### Add Container Labels #####################################
  
negative.code: 
  # add regtools executable to path
  ENV PATH="/regtools/build:${PATH}"
  
  ################################################################################
  ####################### Install R ##############################################
  
  # change working dir
  WORKDIR /usr/local/bin
  
  # install R
  RUN wget https://cran.r-project.org/src/base/R-3/R-${r_version}.tar.gz
  RUN tar -zxvf R-${r_version}.tar.gz
  WORKDIR /usr/local/bin/R-${r_version}
  RUN ./configure --prefix=/usr/local/ --with-x=no
  RUN make
  RUN make install
  
  # install R packages
  RUN R --vanilla -e 'install.packages(c("data.table", "sequenza", "plyr", "tidyverse"), repos = "http://cran.us.r-project.org")'
  
  #################################################################################
  ############################ Install Python #####################################
  