anchor.diff:  LABEL "Description"="Software package which integrate DNA-seq and RNA-seq data\
                        to help interpret mutations in a regulatory and splicing\
                        context."
  -
  -################################################################################
  -##################### Install System Dependencies ##############################
  -RUN apt-get update -y && apt-get install -y \
  -    git \
  -    build-essential \
  -    cmake \
  -    zlib1g-dev
   
   ################################################################################
   ##################### Install Regtools #########################################
  
positive.code: 
  # add regtools executable to path
  ENV PATH="/regtools/build:${PATH}"
  
negative.code: ################################################################################
  ##################### Set Inital Image to work from ############################
  
  # work from latest LTS ubuntu release
  FROM ubuntu:18.04
  
  # set variables
  ENV r_version 3.6.0
  
  # run update
  RUN apt-get update -y && apt-get install -y \
    gfortran \
    libreadline-dev \
    libpcre3-dev \
    libcurl4-openssl-dev \
    build-essential \
    zlib1g-dev \
    libbz2-dev \
    liblzma-dev \
    openjdk-8-jdk \
    wget \
    libssl-dev \
    libxml2-dev \
    libnss-sss \
    git \
    build-essential \
    cmake \
    python3
  
  ################################################################################
  ##################### Add Container Labels #####################################
  