b"\n_START_ARTICLE_\nMarcatura isobarica\n_START_PARAGRAPH_\nLa marcatura isobarica \xc3\xa8 una strategia di quantificazione proteica che sfrutta l'uso di uno spettrometro di massa. \xc3\x88 stata inventata dal Prof. Dr. Darryl Pappin, il cui lavoro \xc3\xa8 stato, poi, commercializzato, da Applied Biosystems col nome di iTRAQ. I peptidi o le proteine vengono marcate con vari gruppi chimici accomunati dall'essere isobari, ovvero dotati della medesima massa complessiva. Tuttavia una frammentazione condotta attraverso una spettrometria di massa tandem permette l'insorgenza di ioni provvisti di masse differenti che fungono da indicatori.\n_START_SECTION_\nProcedimento\n_START_PARAGRAPH_\nIn un esperimento di proteomica che sfrutta la metodologia bottom-up (a partire dai frammenti proteici ricostruisco la sequenza completa della proteina), viene sfruttata una proteasi (generalmente tripsina) per generare una frammentazione indotta del campione proteico. I frammenti vengono, dunque, marcati con l'etichetta isobarica, tipicamente sono marcatori che interagiscono con la regione ammino terminale dei peptidi. La reazione viene condotta attraverso l'uso di un gruppo N-idrossisuccinimmide (NHS), che pu\xc3\xb2 reagire con tre diversi gruppi funzionali amminoacidici. I campioni vengono, ora, mescolati in quantit\xc3\xa0 equivalenti e viene effettuata una corsa con una cromatografia liquida-spettrometria di massa._NEWLINE_Viene effettuata la frammentazione e saranno prodotti: ioni sequenza-specifici che aiuteranno a determinare la sequenza peptidica, e ioni etichette-reporter, la cui abbondanza rispecchier\xc3\xa0 la quantit\xc3\xa0 relativa dei peptidi nei campioni mescolati inizialmente.\n_START_SECTION_\nDisponibilit\xc3\xa0\n_START_PARAGRAPH_\nSono attualmente in commercio due tipologie di etichettatura isobarica: Etichette per la spettrometria tandem (tandem mass tags - TMT) ed etichette isobariche per la quantificazione relativa e assoluta (iTRAQ). I TMT sono disponibili in formato duplex, 6-plex e 10-plex, mentre l'iTRAQ \xc3\xa8 presente solo in formato 4-plex e 8-plex."