b'\n_START_ARTICLE_\nSecuenciaci\xc3\xb3n Ion Torrent\n_START_SECTION_\nHistoria\n_START_PARAGRAPH_\nFue desarrollada por Ion Torrent Systems Inc. y sali\xc3\xb3 al mercado en febrero de 2010. Ion Torrent patrocin\xc3\xb3 la m\xc3\xa1quina como un secuenciador r\xc3\xa1pido, compacto y econ\xc3\xb3mico que se puede utilizar en un gran n\xc3\xbamero de laboratorios como un aparato de mesa.\n_START_SECTION_\nTecnolog\xc3\xada Aplicada\n_START_PARAGRAPH_\nLa incorporaci\xc3\xb3n de desoxirribonucle\xc3\xb3tidos trifosforilados (dNTP) en el ADN en replicaci\xc3\xb3n implica la generaci\xc3\xb3n de un enlace covalente y la liberaci\xc3\xb3n de un pirofosfato y un prot\xc3\xb3n. El dNTP se incorpora exclusivamente en casos de complementariedad con el nucle\xc3\xb3tido de la cadena molde. Este principio es en el que se basa esta t\xc3\xa9cnica de secuenciaci\xc3\xb3n._NEWLINE_En primer lugar, se a\xc3\xadsla el ADN y se corta en fragmentos m\xc3\xa1s peque\xc3\xb1os, los cuales se unen a peque\xc3\xb1as bolas denominadas bead. Cada una de ellas, unidas con millones de fragmentos de ADN, entran en los micropocillos de un microchip. A continuaci\xc3\xb3n, se ba\xc3\xb1a el micro-chip con una soluci\xc3\xb3n de uno de los nucle\xc3\xb3tidos. Si el nucle\xc3\xb3tido se incorpora en la cadena de ADN, se libera un prot\xc3\xb3n, el cual es detectado por la base del pocillo, la cual act\xc3\xbaa como un mini-pHmetro (sensor i\xc3\xb3nico ISFET). Gracias a que cada l\xc3\xa1mina del microchip es semiconductora, se pueden detectar estos peque\xc3\xb1os cambio i\xc3\xb3nicos.\xe2\x80\x8bEste proceso se repite cada 15 segundos con una nueva soluci\xc3\xb3n de cada nucle\xc3\xb3tido, por lo que el micropocillo debe lavarse adecuadamente antes de a\xc3\xb1adir la siguiente soluci\xc3\xb3n para evitar interferencia que falseen los resultados._NEWLINE_Las se\xc3\xb1ales generadas en los pocillos se transmiten directamente a un ordenador, sin necesidad de ser procesadas durante la transferencia._NEWLINE_La exactitud que ha alcanzado el secuenciador en febrero de 2011 era de un 99.6% basada en lecturas de 50 bases, con 100Mb por cada ronda. La longitud de lectura en la misma fecha era de 100 pb. La exactitud para las repeticiones de homopol\xc3\xadmeros de 5 repeticiones de longitud era de 98%. Se debe tener en cuenta que dichas cifras no se han verificado independientemente fuera de la empresa Ion Torrent.\n_START_SECTION_\nVentajas y Limitaciones\n_START_PARAGRAPH_\nLa principal ventaja de este proceso es la velocidad de secuenciaci\xc3\xb3n, as\xc3\xad como los bajos costes de operaci\xc3\xb3n. Esto ha sido posible gracias a que no se utilizan nucle\xc3\xb3tidos modificados y a que la se\xc3\xb1al no es \xc3\xb3ptica._NEWLINE_Dado que el sistema registra las incorporaciones naturales de nucle\xc3\xb3tidos mediadas por polimerasa, la secuenciaci\xc3\xb3n ocurre a tiempo real. De hecho, la tasa de secuenciaci\xc3\xb3n est\xc3\xa1 limitada por el cambio de sustratos nucleot\xc3\xaddicos, es decir el tiempo requerido para el llenado y el posterior lavado de la soluci\xc3\xb3n en el microporo, adem\xc3\xa1s del tiempo que conlleva la polimerizaci\xc3\xb3n. Ion Torrent afirma que cada medida tarda 4 segundos y cada ronda de secuenciaci\xc3\xb3n aproximadamente una hora, tiempo en el que se secuencia entre 100-200 nucle\xc3\xb3tidos._NEWLINE_Asimismo, cuenta con una escalabilidad enorme, pues simplemente se basa en reacciones que ocurren en la naturaleza pero llevadas a cabo en microchips semiconductores. Adem\xc3\xa1s, el precio es considerablemente bajo, siendo de unos 50,000 USD hacerse con un equipo y de alrededor de 1,000 USD realizar una ronda de secuenciaci\xc3\xb3n. Seg\xc3\xban la ley de Moore las t\xc3\xa9cnicas de secuenciamiento g\xc3\xa9nico deben evolucionar exponencialmente hacia una mayor eficacia y un menor coste por cada base secuenciada, por lo que en poco tiempo el n\xc3\xbamero de lecturas por chip deber\xc3\xada incrementarse considerablemente.\xe2\x80\x8b_NEWLINE_No obstante, existen algunas limitaciones. Entre ellas sin duda la m\xc3\xa1s importante es la repetici\xc3\xb3n de varias bases iguales en la hebra molde. En este caso se a\xc3\xb1adir\xc3\xa1n m\xc3\xa1s dNTPs en el mismo momento, generando un cambio de pH m\xc3\xa1s pronunciado y como consecuencia una se\xc3\xb1al el\xc3\xa9ctrica m\xc3\xa1s grande, lo cual actualmente no se detecta con mucha precisi\xc3\xb3n. Otra limitaci\xc3\xb3n ser\xc3\xada la longitud de los fragmentos de ADN que se pretenden secuenciar, que no pueden pasar de las 400 pares de bases, bastante m\xc3\xa1s peque\xc3\xb1as comparadas con otras t\xc3\xa9cnicas como la secuenciaci\xc3\xb3n de Sanger o la pirosecuenciaci\xc3\xb3n. Adem\xc3\xa1s el rendimiento actualmente es m\xc3\xa1s bajo respecto al resto de t\xc3\xa9cnicas de secuenciamiento de pr\xc3\xb3xima generaci\xc3\xb3n, aunque la compa\xc3\xb1\xc3\xada est\xc3\xa1 poniendo esfuerzos en reducir este problema.\xe2\x80\x8b'