b'\n_START_ARTICLE_\nRed biol\xc3\xb3gica\n_START_SECTION_\nBiolog\xc3\xada de redes y bioinform\xc3\xa1tica\n_START_PARAGRAPH_\nLos sistemas biol\xc3\xb3gicos complejos pueden representarse analizarse como redes computables. Por ejemplo, los ecosistemas pueden modelarse como redes de especies o una prote\xc3\xadna puede ser modelada como una red de amino\xc3\xa1cidos. A su vez, los  amino\xc3\xa1cidos pueden representarse como una red de \xc3\xa1tomos conectados entre s\xc3\xad, como el carbono, el nitr\xc3\xb3geno y el ox\xc3\xadgeno. Los nodos y los enlaces son los componentes b\xc3\xa1sicos de una red. Los nodos representan unidades dentro de la red, mientras que los enlaces representan las interacciones entre las unidades. Los nodos pueden representar un gran rango de unidades biol\xc3\xb3gicas, desde individuos hasta neuronas. Dos propiedades importantes de una red son el grado y la  centralidad de intermediaci\xc3\xb3n (<<betweenness>>). El grado es el n\xc3\xbamero de enlaces que conectan a un nodo. La centralidad de intermediaci\xc3\xb3n es una medida de cu\xc3\xa1n central es un nodo dentro de una red.\xe2\x80\x8b Los nodos con una centralidad alta sirven como puentes entre diferentes partes de una red (por ejemplo, las interacciones deben pasar por este nodo para llegar a otras partes de la red). En redes sociales, los nodos con un grado alto o una centralidad alta pueden jugar un papel importante en la composici\xc3\xb3n total de la red._NEWLINE_Al comienzo de la d\xc3\xa9cada de 1980, investigadorxs comenzaron a visualizar el ADN o los genomas  como el dep\xc3\xb3sito din\xc3\xa1mico de un sistema de lenguaje con estados finitos computables, representado como una m\xc3\xa1quina de estado finito\xe2\x80\x8b. Nuevas investigaciones sobresistemas complejos tambi\xc3\xa9n han sugerido puntos de coincidencia en cuanto a la organizaci\xc3\xb3n de informaci\xc3\xb3n en problemas de biolog\xc3\xada, computaci\xc3\xb3n y f\xc3\xadsica, tal como el condensado de Bose-Einstein (un estado especial de la materia) ]]\xe2\x80\x8b. La bioinform\xc3\xa1tica ha ido cambiando su foco de genes, prote\xc3\xadnas y algoritmos de b\xc3\xbasqueda a redes de gran escala, com\xc3\xbanmente denotadas \xe2\x80\x93omas, como bioma, genoma, interactoma y proteoma. Tales estudios te\xc3\xb3ricos han revelado que las redes biol\xc3\xb3gicas comparten muchas propiedades con otras redes como la Internet o las redes sociales.\n_START_SECTION_\nRedes de interacci\xc3\xb3n prote\xc3\xadna-prote\xc3\xadna\n_START_PARAGRAPH_\nMuchas de las interacciones prote\xc3\xadna-prote\xc3\xadna (IPP) que ocurren dentro de una c\xc3\xa9lula forman redes de interacci\xc3\xb3n proteica (RIP) donde las prote\xc3\xadnas son nodos y las interacciones entre ellas son los enlaces.\xe2\x80\x8b Las RIPs son las redes que m\xc3\xa1s se estudian en biolog\xc3\xada. Existen una docena m\xc3\xa9todos de detecci\xc3\xb3n de IPP para identificar tales interacciones. La t\xc3\xa9cnica del doble h\xc3\xadbrido en levadura es una t\xc3\xa9cnica experimental com\xc3\xbanmente utilizada para el estudio de interacciones binarias.\xe2\x80\x8b Estudios recientes han evidenciado que las redes moleculares se conservan a lo largo de tiempos considerables, en t\xc3\xa9rminos evolutivos.\xe2\x80\x8b. Adem\xc3\xa1s, se ha descubierto que las prote\xc3\xadnas con alto grado de conectancia muestran una mayor probabilidad de ser esenciales para la supervivencia que prote\xc3\xadnas con menor grado\xe2\x80\x8b Esto sugiere que la composici\xc3\xb3n total de la red (y no simplemente las interacciones entre pares de prote\xc3\xadnas) es importante para el funcionamiento global de un organismo.\n_START_SECTION_\nRedes de regulaci\xc3\xb3n g\xc3\xa9nica (redes de interacci\xc3\xb3n ADN-prote\xc3\xadna)\n_START_PARAGRAPH_\nLa actividad de los genes es regulada por factores de transcripci\xc3\xb3n, prote\xc3\xadnas que se unen t\xc3\xadpicamente al ADN. La mayor\xc3\xada de los factores de transcripci\xc3\xb3n se unen a m\xc3\xbaltiples sitios de uni\xc3\xb3n de un genoma. Como resultado, todas las c\xc3\xa9lulas poseen una red compleja regulatoria. Por ejemplo, el genoma humano codifica para alrededor de 1400 factores de transcripci\xc3\xb3n que regulan la expresi\xc3\xb3n de m\xc3\xa1s de 20.000 genes humanos (11). Las tecnolog\xc3\xadas para estudiar redes de regulaci\xc3\xb3n g\xc3\xa9nica incluyen ChIP-chip, ChIP-seq y CliP-seq.\n_START_SECTION_\nRedes de co-expresi\xc3\xb3n g\xc3\xa9nica (redes de asociaci\xc3\xb3n transcripto-transcripto)\n_START_PARAGRAPH_\nEstas redes pueden interpretarse como redes de asociaci\xc3\xb3n entre variables que miden la abundancia de transcriptos. Proveen un an\xc3\xa1lisis de datos de microarreglos de ADN, datos ARN-seq, datos de miARN, etc. El an\xc3\xa1lisis de redes de co-expresi\xc3\xb3n g\xc3\xa9nica pondereadas es ampliamente usado para identificar m\xc3\xb3dulos de co-expresi\xc3\xb3n y genes <<hub>> intramodulares. Los m\xc3\xb3dulos de co-expresi\xc3\xb3n pueden corresponder a tipos o v\xc3\xadas celulares. Los <<hubs>> intramodulares que est\xc3\xa1n altamente conectados pueden interpretarse como representativos de su m\xc3\xb3dulo respectivo.\n_START_SECTION_\nRedes metab\xc3\xb3licas\n_START_PARAGRAPH_\nLos compuestos qu\xc3\xadmicos de una c\xc3\xa9lula est\xc3\xa1n conectados por reacciones qu\xc3\xadmicas que convierten un compuesto en otro. Las reacciones son catalizadas por enzimas. As\xc3\xad, todos los compuestos de una c\xc3\xa9lula son parte de una intricada red bioqu\xc3\xadmica de reacciones, llamada red metab\xc3\xb3lica. Es posible utilizar el an\xc3\xa1lisis de redes para inferir c\xc3\xb3mo la selecci\xc3\xb3n act\xc3\xbaa sobre las v\xc3\xadas metab\xc3\xb3licas.\n_START_SECTION_\nRedes de se\xc3\xb1alizaci\xc3\xb3n\n_START_PARAGRAPH_\nLas se\xc3\xb1ales son transducidas dentro de una c\xc3\xa9lula o entre c\xc3\xa9lulas, y as\xc3\xad forman redes complejas de se\xc3\xb1alizaci\xc3\xb3n. Por ejemplo, la v\xc3\xada MAPK/ERK es transducida desde la membrana celular al n\xc3\xbacleo a trav\xc3\xa9s de una serie de interacciones prote\xc3\xadna-prote\xc3\xadna, reacciones de fosforilaci\xc3\xb3n y otros eventos. Las redes de se\xc3\xb1alizaci\xc3\xb3n t\xc3\xadpicamente integran las redes de interacci\xc3\xb3n prote\xc3\xadna-prote\xc3\xadna, las redes de regulaci\xc3\xb3n g\xc3\xa9nica y las redes metab\xc3\xb3licas.\n_START_SECTION_\nRedes neuronales\n_START_PARAGRAPH_\nLas interacciones complejas que ocurren en el cerebro lo hacen un candidato perfecto para la aplicaci\xc3\xb3n de la teor\xc3\xada de redes. Las neuronas en el cerebro est\xc3\xa1n profundamente conectadas entre s\xc3\xad, lo cual resulta en una la presencia de redes complejas en los aspectos estructurales y funcionales del cerebro\xe2\x80\x8b. Por ejemplo, se han mostrado propiedades de redes de peque\xc3\xb1o mundo en conexiones entre \xc3\xa1reas corticales del cerebro de primates\xe2\x80\x8b o durante la degluci\xc3\xb3n en humanos\xe2\x80\x8b. Esto sugiere que las \xc3\xa1reas corticales del cerebro no est\xc3\xa1n directamente conectadas entre s\xc3\xad, sino que la mayor\xc3\xada de las \xc3\xa1reas pueden ser accedidas desde todas las otras a trav\xc3\xa9s de unas pocas interacciones.\n_START_SECTION_\nRedes tr\xc3\xb3ficas (redes alimentarias)\n_START_PARAGRAPH_\nTodos los organismos est\xc3\xa1n conectados a trav\xc3\xa9s de interacciones de alimentaci\xc3\xb3n. En otras palabras, si una especie se alimenta de o es consumida por otra especie, ambas est\xc3\xa1n conectadas entre s\xc3\xad, y pertenecen a una red intricada de interacciones predador-presa. La estabilidad de estas interacciones ha sido una pregunta clave en la disciplina de la ecolog\xc3\xada\xe2\x80\x8b Es decir, qu\xc3\xa9 ocurre con la red si se remueven ciertos individuos: \xc2\xbfse adapta o colapsa? El an\xc3\xa1lisis de redes puede ser utilizado para estudiar c\xc3\xb3mo la remoci\xc3\xb3n de especies influencia la red como un todo\xe2\x80\x8b. Esto es particularmente importante al considerar la potencial p\xc3\xa9rdida de especies debida al cambio clim\xc3\xa1tico global. Tambi\xc3\xa9n se puede explorar la estabilidad de la red tr\xc3\xb3fica y determinar si ciertas propiedades resultan en redes m\xc3\xa1s estables.\n_START_SECTION_\nRedes de interacci\xc3\xb3n entre especies\n_START_PARAGRAPH_\nEn biolog\xc3\xada, las interacciones de a pares han sido hist\xc3\xb3ricamente objeto de estudio intenso. Dados los avances recientes en ciencia de redes ha sido posible escalar este tipo de interacciones para incluir individuos de muchas especies en numerosos grupos de interacciones y comprender la estructura y funci\xc3\xb3n de redes ecol\xc3\xb3gicas mayores.\xe2\x80\x8b El uso del an\xc3\xa1lisis de redes permite el estudio de varios tipos de interacciones (de competitivas a cooperativas) utilizando el mismo marco\xe2\x80\x8b. Por ejemplo, las interacciones planta-polinizador son mutuamente beneficiosas y suelen incluir varias especies diferentes de plantas como de animales. Estas interacciones son cr\xc3\xadticas para la reproducci\xc3\xb3n de la planta y, a su vez, para la acumulaci\xc3\xb3n de recursos en la base de la cadena tr\xc3\xb3fica para consumidores primarios. No obstante, estas redes de interacciones se ven afectadas por presi\xc3\xb3n antr\xc3\xb3pica. El uso del an\xc3\xa1lisis de redes puede proveer informaci\xc3\xb3n clave para ejecutar acciones de conservaci\xc3\xb3n\xe2\x80\x8b. Dentro de las redes de polinizaci\xc3\xb3n, el anidamiento (debido a especialistas que interact\xc3\xbaan con un subconjunto de especies en comparaci\xc3\xb3n con especies generalistas), la redundancia (dado que las mayor\xc3\xada de las plantas son polinizadas por varios animales) y la modularidad juegan un rol importante en la estabilidad de la red\xe2\x80\x8b\xe2\x80\x8b. Estas propiedades pueden ayudar a minimizar el efecto de disturbios de car\xc3\xa1cter antr\xc3\xb3pico, a modo de amortiguador\xe2\x80\x8b. A modo m\xc3\xa1s general, la estructura de las interacciones entre especies dentro de una red ecol\xc3\xb3gica brinda informaci\xc3\xb3n sobre la diversidad, la riqueza y la robustez de un ecosistema o una comunidad.\xe2\x80\x8b Lxs investigadorxs incluso pueden comparar construcciones actuales de redes de interacci\xc3\xb3n de especies con aquellas reconstrucciones hist\xc3\xb3ricas para determinar c\xc3\xb3mo las redes han ido cambiando con el tiempo.\xe2\x80\x8b Las investigaciones m\xc3\xa1s recientes est\xc3\xa1n particularmente focalizadas en entender qu\xc3\xa9 propiedades favorecen la estabilidad de la red.\xe2\x80\x8b\n_START_SECTION_\nRedes de interacci\xc3\xb3n intra-especie\n_START_PARAGRAPH_\nEl an\xc3\xa1lisis de redes provee la capacidad de cuantificar asociaciones entre individuos, lo que posibilita hacer inferencias hacer de la red a nivel especie o poblaci\xc3\xb3n\xe2\x80\x8b. Les investigadores interesades en el comportamiento animal de diferentes taxones est\xc3\xa1n comenzando a incorporar este an\xc3\xa1lisis. Aquelles quienes estudian insectos sociales (abejas y hormigas, entre otros) lo utilizan para entender en profundidad la divisi\xc3\xb3n de trabajo, la asignaci\xc3\xb3n de tareas y la optimizaci\xc3\xb3n de la recolecci\xc3\xb3n dentro de las colonias\xe2\x80\x8b\xe2\x80\x8b\xe2\x80\x8b. Otres est\xc3\xa1n interesades en explicar c\xc3\xb3mo ciertas propiedades de redes a nivel grupo o poblaci\xc3\xb3n pueden explicar comportamientos a nivel individuo. Por ejemplo, un estudio sobre saltarines de cola de alambre (un ave paseriforme) encontr\xc3\xb3 que el grado de un macho predice la habilidad que tiene para escalar en la jerarqu\xc3\xada social\xe2\x80\x8b. Dentro de los \xe2\x80\x9cdelfines nariz de botella\xe2\x80\x9d, el grado y la centralidad de un individuo puede predecir la probabilidad de que exhiba ciertos comportamientos, obtenga m\xc3\xa1s informaci\xc3\xb3n y lidere grupos de viaje\xe2\x80\x8b._NEWLINE_El an\xc3\xa1lisis de redes tambi\xc3\xa9n puede ser utilizado para describir la organizaci\xc3\xb3n social de una manera m\xc3\xa1s general, lo cual revela importantes mecanismos pr\xc3\xb3ximos que promueven el uso de ciertas estrategias comportamentales. Estas descripciones est\xc3\xa1n frecuentemente asociadas a propiedades ecol\xc3\xb3gicas. Por ejemplo, el an\xc3\xa1lisis de red ha revelador diferentes sutiles en la din\xc3\xa1mica de grupos (fusi\xc3\xb3n-escici\xc3\xb3n) de dos especies de \xc3\xa9quidos, la cebra de Grevy y el onagro, que viven en ambientes cambiantes. Las cebras muestran preferencias en sus asociaciones cuando se dividen en grupos m\xc3\xa1s peque\xc3\xb1os, mientras que los onagros no lo hacen\xe2\x80\x8b. Tambi\xc3\xa9n se ha utilizado este an\xc3\xa1lisis para comparar organizaciones sociales de diferentes primates, lo que sugiere que las m\xc3\xa9tricas de redes pueden ser \xc3\xbatiles para explicar comportamientos sociales que se ven en ciertos grupos y no en otros\xe2\x80\x8b._NEWLINE_Finalmente, el an\xc3\xa1lisis de redes tambi\xc3\xa9n puede revelar importantes variaciones en el comportamiento de los animales de acuerdo con cambios en el ambiente. Por ejemplo, un estudio sobre babuinos hembras (Papio hamadryas ursinus) mostr\xc3\xb3 que existen cambios dram\xc3\xa1ticos en las relaciones de amistad frente a variaciones en el ambiente\xe2\x80\x8b. Los cambios ambientales tambi\xc3\xa9n pueden modificar caracter\xc3\xadsticas individuales consideradas parte de la \xe2\x80\x9cpersonalidad\xe2\x80\x9d del individuo. Por ejemplo, las ara\xc3\xb1as sociales que se agrupan con vecinas m\xc3\xa1s audaces tienen a intensificar ese aspecto de su personalidad.\xe2\x80\x8b El an\xc3\xa1lisis de redes sociales es una herramienta valiosa al momento de estudiar el comportamiento animal y la ecolog\xc3\xada social de todas las especies.'