b"\n_START_ARTICLE_\nMarcador de secuencia expresada\n_START_PARAGRAPH_\nUn marcador de secuencia expresada o EST (acr\xc3\xb3nimo del ingl\xc3\xa9s expressed sequence tag) es una peque\xc3\xb1a subsecuencia de una secuencia nucleot\xc3\xaddica transcrita (codificante de una prote\xc3\xadna o no). Se pueden usar para identificar genes que se transcriben y en el descubrimiento de genes, y para determinaci\xc3\xb3n de secuencias.\xe2\x80\x8b La identificaci\xc3\xb3n de los EST ha progresado r\xc3\xa1pidamente, con aproximadamente 52 millones de ESTs disponibles en las bases p\xc3\xbablicas (por ejemplo GenBank mayo de 2008, todas las especies).\xe2\x80\x8b_NEWLINE_Los EST son producidos por una ejecuci\xc3\xb3n de secuenciaci\xc3\xb3n sobre un ARNm clonado (por ejemplo secuenciando varios cientos de pares de bases de un extremo de un clon de ADNc tomado de una biblioteca de ADNc).\xe2\x80\x8b La secuencia resultante es un fragmento de baja calidad, generalmente de 500 a 800 nucle\xc3\xb3tidos, que es la longitud de secuenciaci\xc3\xb3n de los secuenciadores autom\xc3\xa1ticos m\xc3\xa1s habituales. Como esos clones consisten en ADN, que es complementario al ARNm, los EST representan porciones de genes expresados.\xe2\x80\x8b Se puede presentar en las bases de datos tanto como secuencia de ADNc/ARNm o complemento reverso de ARNm, la cadena molde. Es necesario crear un clon de ADN, por que es m\xc3\xa1s estable, de tal forma que representa solo una secuencia expresada del ADN.\xe2\x80\x8b_NEWLINE_Las ESTs (Expressed sequence tags o bien en espa\xc3\xb1ol, marcadores de secuencias expresadas) son potentes herramientas al reducir el tiempo para identificar la ubicaci\xc3\xb3n de un gen determinado dentro del genoma, los cient\xc3\xadficos han demostrado mediante la utilizaci\xc3\xb3n de las ESTs se podido aislar de manera r\xc3\xa1pida los genes que causan la enfermedad de Alzheimer y el c\xc3\xa1ncer de colon.\xe2\x80\x8b_NEWLINE_Las EST pueden asignarse a ubicaciones espec\xc3\xadficas del cromosoma utilizando t\xc3\xa9cnicas de mapeo f\xc3\xadsico, tales como el mapeo h\xc3\xadbrido por radiaci\xc3\xb3n o la hibridaci\xc3\xb3n fluorescente in situ (FISH).\xe2\x80\x8b Por otra parte, si el genoma del organismo del cual se obtuvo la EST se ha secuenciado se pueden alinear las secuencias EST con este genoma. El entendimiento actual de los genes del genoma humano (2006) incluye la existencia de miles de genes basados solamente en evidencia de EST.\xe2\x80\x8b_NEWLINE_En este sentido, las EST se convierten en un instrumento para afinar la transcripciones predichas de esos genes, lo que lleva a la predicci\xc3\xb3n de sus productos proteicos, y finalmente, de su funci\xc3\xb3n.\xe2\x80\x8b Adem\xc3\xa1s, la situaci\xc3\xb3n en la que se obtienen los EST (tejido, \xc3\xb3rgano, estado de enfermedad \xe2\x80\x94por ejemplo, c\xc3\xa1ncer\xe2\x80\x94) proporciona informaci\xc3\xb3n sobre las condiciones en las que el gen correspondiente est\xc3\xa1 actuando. Los EST contienen suficiente informaci\xc3\xb3n para permitir el dise\xc3\xb1o de sondas precisas para chips de ADN que luego se pueden utilizar para determinar la expresi\xc3\xb3n de genes.\xe2\x80\x8b_NEWLINE_Algunos autores usan el t\xc3\xa9rmino \xc2\xabEST\xc2\xbb para describir genes de los que no se tiene mucha informaci\xc3\xb3n.\xe2\x80\x8b\n_START_SECTION_\n\xc2\xbfQue es dbEST?\n_START_PARAGRAPH_\ndbEST es una divisi\xc3\xb3n de GenBank creada en 1992, que contiene la secuencia de datos y la informaci\xc3\xb3n de secuencias de cDNA llamado tambi\xc3\xa9n \xc2\xabUn solo paso\xc2\xbb o \xc2\xabetiquetadas de secuencia expresada\xc2\xbb a partir de una serie de organismos. Como GenBank, los datos en la dbEST son enviados por lo laborarios del mundo y no est\xc3\xa1 curada (corregida.)\xe2\x80\x8b_NEWLINE_Uno de los objetivos de las bases de datos de EST es organizar y consolidar los datos de EST en gran medida redundantes, para mejorar la calidad de la informaci\xc3\xb3n de secuencias y que los datos puedan ser utilizados para extraer el ADNc de longitud completa.\xe2\x80\x8b_NEWLINE_Es uno de los enfoques de alto rendimiento es la secuenciaci\xc3\xb3n de etiquetas de secuencias expresadas. Son secuencias cortas obtenidas a partir de clones de ADN complementario y sirven como identificadores cortos de genes, t\xc3\xadpicamente est\xc3\xa1n en el rango de 200 a 400 nucle\xc3\xb3tidos de longitud obtenidos a partir de ya sea el extremo 5\xe2\x80\x99 o 3\xe2\x80\x99 de los insertos de ADNc.\xe2\x80\x8b_NEWLINE_En la mayor\xc3\xada de los proyectos de EST han desarrollan un elevadp n\xc3\xbamero de secuencias, estos se presentan GenBank y dbEST.\xe2\x80\x8b_NEWLINE_dbEST adem\xc3\xa1s incluye secuencias que son m\xc3\xa1s largas que las tecnolog\xc3\xadas ecol\xc3\xb3gicas tradicionales, o se producen como secuencias individuales o en peque\xc3\xb1os lotes. Entre estas secuencias son productos de los experimentos de presentaci\xc3\xb3n diferencial y experimentos RACE.\xe2\x80\x8b Si una secuencia se caracteriza m\xc3\xa1s tarde y anotado con caracter\xc3\xadsticas biol\xc3\xb3gicas tales como una regi\xc3\xb3n codificante, 5'UTR, 3'UTR o, debe ser presentada a trav\xc3\xa9s del procedimiento de GenBank presentaciones regulares (a trav\xc3\xa9s de Bankit o de lentejuelas), incluso si una parte de la secuencia es ya en dbEST.\xe2\x80\x8b_NEWLINE_Los datos de EST son capaces de proporcionar una estimaci\xc3\xb3n aproximada de los genes que se expresan de forma activa en un genoma bajo una condici\xc3\xb3n fisiol\xc3\xb3gica en particular.\xe2\x80\x8b Las secuencias EST suelen ser de baja calidad, ya que se generan de forma autom\xc3\xa1tica y sin verificaci\xc3\xb3n; y por lo tanto contienen altos porcentajes de errores. Muchas bases son determinadas como ambiguas y representadas por N._NEWLINE_Otro problema de las EST es la presencia de clones quim\xc3\xa9ricos debido a artefactos de clonaci\xc3\xb3n en la construcci\xc3\xb3n de la biblioteca, en la que m\xc3\xa1s de una transcripci\xc3\xb3n se liga a un clon resultante del extremo 5\xe2\x80\x99 de un gen y el extremo 3\xe2\x80\x99 de otro gen. Se ha estimado que hasta el 11\xc2\xa0% de los clones de ADNc pueden ser quim\xc3\xa9ricos.\xe2\x80\x8b_NEWLINE_Las secuencias que no deber\xc3\xadan incluirse en las comunicaciones EST son las siguientes: secuencias mitocondriales, rRNA, secuencias virales, secuencias del vector, vector y del enlazador regiones deben ser retirados de las secuencias EST antes de su presentaci\xc3\xb3n.\xe2\x80\x8b_NEWLINE_La base de datos dbEST (www.ncbi.nlm.nih.gov/dbEST/) contiene colecciones de EST para un gran n\xc3\xbamero de organismos (>250). La base de datos se actualiza regularmente para reflejar el progreso de varios proyectos de investigaci\xc3\xb3n de secuenciaci\xc3\xb3n de EST, cada secuencia EST reci\xc3\xa9n presentada es sujeta a una b\xc3\xbasqueda de similitud en la base de datos.\xe2\x80\x8b"