O presidente da CNBB, d. Geraldo Lyrio Rocha, e o secretário-geral, d. Dimas Lara Barbosa, divulgaram nota na qual dizem ter clareza de que "a transposição do rio São Francisco traz consigo muitas implicações, não havendo unanimidade nem mesmo na Igreja", mas esperam "que o diálogo se estabeleça a fim de que a vida e a justiça prevaleçam sobre quaisquer outras razões".