1941년 나치 독일이 소련을 침공할 당시 쿠즈네초프 휘하의 소련 해군은 유일하게 제대로 역할 수행을 할 수 있었다. 당시 육군은 독일의 도발에 응하는 것을 금지한다는 스탈린의 명령을 수행하고 있었으나, 소련 해군은 당시 육군과 다른 인민 위원부 휘하에 있었기 때문에 쿠즈네초프는 그들의 직접 지휘 명령 계통의 이상의 자리에 위치할 수 있었고, 그 점을 이용해 쿠즈네초프는 6월 22일 전 소련 해군에 전투 준비를 명했고, 소련 해군은 유일하게 제대로 된 저항을 할 수 있었으며 작전 동안 한 대의 선박이나 항공기도 잃지 않았다. 스탈린은 쿠즈네초프가 자신의 명령을 어긴 것에 분노하였지만 소련 해군의 피해 상황에 대해 보고받은 뒤 화를 풀고 쿠즈네초프를 칭찬하였다. 2년간 쿠즈네초프의 주요 관심사는 독일의 침공에 대한 카프카스 방위였고 전쟁을 통해 흑해는 소련 해군의 작전에 중요한 지역이었다. 독일 해군은 강력한 소련 흑해 함대가 지키는 흑해에 감히 공격할 수가 없었고, 쿠즈네초프는 이런 제해권을 이용하여 상륙전 교리를 개발하고 직접 실행시키기도 했다. 그 외에도 쿠즈네초프는 무르만스크로 들어오는 연합군 수송선단의 방어에 힘썻으며 이러한 업적으로 그는 1944년 해군원수로 진급한다.
쿠즈네초프는 누구의 명령을 거역하였나요?
스탈린