1965년과 1966년에 이와모토 요시유키 감독의 아래서 타격 코치를 지내다 긴테쓰에서 퇴단했다. 이때 긴테쓰의 오너인 사에키 이사무가 향후에 대해 질문하자 스카우트 시절부터 알게 된 친구가 고문격으로 있는 철강을 취급하는 회사로 전직한다고 말했다. 그러나 니혼 대학 야구부의 정지 처분 중 맡았던 니타이산의 제자 중에 이후 야쿠르트의 구단에 참여했던 무라카미 히로시가 있었다. 무라카미의 아버지는 각료 경험자이기도 했던 무라카미 이사무였으며 무라카미와 만난 네모토는 산케이 신문의 사장 미즈노 시게오와 친분을 맺었다. 또한 미즈노의 친구인 도요 공업의 마쓰다 쓰네지도 소개받았다. 이 마쓰다는 지방 스승인 후지타의 소꿉친구였으며 후지타의 추천과 전술한 재계 인사들의 덕택으로 1967년 히로시마 카프의 하세가와 료헤이 감독 아래서 코치를 맡게 되었다. 우에다 도시하루가 코치 시절 당시 동료였다. 1968년 팀은 '히로시마 도요 카프'로 운영 형태가 변경되었고 네모토는 새로운 체제에서 감독으로 취임했다. 오너인 마쓰다는 "시즌 전패도 상관없으니 팀의 기초를 만들어달라"고 요구했다. 네모토는 코치로 고모리 미쓰오를 초빙했으며 한신 타이거스에서 야마우치 가즈히로를 영입했고 선수들에게 맹연습을 시켰다. 또한 식사면에서도 제한하는 조치를 취하는 등 같은 해 68승 62패로 3위를 차지해 카프 구단을 창설 이래 첫 A클래스로 이끌었다.

다음 해인 1969년에는 최하위로 전락했지만 1970년 코치로 세키네, 내야 수비 코치로 히로오카 다쓰로를 초빙했다. 세키네와 히로오카 모두 지도자 경력의 시작이었으나 같은 해와 다음 해인 1971년에는 4위와 승률 5할 이상으로 건투했고 그 동안 기누가사 사치오, 야마모토 고지, 미즈타니 지쓰오, 미무라 도시유키 등을 육성해 빨간 헬멧 황금 시대의 초석을 마련했다. 그러나 1972년 개막전부터 부진이 이어져 시즌 도중에 휴식했고 그대로 사임했다. 사임 후에도 팀을 만드는데 히로시마 구단주의 상담에 응했다. 다음은 오사카의 아사히 방송(ABC)에서 야구 해설자를 맡았다.
카프 구단을 첫 A클래스로 이끈 감독의 이름은?
고모리 미쓰오