2009년 6월 19일 입단 테스트에 합격하면서 2년 만에 라쿠텐으로 복귀했는데 라쿠텐 구단의 만류를 뿌리치면서 메이저 리그에 진출한 것을 이유로 노무라 가쓰야 감독은 후쿠모리의 영입에 소극적인 입장을 나타냈지만 후쿠모리가 노무라 감독이 묵고 있는 호텔에 직접 찾아가 라쿠텐 입단과 관련된 담판을 지었다. 6월 후반부터의 전열 복귀였지만 구원 투수로서 7승 10세이브의 성적을 올리는 등 팀의 정규 시즌 2위로 올리는 데에 기여했다. 평균자책점 2.18과 득점 지원률은 6.68을 기록해 가장 높았다. 10월 21일의 클라이맥스 시리즈 제2 스테이지에서는 홋카이도 닛폰햄 파이터스와 상대하면서 라쿠텐이 4점으로 리드한 9회말에 등판하여 터멜 슬레지의 역전 끝내기 만루 홈런을 포함한 1/3이닝 5실점을 기록해 패전 투수가 되었다. 그리고 2010년 시즌부터 등번호는 ‘62’번에서 ‘11’번으로 변경했다.

2010년 개막 이후에는 부진으로 인해 2경기 연속으로 구원에는 실패했고 3월 28일에 오른쪽 팔꿈치에 통증을 호소하면서 1군 등록이 말소되었다. 5월에는 오른쪽 팔꿈치 수술을 받았지만 수술 경과가 좋지 않아 9월에 현역 은퇴를 선언했다. 은퇴 후에는 프로 야구의 세계에서 손을 떼고 도내에서 회사를 경영하는 작은아버지 밑에서 경영자의 길을 걷는다고 말했다.
후쿠모리가 라쿠텐에 재입단하는 것을 끝까지 반대한 사람은?
노무라 가쓰야 감독