1995년 오바산조는 사니 아바차 장군을 물러나게 하는 데 쿠데타에 음모를 꾸민 위조 문책에 투옥되었다. 그는 1998년 7월 8일 아바차의 갑작스런 사망 후 만에 석방되었다. 교도소에 있는 동안 오바산조는 신앙을 새롭게 한 기독교인이 되었다.

1999년 오바산조는 나이지리아 연방 공화국의 대통령이 되었다. 그해 5월 29일 군사 정권의 16년 세월 후에 나이지리아에서 처음으로 선출된 민간인 국가 원수로서 오바산조가 취임한 날은 이제 나이지리아에서 공휴일로서 "민주주의의 날"로 기념되었다.

올레세군 행정부는 나이지리아인들의 신분에 상관없이 국민들의 생활들을 긍정적으로 강한 영향을 준 계획들을 창시하고 집행하였다. 그것들은 빈곤 근절 프로그램, 더 많은 기본적 시설의 규정을 촉진하는 데 나이저강 삼각주의 설립과 그 삼각주의 석유 생산 공동체들에서 사회 봉사들, 만국 기초 교육과 기본적 시설의 정통적 향상을 포함하였다. 이것들은 불우한 나이지리아인들의 경제, 교육과 정치적 개발을 변화시키는 데 목표가 되었다.

오바산조는 2003년 선거에서 무하마두 부하리 장군과 추쿠에메카 오디메구 오주쿠를 꺾은 압도적 대승리에서 재선되었다.
나이지리아에서 민주주의의 날이 처음 생긴 년도는?
1999