혼합식 승강장 2면 3선의 지상역이다. 현재의 새벽, 야간 시간을 제외한 1번 선이 슈젠지 행, 2번 선이 미시마 행의 발착이 되고 있다. 3번 선은 두단식 승강장으로 인하여 다이바 시발 미시마 방면 행 보통 열차와 미시마 발 다이바 행 막차, 다이바 공장에 입고 열차와 출고 열차에만 사용되지만 낮의 차량 고장 시에 대체 차량으로 환승에 사용되는 경우도 있다. 다이바 공장에서 행사 때는 본 승강장에 하루 종일 열차가 유치되기도 한다. 특급 오도리코의 정차역으로 1,2번 선 승강장의 유효 길이는 5량, 3번 선 승강장 유효 길이는 3량이다.

니시구치와 히가시구치 모두 자동 개찰기가 설치되었다. 역 창구는 서쪽에 있다. 예전에는 서쪽 밖에 개찰구가 없고 동쪽의 1번 선(슈젠지행 열차가 발착)에 내린 승객들은 구내 건널목을 쓰고 서쪽 출입구의 안쪽으로 건너가지 않으면 불가능했지만 2001년에 현립 미시마미나미 고등학교가 다이바 지구로 이전한 데 따라 동쪽의 승강장 남쪽에 히가시구치가 증설되었다. 초기에는 아침 러시아워에만 사용되었지만 2005년의 역사 개축에 따라 히가시구치에도 자동 개찰, 매표기가 설치된 오전 7시부터 오후 9시까지 이용할 수 있게 되었다. 현재 서쪽의 자동 매표기 1대가 히가시구치에도 자동 매표기 1대가 터치 패널식으로 대체되었다. 2006년 말부터 발차 벨이, 가마타 신호기산 전자 소리의 것으로 변경되었다(3번 선 제외). 발차 벨은 건널목에 연동되어 있으며 역무원이 발차 벨 버튼을 누르면 건널목이 작동되는 일정한 타이밍으로 발차 벨이 일정 시간에 울린다. 역 남쪽의 건널목에서 히가시구치로 통하는 도로는 과거 역 동부에 존재했던 모리나가 제과의 전용선의 터이다.
다이바 역에서 슈젠지 행과 미시마 행이 발착하는 시간은?
새벽