비오 11세는 교황청과 이탈리아 정부 사이의 오랜 반목을 종식시키고, 과거에 교황청이 누렸던 주권 독립을 다시 획득하는 것을 목표로 삼았다. 이러한 그의 목표는 그의 주요 업적 가운데 하나인 이탈리아 정부와의 1929년 라테라노 조약의 체결과 교황령 바티칸 시국의 독립으로 이어졌다.

교황령의 영토 대부분은 1860년 근대 통일 이탈리아 국가를 세운 비토리오 에마누엘레 2세 국왕(1861 ~ 1878)의 군대에 의해 강탈당하였으며, 1870년에는 로마를 포함한 나머지 영토도 모두 강탈당하였다. 이후 교황청과 이탈리아 정부는 줄곧 대립 상태를 유지하였다. 교황들은 이탈리아의 교황령 점령을 인정하지 않고 바티칸에서 칩거하며 항의를 하였으며, 이탈리아 정부는 항상 반교권주의적인 정책으로 맞대응하였다. 이제 비오 11세는 타협만이 최선의 해결책이라고 생각하였다.

 
베니토 무솔리니 역시 자신의 새 권력기반을 다지기 위해서라도 교황청과 협상을 벌이는 것이 이득이 있으리라고 보고 적극적으로 임하였다. 2년 반 동안 협상을 벌인 끝에 1929년 2월 11일 교황은 이탈리아 정부와 라테라노 조약을 체결하는데 동의하였다. 라테란 조약 제1항에서 교황청은 과거 교황령 시절의 영토에 대한 주권을 포기하는 조건으로 이탈리아로부터 자주 독립국으로서의 바티칸 시의 지위를 보장받게 되었다. 비오 11세는 19세기에 이탈리아 반도가 통일됨으로써 교황령이 몰락한 이후 (비록 최소한의 영토를 가진 국가이기는 해도) 주권국가의 국가원수 자리를 복원한 첫 번째 교황이 되었다. 제2항은 이탈리아와의 정교 협정이다. 이탈리아 정부는 가톨릭교회를 이탈리아의 국교로 공식적으로 인정하였으며, 이혼을 불법화하고 가톨릭교회에 혼인 사항에 대한 법적 권한을 부여하였으며, 모든 학교에서 종교 교육을 다시 실시하도록 하였다. 그 대신에 성직자는 정치에 대해 일절 관여할 수 없게 되었다. 라테란 조약의 세 번째 조항은 이탈리아가 바티칸이 교황령을 상실한 데 대한 금전적인 보상을 제공해주는 것이었다. 비오 11세가 살아있는 동안 바티칸은 이탈리아로부터 받은 자금으로 주식시장과 부동산에 투자하였다. 바티칸은 투자 관리를 위해 평신도 베르나르디노 노가라에게 운영을 맡겼다. 주식과 금, 선물시장 투자에 뛰어난 인물이었던 그는 바티칸의 재정을 상당량 증대시켰다. 그렇지만 세간에 떠도는 소문과는 달리 실제로 바티칸은 그렇게 엄청난 부를 축적하지는 않았다. 이탈리아 정부로부터 받은 보상금은 상대적으로 많지 않은 액수였으며, 투자를 통해 얻은 자금의 대부분은 비용이 많이 들어가는 바티칸의 역사적인 건물들의 유지비로 사용되었다. 이러한 역사적인 건물들은 1870년까지만 해도 교황령의 각 지역으로부터 거두어들인 자금으로 유지하였다.

바티칸과 무솔리니 정권의 관계는 무솔리니가 전체주의 야욕을 드러내며 교회에 대한 권리를 침해하기 시작하면서 급속도로 악화되었다. 예를 들면, 이탈리아 정부는 1931년 교회의 청년 단체들을 모두 강제로 해산시켰는데, 이는 무솔리니를 따르는 파시스트 청년 단체들이 주도권을 잡도록 하기 위함이었다. 그러자 비오 11세는 1931년 회칙 《우리는 원하지 않는다》(Non Abbiamo Bisogno)를 발표하였다. 이 회칙에서 비오 11세는 전체주의 사상과 무솔리니의 교회 정책에 대해 강하게 비판하였다. 비오 11세의 남은 재위기간 동안 무솔리니와의 관계는 계속 악화되어만 갔다.
파시스트 청년 단체들이 주도권을 잡은 해는?
1931