section_heading: Bayern München
paragraph_text: 1. srpnja 2009., van Gaal je preuzeo vodstvo Bayern Münchena.<ref><ref> Van Gaal je određen kao trener "momčadi iz snova".<ref> Van Gaal je započeo s lošim rezultatima u Bayern Münchenu, pobijedivši samo jednu od prve četiri utakmice pod vodstvom kluba, i do studenog su bili pred ispadanjem iz Lige prvaka s dva poraza od Bordeauxa. S Bayer Leverkusenom na vrhu Bundeslige, špekuliralo s da će van Gaal ubrzo dobiti otkaz u kraćem roku i od njegovog prethodnika, Jürgena Klinsmanna. Svađa s talijanskim napadačem Lucom Tonijem, važnom karikom za osvajanje duple krune 2007./08., dovelo je do odlaska Tonija u Romu. Međutim, Bayernova se forma bitno popravila nakon gostujuće pobjede od 4:1 nad Juventusom, koja ih je odvela u drugi dio natjecanja. Također, prošli su u polufinale njemačkog kupa i napokon su dospjeli na vrh ljestvice Bundeslige iza Leverkusena.