La classificazione cerca di descrivere la diversità delle specie batteriche nominando e raggruppando gli organismi in base alle somiglianze. I batteri possono essere classificati in base alla struttura cellulare, al metabolismo cellulare o alle differenze dei componenti cellulari, come DNA, acidi grassi, pigmenti, antigeni e chinoni. Sebbene questi schemi consentissero l' identificazione e la classificazione dei ceppi batterici, non era chiaro se queste differenze rappresentassero variazioni tra specie distinte o tra ceppi della stessa specie. Questa incertezza era dovuta alla mancanza di strutture distintive nella maggior parte dei batteri, nonché al trasferimento genico laterale tra specie estranee. A causa del trasferimento genico laterale, alcuni batteri strettamente correlati possono avere morfologie e metabolismi molto diversi. Per superare questa incertezza, la moderna classificazione batterica enfatizza la sistematica molecolare, utilizzando tecniche genetiche come la determinazione del rapporto citosina della guanina, l' ibridazione genome-genoma, così come i geni sequenziamento che non hanno subito il trasferimento del gene laterale estensivo, come il gene rRNA. La classificazione dei batteri è determinata dalla pubblicazione sull' International Journal of Systematic Bacteriology e sul Manuale di batteriologia sistematica di Bergey. Il Comitato internazionale per la batteriologia sistematica (ICSB) mantiene le regole internazionali per la denominazione dei batteri e delle categorie tassonomiche e per la loro classificazione nel Codice internazionale di nomenclatura dei batteri.
Che cosa sostiene l' incertezza nella classificazione tra lo stesso tipo di batteri?
mancanza di strutture distintive nella maggior parte dei batteri,