La diagnosi delle malattie infettive è quasi sempre iniziata dall' anamnesi medica e dagli esami fisici. Tecniche di identificazione più dettagliate coinvolgono la coltura di agenti infettivi isolati da un paziente. La coltura consente di identificare gli organismi infettivi esaminando le loro caratteristiche microscopiche, rilevando la presenza di sostanze prodotte da agenti patogeni e identificando direttamente un organismo attraverso il suo genotipo. Altre tecniche (come i raggi X, le scansioni CAT, PET o NMR) sono utilizzate per produrre immagini di anomalie interne derivanti dalla crescita di un agente infettivo. Le immagini sono utili per rilevare, ad esempio, un ascesso osseo o un' encefalopatia spongiforme provocata da un prione.
Quali organismi possono essere identificati direttamente da quali organismi?
il suo genotipo