La serie è ambientata tre anni dopo gli eventi di Digimon Adventure 02, quando Digimon che diventa canaglia a causa di un' infezione misteriosa sembra scatenare il caos nel mondo umano. Tai e gli altri DigiDestinati della serie originale si riuniscono con i loro partner e iniziano a combattere con il sostegno del governo giapponese, mentre Davis, Yolei, Cody e Ken sono sconfitti da un potente nemico chiamato Alphamon e scompaiono senza lasciare traccia. Tai e gli altri incontrano anche un altro DigiDestinato chiamato Meiko Mochizuki e la sua compagna Meicoomon che diventano loro amici, fino a quando anche Meicoomon diventa ostile e fugge dopo un incontro con Ken, che riappare improvvisamente, ancora una volta come l' imperatore Digimon. La serie di film prevede anche diversi DigiDestined con i loro partner Digivolve fino al livello Mega per la prima volta, una prodezza solo Tai e Matt aveva raggiunto in precedenza.
Dopo quanto tempo è iniziata un' altra serie dopo la Digimon Adventure 02?
tre anni