In particolare, c' era anche un protocollo segreto al patto, rivelato solo dopo la sconfitta della Germania nel 1945, anche se le sue disposizioni sono trapelate molto prima, ad esempio per influenzare la Lituania. Secondo detto protocollo Romania, Polonia, Lituania, Lettonia, Estonia, Finlandia e Polonia erano divise in "sfere d' influenza"tedesche e sovietiche. Nel nord, Finlandia, Estonia e Lettonia sono state assegnate alla sfera sovietica. La Polonia doveva essere divisa in caso di "riarrangiamento politico": le zone ad est dei fiumi Pisa, Narev, Vistola e San andavano verso l' Unione Sovietica, mentre la Germania occupava l' ovest. La Lituania, adiacente alla Prussia orientale, si troverebbe nella sfera d' influenza tedesca, anche se un secondo protocollo segreto concordato nel settembre 1939 ridistribuì la maggior parte della Lituania all' URSS. Secondo il protocollo segreto, alla Lituania sarebbe stata concessa la città di Vilnius, la sua capitale storica, sotto il controllo polacco durante il periodo tra le due guerre. Un' altra clausola del trattato era che la Germania non avrebbe interferito con le azioni dell' Unione Sovietica nei confronti di Bessarabia, allora parte della Romania; di conseguenza, Bessarabia fu unita all' ASSR moldava e divenne la SSR moldova sotto il controllo di Mosca.
Alla fine Bessarabia divenne sotto il controllo di quale paese?
Unione Sovietica