Il capitolo IX tratta del fatto che il record geologico sembra mostrare forme di vita che improvvisamente emergono, senza gli innumerevoli fossili transitori attesi da cambiamenti graduali. Darwin ha preso in prestito l' argomentazione di Charles Lyell nei Principi di Geologia secondo cui il record è estremamente imperfetto in quanto la fossilizzazione è un evento molto raro, diffuso su vasti periodi di tempo; poiché poche aree erano state geologicamente esplorate, ci poteva essere solo una conoscenza frammentaria delle formazioni geologiche, e le collezioni fossili erano molto scarse. Varietà locali evolute che migravano in un' area più ampia sembrerebbero essere la comparsa improvvisa di una nuova specie. Darwin non si aspettava di essere in grado di ricostruire la storia evolutiva, ma le continue scoperte gli diedero la fondata speranza che nuovi ritrovamenti rivelassero occasionalmente forme di transizione. Per dimostrare che la selezione naturale aveva avuto abbastanza tempo per funzionare lentamente, egli citò nuovamente i Principi di Geologia e altre osservazioni basate sulla sedimentazione e sull' erosione, compresa una stima che l' erosione di The Weald avesse richiesto 300 milioni di anni. L' apparizione iniziale di interi gruppi di organismi ben sviluppati negli strati fossili più antichi, ora noti come esplosione cambriana, ha posto un problema. Darwin non aveva dubbi sul fatto che i mari precedenti si erano brulicati di creature viventi, ma ha dichiarato che non aveva una spiegazione soddisfacente per la mancanza di fossili. Da allora sono state trovate prove fossili della vita pre-Cambriana, che prolungano la storia della vita per miliardi di anni.
Qual è l' argomento addotto da Darwin per prendere in prestito che la documentazione geologica è molto imperfetta, perché la fossilizzazione è rara?
Charles Lyell