Djukanovic a fost alternativ prim-ministru şi preşedinte în perioada 1992-2006. În 1998, el a început să pledeze pentru independenţa Muntenegrului faţă de Serbia, obiectiv atins în mai 2006.
Cukanoviç 1992-2006 yılları arasında başbakan ve cumhurbaşkanı olarak görev yaptı. 1998 yılında Karadağ'ın Sırbistan'dan bağımsızlık kazanmasını savunmaya başladı ve Mayıs 2006'da bu amacına ulaştı.