Însă, în urma unui acord de diminuare a pedepsei încheiat cu procurorii ONU în luna mai, el a pledat vinovat faţă de acuzaţia de crime împotriva umanităţii pentru persecuţiile care au avut loc în timpul războiului din 1992-1995 din Bosnia şi Herţegovina (BiH).
Ancak Mayıs ayında BM savcılarıyla yaptığı bir ceza pazarlığı sonrasında Nikoliç, Bosna-Hersek'teki (BH) 1992-1995 savaşı sırasında uygulanan zulümler nedeniyle insanlığa karşı suçlarından bir kalemi itiraf etti.