Clark a fost de asemenea membru al delegaţiei SUA, condusă de Ambasadorul Richard Holbrooke, în cursul negocierilor din 1995 privitoare la Acordul de Pace de la Dayton care a pus capăt războiului din Bosnia şi Herţegovina.
Clark ayrıca, 1995 yılında Bosna-Hersek'teki savaşın sona ermesini sağlayan Dayton Barış Anlaşması müzakerelerine katılan, Büyükelçi Richard Holbrooke başkanlığındaki Amerikalı heyetin de üyesiydi.