Stambolic a dispărut în timp ce făcea joggingul de dimineaţă într-un parc din Belgrad în data de 25 august 2000, la doar câteva săptămâni înainte de alegerile prezidenţiale în care urma să candideze împotriva lui Milosevic, fost aliat transformat în inamic.
Stamboliç, sonradan hasmı olan eski yandaşı Miloşeviç'e karşı yarışmasının beklendiği cumhurbaşkanlığı seçimlerinden yalnızca birkaç hafta önce, 25 Ağustos 2000 tarihinde sabah koşusunu yaparken ortadan kaybolmuştu.