Tribunalul l-a acuzat pe Gotovina în mai 2001 pentru presupusul rol jucat în asasinarea a cel puţin 150 de civili etnici sârbi şi expulzarea a altor peste 150 000 în timpul ofensivei militare a forţelor croate, ofensivă organizată între 4 august 1995 şi 15 noiembrie 1995 pentru recucerirea regiunii Krajina.
Mahkeme Gotovina hakkında, Hırvat güçlerinin 4 Ağustos-15 Kasım 1995 tarihleri arasında Krajina bölgesini geri almak için giriştiği askeri harekât sırasında en az 150 etnik sivil Sırp'ın öldürülmesi ve en az 150 bin tanesinin topraklarından kovulması olayında oynadığı iddia edilen rol nedeniyle Mayıs 2001'de dava açmıştı.