La trei luni după ce a devenit şeful guvernului kosovar, în 8 martie 2005, el a fost inculpat pentru crime împotriva sârbilor, rromilor şi albanezilor acuzaţi de colaborare cu guvernul fostului preşedinte sârb Slobodan Milosevic.
Kosova hükümetinin başına geldikten üç ay sonra, 8 Mart 2005'te, eski Sırbistan Cumhurbaşkanı Slobodan Miloseviç'in hükümetiyle işbirliği yapmak ve Sırplar, Romanlar ve Arnavutlara karşı suç işlemekle suçlandı.