În 1994, Holbrooke a renunţat la funcţia de ambasador în Germania pentru a se ocupa de BiH în calitate de secretar adjunct de stat pentru afaceri europene.
Holbrooke, dışişleri bakanlığının Avrupa'dan sorumlu bakan yardımcılarından biri olarak BH ile ilgilenmek üzere büyükelçiliği 1994 yılında Almanya'ya devretmişti.