Ceea ce ar putea ameninţa securitatea Macedoniei sunt pericolele diverse exprimate prin posibilele dovezi de extremism naţionalist pe plan intern, intoleranţă rasială şi religioasă şi activităţi legate de terorismul internaţional, crima organizată şi traficul de droguri, arme şi persoane.
Makedonya'da güvenliği tehdit eden şey, aşırı milliyetçilik, ırk ve din farklılıklarına karşı hoşgörüsüzlük ve uluslararası terör, organize suç ve silah, uyuşturucu ve insan kaçakçılığına yönelik faaliyetler gibi asimetrik unsurlardır.