Noul muzeu este cea mai importantă structură modernă construită atât de aproape de Acropole, şi proiectul nu a fost privat de controverse.
Akropolis’e bu kadar yakın olarak inşa edilen en önemli modern yapı olma niteliği taşıyan yeni müze, bu özelliği ile tartışmalara da yol açtı.