El a fost de asemenea felicitat pentru rolul jucat în medierea acordului de pace din 2005 dintre separatiştii Mişcării pentru un Aceh Liber şi guvernul indonezian, care a pus capăt celor aproximativ 30 de ani de lupte.
Ahtisaari, ayrılıkçı Özgür Aceh Hareketi ile Endonezya hükümeti arasındaki yaklaşık 30 yıllık savaşı sona erdiren 2005 barış anlaşmasındaki arabuluculuk rolünden ötürü de övgü aldı.