Ministerul afacerilor externe a creat de asemenea un sector special pentru documentarea şi sprijinirea minorităţilor naţionale macedonene în faţa instituţiilor internaţionale, precum şi pentru încheierea unor acorduri bilaterale privind protecţia minorităţilor naţionale.
Dışişleri bakanlığı ayrıca, Makedon ulusal azınlıklarını uluslararası kurumlarla ve ulusal azınlıklara yönelik ikili koruma anlaşmalarıyla belgeleme ve destekleme amaçlı özel bir sektör de kurdu.