Dink a fost împuşcat mortal în faţa biroului, în anul 2007, într-un asasinat ce părea a avea legături cu gruparea „Deep State” din Turcia. El a transformat această publicaţie, dintr-un mic jurnal al comunităţii armeneşti din Turcia, oferindu-i valenţe noi prin care adresa unele dintre cele mai sensibile probleme legate de identitatea culturală şi etnică a Turciei.
2007 yılında Türkiye’deki “Derin Devlet” unsurlarıyla bağlantılı olduğu iddia edilen bir suikast sonucunda gazete binasının önünde vurularak öldürülen Dink, Agos’u Türkiye’deki küçük çaplı Ermeni cemaatinin sözcüsü olmaktan çıkarıp, modern Türkiye’nin kültürel ve etnik kimliğiyle ilgili bazı hassas meseleleri ele aldığı bir mecra haline getirdi.