În Bosnia şi Herţegovina, luptătorii mujahedeeni afiliaţi al-Qaeda s-au înrolat în armata bosniacă în lupta împotriva forţelor sârbe bosniace.
Bosna-Hersek'te, Kaide ile bağlantılı mücahit savaşçılar Bosnalı Sırp kuvvetlerine karşı savaşta Bosna Ordusu yanında yer aldılar.