Forţele armate se aflau sub jurisdicţia celor două entităţi în mare parte etnice care formează BiH -- Republica Srpska şi Federaţia musulman-croată.
Ordular, BH'yi meydana getiren ve büyük ölçüde etnik özellik taşıyan iki taraf olan Sırp Cumhuriyeti ve Müslüman-Hırvat Federasyonu'nun yetkisi altındaydı.