Tribunalul Penal Internaţional pentru Fosta Iugoslavie (ICTY) l-a inculpat pe Haradinaj în baza a 37 de capete de acuzare privitoare la crime împotriva umanităţii şi încălcarea legilor sau cutumelor de război, acuzându-l de complicitate la persecuţie, ucidere, viol şi alte atrocităţi comise în cursul conflictului din 1998-1999 din Kosovo.
Eski Yugoslavya Hakkındaki Uluslararası Ceza Mahkemesi (ICTY) Haradinay'ı 37 maddeden oluşan insalığa karşı suç ve savaş yasa ve geleneklerini ihlal iddianamesinde, Kosova'daki 1998-1999 ihtilafı sırasında işlenen zulüm, cinayet, tecavüz ve diğer vahşet uygulamalarında rol almakla suçladı.