Printre subiectele de dispută se numără numele de "Macedonia", steaua de la Vergina -- descoperită în Grecia, dar utilizată încă sub o formă modificată pe steagul oficial al Macedoniei -- şi prezenţa contestată a unei "minorităţi macedonene" în nordul Greciei.
Anlaşmazlık noktaları arasında "Makedonya" ismi, Yunanistan'da ortaya çıkarılmasına karşın değiştirilmiş biçimiyle Makedonya'nın resmi bayrağında hâlâ kullanılmakta olan Vergina yıldızı ve kuzey Yunanistan'da bir "Makedon azınlığın" tartışmalı varlığı yer alıyor.