Investigaţiile legate de Ergenekon au început în 2007, odată cu confiscarea mai multor zeci de grenade într-o locuinţă dărăpănată din Istanbul, dar primele menţiuni despre Ergenekon datează din 1996, cu cinci ani înainte ca AKP să fie fondat.
Ergenekon soruşturması, 2007 yılında İstanbul'da bir gecekonduda birkaç düzine el bombasının ele geçirilmesi üzerine açıldı, fakat Ergenekon adı ilk kez 1996 yılında, yani AKP kurulmadan beş yıl önce gündeme gelmişti.