Seselj, în vârstă de 54 de ani, s-a predat tribunalului de la Haga în februarie 2003, la aproximativ zece zile după ce procurorii ONU l-au inculpat pentru crime de război comise în Croaţia, Voivodina şi Bosnia şi Herţegovina din 1991 până în 1993.
54 yaşındaki Seselj, BM savcılarının kendisini 1991-1993 yılları arasında Hırvatistan, Voyvodina ve Bosna-Hersek'te işlenen savaş suçlarıyla suçlamalarından yaklaşık on gün sonra Şubat 2003'te Lahey Mahkemesine teslim oldu.