În martie 1996, Tudjman, preşedintele Croaţiei de la acea vreme, l-a numit pe Gotovina în funcţia de Comandant al Inspectoratului Croat al Armatei.
Mart 1996'da, o sırada Hırvatistan Cumhurbaşkanı olan Tudjman, Gotovina'yı Hırvat Ordusu Teftiş Kurulu'nun başkanlığına atadı.