Ţările din Europa de Sud-est au moştenit multe probleme structurale în acest domeniu, inclusiv o infrastructură de cercetare şi tehnologie în mare parte învechită, şi o lipsă a cererii industriale pentru cercetarea aplicată, combinate cu un nivel scăzut al bugetelor alocate cercetării şi dezvoltării de către întreprinderi, cu exodul de inteligenţă, cu fragmentarea sistemului de cercetare şi cu lipsa legăturilor între industrie şi sectoarele de cercetare.
Güneydoğu Avrupa ülkeleri, büyük oranda modası geçmiş araştırma ve teknoloji altyapısı ve uygulamalı bilimlere yönelik sektörel talep kıtlığının yanı sıra işletmelerin araştırma ve geliştirmeye düşük kaynak ayırmaları, beyin göçü, araştırma sisteminin parçalanması ve sanayi ile araştırma sektörleri arasında bağlantı eksikliği de dahil olmak üzere bu alanda bir çok yapısal sorun devraldılar.