Tribunalul Penal Internaţional pentru fosta Iugoslavie (TPII) l-a pus sub acuzaţie în legătură cu conflictul din 1992-1995 din Bosnia Şi Herţegovina (BiH), ce s-a soldat cu aproximativ 20.000 de morţi şi două milioane de refugiaţi.
Eski Yugoslavya Uluslararası Ceza Mahkemesi (ICTY) Karaciç'i yaklaşık 200 bin kişinin ölümü ve iki milyon kişinin iltica etmesiyle sonuçlanan Bosna-Hersek'teki (BH) 1992-1995 ihtilafıyla ilgili olarak suçladı.