Conflictul dintre cele două instituţii de vârf a atins culmea odată cu procesul lansat împotriva unei grupări ultranaţionaliste laice cunoscute public sub numele de Ergenekon, ai cărei membri sunt judecaţi pentru presupusa tentativă de răsturnare a guvernului.
Bu iki baş kurum arasındaki ihtilaf, üyelerinin hükümeti devirmeye çalıştıkları iddiasıyla yargılanmakta olduğu sözde Ergenekon adlı aşırı milliyetçi ve laik bir gruba karşı devam eden davada zirveye ulaştı.