Kada je 2004. godine ovaj štab prvobitno uspostavljen, to je značilo supredsjedavanje Komisijom za reformu odbrane u cilju ukidanja entitetskih vojski, stvaranje jedinstvenih oružanih snaga na nivou države pod demokratskim civilnim nadzorom, te projektiranje vojne strukture koja je ispunjavala realne potrebe i kapacitete BiH.
Το 2004, όταν ιδρύθηκε το αρχηγείο, αυτό σήμαινε κοινή προεδρία στην Επιτροπή Αμυντικής Μεταρρύθμισης για εξάλειψη των στρατών της οντότητας, δημιουργία ενιαίας κρατικής ένοπλης δύναμης υπό τη δημοκρατική επίβλεψη πολιτών και σχεδιασμό στρατιωτικής δομής η οποία πληρούσε τις ρεαλιστικές ανάγκες και τις ικανότητες της Β-Ε.