Neki smatraju da bi taj protokol mogao tužioce BiH staviti u inferiornu poziciju, tako da oni faktički postanu ogranak srbijanskog tužilaštva.
Μερικοί αισθάνονται πως το Πρωτόκολλο θα μπορούσε να θέσει τους εισαγγελείς της Β-Ε σε μειονεκτική θέση, καθιστώντας τους -- στην πραγματικότητα -- παράρτημα της εισαγγελίας της Σερβίας.