Osim pitanja posebnih za pojedinačne zemlje, program IPA fokusira se i na prekograničnu saradnju.
Πέρα από κάποια ζητήματα συγκεκριμένα για κάθε χώρα, το πρόγραμμα ΙΡΑ επικεντρώνεται επίσης στη διασυνοριακή συνεργασία.