Među najspornijim problemima su razmirice oko niza pitanja, uključujući razgraničenje nacionalnog zračnog prostora i označavanje teritorijalnih voda u Egejskom moru, kao i podijeljeno ostrvo Kipar.
Διαφωνία σχετικά με αρκετά ζητήματα, όπως η οριοθέτηση του εθνικού εναέριου χώρου και των χωρικών υδάτων στο Αιγαίο, καθώς επίσης η διχοτομημένη Κύπρος είναι μεταξύ των πιο επίμαχων προβλημάτων.