Otvoreni spor oko granice otkako su te dvije zemlje 1991. godine proglasile nezavisnost od bivše Jugoslavije povremeno utječe na veze između Zagreba i Ljubljane.
Παρατεταμένη συνοριακή διαφωνία από τη διακήρυξη ανεξαρτησίας των δυο εθνών από την πρώην Γιουγκοσλαβία το 1991 έχει πλήξει περιοδικά τους δεσμούς μεταξύ Ζάγκρεμπ και Λιουμπλιάνα.