Обвинението на МКТЈ против него го товари Рајиќ за командуваое со оперативната група на Хрватскиот одбранбен совет (ХВО), вооружени сили на самопрогласената Хрватска заедница во Херцег-Босна, како и дека на 23-ти октомври 1993 година единиците, под негова команда, го нападнале и го разрушиле Ступни Дол.
Documentul de acuzare emis de ICTY împotriva acestuia susţine că Rajic a comandat un grup operaţional al Consiliului Croat de Apărare (HVO) -- forţa armată a auto-proclamatei Comunităţi Croate Herceg-Bosna -- şi că în 23 octombrie 1993 unităţile aflate sub comanda sa au atacat şi distrus Stupni Dol.