Готовина, кој заедно со воените водачи на босанските Срби, Радован Караџиќ и Ратко Младиќ, се наоѓа на врвот од листата на најбарани обвинети од страна на Трибуналот на ОН, беше обвинет во јуни 2001 година.
Gotovina, împreună cu liderii sârbo-bosniaci din timpul războiului Radovan Karadzic şi Ratko Mladic, se află printre principalii inculpaţi urmăriţi de tribunalul ONU şi a fost pus sub urmărire penală în iunie 2001.