МКТЈ го издаде своето првично обвинение против Жупљанин (56) во декември 1999 година, според кое поранешниот командант на Регионалниот центар на безбедносните сили во Бања Лука е одговорен за воени злосторства против несрпското население за време на конфликтот во БиХ во периодот 1992-1995 година.
TPII l-a inculpat iniţial pe Zupljanin, în vârstă de 56 de ani, în decembrie 1999, învinuindu-l pe fostul comandant al Centrului Regional al Serviciilor de Securitate din Bania Luka pentru crime de război comise împotriva non-sârbilor în timpul conflictului din 1992-1995 din BiH.