Beograd je optužio Čekua za umiješanost u ratne zločine tijekom sukoba na Kosovu 1998-1999 i rata u Hrvatskoj 1991-1995, kada se borio na strani Hrvatske vojske.
Beogradi e ka akuzuar Çekun për pjesëmarrje në krime lufte gjatë konfliktit 1998-1999 në Kosovë dhe në luftën në Kroaci në 1991-1995 kur ai luftoi në anën e ushtrisë kroate.