Prije početka akcesijskih pregovora u listopadu 2006, turske su vlasti potpisale protokol kojim se sporazum o carinskoj uniji s EU iz 1963. proširuje na sve nove članice, uključujući Cipar.
Përpara se të fillonin bisedimet e hyrjes, në tetor të vitit 2006, autoritetet turke nënshkruan një protokoll duke shtrirë marrëveshjen e bashkimit të doganave të vitit 1963 me BE tek të gjithë anëtarët e rinj, duke përfshirë Qipron.