Međunarodni kazneni tribunal za bivšu Jugoslaviju (ICTY) podignuo je u studenom 2003. godine optužnicu protiv Babića za zločine protiv čovječnosti zbog progona na političkoj, rasnoj i vjerskoj osnovi, kao i još četiri točke koje ga terete za kršenje pravila i običaja rata, uključujući ubojstva, zlostavljanja, hotimično ili vojno neopravdano razaranje sela i uništavanje ili ostećivanje obrazovnih ili vjerskih institucija.
Babiç u padit nga Gjykata Penale Ndërkombëtare për ish Jugosllavinë (ICTY) në nëntor 2003 me një akuzë të krimeve kundër njerëzimit për ndjekje mbi baza politike, raciale e fetare dhe katër akuza të shkeljes së ligjeve apo rregullave të luftës, duke përfshirë vrasjen, trajtimin mizor, shkatërrimin e kotë apo ushtarakisht të panevojshëm të fshatrave dhe shkatërrimin ose dëmtimin e institucioneve arsimore e fetare.