Rupel je također izrazio podršku svoje zemlje pristupanju Hrvatske EU, rekavši "Slovenija želi da Hrvatska postane članica Evropske unije i da ukloni sve prepreke i poteškoće što je prije moguće."
Rupel shprehu gjithashtu mbështetjen e vendit të tij për hyrjen e Kroacisë në BE duke thënë se "Sllovenia do që Kroacia të bëhet një anëtare e Bashkimit Evropian dhe të heqë të gjitha pengesat dhe vështirësitë sa më parë të jetë e mundur."