Thaci će se suočiti i s još dvije prepreke: aktuelnim pritužbama o tome da su izbori od 12. decembra i djelimično ponovljeno glasanje održano u januaru bili poremećeni prevarama, te navodima izvjestioca Vijeća Evrope Dicka Martyja o tome da je premijer bio uključen u navodnu trgovinu organa od strane OVK tokom sukoba iz perioda 1998-1999.
Thaçi do të ndeshë gjithashtu dy pengesa të tjera: ankesat në vazhdim se zgjedhjet e 12 dhjetorit dhe një rivotim i pjesshëm i zhvilluar në janar u prishën nga mashtrimet dhe akuzat nga raportuesi i Këshillit të Europës Dik Marti se kryeministri ishte përfshirë në trafikimin e dyshuar të organeve nga UÇK pas konfliktit të 1998-1999.