Karadžić, koji je vršio i formalnu i stvarnu vlast i kontrolu nad snagama bosanskih Srba i nad svim organima SDS-a i vlade, optužen je i u vezi s ubistvom iz jula 1995. i do 8.000 muškaraca i dječaka, bosanskih Muslimana, zarobljenih na nekoliko različitih lokacija u i oko "bezbjedne zone" UN-a Srebrenice.
Karaxhiç i cili ushtroi si pushtetin dhe kontrollin zyrtar dhe atë de facto mbi forcat serbe boshnjake dhe të gjithë SDS dhe autoritetet qeverisëse, u padit gjithashtu në lidhje me vrasjet e korrikut 1995 të deri në 8,000 burrave e djemve muslimanë boshnjakë kapur në disa vende të ndryshme në dhe pranë "zonës së sigurtë" të Srebrenicës.