Tužioci kažu da Ergenekon ima rasprostranjene ćelije, uključujući i medijske ličnosti i atentatore, ali da te ćelije nemaju međusobnog kontakta i da primaju instrukcije s vrha.
Tužitelji kažu da Ergenekon ima rasprostranjene ogranke, uključujući medijske osobe i plaćene ubojice, ali kako ogranci nemaju kontakt jedni s drugima i primaju instrukcije s vrha.