Iako se suđenje za Ergenekon smatra mogućnošću za jačanje demokratije, njegovoj legitimnosti prijete "ozbiljne zabrinutosti" povodom postupanja u istragama, pravosudnim postupcima i krivičnim procedurama.
Iako se suđenje za Ergenekon promatra kao prigoda za učvršćivanje demokracije, "ozbiljne zabrinutosti" glede provedbe istraga, sudskih procesa i kaznenih procedura prijete njegovoj legitimnosti.