Срещу него са повдигнати и две обвинения в геноцид заради предполагаемата му роля в клането в Сребреница през 1995 г., при което бяха убити над 7 000 босненски мъже и момчета мюсюлмани, и 43-месечната обсада на Сараево.
Mladiç ayrıca, 7 binden fazla Bosnalı Müslüman erkek ve oğlan çocuğunun öldürüldüğü 1995 Srebrenitsa katliamı ve 43 ay süren Saraybosna kuşatmasında oynadığı iddia edilen rollerden ötürü iki adet de soykırım suçlamasıyla karşı karşıya bulunuyor.