МНТБЮ отправи официално обвинения срещу Готовина през 2001 г. за участие в жестокости, извършени срещу сърбите от Крайна в края на конфликта от 1991-1995 г. в Хърватия.
ICTY, Hırvatistan'da 1991-1995 yılları arasında yaşanan çatışmaların sonlarına doğru Krajina'lı Sırplara karşı gerçekleştirilen zulümlere karıştığı iddiasıyla suçlanan Gotovina aleyhindeki ithamları 2001 yılında resmileştirdi.