В това си качество той фактически и юридически командва и контролира всички хърватски сили, участващи в операция “Буря” в южната част на района на Краина, твърдят прокурорите на ООН в изменения обвинителен акт срещу Готовина, който бе публикуван през март 2004 г.
BM savcıları Mart 2004'te kamuoyuna açıkladıkları Gotovina aleyhindeki değiştirilmiş iddianamede, zanlının bu görevi süresince, Fırtına Operasyonu kapsamında Krajina bölgesinin güney bölgesinde konuşlandırılan Hırvat güçlerinin tümü üzerinde fiili ve kanuni komuta ve kontrole sahip olduğunu iddia ettiler.