Готовина, който оглавява списъка на най-издирваните от Трибунала на ООН обвиняеми заедно с военновременните лидери на босненските сърби Радован Караджич и Ратко Младич, бе обвинен през юни 2001 г.
Savaş zamanı Bosnalı Sırp liderleri Radovan Karadziç ve Ratko Mladiç ile birlikte BM mahkemesinin arananlar listesinin başında yer alan Gotovina hakkındaki suçlama Haziran 2001'de yayınlandı.