Противниците на "Ергенекон" твърдят, че военните не са планирали преврат, и че Ергенекон не е нищо друго освен конспирация, измислена от ПСР, за да потисне опозицията и да я накара да замълчи.
Ergenekon sürecini eleştirenler ise, ordunun darbe hazırlığı içinde olmadığını ve Ergenekon'un, muhalefeti bastırıp sindirmek amacıyla AKP tarafından tasarlanan bir komplodan ibaret olduğunu öne sürüyor.