Караджич, който упражнява както формално, така и де факто власт и контрол върху босненските сръбски сили и всички власти и СДП, също е обвинен във връзка с убийствата през юли 1995 г. на 8000 босненски мюсюлмани - мъже и момчета, заловени в няколко различни места в и около определената от ООН за "безопасна зона" Сребреница.
Bosnalı Sırp güçleri ve bütün SDS ve hükümet yetkilerinin hem resmi hem de fiili olarak güç ve kontrolünü elinde tutan Karaciç, Temmuz 1995'te BM "güvenli bölgesi" Srebrenitsa içinde ve civarındaki çok sayıda farklı noktada yakalanmış 8 bin kadar Bosnalı Müslüman erkek ve oğlan çocuğunun katledilmesiyle ilgili olarak da suçlanıyor.