След края на войната Плавшич наследи от Караджич президентския пост на общността на босненските сърби Република Сръбска.
72 yaşında bir biyoloji profesörü olan Plavsiç, Radovan Karadziç'in bir zamanlar yakın müttefiki ve savaş zamanındaki yardımcısıydı. Ne var ki, bu kişiyle ilişkileri zamanla kötüleşti.