Когато през 1998 г. избухва въоръженият конфликт със Сърбия, Ругова е държан настрана от бунтовническата Армия за освобождение на Косово, тъй като много етнически албанци смятат, че той е прекалено пасивен.
1998 yılında Sırbistan ile silahlı çatışmalar patlak verdiğinde, isyancı Kosova Kurtuluş Ordusu Rugova'nın yanında yer alırken pek çok etnik Arnavut da onu fazla pasif buluyordu.