Готовина бе един от тримата най-издирвани обвинени във военни престъпления, извършени по време на конфликтите на Балканите през 1990-те тодини, заедно с бившия лидер на босненските сърби Радован Караджич и неговия военен командир Ратко Младич.
Gotovina, eski Bosnalı Sırp lider Radovan Karadzic ve askeri komutanı Ratko Mladic ile birlikte 1990'larda Balkanlar'da yaşanan çatışmalar nedeniyle aranan kaçak savaş suçu zanlıları listesinin en üst sıralarındaki üç kişiden biriydi.