Бабич бе обвинен от Международния наказателен трибунал за бивша Югославия (МНТБЮ) през ноември 2003 г. по един пункт на обвинението в престъпления срещу човечеството за преследване по политически, расови и религиозни причини, както и по четири пункта за нарушение на законите и обичаите за водене на война, включително убийство, малтретиране, произволно или ненужно от военна гледна точка разрушаване на села и разрушаване или нанасяне на щети на образователни или религиозни сгради.
Babiç'e, Kasım 2003'te Eski Yugoslavya Hakkındaki Uluslararası Ceza Mahkemesi (ICTY) tarafından siyasi, ırksal ve dini sebeplerle zulmetmekten insanlığa karşı suçun yanı sıra aralarında cinayet, kötü muamele, köylerin nedensiz ve askeri açıdan gereksiz imhası ve eğitim amaçlı ve dini kurumlara hasar vermenin de yer aldığı dört adet savaş yasa ve geleneklerini ihlal iddiasıyla suçlamada bulunulmuştu.