След като се оттегля от активна спортна кариера през 1966 г., Кючюкандонядис работи като треньор на известни клубове в Гърция, Южна Африка и Турция, сред които са "Егалео", "Йоханесбург", "Самсунспор" и други.
Türkiye’den yurtdışına transfer olan ilk futbolcu olarak 1951 yılında İtalya’nın Fiorentina kulübüne gitti. 1966 yılında futbolu bırakan Küçükandonyadis, Yunanistan’da Egaleo, Güney Afrika’da Johannesburg ve Türkiye’de ise Samsunspor gibi önemli takımların teknik direktörlüğünü yaptı.