Той бе похвален още и за ролята си на посредник през 2005 г. в мирното споразумение между сепаратисткото Движение за освобождение на Ачех и индонезийското правителство, което сложи край на близо 30 години борба.
Ahtisaari, ayrılıkçı Özgür Aceh Hareketi ile Endonezya hükümeti arasındaki yaklaşık 30 yıllık savaşı sona erdiren 2005 barış anlaşmasındaki arabuluculuk rolünden ötürü de övgü aldı.