Стипе Месич, който печели президентстките избори през февруари 2000 г., освобождава Готовина от военна служба на 29 септември същата година.
Şubat 2000'de Hırvatistan cumhurbaşkanlığı seçimlerini kazanan Stipe Mesic, aynı yılın 29 Eylül günü Gotovina'yı ordudan ihraç etti.