След като се оттегля от активна спортна кариера през 1966 г., Кючюкандонядис работи като треньор на известни клубове в Гърция, Южна Африка и Турция, сред които са "Егалео", "Йоханесбург", "Самсунспор" и други.
Pas daljes së tij në pension si futbollist aktiv në vitin 1966, Kuçukandoniadis shërbeu si trajner për klube të njohura në Greqi, Afrikën e Jugut dhe Turqi, si për Egaleo FC, Johannesburg dhe Samsunspor, mes të tjerash.