Караджич, който упражнява както формално, така и де факто власт и контрол върху босненските сръбски сили и всички власти и СДП, също е обвинен във връзка с убийствата през юли 1995 г. на 8000 босненски мюсюлмани - мъже и момчета, заловени в няколко различни места в и около определената от ООН за "безопасна зона" Сребреница.
Karaxhiç i cili ushtroi si pushtetin dhe kontrollin zyrtar dhe atë de facto mbi forcat serbe boshnjake dhe të gjithë SDS dhe autoritetet qeverisëse, u padit gjithashtu në lidhje me vrasjet e korrikut 1995 të deri në 8,000 burrave e djemve muslimanë boshnjakë kapur në disa vende të ndryshme në dhe pranë "zonës së sigurtë" të Srebrenicës.