Войските бяха под юрисдикцията на двете предимно етнически автономни области на БиХ - Република Сръбска и мюсюлманско-хърватската федерация.
Ushtritë kanë qenë nën juridiksionin e dy njësive të mëdha etnike që përbëjnë BiH: Republika Serbe dhe Federata Muslimano-Kroate.