Назначен на длъжността от Слободан Милошевич, Павкович командваше сръбските въоръжени сили в периода 1998-1999 г., по време на конфликта в Косово и остана на поста до края на юни 2000 г.
Pavkoviç, i emëruar nga Sllobodan Millosheviç, udhëhoqi forcat serbe gjatë fushatës së viteve 1998-1999 në Kosovë dhe mbajti funksionin e tij si shefi i ushtrisë deri në fund të qershorit 2002.