По време на двата президентски мандата на Глигоров, между 1991 и 1999 г., Македония стана член на ООН под временното наименование "Бивша югославска република Македония", прие временното споразумение с Гърция през 1995 г. и премина през противоречив икономически преход.
Gjatë dy mandateve të Gligorovit si president, mes 1991-shit dhe 1999-tës, Maqedonia u bë një anëtare e OKB-së nën referimin e përkohshëm "Republika ish-Jugosllave e Maqedonisë", pranoi Marrëveshjen e Përkohëshme më 1995 me Greqinë dhe kaloi përmes një tranzicioni ekonomik polemik.