Готовина, който оглавява списъка на най-издирваните от Трибунала на ООН обвиняеми заедно с военновременните лидери на босненските сърби Радован Караджич и Ратко Младич, бе обвинен през юни 2001 г.
Gotovina, împreună cu liderii sârbo-bosniaci din timpul războiului Radovan Karadzic şi Ratko Mladic, se află printre principalii inculpaţi urmăriţi de tribunalul ONU şi a fost pus sub urmărire penală în iunie 2001.