Турската влиятелна и силно светски настроена армия, която е подозрителна към свързаната с ислямизма ПСР още от идването й на власт през 2003 г., отрича всякаква връзка с „Ергенекон” и сътрудничи на разследването.
Puternica armată a Turciei, care are o poziţie ferm secularistă şi a avut suspiciuni legate de AKP, despre care se ştie că are rădăcini islamice, încă de la urcarea la putere a AKP în 2003, a negat orice legătură cu cazul Ergenekon şi a cooperat cu investigaţia.