Отношенията му с йерархията на Католическата църква са постоянно напрегнати, тъй като той критикува намесата им в политиката, а те го критикуват, че не защитава националните интереси.
Relaţiile lui Mesic cu ierarhia Bisericii Catolice au fost permanent tensionate, acesta emiţând critici cu privire la implicarea bisericii în politică, iar aceasta criticându-l şi susţinând că nu apără interesele naţionale.