Стамболич изчезна, когато е тичал сутринта в белградски парк на 25 август 2000 г., само няколко седмици преди президентските избори, на които той щеше да участва срещу Милошевич - бивш съюзник, превърнал се в негов враг.
Stambolic disappeared while taking his morning jog in a Belgrade park on 25 August 2000, only weeks before presidential elections in which he was expected to run against Milosevic, a former ally turned foe.