Милутинович бе обвинен заедно с Милошевич и трима други бивши сръбски висши длъжностни лица като участник в общото престъпно начинание за изгонването на значителна част от албанското население от Косово, за да бъде постигнат постоянен сръбски контрол над провинцията.
Milutinovic has been indicted alongside Milosevic and three other former top Serb officials as a member of a joint criminal enterprise to expel a substantial portion of the Albanian population from Kosovo, to ensure continued Serbian control over the province.