Ислямистките корени на ПСР обаче предизвикаха подозренията на силните военни в страната, които смятат себе си за гарант на светския ред в Турция, макар Ердоган и други партийни лидери неколкократно да подчертават, че нямат скрита религиозна партийна програма.
Ωστόσο, οι Ισλαμικές ρίζες του ΑΚΡ έχουν πυροδοτήσει υποψίες στον ισχυρό στρατό της χώρας, ο οποίος θεωρεί πως ρόλος του είναι η εξασφάλιση της κοσμικής τάξης στην Τουρκία, αν και ο Ερντογάν, καθώς και άλλα κομματικά στελέχη, έχουν επανειλημμένως δηλώσει ότι δεν διαθέτουν μυστική θρησκευτική ατζέντα.