Тя оттегли също акредитацията на две държавни агенции за управление на фондовете по предприсъединителната програма ФАР поради съмнения за случаи на измама и нередности, но заяви, че ще отмени решението си, след като София предприеме корективни действия.
Επίσης, απέσυρε τη διαπίστευση δυο κρατικών υπηρεσιών που διαχειρίζονταν κονδύλια στο πλαίσιο του προενταξιακού προγράμματος PHARE, λόγω ύποπτων υποθέσεων απάτης και παρατυπιών, ωστόσο ανέφερε ότι θα προβεί σε απόφαση αφού λάβει η Σόφια διορθωτικές ενέργειες.