Готовина бе един от тримата най-издирвани обвинени във военни престъпления, извършени по време на конфликтите на Балканите през 1990-те тодини, заедно с бившия лидер на босненските сърби Радован Караджич и неговия военен командир Ратко Младич.
Ο Γκοτόβινα ήταν ένας από τους τρεις βασικούς καταζητούμενους φυγόδικους εγκλημάτων πολέμου από τις Βαλκανικές συγκρούσεις της δεκαετίας του 1990, μαζί με τον πρώην Σερβοβόσνιο ηγέτη Ράντοβαν Κάραζιτς και το στρατιωτικό διοικητή του Ράτκο Μλάντιτς.