Проектът за Камара за военните престъпления първо предвиждаше изграждане на нов затвор под контрола на централното правителство, тъй като понастоящем затворите в БиХ са под контрола на двете автономни области.
Το σχέδιο του δικαστήριο εγκλημάτων πολέμου αρχικά είχε προτείνει την κατασκευή νέων φυλακών υπό την αιγίδα της κεντρικής κυβέρνησης, καθώς οι φυλακές της Β-Ε βρίσκονται υπό την αιγίδα των δυο οντοτήτων.