Националната програма предвижда и прехвърляне на отговорностите за граничния контрол от македонската армия към вътрешното министерство - процес, започнал през май с прехвърлянето на отговорностите по южната граница, който се очаква да приключи до края на 2005 г.
Το Εθνικό Πρόγραμμα περιλαμβάνει επίσης τη μεταφορά αρμοδιοτήτων συνοριακής ασφάλειας από τον ARM στο υπουργείο Εσωτερικών -- διαδικασία η οποία ξεκίνησε το Μάη, με την παράδοση των νοτίων συνόρων, και αναμένεται να ολοκληρωθεί μέχρι τα τέλη του 2005.