Макар че организацията има подразделение, което функционира като търговско дружество, в голямата си част работата на БМРР се извършва от нестопанското й звено, спонсорирано от десетина филантропични организации, между които Фонд "Братя Рокфелер" и Балканският тръст за демокрация, и европейски правителства, Холандия и Норвегия.
Μολονότι ένα τμήμα του οργανισμού λειτουργεί σε εμπορική βάση, το μέγα μέρος του έργου του BIRN επιτελείται από το μη κερδοσκοπικό του σκέλος, το οποίο υποστηρίζεται χρηματικά από περίπου 12 φιλανθρωπικά ιδρύματα – στα οποία περιλαμβάνεται το ταμείο των αδελφών Ροκφέλερ και το Βαλκανικό Ταμείο για τη Δημοκρατία – καθώς και ευρωπαϊκές κυβερνήσεις, η Ολλανδία και η Νορβηγία.