По това време Йованович е заместник-командир на ОСО, внедрен там от известните с лошата си слава паравоенни формирования на Милошевич, които са воювали в балканските войни през 90-те.
Εκείνο το διάστημα, ο Γιοβάνοβιτς ήταν υποδιοικητής της JSO, η οποία συγκροτήθηκε από τις τάξεις των περιβόητων παραστρατιωτικών μονάδων του Μιλόσεβιτς που πολέμησαν κατά τη διάρκεια των βαλκανικών πολέμων τη δεκαετία του 1990.