Глигоров обаче си навлече гнева на страната през 1994 г., когато каза пред гръцки медии, че македонците са славянски народ, дошъл на Балканите през 6-и век, и нямат връзка с Александър Македонски и неговата цивилизация.
Ωστόσο, ο Γκλιγκόροφ είχε προκαλέσει επίσης οργή στη χώρα του το 1994 όταν δήλωσε σε ελληνικά ΜΜΕ πως οι πολίτες της πΓΔΜ είναι Σλαβικός λαός, ο οποίος ήρθε στα Βαλκάνια τον 6ο αιώνα, και δεν έχει καμία σχέση με το Μέγα Αλέξανδρο και τον πολιτισμό του.