Прокуратурата твърди, че "Ергенекон” има широко разклонени клетки, включващи медийни деятели и наемни убийци, но че тези клетки не контактуват помежду си, а получават нарежданията си от горе.
Εισαγγελείς αναφέρουν ότι η Εργκένεκον διαθέτει εκτεταμένο πυρήνα, ο οποίος περιλαμβάνει από προσωπικότητες των ΜΜΕ μέχρι δολοφόνους, ωστόσο δεν έχουν επαφή μεταξύ τους και λαμβάνουν οδηγίες από την ηγεσία.