Предявяват му се и две обвинения в геноцид заради 44-месечната обсада на Сараево и клането в Сребреница от 1995 г., което е най-голямата жестокост, извършена в Европа след Втората световна война.
Ο Κάρατζιτς αντιμετωπίζει δύο κατηγορίες γενοκτονίας για την 44μηνη πολιορκία του Σεράγεβο και το μακελειό της Σρεμπρένιτσα το 1995, τη χειρότερη θηριωδία στην Ευρώπη από την εποχή του 2ου Παγκοσμίου Πολέμου.