Войските бяха под юрисдикцията на двете предимно етнически автономни области на БиХ - Република Сръбска и мюсюлманско-хърватската федерация.
Οι στρατιωτικοί ήταν η εξουσιοδότηση των δύο μεγαλύτερων εθνικών οντοτήτων που αποτελούν την Β-Ε --Δημοκρατία της Σρέπσκα και Μουσουλμανική-Κροατική Ομοσπονδία.