В това си качество той фактически и юридически командва и контролира всички хърватски сили, участващи в операция “Буря” в южната част на района на Краина, твърдят прокурорите на ООН в изменения обвинителен акт срещу Готовина, който бе публикуван през март 2004 г.
Υπό το ρόλο αυτό, ασκούσε τον ουσιαστικό ή άλλως έλεγχο και διοίκηση των κροατικών δυνάμεων που μετείχαν στην επιχείρηση Καταιγίδα στο νότιο τμήμα της περιοχής της Κράινα, ισχυρίστηκαν οι εισαγγελείς του δικαστηρίου στην τροποποιημένη κατηγορία κατά του Γκοτόβινα που δημοσιεύτηκε το Μάρτιο του 2004.