Въпросът с муджахадините е много деликатен в БиХ поради нарасналите опасения след нападенията срещу САЩ на 11 септември 2001 г., че някои от бойците, останали в БиХ след войната, могат да са свързани с терористични групи.
Το θέμα των μουζαχαντίν είναι πολύ ευαίσθητο στην Β&Ε εάν ληφθούν υπόψη οι αυξημένοι φόβοι μετά τις επιθέσεις της 11ης Σεπτεμβρίου 2001, στις Ηνωμένες Πολιτείες, ότι ορισμένοι από τους άνδρες που παρέμειναν στη Β&Ε μετά τον πόλεμο ενδεχομένως να συμμετέχουν σε τρομοκρατικές ομάδες.