Граничният й спор със Словения обаче се превърна в основна пречка към края на 2008 г., когато заради него Любляна реши да блокира кандидатурата на Загреб за членство в ЕС.
Αλλά η συνοριακή διαφωνία με τη γειτονική Σλοβενία αποδείχθηκε σημαντικό εμπόδιο στα τέλη του 2008, όταν η Λιουμπλάνα αποφάσισε να εμποδίσει την προσπάθεια ένταξης του Ζάγκρεμπ στην ΕΕ.