По време на войната Караджич бе президент на босненско-сръбската република и председател на нейния съвет за национална сигурност, а така също главнокомандващ босненско-сръбските въоръжени сили и лидер на Сръбската демократическа партия.
Κατά τη διάρκεια του πολέμου, ο Κάρατζιτς ήταν πρόεδρος της Βοσνιοσερβικής δημοκρατίας και του Εθνικού της Συμβουλίου Ασφαλείας καθώς και ανώτατος διοικητής των σερβικών ενόπλων δυνάμεων της Βοσνίας και ηγέτης του Σερβικού Δημοκρατικού Κόμματος.