Дългогодишното разделение на Кипър е най-голямата пречка пред укрепването на сътрудничеството, а също така оказва негативно влияние и върху кандидатурата на Турция за членство в ЕС.
Η εδώ και δεκαετίες διχοτόμηση της Κύπρου αποτελεί το μεγαλύτερο πρόβλημα στην ενίσχυση της συνεργασίας, ενώ έχει επίσης πλήξει την προσπάθεια ένταξης της Τουρκίας στην ΕΕ.