Разследването на Ергенекон започна през 2007 г. с конфискуването на няколко десетки ръчни гранати в барака в Истанбул, но за пръв път "Ергенекон" се споменава през 1996 г., половин десетилетие преди основаването на ПСР.
Η έρευνα στην υπόθεση Εργκένεκον ξεκίνησε το 2007 με την κατάσχεση αρκετών δεκάδων χειροβομβίδων σε ένα σπίτι-παράγκα στην Ιστανμπούλ, ωστόσο η πρώτη αναφορά στην Εργκένεκον ανάγεται στο 1996, πέντε χρόνια πριν τη σύσταση του ΚΔΑ.