Ο Γκοτόβινα ήταν ένας από τους τρεις πιο καταζητούμενους φυγόδικους εγκλημάτων πολέμου από την περίοδο των βαλκανικών συγκρούσεων της δεκαετίας του 1990, μαζί με τον πρώην βοσνιοσέρβο ηγέτη Ράντοβαν Κάρατζιτς και τον στρατιωτικό του διοικητή Ράτκο Μλάντιτς.
Gotovina was one of the three most wanted war crimes fugitives from the Balkan conflicts in the 1990s, along with former Bosnian Serb leader Radovan Karadzic and his military commander, Ratko Mladic.