Όπως και άλλα ιδρύματα της Β-Ε, το MPI θα έχει τριμερή ηγεσία με εκπροσώπους και από τις τρεις εθνικές ομάδες, οι οποίοι θα κατέχουν θέσεις εκ περιτροπής.
Like other BiH institutions, the MPI will have a tripartite leadership with representatives from each of the three ethnic groups holding rotating positions.