Όταν ξέσπασε η ένοπλη σύγκρουση με τη Σερβία το 1998, ο Ρουγκόβα εκτοπίστηκε από τον επαναστατικό Απελευθερωτικό Στρατό του Κοσσυφοπεδίου, καθώς αρκετοί Αλβανοί τον θεώρησαν πολύ παθητικό.
When the armed conflict with Serbia broke out in 1998, Rugova was sidelined by the rebel Kosovo Liberation Army, as many ethnic Albanians considered him too passive.