Sa lado nin akademiko, si Alzona nagsurat nin nagkapirang mga libro sa historya kan Filipinas. An saiyang inot na libro, na naipublikar kaidtong 1932, iyo may titulo na A History of Education in the Philippines 1565–1930. May pagbisto ini bilang (sa Ingles) "a comprehensive account of the education and cultural development of the country [and] probably the most complete and comprehensive work on the subject to date". Si Alzona nagsurat man nin mga biyograpiya para sa mga kababaihan arug ki Paz Guazon asin Librada Avelino, asin nagpalis sa mga historikal na kagibohan ni Jose Rizal sagkod Graciano Lopez Jaena. Nagin awtor man siya nin sarong historikal na monograp na nakasurat sa lenggwaheng Espanyol na iyo an El Llegado de España a Filipinas, kun sain siya nakaresibe nin Lone Prize na piggawad kan Il Congreso de Hispanistas de Filipinas kaidtong 1954.