Am Amerikanong kolonyal na gobyerno iyo pigtogdas ini kan 1901 bilang an Philippine Weather Bureau, na naglakop sa meteorolohiya, astronomiya, asin heomagnetismo. Nagpundo an bureau kan Ikaduwang Gerang Pankinaban. Durante sa Labanan sa Manila, an gabos na mga instrumento asin importanteng dokumento kan bureau iyo nadistroso sagkod naraot na dagos. Sarong ispesipikong gobyernong ahensya an naitogdas bilang saiyang karibay. An obserbatoryo nagpadagos liwat nin operasyon kan 1951 sa Baguio, pangenot sa pag-aadal kan sismolohiya asin kan iyonospero. Kan 1963, ini iyo pigbalyo sa kampus sa Loyola Heights kan Ateneo de Manila na Unibersidad kun sain ini nagpadagos sa pag-aadal sa sismolohiya, heomagnetismo, asin pisikang radyo, asin iba pa.