Durante kan Ikaduwang Gerang Pankinaban, an pwersang Hapon ginibo an simbahan na kampo konsentrasyon kan mga preso. Manta na an batalya sa Manila kan 1945 naghihinapos, an mga Hapon pigkulong mga padi asin ginatos na mga residente sa laog kan simbahan. Ngani mapalayas an mga Hapon nagpapa-ipli sa laog, an pwersang Amerikano asin Filipino nagkondukta nin air raid sa Intramuros. Gibo kaini, mga estruktura sa laog kan pinader na siyudad biyo na nagkagaraba alagad milagrosong an Simbahan nin San Agustin mismo nakatindog pa giraray; saro ini sa kakadikit na nawalat bilog sa Intramuros pakatapos kan gera.