Bunga kan pagkadaog ni Saddam Hussein sa Gerang Golpo (1991), asin resulta man kan Operation Provide Comfort kan mga Amerikano na iyo an pagsurog kaini sa mga Kurdo,  nakamit kan mga Kurdo an total na pagkapot asin pagkontrol kan saindang inaapod na tradisyonal na erokan asin teritoryo sa may bandang amnayan kan Irak, na midbid bilang Kurdistan Irak o "Kurdistan Habagatan". Namukna an inapod na autonomong sona sa parteng ini huli kan mga pangyayari, asin sarong eleksyon na talingkas- na enot nanggad na pangyari sa Irak - an ginibo kan 1992. Duwang partido pulitikal na Kurdo an nagbanggaan sa eleksyon, an Partido Demokratikong Kurdistan (PDK) asin an Patriotikong Buronyog kan Kurdistan (PBK) na pinamoonan ni Jalal Talabani. An duwang partido ogaring nabanga nanggad an boto kaya pighiriras an mga ministro nin pantay-pantay sa magkaduwang lado. Alagad, kan Mayo 1994 nagpolpogan an Peshmerga kan PDK asin PBK kun saen si Barzani kan taon 1996 hinagad an asistensya kan  rehimen ni Saddam Hussein ngane madaog niya an pwersa kan PBK, na an huri man ngane naghahagad tabang sa Iran. An PDK naalaw an pwersa kan PBK sa mga mayor na syudad kan Iraki Kurdistan, pero an inalaw na PBK nagtiripon liwat asin nasakop asin nakaptan man an Suleimani asin ibang parte kan probinsya nin Hawler. Kan  natapos an gera sibil, huli sa pakikiaram kan mga Amerikano, an sona Kurdo nabanga sa duwang pwersa, an PDK kapot an Amnayan-solnopan na parte, an PBK, kapot an Habagatan-subangan. Pero kan Pagsakyada kan Irak taon 2003 kan mga pwersang amerikano, an  duwang lado luwayluway nagtogdas nin sarong bugkos na gobyerno rehiyonal. Si Barzani nagin myembro sa mas dakulang Konseho Gobyerno kan Irak asin nagin ngane pamayo kaini kan Abril 2004. Dangan siya napili na Presidente kan Rona nin Iraking Kurdistan kan Parlamento kan Iraking Kurdistan kan Hunyo 2005.