Kan Enero 10, 2004, si Salonga ikinasal ki Robert Charles Chien, sa Intsik-Hapon na tagapamahalang direktor kan sarong kompanya nin entertainment software sa Los Angeles, California, na saiyang nanagboan mantang nagkakanta sa Flower Drum Song. They have one daughter. Si Salonga saro man na panatiko nin video game. Siya nakaistar sa Filipinas asin Estados Unidos.