تم جمع هذه التطورات، إلى جانب نتائج علم الأجنة وعلم الحفريات، في نظرية التطور عن طريق الانتقاء الطبيعي لتشارلز داروين التي نُشرت عام 1859. وبذلك اتخذ داروين منهجًا جديدًا في نظرية التطور العضوي، عن طريق توضيح العمليات التي يمكن أن يحدث التطور من خلالها، وتقديم أدلة قائمة على الملاحظة على قيامه بذلك.