এই আবেদনের প্রেক্ষিতে ২০০৮ সালের ফেব্রুয়ারি মাসে তত্কালীন মহানগর দায়রা জজ এএনএম বশিরউল্লাহ ৭টি নির্দেশনা দিয়ে মামলা দুটি অধিকতর তদন্তের নির্দেশ দেন। বর্তমান তদন্ত কর্মকর্তা দাবি করেন অস্ত্র চালানবাহী জাহাজটি চিহ্নিত করা ছাড়া আদালতের ৬টি নির্দেশনা অনুযায়ী তদন্ত শেষ করা হয়েছে।