Un tema central de la serie son las cutie marks, símbolos icónicos que aparecen mágicamente, una vez que hayan descubierto su talento especial en la vida. Mientras que los ponis adultos se ven físicamente jóvenes, las seis personajes principales deben ser considerados como a los adolescentes humanos en el rango de 14 a 18 años de edad. En el episodio Crónicas de la Amistadmuestra cómo cada una de las ponis recibieron su cutie mark cuando eran muy jóvenes. Varios episodios se centran en las hazañas de un trío de ponis mucho más jóvenes que se hacen llamar las Cutie Mark Crusaders (formado por Apple Bloom, hermana de Applejack; Sweetie Belle, hermana de Rarity; Scootaloo, hermana adoptiva de Rainbow Dash; en la 3° temporada; Babs Seed, prima de Apple Bloom; y en la 6° temporada; Gabby una grifo), que aún no habían recibido sus cutie marks y eran víctimas de burlas por otras ponis jóvenes como costados en blanco. En respuesta, ellas tratan de descubrir sus talentos y recibir sus propias cutie marks, a menudo haciéndolo de manera cómica. 