28 чэрвеня 2001 г. Мінскі дзяржаўны медыцынскі інстытут перайменаваны ў дзяржаўную вышэйшую навучальную ўстанову Беларускі дзяржаўны медыцынскі ўніверсітэт». З 2001 года БДМУ мае статус вядучага медыцынскага ўніверсітэта Рэспублікі Беларусь.