1 лістапада 1989 г. член-карэспандэнт АН БССР Ф. М. Капуцкі быў прызначаны першым прарэктарам па вучэбнай рабоце БДУ. У сувязі з гэтым прызначэннем ён быў вызвалены ад штатнай пасады загадчыка кафедрай і лабараторыяй, узначаліўшы іх на грамадскіх пачатках. Пачынаўся новы, бадай самы складаны перыяд дзейнасці.