Уніяцкая Царква ў розны час падпарадкоўвалася такім дзяржаўным установам як Міністэрства народнай асьветы і іншаземных веравызнаньняў, Міністэрства ўнураных справаў, галоўнае ўпраўленьне (з 1832 — дэпартамент) іншаземных веравызнаньняў, другі дэпартамент Рыма-каталіцкай калегіі, Грэка-ўніяцкая калегія. Іх дзейнасьць таксама адлюстроўвае палітыку Мікалая І адносна Ўніяцкай Царквы.