Siya naelihir sa pwetong Primer Ministro kan enot na gobyerno kan 17 Marso Supremo Konseho nin Lithuania. Huli kaini, siya an nagin pinakaenot na babae na nangagin Primer Ministro nin Lituania. Siya tolos an nagsabat kan mga problema na resulta kan embargo ekonomiko na isinapaw ni Mikhail Gorbachev sa pagngata kutana na magbalik sa kontrol kan nagbabaraak nang USSR an Lituania. Si Prunskienė naglayog sa iba-ibang mga nasyon pati na sa Estados Unidos, sa paghinowa na makua an mga suporta kaini sa negosasyon niya ki Gorbachev ngani mahale an embago asin di nulok niya an Helsinki Commission. Pakalihis siyam na bulan sa opisyo, siya nagbutas na asin ngapit pinamayohan niya an Departamento nin Agrikultura nin Lithuania.