Nakurtihan an Dagat Selebes nin abot sa 42 milyong taon harayong-harayo sa lawas kan dagá. 22 milyong taon nakalihis, mga hiro sa irarom na pigtulak an Selebes parani sa mga bulkan kan Indonesya asin Filipinas para makakuha nin yabat. 12 milyong taon pa an nakalihis sagkod ang an Dagat Selebes pigiba kan yabat na pangkontinental, kaiba an karbon, na ipigbulos gikan sa nagtatambong bukid sa Borneo asin sa lunas na dumaong kaatubangan kan Eurasia.