Nuevamente candidatu presidencial nochobre de 1999, depués de ganar nes internes partidaries a Danilo Astori pol 82.4% de los votos, foil candidatu más votáu al llograr el 40,11% de los sufraxos, polo que tuvo que definir la so eleición na segunda vuelta eleutoral col candidatu del Partíu Coloráu, Jorge Batlle. Nesta definición llogról 45.87% de los votos, resultando vencedor Batlle.