Yrigoyen foi cuestionáu por integrantes del so propiu partíu por exercer un lideralgu personalista. Foi asocedíu na presidencia pol tamién radical Marcelo T. de Alvear, mientres quel so mandatu producir el quebre de la UCR en dos partíos, arrexuntando unu a los yrigoyenistas y lotru a los antipersonalistas. La eleición presidencial de 1928 se polarizó ente dos partíos radicales: per un sitiu la Unión Cívica Radical con Yrigoyen a la cabeza y pol otru la Unión Cívica Radical Antipersonalista cola candidatura de Leopoldo Melo. Yrigoyen ganó per segunda vegada con amplia mayoría nunes eleiciones que fueron conocíes como «el plebiscitu». Mientres el so segundu mandáu asocediól Crac del 29, la mayor crisis financiera mundial hasta esi momentu. El gobiernu nun pudo reaccionar ante la crisis y foi perdiendo sofitu. Poco primero de el so derrocamientu, el so gobiernu tuvo cerca de llograr la nacionalización del petroleu, un fechu que se considera una de les causes del golpe dEstáu. El 6 de setiembre de 1930 foi derrocáu pol golpe lideráu pol xeneral José Félix Uriburu. Desaposiáu de les sos riqueces como estanciero, foi confináu a la isla Martín García, onde compartió presidiu con dellos presos políticos. Finól 3 de xunetu de 1933. El so entierru foi una de les manifestaciones bonales más masives y sorpresives de la hestoria arxentina, dirixíu hastal panteón de los cayíos na Revolución del Parque, que ye onde permanez. La orientación política del gobiernu de Hipólito Yrigoyen dio llugar a lapaición del yrigoyenismo como corriente ideolóxica dientro del radicalismu arxentín.