La última aición importante de la Guerra de Castes foil sitiu que los mayes impunxeron a Tihosuco por tiempu de 50 díes, en 1865. La rindición definitiva de los mayes consiguir el Xeneral Ignacio A. Bravo, quién en 1899 ocupó la xefatura militar de Yucatán. Bravo entamó una meyora paulatina y consolidó toles posiciones ganaes, hasta quocupó definitivamente Chan Santa Cruz en mayu de 1901, colo que la península quedó sol control direutu del Gobiernu Federal. Sería un añu más tarde cuando Yucatán sufriría la segunda dixebra territorial, al decretase la creación del territoriu federal de Quintana Roo, con capital nel puertu de Payu Obispu (güei Chetumal). Con esto, tres mediu sieglu aciar, Yucatán sería desmembrado perdiendo más de les dos terceres partes del so territoriu orixinal.