Metal Gear Solid 3: Snake Eater, que ye cronológicamente el primer xuegu de la serie, presenta una versión más nueva de Big Boss, cuando taba sol nome en clave de Naked Snake, mientres la Guerra Fría. El xuegu centrar na evolución desti postreru, daprendiz a soldáu llexendariu, según la cayida de la so mentora y figura matriarcal, The Boss. Depués duna supuesta deserción desta postrera escontra la Xunión Soviética, y pevitar un llanzamientu nuclear escontra los Estaos Xuníos, Naked Snake ye unviáu a Rusia pa matar a The Boss y terminar cola amenaza entamada por Yevgeny Borisovitch Volgin, un coronel del Departamentu Central dIntelixencia, con planes de derrocar al gobiernu soviéticu. Los oríxenes de «Metal Gear», Los Patriots, y lunidá FOXHOUND, esplorar nel xuegu.