Consecuentemente y siendo inda diputáu per San José, Luis Eduardo Pérez foi nomáu vicepresidente del Primer Congresu Patriu celebrául 14 de xunu de 1825 na villa de Florida, nel cual fíxose la declaratoria unánime pola independencia de la Provincia Oriental con respectu al Imperiu brasilanu, según el so reincorporación a les Provincies Xuníes del Ríu de la Plata, polo cual como vicepresidente robló lactal día 25 dagostu.