Güei, tol procesu de la PCR ta automatizado por aciu un aparatu llamáu termociclador, que dexa calecer y esfrecer los tubos de reacción pa controlar la temperatura necesario pa cada etapa de la reacción. Munchos termocicladores modernos faen usu del efeutu Peltier, que dexa tantu calecer como esfrecer los tubos a cencielles invirtiendo la corriente llétrica. Los tubos usaos pa PCR tienen una paré bien fina, lo que favorez una bona conductividá térmica, dexando que salgame rápidol equilibriu térmicu. Casi tolos termocicladores tienen un sistema que calez la tapa de zarru col fin devitar la condensación sobre los tubos de reacción. Los termocicladores más antiguos escarecíen desti sistema y solucionaben el problema de la condensación con una capa daceite na parte cimera del amiestu de reacción o con un pocu de cera dientro de los tubos. Anguaño esisten dellos termocicladores quutilicen o pueden utilizar aceite mineral nel tubu de PCR como los termocicladores de nueva xeneración de fluxu de aíre.