En 2004, Jovovich volvió interpretar el papel de Alice na secuela de Resident Evil, Resident Evil: Apocalypse. El papel riquía formase tres hores al día pa lluchar. Amás de los trés meses enantes de la filmación na quhabía «entrenamientu de tiru, artes marciales, tou». Apocalipsis recibió reaiciones entá más negatives de los críticos que la primer película. Tres lestrenu, Jovovich nun taba satisfecha coles resultancies y lesfuerzu del direutor Alexander Witt. Señaló mientres una entrevista esi añu que les sos películes daición amosaben la parte comercial de la so carrera, ente quactuaba en «les películes independientes que nunca sobresalieron» paselar el so llau artísticu, y «ye un bon equilibriu». Al añu siguiente, apaeció nun fallíu tráiler pa una adautación de Calígula de Gore Vidal como Drusilla. En 2006, la película de Jovovich, thriller de ciencia ficción Ultraviolet, foi llanzadal 3 de marzu. Jovovich tamién protagonizó la película .45, como Kat, la novia movida pola vengación dun comerciante illegal de drogues y armes, interpretáu pol actor y DJ inglés Angus MacFayden.