El Llibertador designar ministru del Interior en 1829, y en 1830 ministru de Rellaciones Esteriores. El 2 de marzu desi mesmu añu ocupó, como presidente del Conseyu de Ministros, la Presidencia de la República en reemplazu de Bolívar por haber esti dimitíu antel Congresu. El 4 de mayu siguiente, el Congresu escoyó de presidente de la República a Joaquín Mosquera y de vicepresidente al xeneral Domingo Caycedo, quien siguió al frente del gobiernu hastal 15 de xunu, cuando llegó Mosquera a Bogotá. El 2 dagostu de 1830, nuevamente asumiól mandu hastal 17 del mesmu mes. El 4 de setiembre retirar del mandu tantul presidente, Mosquera, comol vicepresidente, Caycedo, dempués de los incidentes col batallón Callao, y el 5 asumió la dictadural xeneral Rafael Urdaneta.