Yá entrául sieglu XVI la ilesia gótica esperimental so tresformamientu al estilu mudéxar. Nesta centuria asoceden fechos de trescendencia pal templu, como la construcción duna bóveda estrellada de crucería flamíxera llena de florones rellucientes doru (1504-1515), a semeyanza de les quafataben el Palaciu de la Aljafería.