La presencia de Companys en París amenara reticencies per parte de les autoridaes franceses, que lo queríen fora de la capital pol so radicalismu y por ximelgar a les mases de refuxaos. Por cuenta de ello Companys abandonó París en xunu de 1939. Gracies a les xestiones de Joan Casanelles, antiguu diputáu y amigu de Companys, el presidente y la so esposa establecer na llocalidá bretona de La Baule-les-Pins (Loira Atlánticu). Dende ellí movíase frecuentemente a París, tantu pa tar al corriente de los asuntos xestionaos na oficina parisina de la Xeneralidá, como pa visitar al so fíu Lluís, que taba internáu nun sanatoriu por cuenta de la so grave enfermedá mental. En mayu la so fía Maria, xuntu col so home, Hèctor Gally, partieren escontra Méxicu. A pesar de los ruegos de la so fía, Companys decidió quedase en Francia pa nun perder el contautu col so fíu. Cola gana francesa ante lAlemaña nazi y la firma de la capitulación, el matrimoniu Companys quedó na zona ocupada. Tres la cayida de París en manes de los alemanes (14 de xunu), lembaxador español en Francia, José Félix de Lequerica, solicitó a les nueves autoridaes que toles organizaciones de exiliaos españoles ya instituciones polítiques fueren disueltes. Cola collaboración de les autoridaes alemanes, el personal de la embaxada pudo prindase de tol patrimoniu de diches organizaciones. Tres la firma del armisticiu, Ramón Serrano Súñer, ministru de la Gobernación, unvió a Francia al secretariu xeneral de la Direición Xeneral de Seguridá, coles mires dalcontrar a los dirixentes republicanos quentá taben en Francia, consiguir la so captura y entrega a España. Gracies a la documentación prindada, el 8 dagostu les autoridaes de la zona docupación alemana recibieron una llista con 800 nomes pa la so detención y entrega a les autoridaes franquistes. El 13 dagostu axentes alemanes de la policía militar alemana detuvieron a Companys nuna casa de La Baule-les-Pins, xunto a Nantes. y apurrir a les autoridaes franquistes el 29 dagostu de 1940.