El sistema de puntos del Tour de Francia 1905 resultó abondo positivu pamenorgar les trampes feches polos ciclistes, polo que los organizadores decidieron volver emplegar nuevamente en 1906, anque con dellos cambeos: mientres en 1905 les diferencies de tiempu teníen dalgún efeutu na distribución de los puntos, en 1906 les diferencies de tiempu nun yeren compatibilizaes, y los puntos namái se daben col orde en que remataben la etapa los ciclistes. El ganador de la etapa recibía un puntu, el segundu ciclista dos puntos y asina socesivamente. Al rematar la octava etapa, namái quedaben en competición 16 ciclistes, y los resultaos de les primeres ocho etapes volvieron calculase, teniendo en cuenta namái los ciclistes que quedaben, redistribuyendo los puntos ente los ciclistes restantes acordies coles les sos posiciones naquelles etapes.