En 1997 Watson tornó al cine con The Mill on the Floss, The Boxer y Metroland. En 1999, otra vegada como en 1996, Watson foi nomada pa un Oscar como meyor actriz pola so interpretación de la chelista británica Jacqueline du Pré na película Hilary and Jackie. En 1999 actuó en Cradle Will Rock, estrenada nEspaña como Cradle Will Rock, dirixida por Tim Robbins, y Angelas Ashes, adautación de la novela Angelas Ashes escrita por Frank McCourt y ganadora dun Premiu Pulitzer.