Electroforesis en xel ye unu de los actos que ye utilizáu usando principios similares conocíos como CEpero en llugar dutilizar un capilar, el gran xel de poliacrilamida utilizar pa dixebrar los fragmentos dADN. Un campu llétrico ye aplicáu, como na CE, pero en llugar de correr toles amueses por un detector, los fragmentos más pequeños execútense cerca de la parte inferior del xel y tol xel ye escaniáu y guardáu nun ordenador. Esto produz una imaxe que muestra tolos de les bandes correspondientes a distintos tamaños y repite la escalera alélica. Esti métodu nun riquir lusu de les normes de tamañu, una y bones la escalera alélica execútase xuntu coles amueses y sirve pa esti propósitu. La visualización puede ser al traviés del usu de marcaos tintes fluorescentes primers na tinción de plata o pol xel antes descaniar. A pesar de que ye rentable y puede ser de bastante altu rendimientu, paplicar la tinción de plata ITS suspéndese. Amás, munchos llaboratorios tán eliminación gradualmente xeles a favor de la CE, faciendol costo de les máquines fáigase más afechisca. 