Perl graduóse en 1948 nel Institutu Politéunicu de Brooklyn (agora conocíu como Universidá Politéunica) en Brooklyn, y recibió la so doctoráu de la Universidá de Columbia en 1955. La so carrera trescurrió na Universidá de Michigan y nel Stanford Linear Accelerator Center (SLAC), onde afayól tauón mientres esperimentos llevaos a cabu nel acelerador de partícules SPEAR.