En 2003 el Partíu Popular (PP) se querelló contra él por ser el promotor y propietariu del dominiu dInternet noalaguerra.org. El sitiu web amosáu nesi dominiu, agospiáu en Nodo50, centrábase na crítica del PP, entós al frente del gobiernu dEspaña, pola so implicación nel sofitu a la invasión dIraq en 2003 y la posterior Guerra dIraq. El PP consideró que parte de los conteníos constituyíen inxuries y llevantos contral mesmu partíu y a dellos dirixentes, con afirmaciones del tipu «cómplices dasesinatu» en referencia a los diputaos populares que dieren el so sofitu, en votación secreta, a la participación española na guerra dIraq. Lacusación pidió pena de cinco años de cárcel contra Monedero y a los desconocíos responsables de la páxina. Na so defensa, Monedero argumentó que se llindara a financiar la iniciativa de dellos alumnos y que la querella del PP atendía a motivos políticos por implicase en contra de la guerra nIraq. Negóse dar nomes dalumnos, el PP siguió cola querella. La causa sería sobreseída.