La Unión del Pueblu Estoniu allegó en solitariu a los comicios de 1999 y consiguió namái 7 escaños, razón pola que Rüütel dexó la presidencia del mesmu en 2000 y asumió un cargu honoríficu. La formación siguiría esistiendo con altibaxos hasta la so desapaición en 2012. Con too y con eso, Rüütel caltuvo un papel relevante na política nacional.