Los capuchinos franceses al mandu de Juan de París establecieron una misión nEl Cairo en 1630 y misionaron nel altu Exiptu por encargu de la Congregación de Propaganda Fide, y los xesuites empezaron a misionar nExiptu en 1675. Mientres esi sieglu hubo un granible intercambiu teolóxicu ente les Ilesies copta y romana. En 1687 la Propaganda Fide estableció una viceprefeutura nel altu Exiptu, denominando a la misión in adjutorium coptorum, al cargu de franciscanos recoletos. Dende 1698 dependió de la Custodia de Tierra Santa y foi alzada a prefeutura apostólica del Altu Exiptu. Estos esfuercios misioneros llograron formar una pequeña comunidá de coptos católicos, principalmente dempués de 1720. En 1729 la Propaganda Fide emitió un decretu prohibiendo a los sacerdotes católicos coptos la intercomunión colos non católicos.