El gran tiburón blancu esiste dendel Miocenu. Los fósiles más antiguos conocíos del tiburón blancu daten dhai unos dieciséis millones daños. Sicasí la filoxenia del gran tiburón blancu sigue siendo oxetu dalderique. La hipótesis orixinal de los oríxenes del tiburón blancu ye que comparte un ancestru común con un tiburón prehistóricu, comol megalodon. Les semeyances ente los restos físicos y el tamañu estremu de dambos llevó a munchos científicos a creer questos tiburones taben estrechamente rellacionaos, y el nome de Carcharodon megalodon aplicar a esti postreru. Sicasí, una nueva hipótesis propón que C.xa0megalodon y el tiburón blancu son parientes llonxanos (anque compartiendo tamién la familia Lamnidae). El gran tiburón blancu tamién ta más estrechamente rellacionáu con una antigua especie de tiburón, el tiburón mako, qua C.xa0megalodon, una teoría que paez tar sofitada pol descubrimientu dun conxuntu completu de quexales con 222 dientes y les 45 vértebres de Carcharodon hubbelli en 1988 y publicáu el 14 de payares de 2012. Amás, nueves hipótesis venceyen C.xa0megalodon al xéneru Carcharocles, que tamién inclúi otros tiburones como Megalodon; Otodus obliquus ye lantiguu representante del xéneru estinguíu Carcharocles.