En 1821 Santander foi escoyíu Vicepresidente de Colombia nel Congresu de Cúcuta, cargu quexerció hasta 1826, pa dempués ser reelixíu hasta 1828. Esti cargu fuera desempeñáu infructuosamente mientres dos años por Francisco Antonio Zea, Antonio Nariño, José María del Castillo y Rada y Juan Germán Roscio, y que la so dificultá aniciaba en quacarretaba la xefatura del Estáu y del gobiernu del país por cuenta de la ausencia del presidente titular, Simón Bolívar, poles guerres dindependencia dEcuador, Perú y la futura Bolivia.