En ochobre de 2011 Duque retornó a lAxencia Espacial Europea dempués de la so excedencia, onde retomól so puestu dAstronauta. Dende 2011 hasta 2015 lideró la Oficina dOperaciones de Vuelu, con responsabilidá sobre les actividaes europees na Estación Espacial Internacional. Anguaño ye responsable de revisión de proyeutos futuros de la ESA pa vuelos tripulaos, dientro del cuerpu dastronautes de la ESA.