Dempués de la Unión de Lublin en 1569 que formó la Commonwealth, el Gran Ducáu caltuvo gran parte de la so autonomía, y el Voivodato de Vilnius siguió siendol so voivodato capital, al igual que Vilnius siguió siendo la so capital, anque la capital del Commonwealth foi la primera en Cracovia ( Voivodato de Cracovia ) y más tarde en Varsovia ( Voivodato de Mazovia ). En 1793, los voivodados de Breslauja y Merkinė (Merkinė yera realmente parte de Vinius, pero considerábase nominalmente parte de Smolensk) creáronse a partir de partir norte de la mesma. El voivodato de Breslauja taba formáu polos condaos de Breslauja, Vilkmergė y Anykščiai y el de Merkinė taba formáu polos de Merkinė, Prienai y Eišiškės .