Caltuvo una estrecha rellación con Isaac Newton y dellos historiadores consideren que la mesma foi de tipu sentimental. En 1691, Fatio, que taba fondamente impresionáu pola teoría de la gravitación daquel, empezó a ellaborar una nueva versión del llibru de Newton Philosophiae Naturalis Principia Mathematica, quenxamás concluyó. Escontra 1694, dambos homes habíense desamoráu.