El NCBI ye dirixíu por David Lipman, unu de los autores orixinales del programa dalliniación de secuencies BLAST y una figura estensamente respetada en bioinformática. Tamién dirixe un programa dinvestigación intramuros, incluyendo grupos empobinaos por Stephen Altschul (otru co-autor de BLAST), David Landsman, y Eugene Koonin (autor prolíficu sobro xenómica comparativa).