En 2009, cola llegada de Martin Jol al banquín, Vertonghen foi pieza fundamental pal equipu nel cursu 2009-10. Na campaña xugó 32 partíos, anotando tres goles. Ye de destacar non yá la so presencia como central absolutu -xuntu col tamién belga Toby Alderweireld-, sinón quatraxo latención de clubes importantes comol Barcelona ol AC Milan. Na campaña 09-10, ganó la copa local al vencer en doble final al Feyenoord.