Al faese Felipe II del tronu lusu caltiénse la estructura del obispáu pero, cuando en 1640 Portugal sublévase, Ceuta caltién la so fidelidá a Felipe IV. La muerte del Preláu da Silva en 1645 ensin tar resueltul conflictu da llugar a una llarga sede vacante, que se resuelve, tres el tratáu de Paz y Amistá de 1668, nomando a Antonio Medina Cachón en 1675, yá ensin venceyu con Tánger.