Al cayer el gobiernu de Gálvez, los representantes criollos de Los Altos aprovecharon pa dixebrase del Estáu de Guatemala el 2 de febreru de 1838. El gobernador Valenzuela nun pudo faer nada al respeutu, y el congresu de la Federación Centroamericana reconoció al Sestu Taol 5 de xunu de 1838 con una xunta de gobiernu provisional compuesta por Marcelo Molina Mata, José M. Gálvez y José A. Aguilar, ente quel xeneral mexicanu Agustín Guzmán —antiguu oficial del exércitu de Vicente Filísola que saniciara en Quetzaltenango— quedó al mandu del exércitu del Estáu. La bandera de Los Altos yera un cambéu de la de les Provincies Xuníes del Centru dAmérica, con escudu nel centru amosando un volcán al fondu y un quetzal resplandorientu —una ave local que representaba la llibertá— delantre. Foi la primer bandera centroamericana quemplegól quetzal como símbolu; esta ave dende 1871 forma parte de la bandera de Guatemala. Finalmente, navientu de 1838, Molina foi electu como Gobernador del Estáu, y de momentu empezó a trabayar nel desenvolvimientu del puertu nel Pacíficu y nameyorar les rellaciones col gobiernu federal en San Salvador.