Debutó en Primer División el 8 de xunu de 1988 a los 20 años na Liguilla Pre-Libertadores nel empate 0-0 contra River Plate. Nel so primer partíu tuvo que ser reemplazáu yá que recibió un golpe de Nelson Gutiérrez nel pómulu que lu dexó inconsciente. El so primer gol marcar tamién a River el 11 davientu desi añu na derrota 3 a 2 nel estadiu Monumental. Col correr de los partíos foi ganándosel so llugar como titular: xugó 26 alcuentros y marcó un total de 12 goles. La temporada de Central foi regular y terminó decimoterceru, polo que tuvo de participar de la Liguilla Reclasificatoria. Ellí Juan xugó dos partíos contra Newells Old Boys y fixo un gol.