La serie moderna sí recibió premios de crítica y públicu. En 2005, nos Premios Nacionales de Televisión, Doctor Who ganól premiu de Drama Más PopularChristopher Eccleston el de Actor Más Popular y Billie Piper el de Actriz Más Popular. La serie y Piper volvieron ganar los sos respeutivos premios en 2006 y David Tennant, el Décimu Doctor, el de Actor Más Popular. Una escena del episodiu The Doctor Dances ganól Momentu dOru de los premios Momentos de TV de 2005 de la BBC, amás de ganar les votaciones a Meyor Drama de la web BBC.co.uk en 2005 y 2006. El programa tamién ganól premiu a Meyor Drama de la revista Broadcast.Doctor Who foi nomáu a la Meyor serie dramática de los premios de la Royal Television Society en 2006, pero perdió frente a la serie Bodies. El programa tamién recibió delles nominaciones pa los premios de Broadcasting Press Guild de 2006, pa Meyor Drama, Meyor Actor, Meyor Actriz y Meyor Guionista, anque nun ganó nengunu. 