El Territoriu Antárticu Británicu ye alministráu pol Foreign and Commonwealth Office (FCO). Un comisionado ye nomáu pal territoriu, quien ye siempres el xefe del Overseas Territories Department, perteneciente al FCO. Hasta xunetu de 1989 el Territoriu foi alministráu pol altu comisionado residente nes islles Malvines, pero dende entós el puestu de comisionado tuvo en manes del xefe del Departamentu del Atlánticu Sur y LAntártida del Foreign and Commonwealth Office en Londres y el dalministrador pol xefe de la seición de Rexones Polares desi departamentu.