El 29 dabril de 2011, los San Francisco 49ers axustaron colos Denver Broncos la decimotercer posición na segunda ronda (45º eleición) pa escoyer a Kaepernick como la cuarta selección de la segunda ronda (36º eleición) nel draft de 2011. Los Tarascos recibieron les seleiciones 45, 108 y 141, en cuenta de la selección global númberu 36.