El so clima ye grebu y semiárido onde la temperatura escasamente supera los 12 ° C y les medies tan solo 3 °C. La rexón esperimenta unos 7xa0meses diviernu y 5xa0meses de branu. El permafrost preséntase solo marginalmente, pero la nieve ye frecuente, especialmente nel iviernu. Los Andes, al oeste del desiertu, son la razón principal pal estáu del desiertu patagónico, yá que inhiben el fluxu de mugor del oeste del sur del Pacíficu dalgamar linterior. Esto crea una solombra dagua que da cuenta de la formación del desiertu y ye por eso, a pesar daprosimao la metá del desiertu que namái unos 200 quilómetros del mar, como un gran desiertu atópase na rexón. La corriente fría de Malvines fuera la mariña atlántica dAmérica del Sur tamién contribúi a la aridez de la zona.