Падчас вайны ўсё змянілася, і храм зноў пачалі наведваць праваслаўныя вернікі. Здавалася б, усё павінна было пайсці на лад пасля вайны, але стала яшчэ горш: праз чатыры гады пасля заканчэння вайны царква Святой Марыі Магдаліны была цалкам зачынена для вернікаў. У будынку былога храма размясціўся Дзяржаўны архіў кінафотадакументаў.