Большасці карт сайтаў не атрымоўваецца расчыніць шматузроўневую структуру архітэктуры сайта. У цестах на юзабіліті карыстачы часта ігнаруюць карту сайта ці проста не могуць яе знайсці. Складанасць карты таксама з'яўляецца праблемай: карта павінна быць менавіта картай, а не галаваломкай па навігацыі.