У 1943 годзе ўжо немцы звяртаюцца да Вайцэхоўскага прапановай прыйсці на месца генерала Уласава. Але і тут Сяргей Мікалаевіч адмаўляецца. Тым не менш, праз два гады ён быў арыштаваны ў Празе органамі савецкай контрразведкі, вывезены ў Маскву, дзе яго асудзілі за ўдзел у белагвардзейскім руху на дзесяць гадоў папраўчых лагераў. Там, у лагернай бальніцы Азерлага паблізу горада Тайшэт Іркуцкай вобласцi, ён і пайшоў з жыцця ў 1951 годзе, так і не дачакаўшыся вызвалення…