Як і іншыя дапаўненні ад Gearbox, Half-Life: Opposing Force і Half-Life: Decay, Blue Shift адлюстроўвае падзеі, якія адбыліся ў Half-Life, але з пункту гледжання іншага персанажа: ахоўніка «Чорнай Мезы» — Барні Калхуна.