Эўтрафікацыя можа быць выклікана як старэннем вадаёма, так і антрапагеннымі фактарамі, напрыклад, трапленне угнаенняў у ваду. Асноўныя хімічныя элементы, якія ёй спрыяюць, — фосфар і азот. Адным з этапаў эўтрафікацыі як раз з'яўляецца зарастанне вадаёма багавіннем.