Існаваў велізарны воз праблем з сумяшчальнасцю паміж рознымі версіямі ядра Міранды і нават паміж версіямі асобных плагінаў. Асабліва гэта тычылася падтрымкі Unicode, якая ў Miranda IM так і не даведзена да канца.