Liqeni i Ohrit është e vendosur në pjesën juglindore të Shqipërisë dhe ështëliqeni më i thellë në tërë gadishullin e Ballkanit, me një thellësi maksimale prej afro 300 m. Sistemi i Prespës përbëhet nga dy liqene, Prespa e Madhe dhe Prespa e Vogël.