ИКСИ составында түбәндәге факультеттар эшләй: ғәмәли математика, махсус техника, мәғлүмәт хәүефһеҙлеге һәм оператив-техник факультет, тәбиғәт фәндәре кафедраһы, инглиз теле һәм махсус профилдәр киске физика-математика мәктәбе, бюджетҡа ҡарамған ғилми-тикшеренеү лабораторияһы.