1991-1998 йылдарҙа Ә. Х. Мәхмүтов - Башҡортостан Республикаһы Президенты ҡарамағындағы Башҡортостан дәүләт хеҙмәте һәм идара итеү академияһы, 1997-1998 йылдарҙа Башҡортостан белем биреү учреждениелары консорциумының президенты-ректоры.