1936 йылдың 20 декабрендә йәки 1937 йылдың 2 ғинуарында Преображенский яңынан ҡулға алына. 1937 йылдың 13 июлендә йәштәр троцкист үҙәген етәкләгәне һәм контрреволюцион террорсылыҡ ойошмала ҡатнашҡаны өсөн Преображенскийҙың енәйәт эше СССР-ҙың Юғары судының Хәрби коллегияһында ҡарала; Е.xa0А.xa0Преображенский атып үлтереүгә хөкөм ителә һәм шул уҡ көндә уға хөкөм үтәлә. 1988 йылдың 22 декабрендә СССР-ҙың Юғары судтың пленумы тарафынан үлгәндән һуң аҡлана