2005 йылдан вуз бакалавриат программалары буйынса күп кимәлле әҙерлек башланы. Әлеге ваҡытта белем биреү поцесы 7 бакалавриат йүнәлеше буйынса тормошҡа ашырыла. Магистратураның 4 йүнәлеше буйынса белем биреү эшмәкәрлегенә хоҡуҡ биреүсе лицензия алған. Университетта юғары квалификациялы уҡытыусылар әҙерләүсе система булдырылған. Фән кандидаттары вуз аспирантураһында 26 һөнәр буйынса әҙерләнә, унда 400 кеше уҡый. 6 һөнәр буйынса докторантура асылған. Университеттың ғилми эшмәкәрлеге, ҡайһы берҙәре инновацион характерҙағы, 14 төп йүнәлеш буйынса тормошҡа ашырыла. Мәҫәлән, педагогик белем сифаты: методология, теория һәм практика; Себерҙә йәшәүсе яңы быуындың гражданданлыҡ характеры формалашыуы проблемалары; балалар һәм өлкәндәр йәмғиәтте үҙ итһен өсөн, уларҙы социаль-педагогик «оҙатыу» (сопровождение) һәм интеграция теорияһы һәм практикаһы; асыҡ белем биреүҙең йөкмәткеһе, саралары, технологиялары һ. б.