Cinco año dempués, en 2003, les meyores de los estudios filogenéticos en munchos grupos de angiospermas motivaron la compilación y publicación d'un segundu trabayu (An update of the Angiosperm Phylogeny Group classification for the orders and families of flowering plants: APG II) conocíu como sistema de clasificación APG II, nel cual afondáronse los analises previos, añediendo nuevos ordes y circunscribiendo nuevamente delles families.