Na edá media, a pesar de la oposición xeneral al atomismu basada en considerancies teolóxiques, y sobremanera pola fuerte influyencia d'Aristóteles, esta doctrina foi caltenida por Guillermo de Conches y Nicolás de Autrecourt. La teoría cobra nueva puxanza nos sieglos XV y XVI, coincidiendo cola crítica al aristotelismu, coles idees de Nicolás de Cusa y Giordano Bruno, algamando un puntu culminante cola renovación de Gassendi, que considera l'atomismu como la hipótesis más razonable pa la esplicación de los fenómenos de la naturaleza. Nesta dómina fueron aldericaos los problemes inherentes a la doctrina atomista: dificultá lóxica d'almitir qu'esista una porción de materia que nun se pueda estremar y les dificultaes d'esplicar la diversidá de les propiedaes físiques y químiques de los cuerpos. Coles mesmes ye innegable la influyencia qu'adquirió más tarde nos oríxenes de la teoría atómica científica, empezando pol científicu serbiu Ruđer Bošković (1711-1787), primero n'esbozar una teoría atómica moderna de fundamentu newtoniano qu'establez fuercies de cohesión y de repulsión.