La ciudá cunta col Centru Universitariu Puerto Natales, perteneciente a la Universidá de Magallanes y fundáu nel 6 d'avientu de 1996, que imparte carreres de nivel téunicu y profesional. El Centru Universitariu funciona como unu de los centros d'investigación más importantes de la provincia d'Última Esperanza. Esti Centru, atópase allugáu a 1.5 quilómetros al norte del centru de la ciudá.