Cola llegada de los españoles,los Mixteca yá falaben numberoses variedaes del idioma mixteco, yá pa esi entós con diversos graos de inteligibilidad mutua. Acordies con Spores (1967 y 2007) escontra'l Preclásicu la llingua falada na rexón yera l'idioma protomixtecano, del que deriven non yá toles llingües mixteques conocíes na actualidá, sinón tamién el triqui, que falen los miembros del pueblu homónimu na parte meridional de la Mixteca Alta. Los graos de diverxencia ente les numberoses llingües mixteques de l'actualidá son productu de la hestoria de los sos falantes: por casu, según analís glotocronológicos, la variedá costeña del mixteco dixebrar del mixteco nuclear de les tierres altes escontra'l sieglu X o XI de la era cristiana, lo que coincide cola tardida colonización de la Mariña Chica per parte de los mixtecos.