Por definición, cualquier sustancia hidrofóbico en contautu col agua provoca qu'ésta fuxa y arrexuntar n'estructures denominaes clatratos. Esta ordenación correspuende a un amenorgamientu de la entropía del sistema. Nel casu de les proteínes, los residuos hidrofóbiques de los aminoácidos queden empobinaos, nel so plegamientu, escontra l'interior de la molécula, en contautu colos sos asemeyaos y alloñaos de l'agua. Arriendes d'ello, la internalización de los grupos hidrófobos aumenta la aleatoriedad del sistema 'proteína más enagua' y, poro, produz un aumentu d'entropía al doblar. Esti aumentu d'entropía produz una contribución negativa a la enerxía llibre del plegáu y aumenta la estabilidá de la estructura proteica.