Tres los ésitos llograos, Necaxa foi convidáu a participar na Copa Merconorte 2001 onde arollaron a los sos rivales suramericanos al calificar a la segunda fase con una satisfactoria cifra de 5 victories contra una sola derrota, en total 15 puntos nel grupu A qu'incluyía al América de Cali, Alianza Lima y Aucas, cayendo namái con esti últimu equipu en condición de llocal. Pero los Rayos confiáronse y fueron esaniciaos nes Semifinales por Millonarios de Colombia, pos, dempués d'empatar en marcador global 5-5, perdieron en penales 3-1.