Foi fundada en 1520 polos portugueses, y en 1596 convirtióse na capital del Timor Portugués. Mientres la Segunda Guerra Mundial, Dili foi ocupada polos xaponeses. Timor Oriental algamó la independencia formal de Portugal el 28 de payares del 1975. Ensin previu avisu, namái nueve díes depués, el 7 d'avientu, les fuerces armaes indonesies invadieron Dili. El 17 de xunetu del 1976 Indonesia anexonó Timor Oriental col nome de Timor Timur  y Dili convertióse na capital de la rexón.