En 2006 tuvo un bon entamu de temporada ganando la París-Niza, según el Tour de California y el Tour de Georgia. Darréu centró la so preparación nel Tour de Francia. Un día antes del entamu de la Grande Boucle fueron escluyíos de la carrera pola so implicación na Operación Puerto dellos corredores, incluyendo a dalgunos de los favoritos y rivales de Landis pa la xeneral: Jan Ullrich, Ivan Basso y Francisco Mancebu. La esclusión d'una mayoría de los sos compañeros d'equipu del Astaná por dichu motivu fizo que Alexander Vinokourov tampoco pudiera participar, a pesar de nun tar implicáu na trama. Estes ausencies, sumaes a la de Armstrong (retiráu voluntariamente tres el so séptimu trunfu), fixeron que la llucha pol maillot mariellu presentárase abierta ya incierta.