Karl Ernst von Baer nació en Piibe, ciudá entós daquella del Imperiu rusu y anguaño perteneciente a Estonia. Educáu na escuela catedral de Reval (Tallin) y l'Universidá de Dorpat (Tartu), siguió los sos estudios universitarios en Berlín, Viena y Wurzburgu, onde Ignatius Döllinger introduciólu, xunto a Pander y d'Alton, nel nuevu campu de la embrioloxía. A partir de 1817 von Baer exerz como profesor de zooloxía y anatomía na Universidá de Königsberg. En 1834 treslladóse a San Petersburgu, integrándose na Academia de les Ciencies, primero en zooloxía (1834-46) y más tarde en anatomía comparada y fisioloxía (1846-62). Los últimos años de la so vida (1867-76) pasar en Dorpat, onde se convirtió n'unu de los principales críticos de la teoría de la evolución de Charles Darwin.