La primer metá del sieglu XIX foi un tiempu difícil pa Coímbra, cola ocupación de la ciudá poles tropes de Junot y Masséna, mientres la invasión francesa y, darréu, la estinción de les órdenes relixoses. Mientres la invasión de Portugal por Napoleón Bonaparte, una milicia portuguesa, dirixida pol coronel Nicholas Trant, un oficial británicu, con una fuercia de 4000 militares, cutió duramente a Masséna cuando, el 6 d'ochobre de 1810, la ciudá foi reconquistada a les tropes napoleóniques. En marzu de 1811 la milicia celebró la esitosa resistencia pa caltener la ciudá nes sos manes contra l'exércitu francés, lo cual taba en retirada.