Polo que se refier a esta segunda Biblioteca, tamién conocida como Biblioteca-fía o Biblioteca del Serapeo, a finales del sieglu IV, l'emperador Teodosio el Grande, en respuesta a un pidimientu del patriarca d'Alexandría, unvió un decretu de prohibición contra'l paganismu n'Exiptu: nel añu 391, el patriarca Teófilo d'Alexandría promovió una revuelta mientres la cual el templu de Serapis resultó asaltáu pos nél Diocleciano, tres el saquéu de la ciudá, mandara alzar nel so honor una columna conmemorativa na so calidá de dios viviente, y esti emperador resultaba la personificación de les persecuciones contra los cristianos, polo que nel llugar consagróse como ilesia dedicada a San Xuan Bautista la cual subsistió hasta la conquista árabe.