Khama permaneció na presidencia hasta la so muerte por cáncer d'entrellenzu en 1980, y foi asocedíu pol vicepresidente Quett Masire. Cuarenta mil persones asistieron al so funeral d'Estáu en Gaborone. Foi soterráu nel campusantu familiar, nuna colona de Serowe, nel Distritu Central de Botsuana.