En 1465 l'italianu Leon Battista Alberti inventó un nuevu sistema de sustitución polialfabética que supunxo una gran meyora de la dómina. Otru de los criptógrafos más importantes del sieglu XVI foi'l francés Blaise de Vigenère qu'escribió un importante tratáu sobre "la escritura secreto" y que diseñó una cifra que llegó a los nuesos díes acomuñada al so nome. A Selenus débese-y la obra criptográfica "Cryptomenytices et Cryptographiae" (Luneburgu, 1624). Nel sieglu XVI María Estuardo, reina d'Escocia, foi executada pola so prima Sabela I, reina d'Inglaterra, al afayase una intriga d'aquella tres un criptoanálisis esitosu per parte de los matemáticos d'Isabel. Mientres los sieglos XVII, XVIII y XIX, l'interés de los monarques pola criptografía foi notable. Les tropes de Felipe II emplegaron mientres enforma tiempu una cifra con un alfabetu de más de 500 símbolos que los matemáticos del rei consideraben inexpugnable. Cuando'l matemáticu francés François Viète consiguió criptoanalizar aquel sistema pal rei de Francia, coles mesmes Enrique IV, la conocencia amosada pol rei francés impulsó una quexa de la corte española ante del papa Pío V acusando a Enrique IV d'utilizar maxa negro pa vencer a los sos exércitos.