Presentó la so tesis doctoral nel departamentu d'arqueoloxía de la Universidá de Chicago en 1978, so la direición de Leslie G. Freeman col títulu de Analysis of Design Structure: Variability Among Magdalenian Engraved Bones from North Coastal Spain na qu'estudiaba materiales óseos vos grabaos provenientes de les cueves cantábriques. De la mano de L.G. Freeman había tomáu contautu cola arqueoloxía europea participando nes escavaciones de Cueva Morín (Cantabria). La redaición d'el so Tesis compaxinar con un puestu docente na Universidá estatal San José mientres seis años, darréu incorporóse a la facultá d'antropoloxía de SUNY/Binghamton en 1982, onde ella tamién foi codireutora del centru d'estudios de les muyeres. Aceptó una plaza como profesora acomuñada n'antropoloxía na universidá de Berkeley en 1987. Amás de los sos trabayos de campu, desenvolvió otres temes d'investigación y publicó artículos sobre pedagoxía y l'enseñanza d'arqueoloxía; el desenvolvimientu y usu de recursos d'internet na enseñanza d'Introducción a Arqueoloxía; según un programa sobre arqueoloxía nes escueles. En 2009, recibió'l premiu d'excelencia de Berkeley, pol so trabayu sobre la diversidá ya igualdá d'oportunidaes. Con anterioridá, recibiera'l Distinguished Teaching Award (1996) y el Premiu d'Iniciatives Educatives (2001). Tamién impulsó los fondos pa la creación de llaboratorios multmedia d'enseñanza nel Departamentu d'Antropoloxía. En xunetu de 1997, Margaret W. Conkey foi nomada Class of 1960 Professor of Anthropology.