En 1806 vuelve tomar parte activa na guerra contra Prusia. Na batalla de Jena dirixe un asaltu fronteru contra les llinies prusianes que fracasa, y bien pudiera ser el so final si'l mariscal Jean Lannes, que percibe la so situación, nun interviniera nel so sofitu. Tres Jena, Ney combate na batalla de Erfurt, pasando depués a dirixir el victoriosu asediu de Magdeburgu, que ye tomada en tan solu venticuatro hores. En llugar de detener al so exércitu avanza tres los pasos de Napoleón, lo que-y dexa intervenir a tiempu na batalla de Eylau, xusto nel momentu que el mariscal Murat lluchaba heroicamente pa evitar que l'exércitu francés fora estremáu en dos. La llegada de Ney provoca una retirada de les tropes ruses, de forma que la batalla acaba en tables. Les fuercies franceses taben tan exhaustas que Napoleón encarga al recién llegáu Ney la inspeición del campu de batalla, una inmensa llanura cubierta de nieve robrizo pola sangre. Asina, nel so informe va dicir: Quel massacre! Et sans resultat! («¡Qué masacre! ¡Y ensin resultancia!»).