Mientres los 7 años que Serzh tuvo nel cargu de Ministru de Defensa, el gobiernu del presidente Kocharián tuvo qu'encarar numberosos casos de corrupción, acusaciones d'autoritarismu, y de fraude eleutoral cometíu mientres les eleiciones xenerales realizaes en 2003, que la so acusación foi realizada y evidenciada pola Organización pa la Seguridá y la Cooperación n'Europa (OSCE). Sicasí, Armenia permaneció xeneralmente estable tres la constante crecedera económica que promediaba el 12% añal, polo que pudo evitase un alzamientu social, como asocediera na vecina Xeorxa , que provocó l'arrenunciu del presidente Shevardnadze en 2004.