Empezó la so carrera política en 1973, cuando foi nomáu conceyal del Conceyu de Santander pol terciu familiar. Más tarde, en 1976, foi designáu primer teniente d'alcalde. Tres les eleiciones xenerales de 1977 foi designáu alcalde de Santander. Nes primeres eleiciones municipales, celebraes en 1979, foi cabeza de llista pola Unión de Centru Democráticu. La llista de UCD foi la más votada, pero ensin consiguir mayoría absoluta. A pesar de que'l PRC apautara colos partíos d'esquierda (PSOE, PCE y PTE-ORT), colos que sumaben mayoría absoluta, la eleición de Jesús Cabezón (PSOE) como alcalde, los rexonalistes finalmente votaron al so propiu candidatu, lo que dexó la eleición de Hormaechea. Más tarde, nes eleiciones municipales de 1983 volvió ser reelixíu al mandu de la Coalición Popular en calidá d'independiente. Juan Hormaechea siguió na alcaldía hasta l'añu 1987 cuando decidió dar el saltu al gobiernu autónomu.