El primer matrimoniu de Merrill, con Barbara Leeds en 1941, acabó en divorciu en 1950. Casóse darréu con Bette Davis, la so compañera de repartu en All About Eve, apurriendo Davis una fía, B. D. Hyman, d'un anterior matrimoniu. Anque'l matrimoniu adoptó otros dos fíos, decidieron divorciase en 1960.