En 1956 empezó a trabayar en cribos moleculares. Los cribos moleculares son compuestos cristalinos con poros de tamañu molecular que pueden penerar o dixebrar les sustances bien complexes. Edith Flanigen fixo contribuciones sustanciales al desenvolvimientu de productos de zeolita Y (Faujasita), un cribu molecular específicu pa refinar petroleu de manera eficiente. Darréu la zeolita Y foi superada pola zeolita X. Cuando se refina "petroleu crudo", hai que dixebralo en distintos partes, o fracciones. La gasolina ye una de les munches fracciones que provienen de refinación de petroleu. Les zeolitas de Flanigan utilícense como catalizadores, una sustancia qu'ameyora les reacciones químiques. La zeolita Y ye un catalizador qu'aumenta la cantidá de fracción de gasolina a partir del petroleu, polo que la refinación de petroleu más seguro y granible.