Dende'l principiu de la concesión, la estabilidá económica del contratu viose amenazada. Los índices de crecedera de volume de pasaxeros y d'operaciones nun concordar con aquellos del proyeutu inicial, polo tanto'l financiamientu de les obres a realizar taben en peligru. La salida de ACES ya Intercontinental del mercáu, los atentaos del 11 de setiembre de 2001 y la crisis nel sector aeronáuticu citáronse como causantes d'esta situación. Asina empezaron les disputes llegales ente l'Aeronáutica Civil y el concesionariu hasta llegar a un Tribunal d'Arbitramientu a mediaos del 2005. Finalmente llegóse a una renegociación del contratu pa dar la posibilidá de fortalecimientu financieru de la empresa concesionaria y la iniciación de les obres obligatories, so los lineamientos d'un nuevu Plan Maestru pa desenvolver l'aeropuertu.