A la muerte del papa Sabiniano en febreru de 606, Bonifacio foi escoyíu como socesor, pero'l so regresu dende Constantinopla a Roma retrasóse mientres cuasi un añu. Aldericóse enforma avera del por qué d'esti llargu interregno; dellos historiadores cunten que la intención yera dexar que Bonifacio concluyera'l so trabayu en Constantinopla, anque munchos más piensen qu'esto se debió a problemes na eleición. Créese que Bonifacio aportunó en que la eleición papal fuera llibre y xusta y que quiciabes se negó a asumir el cargu pontificiu hasta convencese de qu'asina fuera.