L'altitú del términu bazcuya ente los 988 y los 1.300 m., siendo los sos altores más importantes el Cuetu Quiñones (1.324 m.) y el Picu de la Dehesilla (1.316 m.) El principal cursu fluvial ye'l Madarquillos que naz na Sierra d'El Acebal. Nél conflúin los regueros de San Benitu y el Fondu, según el ríu de la Nava o Cocinillas. Estos ríos van desaguar al Banzáu de Pontes Vieyes, qu'empieza nel estremu sur del términu de Madarcos, nel sitiu llamáu de San Cristóbal.