Perdíu'l poder territorial, la cura d'almes tuvo que reorganizase: la mayoría de les parroquies del antiguu arzobispáu pasaron a ser protestantes, munches ilesies fueron derruidas o desacralizadas y convertíes n'escueles evanxéliques. El restu de les parroquies y monesterios de la archidiócesis de Magdeburgu, que los sos miembros nun habíen abjurado del so catolicismu, fueron puestos so la supervisión del llamáu Vicariato apostólicu misioneru del Norte, dientro de la dependencia del arzobispáu de Colonia dende 1668. En 1821, l'área pastoral foi treslladada so la direición de la diócesis de Paderborn. En 1994, tres la reunificación d'Alemaña, el Papa Xuan Pablo II refundó la diócesis de Magdeburgu, sufragánea de l'archidiócesis de Paderborn, nel territoriu del antiguu arzobispáu de Magdeburgu, coles llendes del actual estáu federáu de Saxonia-Anhalt.