Pocu dempués de la publicación, foi-y ufiertáu'l puestu de médicu imperial na corte de Carlos V. Informó al senáu de Venecia de que dexaba'l so puestu en Padua, lo qu'impulsó al duque Cosme I de Médici a intentar convence-y a que se treslladara a la Universidá de Pisa, ufierta que Vesalio tornó. Na corte tuvo problemes nes sos rellaciones colos otros médicos, que lo consideraben un simple "barberu" por envidia.