Sobre l'orixe últimu del topónimu esisten dos teoríes. La primera rellaciona Múgica con otros topónimos de la zona que presenten la mesma terminación -ica: Guernica, Gatica, Ordorica, Gorocica, etc; o la similar -aca: Mundaka, Meñaca, etc. Según esta teoría esti sería un sufixu d'orixe celta, quiciabes un estáu más antiguu del actual sufixu locativu -aga. El significáu del nome permanecería escuru, quiciabes pudiera tar rellacionáu con dalgún nome propiu.