Berzelius tuvo tamién una influencia importante sobre la bioloxía. Foi'l primeru en faer la distinción ente los compuestos orgánicos (aquellos que contienen carbonu), y los compuestos inorgánicos. En particular, asesoró a Gerardus Johannes Mulder nel so analís elemental de compuestos orgánicos, tales como'l café, el té y delles proteínes. El términu "proteína" foi de fechu acuñáu por Berzelius, dempués de que Mulder reparara que toles proteínes paecíen tener la mesma fórmula empírica, y llegó a la conclusión errónea de que podríen tar compuestes por un solu tipu de molécula (bien grande). Berzelius propunxo esti nome porque estes molécules paecíen ser la sustancia primitivo de l'alimentación animal que les plantes preparen pa los herbívoros.