Flores foi acusada de nepotismu por tener a dellos de los sos parientes cercanos trabayando como emplegaos na Asamblea Nacional, ente que ella yera diputada.<ref name="ETcolombia">{{cita publicación |last1=Llares Martiz|first1=Valentina|títulu=Denuncien por nepotismu a la presidenta del Congresu venezolanu, Cilia Flores|url=http://www.eltiempo.com/archivo/documento/CMS-4378170|fechaaccesu=12 d'agostu de 2015|agency=El Tiempu (Colombia)|fecha=15 de xunetu de 2008}}</ref>familiares-en-l'asamblea/ "Ye falsu que tenga munchos familiares na Asamblea" 30 May 2008. Acordies con el diariu Talo como'', 16 familiares de Flores trabayaben n'oficines de l'Asamblea Nacional mientres ella taba na Asamblea Nacional. Flores respondió a los periodistes que publicaron les acusaciones de nepotismu afirmando que yera parte d'una campaña de desprestixu, que califica de "mercenarios de la pluma". Tanto la oposición como'l oficialismo denunciaron el nepotismu definiéndolo como una inxusticia. Pa 2012, los familiares de Flores consiguiríen aportar a 42 puestos na Asamblea Nacional.