Dempués de la Guerra Civil, en xunu de 1940 nació'l nuevu Club Deportivo Logroñés, que se adscribió a la Federación Guipuzcoana. Cada temporada apostaba la categoría rexonal y cola so bona clasificación pasaba a apostar la fase de Tercer División. Na temporada 1942-43 quedó campeón de la Copa de Guipúzcoa.