El club cuntó con un equipu de béisbol dende los años 60s. Poco dempués de la so creación, en 1962 ganó'l campeonatu alemán de béisbol (Bundesliga) apoderando al campeón defensor TB Mannheim Germania, por 10:6. Al añu siguiente, el Bayern de Múnich enfrentar na final ante'l mesmu rival. Dempués de convertise en subcampeón nacional en 1966, el Bayern de Múnich volvió ganar el títulu de Bundesliga en 1969. La disolución de la seición de béisbol llevar a cabu na década de 1970 dempués d'un tercer títulu de subcampeón en 1970.