Los antibióticos prescríbense siempres qu'esista barruntu de neumonía o se constate deterioru na función pulmonar. Davezu, escoyer en función del historial d'infeiciones qu'afectaron al paciente primeramente. Munches de les bacteries comunes na fibrosis quística son resistentes a gran cantidá d'antibióticos y riquen selmanes de tratamientu intravenosu con vancomicina, tobramicina, meropenem, ciprofloxacina y piperacilina.