N'humanos y munchos otros animales, el ácidu clorhídricu ye parte del ácidu gástrico segregáu nel estómagu p'ayudar a hidrolizar a les proteínes, según pa convertir la proenzima inactiva pepsinógeno na enzima activa pepsina. Dellos organismos producen ácidos pal so defensa; por casu, les formigues producen el ácidu fórmico.