En 1642, Milton se casa con Mary Powell, que tenía entós 17 años. La rellación nun duró enforma, y pocu dempués Mary abandonólu, tornando a la casa de los sos padres en Oxford, pos Milton tenía un calter focicón. Esta situación dio llugar a los famosos «Trataos sobre'l divorciu», onde s'argumentaba a favor del divorciu por incompatibilidá de personalidaes: en 1643, publica la Doctrina y disciplina del divorciu y en 1644, El xuiciu sobre'l divorciu de Martín Bucer. La publicación d'estos testos causó un escándalu nel parllamentu y ente'l cleru, qu'intentó censuralos; por causa de esto, mientres el branu de 1644 Milton escribió'l so Areopagítica, una apoloxía de la llibertá de prensa. Per otru llau, Milton, que quedara en cierta midida desencantáu de la educación de Cambridge, escribe Sobre la educación, un tratáu que propón establecer un estudiu rigorosu pa los mozos d'Inglaterra. En 1645, publicar otros trés obres: Tetrachordon, Colasterion, y una coleición de Poemes de Mr. John Milton, n'inglés y en llatín.