N'ochobre de 2006 anunció la so dimisión como alcalde d'Estelleru pa presentase a la presidencia del Gobiernu de Cantabria como candidatu del PP nes eleiciones autonómiques de 2007. En dichos comicios, la candidatura d'Ignacio Diego foi la más votada y llogró 17 de 39 escaños del Parllamentu de Cantabria. Nun consiguió la mayoría absoluta, dando llugar a que'l pactu ente socialistes (PSC-PSOE) y rexonalistes (PRC) revalidar de nuevu.