Cuando'l Llibertador volvió a Lima'l 10 de febreru de 1826, La Mar presentó-y el so arrenunciu, qu'aquel se negó a almitir, concediéndo-y solo una llicencia temporal por motivu de salú (al paecer sufría d'un mal hepáticu). N'usu d'aquella llicencia, el día 25 de febreru La Mar dexó la presidencia del Conseyu en manes de Hipólito Unanue y retiróse a Guayaquil, dende onde aportunó nel so arrenunciu total, a tal puntu que Bolívar se la aceptó por Decretu del 8 de xunu, nomando nel so reemplazu al mariscal Andrés de Santa Cruz.