L'únicu gran honor que-y foi torno a Matthäus en competiciones, foi'l de la UEFA Champions League. Lo conocío, a dos minutos de recoyer la medaya de ganador en 1999 ante'l Manchester United , qu'anotó dos goles nos últimos minutos na final, dempués de que foi sustituyíu a los 86 minutos de xuegu, ente que l'equipu entá ganaba 1-0. Cuando los dos equipos fueron recoyese les sos medayes, Lothar quitóse la medaya de sub-campeones de momentu, yá que yera la segunda vegada que quedó nel bandu perdedor en circunstancies similares; na final de 1987. Bayern ganaría la Lliga de Campeones en 2000-01 y más tarde la Copa Intercontinental. El so postreru partíu oficial col Bayern tuvo llugar en Múnich el 8 de marzu de 2000, contra'l Real Madrid , que'l Bayern ganó 4-1.