Bactra, la so capital (actual Balh) florió sol dominiu árabe hasta que foi destruyida polos mongoles en 1221. Depués recuperóse parcialmente, pero tuvo de dexar el so llugar de primacía a Mazari Sharif, ciudad santuario allugada a poca distancia al sudeste. Esti santuariu compite, nel islamismu popular, cola ciudá iraquí de Nayaf pol honor de ser l'últimu llugar de descansu d'Ali (600-661), xenru del profeta Mahoma y primer imán de la fe xiín. En sieglos más recién, l'orixinal Tojaristán iraniu viose infiltrado por migraciones de pueblos túrquicos, particularmente turkmenos y uzbecos, a tal puntu que la rexón ye conocida tamién en tiempos modernos como Turquestán afganistanu.