Machar robló l'Alcuerdu de Paz de Ḥartum en 1997, obligando al frente Nacional Islámicu a adoptar una constitución democrática cola llexitimación de la llibre determinación del pueblu del sur de Sudán, per primer vegada na hestoria de Sudán. Dempués de la firma, convertir nel líder de les Fuercies de Defensa del Sur de Sudán (SSDF, el recién renombráu SSIM) (1997 -2002) L'Alcuerdu de Paz de Ḥartum ufiertó al Sur la llibre determinación nel papel y fixo de Machar l'Asistente del Presidente de la República del Sudán y el Presidente del Conseyu Coordinador de Sur de Sudán (7 d'agostu de 1997 a 31 de xineru de 2000).