Volvió collechar candidatures en distintos premios como nos Óscar, na categoría d'meyor actriz, al Globu d'Oru a la meyor actriz en drama, al Premiu del Sindicatu d'Actores a la meyor actriz y al BAFTA a la meyor actriz pola so interpretación de Sarah Miles en The End of the Affair (1999). Nella compartía cartelu con Ralph Fiennes y de la que'l críticu cinematografíco Christopher Brandon dixo: “Moore y Fiennes realicen unes apasionaes y sexys interpretaciones.” Tamién foi candidata en 1999 al Premiu del Sindicatu d'Actores a la meyor actriz de repartu por Magnolia (1999). Dempués llegaríen Hannibal (2001), al llau d'Anthony Hopkins y onde interpretó a Clarice Starling. Siguió-y la comedia Evolution (2001) dirixida por Ivan Reitman. En 2002 estrenó The Hours, xunto a Meryl Streep y Nicole Kidman, y Far from Heaven, con Dennis Quaid. Foi nuevamente candidata al Óscar por dambes actuaciones, nes categoríes de meyor actriz y meyor actriz de repartu, siendo una de les poques actrices en consiguir una doble nominación nun mesmu añu. Tamién collechó candidatures a los Premios del Sindicatu d'Actores como meyor actriz y meyor actriz de repartu y a los Globos d'Oru como meyor actriz en drama y como meyor actriz de repartu, respeutivamente. Jeffrey Overstreet escribió: “la meyor razón pa ver la película ye reparar una de les meyores interpretaciones de Julianne Moore”, arriendes de la so participación en Far from Heaven.