Nes votaciones de 1834 escoyóse como presidente al conservador José Cecilio del Valle. Sicasí este finó en Guatemala el 2 de marzu d'esi mesmu añu. Esti tracamundiu llevó a qu'en 1835 nomárase nuevamente a Francisco Morazán Presidente Federal hasta 1839. Pol poder qu'adquirieren los lliberales d'El Salvador, Morazán tuvo que treslladar la capital federal a San Salvador en 1835. Gradualmente, la Federación empezó a derrumbar. Ente los años de 1838 y 1840, los Estaos entraron n'otra guerra civil.