El 26 d'avientu de 2016, anuncióse l'arrenunciu d'Alfonso Prat-Gay y la división del Ministeriu de Facienda y Finances Públiques en dos, siendo Caputo nomáu pa ser el Ministru de Finances dende xineru de 2017. Con un patrimoniu declaráu de 55,75 millones de pesos, ye'l segundu miembru del gobiernu nacional más ricu.