El 4 d'abril de 1786 alcordóse la fusión de l'antigua Universidá Xesuita y la Dominica de Santu Tomás, estableciéndose la Real Universidá Pública, nel mesmu llocal de la Universidá Gregoriana, nel primer patiu a llau de \"La Compañía\". Nos sos claustros formáronse Eugenio de Santa Cruz y Espejo y José Mejía Lequerica, mentalizadores de la independencia. Na masacre del 2 d'agostu de 1810 ofrendaron la so vida Manuel Quiroga y Pablo Arenas, Vicerrector y Prosecretario de la Universidá, nel so orde, eminentes patriotes.