Fíu del docente Gustavo Petro Sierra y Clara Nubia Urrego. Ñació'l 19 d'abril de 1960 en Barraquera d'Oru, Córdoba. Foi bautizáu Gustavo Francisco n'honor al so padre y el so güelu. Cuando cursaba 2ᵘ grau la so familia treslladóse a Zipaquirá. Ellí, estudió nel Colexu de La Salle de Zipaquirá, u fundó'l periódicu llamáu Carta al Pueblu y un centru cultural al que llamó Gabriel García Márquez. Mientres esa etapa, Petro entamó axuntase con movimientos sindicalistes y obreros de Zipaquirá. Petro graduóse a los 16 años del Colexu Nacional San Juan Bautista de La Salle y llogró unu de los meyores puntaxes del exame del ICFES para l'ingresu a la educación cimera, en toa Colombia.