Echáronse los cimientos esi mesmu añu de 1527, empezando la construcción polos pies, pa poder faer usu de l'antigua colexata mientres duraben les obres. La idea yera llegar al cruceru, que cayería na zona del antiguu claustru, y empezar entós la baltadera total. Pero al avanzar tan amodo, el mesmu Gil de Hontañón viose obligáu a faer reformes na colexata vieya pa siguir l'usu llitúrxicu ensin problemes. Gil de Hontañón morrió en 1577 y les obres siguíen práuticamente como de primeres. Pasaren 50 años y la moda y les téuniques nel arte de construyir camudaren.