A les rivalidaes ente los altos mandos militares, qu'entamaben aiciones ensin coordinación, sumábase la de la diverxencia política sobre la reforma del sistema del Antiguu Réxime y el surdimientu de reclamaciones particulares en cada territoriu, al amparu del clima de federalismu de facto favorecíu dende les distintes xuntes provinciales. A pesar d'ello, un alcuerdu xeneral dexó constituyir el 25 de setiembre de 1808 n'Aranjuez la denomada Xunta Suprema Gubernativa, presidida por Floridablanca y con un poder llindáu, y la Xunta Militar, presidida polos xenerales Castaños, Castelar, Morla, González Llames, Marqués de Palaciu y Bonu, que la so aición resultó ineficaz como demostraríen la socesión d'acontecimientos posteriores. Poques selmanes antes de la entrada de la Grande Armée, les fuercies españoles llograron tomar el control de Logroño (10 de setiembre) y esplegar posiciones en redol a Tudela, a onde llegó Castañales el 17 d'ochobre, y Burgos, escontra onde se dirixiera dende Madrid l'exércitu d'Estremadura col xeneral Bellvedere al frente el 29 d'ochobre.