كان تومسون أشهر من قام بتجريف سينوتة ساغرادو (سينوتة المقدسة) من عام 1904 إلى عام 1910، حيث استعاد تحف من الذهب والنحاس والأحجار الكريمة المنحوتة، فضلاً عن النماذج الأولى على الإطلاق لما كان يعتقد أنه قماش وأسلحة خشبية للمايا قبل كولومبوس.