إلى الآن لم يتم تحديد الفيسيولوجيا المرضيّة للانغماد المعوي مجهول السبب ويُعتقد بأنها حالة ثانوية لاختلال توازن القوى الطولانيّة على طول الجدار المعوي , وفي النمط المعوي-المعوي ينتج هذا الاختلال عن تواجد كتلة نسيجيّة أو حدوث نمط غير مُنتظم من التمعّج بعد اجراء العمليّات الجراحيّة .