Partenstein liegt in da Region Main Spessart mittn im Spessart am linkn Ufa vo da Lohr, uma siem Kilometa noadwestli vo da Stod Lohr am Main. Da topografisch hechste Punkt vo da Gmoagemarkung befindt se mid  am Gaulskopf, noadestli vo Partenstein, da niedrigste liegt an da Lohr auf .