Im 11. Joahundat is Margilan de greßte Stod im Ferghanatal gwen; am Aufaung vum 16. Joahundat hot da Babur, da Begründa vum Mogulreich, gsogt, dass d'Qualität vu de Granatöpfi, Marüna und vum Wüüd aus Margilan a Wahnsinn is. Außadem hod a de Leid duat, d'Sarten, ois aungriffslustig bschrim und außagstrichn, dass de meistn vu de bekaunntn Exorziste in Buchara und Samarkand Margilanis san. In dera Zeit woan de Gschäftsleid aus Margilan Schlüsselspiela im zentralasiatischn Haundl. Nachdem de Stod im 18. Joahundat zum Khanat Kokand gheat hod, homs 1876 de Russn eingnumma. In da Sowjetzeit woa Margilan s'Zentrum vum usbekischn Schwoazmoakt und heit güüt de Stod wie aa Namangan ois a Hochburg vum konservativn Islam.