Ang El Niño ug La Niña mahimong adunay daku nga epekto sa ekosistema sa coral reef, ug ilabi na sa mga coral reefs. Sa tibuok kalibutan, ang ENSO nakamugna og dinaghang bleaching ug coral mortality sa panahon sa 1982-1983, ref 1997-1998, ref 2002-2003, ref 2005, ref ug 2010, ug nakaamot sa pagkapuo sa usa ka matang sa coral. ref