Роля сельскай гаспадаркі ў эканоміцы краіны нязначная. Яно дае менш трох адсоткаў ВНП краіны і забяспечвае 70% патрэб насельніцтва ў харчаванні. Японія - найбуйнейшы ў свеце імпарцёр сельскагаспадарчай прадукцыі. Галоўныя галіны спецыялізацыі сельскай гаспадаркі: вырошчвання рысу, плодаагародніцтву і рыбалоўства. На паўночным усходзе і ўзбярэжжа Японскага мора распасціраецца так званы рысавы пояс. Японія вядзе рыбны промысел ва ўсіх раёнах Сусветнага акіяна і зяўляецца сусветным лідэрам па лоўлі рыбы і морапрадуктаў.