Кульмінацыяй «справы Новікава» стаў яго арышт у 1792 годзе; у якасці доказу супраць яго фігуравала цыдулка Васіля Бажэнава, якая адносіцца да 1784 годзе, у якой архітэктар адчытваўся пра тайную сустрэчу з цэсарэвічам.