Універсітэт працуе сумесна з Медыцынскім цэнтрам Сан-Дыега і супрацоўнічае з шэрагам рэгіянальных навуковых цэнтраў, сярод якіх: Інстытут Солка, Інстытут медыцынскіх даследаванняў Бернема, Навукова-даследчы інстытут Скрыпса.