Deniker ye naixito en 1852 de padres franceses en Astrakhán, (Tartaria, Rusia). Primero estudeó en o instituto tecnico de Sant Petersburgo, on se fació incheniero, y con esta profesión podió viachar a saber-lo de vegatas ta os distritos petroliferos d'o Caucaso, ta Europa Central, ta Italia y Dalmacia. S'establió en París en 1876, estudeó en a Sorbona y se doctoró en sciencias naturals en 1886. En 1888 lo nombroron librero cabo d'o Museu d'Historia Natural de París.