O río Ammer naixe en a parte sud d'o estau de Bavera y escurre en dirección preferentment norte, dica plegar a lo Ammersee per lo sud, an desaugua. O prencipal emisario d'o laco, que sale per la marguin norte, ye lo río Amper, que puede considerar-se lo curso baixo d'o río Ammer. L'Amper desemboca finalment en o río Isar, amán d'a ciudat de Moosburg, dimpués d'un curso total de 185 kilometros.