A primers de 2005, o guitarrista dentró en o estudio pa gravar o suyo quinto álbum con os Ret Hot Chili Peppers, Stadium Arcadium, en o qual domina a suya guitarra en a mayoría d'as cancions, realizando tamién os coros. En os arreglos d'o disco, Frusciante utilizó una amplia gama de sons, que van dende os escuitaus en Blood Sugar Sex Magik dica os de By the Way. Quantos criticos, y mesmo o propio Frusciante, notoron a influencia de Jimi Hendrix en a mayoría d'os solos d'o disco. Amás, expandió a cantidat d'efectos d'a suya guitarra y emplegó atros trastes, como que o sintetizador y o melotrón.