O chelo a deseparau bellas islas d'a parti continental, deixando dos grans islas que se troban sin habitar, Secretary Island y Resolution Island. Quantos lacos son totalment o parcial aintro d'as mugas d'o parque, entre os que destacan o laco Te Anau, o laco Manapouri, o laco Monowai, o laco Hauroko, y o laco Poteriteri.