Debutó en a Primera división espanyola o 24 de marzo de 2004, en un partito entre o Sevilla FC y o Málaga CF. Manimenos, no estió dica la temporata 2005/06 quan estió un fixo en o equipe. Iste anyo esdevinió en un idolo de l'afición, ya que un gol d'ell en a prolarga d'as semifinals contra o Schalke 04, metió a lo Sevilla en a suya primera final d'a Copa d'a UEFA, competición que rematarba ganando ixa mesma anyada chugando a final contra o Middlesbrough FC con un resultato de 4-0. Convocato como suplent, Puerta chugó los zaguers quatro menutos d'a final.