Dimpués de la reconquiesta Benafer yera en la baronía d'Exerica. La población musulmana fue forachitada en 1368 dimpués d'una revuelta en lo contexto de la guerra de los dos Peros. L'11 d'aviento de l'anyo 1379 Benafer recibió carta de población a favor de vint pobladors cristians; lo texto ye escrito en aragonés.