L'Aiguabarreig de Mequinenza ye controlau por a ZEPA Matarranya-Aiguabarreig, d'as qualas 7.417,26 ha se sitúan en o municipio de Mequinenza. A ZEPA engloba a zona central de l'Aiguabarreig, dende Torrent d'a Cinca, tot o espacio fluvial de Mequinenza dica a unión con o río Matarranya en a comarca homonima. Para a cuenca d'o río Matarranya, a ZEPA incluye os municipios de Fayón, Nonasp, Favara y Maella.