Frusciante prencipió a treballar con o suyo amigo Omar Rodríguez-López y a suya banda The Mars Volta, contribuindo en os coros y tocando os trastes electronicos en o disco De-Loused in the Comatorium. Tamién contribuyó con os solos d'o disco Frances the Mute, y en o suyo disco Amputechture tocando a guitarra en siet d'as ueito cancions d'o treballo. Por a suya parte, Omar Rodríguez ha treballau en quantos treballos en solitario de Frusciante.