O toponimo Bascuñana deriva d'a forma latina VASCONIANA y fa referencia a repoblacions medievals en as que intervinioron bascos. Manimenos tamién existe a posibilidat que siga un toponimo transportau relacionau con pobladors provinients d'a localidat burgalesa de Bascuñana ya en tiempos en que os habitants d'orichen basco d'ixa localidat yeran asimilaus a los castellans.