في 17 أكتوبر 1897 رسمه البابا كيرلس الخامس اسقفا على دير البرموس باسم ايسوذورس وكان له من العمر 30 سنة. في 31 ديسمبر 1897 اصدر المجمع قرار بتجريد الانبا ايسوذورس، فاشترى منزل بقرب الدار البطريركية بالازبكية واعد فيه كنيسة خاصة وقد كان له نشاط واسع في إصدار المجلات وتأليف الكتب. في أبريل 1941 تم الصلح اخيرا بين الانبا ايسوذورس والبابا يوأنس التاسع عشر على الا يباشر عملا كهنوتيا غير تقديس الاسرار.