أدت الصراعات السياسية والعسكرية في القرن السادس والسابع، الى رحيل مدرسة الاسكندرية الى دير القديس أنبا مقار ظلت المدرسة في برية القديس مقاريوس حتى بداية القرن الحادي عشر؛ لأن المراجع الكنسية الخاصة بتاريخ الكنيسة والتي نقل منها الأنبا ساويرس أسقف الأشمونين تاريخ بطاركة كنيسة الاسكندرية القبطية جاءت من مكتبة دير الانبا مقار.