水の神殿へは「ハイリア湖畔」から行ける。以下、ダンジョンに入るまでの手順を簡単に解説。詳しくは「攻略チャート7」を参照。氷の洞窟で「青い炎」を入手する。ゾーラの里で凍っているキングゾーラを「青い炎」で溶かし、お礼に「ゾーラの服」をもらう。「水のセレナーデ」を吹いてハイリア湖畔にワープしてくる(A)。ゾーラの服とヘビィブーツを装備し、ワープして来た所の北の水の中に入る(B)。神殿の入口の上にあるクリスタルスイッチをフックショットで押すと入口が開くので、水の神殿に入る。ダンジョン攻略のヒント水中で行動するためにはゾーラの里にいるキングゾーラからもらえる「ゾーラの服」が必要。ヘビィブーツに履き替えることで、水中の探索が可能になる。水中への出入りは何度も繰り返すことになるので、ブーツの履き替えがやや面倒。水中では攻撃手段が限られている。ヘビィブーツを履いて水底に足をつけている時のみフックショットが使用可能。水の神殿の攻略の要は水位。トライフォースが描かれた石版を調べ、その前で「ゼルダの子守唄」を吹くと水位を変化させられる。これら石版は全部で3つある。このダンジョンで手に入る「ロングフック」はフックショットの2倍の長さ。フックショットでは遠すぎて届かない的はロングフックを入手するまで探索は後回し。攻略ダンジョンマップ入手まで入口からまっすぐ進むと、水中からそびえたつ塔のある大部屋に出てくる。ヘビィブーツに履き替えて水の中に飛び込み、底(1F)まで沈む。大部屋の東側、入口に2つの燭台がある通路を進む。