間の結合を表すモースポテンシャル項で考慮する。120)で行っている。ピークの位置もおおよそ再現できている。ピークの高さに関してはずれがみられる。用した結果を報告する予定である。東工大資源研[email&#160;protected][email&#160;protected]�り取ったポリペプチドを非破壊的に気化し、高分解能の振動スペクトルを取得することが可能になった。原子に及ぶポリペプチドの振動スペクトルの帰属と構造決定には理論計算が必要不可欠である。造の探索と調和近似に基づくスペクトル計算を行い、振動分光実験により得られたスペクトルと比較することで行われてきた。大な数の準安定状態が存在するため、最安定構造の探索は容易ではない。非調和性の強い水素結合が分子内に多数存在し、調和近似に基づく振動スペクトルは信頼性が低い。慮した振動状態計算を組み合わせることで、上記の問題を克服する。残基ペプチド(SIVSF:下図)の振動スペクトルを計算し、実験で得られたスペクトルと比較することで構造決定を行った。最初に、レプリカ交換分子動力法により構造探索を行った。数の系のコピー(レプリカ)の分子動力学計算を独立・並行的に実行し、適当な頻度で隣り合うレプリカ間の温度を交換することで、幅広い構造空間のサンプリングを可能とする。点のスナップショットを取得した。個の候補構造を抽出した。点選びスペクトル計算を行った。得られた非調和ポテンシャルに基づく振動状態計算を実行、という手順で行った。計算の詳細およびスペクトルの帰属については当日報告する。素の変異耐性などの研究が盛んに行われている。謝に関与する酵素である。関する知見が様々な分野において報告されている。ドメインとなることが報告されている(Fig.2)[1]。結合の阻害要因ではないかと報告されている[2]。基質結合描像を推察するとともに、構造と活性の相関を明らかにする。TIP3P水分子を用いた。